Omics research is changing the way medicine develops new strategies for diagnosis, prevention, and treatment. With the surge of advanced mac … igence-based frameworks, together with advances in quantum algorithms, has the potential to enhance multiomicsc analyses, increasing the efficiency and reliability of the gene expression profile prediction. The development of more accurate computational models will significantly reduce the error rates in interpreting large datasets. By making analytical work …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder with a complex etiology. Emerging evidence implicates gut microbiota dysbiosis in ALS pathology via the gut-brain axis, yet the specific integrative profile of the gut microbiome, virome, and metabolome, particularly in Chinese patients, remains incompletely characterized. Although global diversity indices showed no significant differences, taxonomic analysis revealed distinct compositional shifts. The ALS microbiome was characterized by a significant depletion of beneficial anti-inflammatory genera, specifically Akkerma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumor cell heterogeneity is a fundamental driver of breast cancer aggressiveness, underlying recurrence, metastasis, and therapy resistance. Understanding the biological characteristics and functions of specific tumor cell clusters in the tumor microenvironment is crucial for advancing precision oncology.
METHODS: We delineated breast cancer tumor cell heterogeneity by integrating single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics, bulk transcriptomics, genomic and radiomic data. The oncogenic functions of the candidate gene TMSB10 were rigorously validated in vitro. To advance
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the key bile acid metabolites and the target of action during calcium oxalate (CaOx) kidney stone formation using a multi-omics approach. CaOx kidney stone models in Sprague-Dawley (SD) rats were established by 1% ethylene glycol (EG). In CaOx kidney stone rat models, targeted metabolomics analysis revealed four differentially expressed bile acids in serum, and 11 differentially expressed bile acids in kidneys, and chenodeoxycholic acid (CDCA) was identified as the key metabolite in the formation of CaOx kidney stones. Transcriptomics of rat kidneys rev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study systematically investigates the clinicopathological and molecular significance and tumorigenic functions of TOP2A in the kidney cancer subtypes KIRC, KIRP, and KICH through integrative bioinformatics analyses utilizing TCGA and a suite of different databases, including cBioPortal, UALCAN, GEPIA, TIMER, KM Plotter, TISIDB, OncoDB, ENCORI, MEXPRESS, String, GeneMANIA, and the Human Protein Atlas etc. TOP2A expression was found to be significantly upregulated across a range of clinical contexts, including pathological stage, histological subtype, tumor grade, and lymph node involvement
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postoperative delirium (POD) is a frequent neuropsychiatric complication after cardiac surgery, yet the biological basis of individual susceptibility remains unclear. In this prospective cohort study, 317 adults undergoing elective on-pump cardiac surgery were enrolled and followed for POD during the first 7 postoperative days. Thirty patients who developed POD were then matched 1:1 with 30 non-POD controls by age, sex, and primary diagnosis for multi-omic analyses. Preoperative fecal samples were collected from the first bowel movement after admission and before prophylactic antibiotic admini
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The abilities of recent high throughput techniques to measure biological responses is rapidly growing, therefore methods to analyse and organise these vast amounts of data into meaningful results are needed. Adverse outcome pathways (AOPs) and AOP networks (AOPNs) are an increasingly recognised framework for translating mechanistic information into useable knowledge to support policy decisions. However, many traditional statistical approaches may be ineffective at capturing nuances of high throughput data, particularly from multiple disparate layers of biological organisation. We present a com
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Anthocyanin accumulation is a developmentally regulated trait shaped by complex interactions between metabolic and transcriptional networks. However, dissecting the regulatory mechanisms underlying anthocyanin biosynthesis is often complicated by confounding variation in plant growth and environmental conditions. Methods: Here, we used a time-resolved multi-omics approach to investigate anthocyanin accumulation in maize seedlings by comparing an anthocyanin-rich inbred line PH19401 with an anthocyanin-deficient line YPX across five developmental stages. Results: Untargeted metabolo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intervertebral disc degeneration (IVDD) is a primary cause of low back pain, with its molecular mechanisms remaining incompletely understood. Ubiquitin-conjugating enzymes (E2 enzymes) play critical roles in protein degradation and maintenance of cellular homeostasis, yet their expression profiles and functional significance in IVDD remain largely unexplored. Using Gene Expression Omnibus (GEO) datasets (GSE70362 and GSE23130), we performed differential expression analysis, intersected with ubiquitination-related genes, and applied weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) to identi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To define the shared and divergent immune architecture of periodontitis (PD) and peri-implantitis (PI) and to identify intercellular communication programs linked to plasma cell accumulation.
