AbstractThe treatment paradigm for lymphoma, a highly heterogeneous group of hematologic malignancies, has been revolutionized by the develo … rgeting chimeras, the design of rational, synergistic combination strategies, and the leveraging of multiomics and artificial intelligence to decipher complex signaling networks. By continuing to translate molecular insights into clinical practice, the field is steadily moving toward the goal of achieving precision cures for patients with lymphoma.
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BC) presents a major clinical challenge due to high recurrence and progression rates, highlighting the need for … stigated using a comprehensive suite of in vitro assays and in vivo models. We performed integrated multiomics analyses (RNA-seq, m6A-seq, and RIP-seq) and validated the underlying molecular mechanisms by performing additional targeted assays to elucidate the downstream regulatory network. Finally, the therapeutic potential of targeting this axis was validat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcopenia in alcohol-related liver disease (ALD) is of high clinical significance, but there are no effective treatments. Hyaluronan 35 kDa … rce microscopy, and muscle contractile responses to electrical stimulation ex vivo were quantified. Multiomics, weighted gene co-expression network, and image analyses were also performed. Ethanol caused a sarcopenic phenotype in myotubes and mALD (lower myotube/muscle fiber diameter, muscle mass), less protein synthesis, impaired mTORC1 signaling, and highe …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cortex Dictamni (CD) is a traditional Chinese medicine that is commonly used to treat various skin diseases. Recently, clinical … LB) and cytochrome P450 (CYP) 3A4 levels, indicating significant hepatotoxicity in rats. Integrated multiomics analysis revealed that NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2 (Ndufs2) is a critical regulator of CD-induced hepatotoxicity involving oxidative phosphorylation (OXPHOS). CD inhibited the viability of HPHs and dHepaRG cells, demonstrating its …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin 9), which is mainly secreted by the liver, is not only a therapeutic target for hy … utralizing antibody. Moreover, we performed multiorgan histological and transcriptome analyses, and multiomics and single-cell RNA-sequencing studies of the liver during HTR, as well. We further used hepatocyte-specific Pcsk9 knockout mice to investigate whether the liver regulated HTR through PCSK9. Last, we explored the regulatory effect of the PCSK9/CD36 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genetic and experimental studies support a causal involvement of interleukin-6 (IL-6) signaling in atheroprogression. While tria … infiltration, adaptive immune system activation, and cytokine signaling.
CONCLUSIONS: Integrating multiomics data, we found a proteomic signature of IL-6 signaling activation and mediators of its effects on cardiovascular disease. Our analyses suggest the interferon-γ-inducible chemokine CXCL10 to be a potentially causal mediator for atherosclerosis in thr …
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteogenesis imperfecta (OI) is a heritable and chronically debilitating skeletal dysplasia. Patients with OI typically present with reduced … 172Asp as OI-causative and highlights the value of extrapolating molecular signatures identified in multiomics studies to characterize novel genetic variants.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gut colonisation by extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli is a risk factor for developing overt infect … as assessed by various methods including random forest (AUROC=0·61).
INTERPRETATION: By combining multiomics and machine-learning approaches, we conclude that asymptomatic gut carriage of ESBL-producing E coli is not associated with an altered microbiome composition or function. This finding might suggest that microbiome-mediated colonisation resistance ag …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Most of biomarker panels, extracted from single omics traits, still need improvement since they display a gray zone where predic … red to the peptides alone. To our knowledge, this report is the first to demonstrate that combining multiomics traits extracted from (fetal) urine samples displays clear promise for kidney disease stratification.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although coiled-coil domain containing 69 (CCDC69) has been implicated in tumor biology, its role in triple-negative breast cancer (TNBC) and immune regulation remains unclear. Bulk transcriptomic data, single-cell RNA sequencing datasets, and spatial transcriptomics were used to investigate the role of CCDC69 in TNBC. Germinal center B-cell (GCB) signatures were quantified using single-sample gene set enrichment analysis (ssGSEA), and their associations with CCDC69 expression were assessed using correlation, ROC, and logistic regression analyses. An independent external TNBC cohort (GSE58812)
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Gestational diabetes mellitus (GDM) is a common pregnancy complication which could induce immune dysfunction. Although intrauterine hyperglycemia impairs fetal immune development, its cell-type specific effects on neonatal immune cells, and cell‑cell communication remain unclear.
METHODS: In this pilot study, we performed integrated 5' single‑cell RNA sequencing and TCR repertoire analysis of cord blood mononuclear cells from two GDM and one type 2 diabetes mellitus (T2DM) mother-neonate pairs, with public healthy cord blood data (GSE157007) as controls. After quality control, 5
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Biomarkers are needed to predict treatment response and guide therapeutic decisions in Crohn disease (CD). We aimed to develop and validate a multi-omics machine learning (ML) model to predict response to nutritional therapy in pediatric CD.
