Cholangiocarcinoma (CCA) is a highly desmoplastic biliary malignancy in which durable benefit from chemotherapy, immune checkpoint blockade, … apeutic strategies for identifying and rewiring pathogenic CAF niches using single-cell and spatial multiomics, multiplex imaging, patient-derived models, FAP imaging, senescence-associated interventions, ECM normalization and rational stromal-immunotherapy combinations. This framework emphasizes that post-treatment CAF evolution should be interpreted agains …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Resistance to anti-programmed cell death protein-1 (PD-1) treatment in gastric cancer (GC) is closely associated with an immunosuppressive tumor microenvironment. However, the role of neutrophils in resistance to anti-PD-1 therapy remains unclear.
METHODS: Single-cell RNA sequencing was performed on tumor samples from patients with advanced GC receiving anti-PD-1 therapy to identify neutrophil subsets associated with neutrophil extracellular traps (NETs). Multilevel experimental validation was conducted using multiomics analysis, flow cytometry, multiplex immunofluorescence, and i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patchouli alcohol (PA), the active ingredient of Pogostemonis Herba, is important in medicine and food, effectively alleviating … BS-D treatment. Molecular docking predicted a strong binding affinity between PA and these targets. Multiomics indicated aberrant gastrointestinal motility, imbalanced excitatory and inhibitory neurons, and significantly reduced myosin Va expression under chronic restraint stress-induced IBS-D rat. PA treatment significantly improved these symptoms and resto …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The E7 oncoprotein of mouse papillomavirus (MmuPV1) plays a pivotal role in both viral infection and cancer development. While e … E7 oncoprotein in promoting disruption of keratinocyte homeostasis in mouse keratinocytes. Using a multiomics approach, we observed that MmuPV1 E7 promoted several phenotypes associated with "high-risk" human papillomavirus (HPV) infection. Specifically, we confirmed that MmuPV1 E7 does not increase E2F-responsive gene expression and proliferation of mouse …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Subarachnoid hemorrhage (SAH) is an uncommon type of potentially fatal stroke. The pathophysiological mechanisms of brain injury remain unclear, which hinders the development of drugs for SAH. We aimed to investigate the pathophysiological mechanisms of SAH and to elucidate the cellular and molecular biological response to SAH-induced injury.
METHODS: A cross-species (human and mouse) multiomics approach combining high-throughput data and bioinformatic analysis was used to explore the key pathophysiological processes and cells involved in SAH-induced brain injury. Patient data wer…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shudage-4, an ancient and well-known formula in traditional Mongolian medicine comprising four different types of traditional Chinese medici … ficantly differential metabolites were closely associated with the Shudage-4 treatment. The further multiomics joint analysis found that significantly upregulated 5 plasma metabolites in Shudage-4-treated rats compared to model rats were negatively correlated with gene set expression related to ROS in gastric tissue. Shudage-4 alleviated WIRS-induced gastric …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The functional status of immune cells in the tumor microenvironment and tumor characteristics may explain bacillus Calmette-Guérin (BCG) failure in high-risk non-muscle-invasive bladder cancer (NMIBC).
OBJECTIVE: To characterize molecular correlates of post-BCG high-grade (HG) recurrence using multiomics analysis.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Patients with BCG-treated NMIBC (n = 156) were included in the study. Metachronous tumors were analyzed using RNA sequencing (n = 170) and whole-exome sequencing (n = 195). Urine samples were analyzed for immuno-oncology-related protei…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Irritable bowel syndrome (IBS) is a common clinical label for medically unexplained gastrointestinal (GI) symptoms, recently d … een the central and the peripheral components of the brain-gut-microbiota axis at the levels of the multiomics, microbiota profiles, and brain connectome of a cohort of 100 patients with IBS and matched controls; study long-term safety and efficacy of the low-FODMAP diet on changes in nutritional status, gut microbiota composition, and metabolites; and to in …
Протокол клинического исследованияСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intrauterine adhesions (IUA) are a leading cause of acquired female infertility that predominantly arises following surgical int … an and murine models, with four verified using immunohistochemistry (IHC).
RESULTS: Our integrated multiomics analysis identified seven hub genes associated with IUA pathogenesis through GO, KEGG, and GSEA enrichment analyses. The expression levels TUBB3, WNT5A, GDF7, IGF1, and BIRC5 were downregulated, and those of PTGDS and CCL14 were upregulated. The qPC …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GWAS on grain uniformity and transcriptomics across spike shapes/positions reveal checkpoints in barley grainheterogeneity development. Grain uniformity, defined as the consistency of grain size among siblings within a sample, can influence yield performance and malting quality in barley, yet its genetic basis remains poorly understood. Here, we combine genome-wide association analysis of 334 barley accessions with spatiotemporal transcriptomics of two cultivars exhibiting contrasting uniformity. We identified six quantitative trait loci (QTLs) across chromosomes 1H, 2H, 4H, and 5H. The non-un
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colon adenocarcinoma (COAD) is a heterogeneous malignancy whose molecular complexity limits effective therapy. Existing transcriptome-based classifications capture only part of this diversity. To refine COAD stratification, we integrated genomic, epigenomic, and transcriptomic data from 297 The Cancer Genome Atlas patients. Ten complementary clustering algorithms were combined through a consensus ensemble framework to ensure robust and unbiased subtype discovery. The resulting molecular subtypes were characterized by genomic alterations, signaling pathways, tumor microenvironment features, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute pancreatitis (AP) pathogenesis involves gut microbiota dysbiosis. Although Lactobacillus salivarius Li01 (Li01) is a well-characterised probiotic strain, its specific role in AP via the 'gut-pancreas axis' remains unclear. Li01 pretreatment via oral gavage was assessed in an L-arginine-induced AP mouse model. The gut microbiota composition and abundance were analysed via 16S rRNA sequencing, complemented by untargeted faecal metabolomics and pancreatic transcriptomics analyses. Li01 pretreatment significantly alleviated histopathological damage to the pancreas and reduced serum amylase a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cerebral infarction (CI) is a major cause of adult disability and mortality worldwide. Mounting evidence supports the critical role of the gut-brain axis in cerebrovascular disease progression. This study aimed to characterize the alterations in gut microbiota, serum metabolome, and serum proteome in patients with CI, and to identify multi-omics signatures associated with clinical symptoms.
METHODS: A total of 20 CI patients and 20 healthy controls (HC) were enrolled. Fecal microbiota was profiled using 16 S rRNA gene high-throughput sequencing. Serum metabolomics and proteomics w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine oral melanoma is a highly aggressive tumor with limited therapeutic options and a poor prognosis. To elucidate the molecular mechanisms underlying its progression and response to radiation therapy (RT), we performed a longitudinal multi-omics analysis incorporating whole-genome sequencing (WGS) and RNA sequencing (RNA-seq) on tumor and blood samples from a single neutered male mixed-breed canine case. WGS of pre-treatment tumor tissue revealed a predominance of endogenous mutational processes, with frequent mutations in cancer-associated genes such as NTRK3, EGFR, and ADAM17, and struct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gene-wise intratumor heterogeneity (ITH), defined as spatial variability in the expression of individual genes across tumor regions, remains incompletely characterized in non-small cell lung cancer (NSCLC). Identifying low-ITH genes as predictive biomarkers offers a promising strategy to enhance the reliability of immunotherapy outcome prediction.
METHODS: We profiled gene-wise ITH using multi-region scRNA-seq data and a computational framework combining variance and clustering metrics. Prognostic low-ITH genes were screened via immunotherapy RNA-seq datasets and six machine learn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transplant-associated cutaneous squamous cell carcinoma (TSCC) is one of the most common malignancies in solid organ transplant recipients and is strongly associated with long-term immunosuppression. However, the transcriptional programs and molecular mechanisms through which chronic immunosuppression reshapes intratumoral CD8⁺ T-cell differentiation remain poorly understood.
METHODS: We integrated single-cell transcriptomic and T-cell receptor repertoire analyses of TSCC and immunocompetent cutaneous squamous cell carcinoma (SCC). An independent SCC cohort containing paired tumor
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetes-associated cognitive dysfunction represents a global health challenge, yet the mechanisms by which anesthetics modulate cognitive function in diabetic states remain poorly understood. We systematically compared the effects of 2-hour brief exposure to sevoflurane (SEV) and propofol (PRO) on cognitive function and neuropathology in streptozotocin (STZ) -induced diabetic mice. Morris water maze and Y-maze tests revealed that SEV significantly exacerbated spatial memory and learning deficits in mice, while PRO showed no significant effects. Additionally, diabetic mice exhibited reduced Ne
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reversible disruption of the blood-brain barrier (BBB) occurs within hours after the onset of ischemic stroke (IS), offering a critical window for therapeutic intervention. However, the molecular characteristics and their potential as circulating biomarkers associated with this transient phase of BBB dysfunction remain poorly defined. To elucidate these mechanisms, we employed an oxygen-glucose deprivation (OGD) model in human cerebral microvascular endothelial cells (hCMEC/D3) to simulate early ischemic stress, and systematically profiled their secreted proteome and metabolome. By comparing w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Depression is a leading cause of mental and physical disability globally, with its onset and progression influenced by a complex interplay of dietary, psychological, and biological factors. Recent research suggests a link between sugar-sweetened beverage (SSB) consumption and depression risk, although the potential biological pathways underlying this association remain poorly understood.
METHODS: This study utilized data from 192,045 participants in the UK Biobank to examine the prospective association between SSB consumption and incident depression using Cox proportional hazards
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is a prevalent chronic liver disorder with limited therapeutic options. Xiong's Shiwei Wendan Decoction (XSWD) is a traditional Chinese formula that has shown clinical benefits in MASLD, but its bioactive constituents and underlying mechanisms remain poorly characterized. In this study, an integrated approach combining UHPLC-Q-TOF/MS-based serum pharmacochemistry with multi-omics was employed to elucidate the chemical basis and mechanisms of XSWD in treating MASLD. The bioactive constituents of XSWD-containing serum were characte
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.