METHODS: Treatment-naive children with newly diagnosed CD who were initiating exclusive enteral nutrition (EEN) were prospectively enrolled in this study. Metabolomics and lipidomics were measured in the serum and stool, as well as the fecal microbiome. Following feature selection via minimum redundancy maximum relevance, random-forest models
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic cardiomyopathy (DCM) is a critical pathological driver of heart failure in diabetic patients, primarily characterized by progressive myocardial fibrosis. Nevertheless, the core molecular network linking upstream metabolic dysregulation to the aberrant activation of downstream cardiac fibroblasts remains largely elusive. In this study, we combined in vivo and in vitro approaches with bioinformatics analysis. A high-fat diet-induced mouse model of diabetic myocardial fibrosis was established, and transcriptome sequencing was performed to screen for hub genes, which were subsequently val
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is characterized by persistent airflow limitation, chronic airway inflammation, and immune dysregulation, and currently available therapies remain insufficient to effectively halt disease progression. In this study, we used an integrative, hypothesis-generating strategy to investigate the potential mechanisms of baicalein against COPD by combining multi-dataset transcriptomic analysis, single-cell transcriptomics, machine learning-based feature selection, Mendelian randomization (MR), molecular simulation, virtual knockout analysis, and in vitro val
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biologically informed deep neural networks, which connect input layer to hidden layers based on genepathway relationship have gained popularity in recent years. However, most existing methods do not incorporate protein-protein interactions (PPI) and protein-DNA interactions (PDI) in their designs. In this study, we introduce BioLM-NET, a deep learning-based framework that fuses single cell or bulk gene expression data and DNA methylation data with prior biological knowledge including Protein- Protein Interactions (PPI), Protein-DNA Interactions (PDI). BioLM-NET also aggregates latent represent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired resistance to 5-fluorouracil (5-FU) is a primary clinical challenge in colorectal cancer (CRC) treatment. Our study aimed to identify key factors predictive of 5-FU resistance and to elucidate their functional mechanisms by combining multi-omics analysis with experimental verification. The prognostic model was constructed based on the gene expression omnibus (GEO, GSE196900, GSE166555) and the cancer genome atlas (TCGA)-Colon Adenocarcinoma (COAD) datasets combined with regression analysis. Kaplan-Meier (K-M), receiver operating characteristic (ROC) curve, and nomogram were used to ev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundThis study aimed to identify DNA repair-related genes causally affecting OCC risk by integrating multi-omics data using summary data-based Mendelian randomization (SMR).MethodsSMR analyses were performed using GWAS, mQTL, eQTL, and pQTL data. Causal associations were assessed via SMR and HEIDI tests, and colocalization analysis identified shared genetic variants. Findings were validated in the FinnGen_OCC cohort.ResultsThis study identified 160 methylation sites (96 genes), 30 eQTLs, and 2 pQTLs linked to OCC. Colocalization confirmed 96 mQTLs, 20 eQTLs, and 2 pQTLs (GPN1, HNRNPAB).
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies highlight the critical role of gut microbiota in sepsis pathogenesis and its potential link to neurological disorders, particularly sepsis-associated encephalopathy (SAE). However, the exact relationship between gut microbiota, their metabolites, and SAE’s etiology and progression remains enigmatic. We aimed to elucidate how gut bacteria, fungi, and their metabolites contribute to the development and progression of SAE. METHODS: This study was a prospective cohort study. Patients who met the criteria for sepsis 3.0 were included and were divided into SAE and non-SAE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tri(1,3-dichloro-2-propyl) phosphate (TDCIPP) is a commonly used organophosphate ester that has the potential to adversely affect human health. Although previous studies have closely associated TDCIPP with cognitive impairment, the underlying mechanisms remain unclear. To elucidate the neurotoxic effects of TDCIPP and its mechanistic contribution to cognitive impairment in 3 ×Tg-AD mice, a multi-omics approach incorporating proteomics, untargeted metabolomics, and 16S ribosomal RNA (rRNA) gene sequencing was employed to evaluate the impact of TDCIPP exposure on neurobehavioral function. TDCIPP
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular vesicles (EVs) can encapsulate and deliver diverse bioactive cargos, enabling multimolecular parallel communication and network-level regulation, and are emerging as promising nanotherapeutics. However, existing engineering strategies predominantly focus on single-function enhancement, limiting coordinated improvements in multi-dimensional regulation. As a proof of concept, we propose a lncRNA-driven multi-omics (transcriptomic and proteomic) reconstitution EV engineering strategy that leverages synergistic functional enhancement to generate multifunctional EVs (MF-EVs) with hepa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.