METHODS: Differentially expressed genes (DEGs) in PD and PI versus healthy controls were identified from two bulk datasets (GSE223924, GSE106090); robust cross-dataset common DEGs underwent functional enrichment and protein-protein interaction analysis. A single-cell atlas (GSE171213) supported dual deconvolution (BisqueRNA, CIBERSORTx) and CellChat-based, plasma cell-centered communication in
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ulcerative colitis (UC) is an inflammatory bowel disease characterized by variable extent colon and rectum inflammation. The pathogenesis is not yet clear, with no curative treatments available. HuanglianKushen decoction (HKD) is derived from Puji Fang (Prescriptions for Universal Relief) which records its effect for improving symptoms of acute severe UC. However, weak research on its efficacy and pharmacological mechanism limits its clinical application.
PURPOSE: This study aims to establish the quality control method for the HKD aqueous extract and explore its mechanism of actio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a chronic immune-mediated disease driven by genetic susceptibility and environmental factors, including microbial exposure. While HLA-C-linked variants represent the strongest genetic risk factors, their relationship with the cutaneous microbiome remains incompletely understood. This study aimed to investigate host-microbiome interactions in psoriasis through integrative multi-omics analysis. Skin microbiome profiling using 16S rRNA sequencing and targeted genotyping of psoriasis-associated single-nucleotide polymorphisms (SNPs) was performed in lesional and non-lesional skin from
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Producing functional proteins involves multiple steps during mRNA translation on the ribosomes. However, co-translational regulatory mechanisms remain poorly characterized in intact mammalian systems. As a proof-of-concept, we developed a multi-omics approach to investigate endothelial-specific, co-translational regulation by modifying the translating ribosome affinity purification (TRAP) in vivo. We simultaneously co-immunoprecipitated (IP) polysome-associated mRNAs and proteins from the hearts of hemagglutinin-tagged ribosomal protein L22 mice (RiboTag) crossed with inducible endothelial-spe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Compromised bowel function and altered gut microbiota may disrupt gut-liver axis in short bowel syndrome (SBS), contributing to the development of intestinal failure-associated liver disease (IFALD). We conducted a multi-omics study integrating data from gut microbiota and liver transcriptomes with serum bile acids and clinical data in pediatric SBS-IF.
METHODS: Fifty-nine pediatric SBS-IF patients provided 177 fecal samples, 100 during parenteral nutrition (PN) and 77 after weaning off PN. Gut microbiota was analysed using 16 S rRNA amplicon sequencing and sequence-based
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Perfluorooctanoic acid (PFOA), a pervasive environmental pollutant, has been implicated in hepatic injury and metabolic dysfunction. However, its role as an environmental risk factor in the pathogenesis of Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) remains incompletely understood, particularly from a systems biology perspective.
METHODS: This study employed an integrative approach combining computational toxicology, multi-omics data analysis, and machine learning. Public databases were utilized to identify PFOA-related targets and MASLD-associated genes. A co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic pathways are crucial in hepatocellular carcinoma (HCC) pathogenesis, but causal metabolic genes remain unclear. This study used Summary data-based Mendelian Randomization (SMR) and colocalization to identify metabolism-related genetic loci influencing HCC risk.
METHODS: Differentially expressed genes in hepatic malignancy phenotype versus normal tissues from TCGA and GTEx were analyzed. Metabolism-related candidates were examined via SMR and colocalization using multi-omics data: methylation (mQTL), expression (eQTL), and protein (pQTL) quantitative trait loci.
RESULTS:
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inflammatory bowel disease (IBD), comprising Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), is a complex condition with diverse manifestations; recent advances in multi-omics technologies are helping researchers unravel its molecular characteristics to develop targeted treatments.
OBJECTIVES: In this work, we explored one of the largest multi-omics cohorts in IBD, the Study of a Prospective Adult Research Cohort (SPARC IBD), with the goal of identifying predictive biomarkers for CD and UC and elucidating patient subtypes.
DESIGN: We analyzed genomics, transcriptomics (gut biop
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal cord injury (SCI) leads to permanent paralysis, with no current treatments capable of enhancing neurological recovery. Tetramethylpyrazine (TMP) has recently emerged as a potential therapeutic agent for SCI, although further investigation is required to clarify its mechanisms of action.
METHODS: To evaluate the therapeutic effects of TMP on SCI, SCI models were established in rats, followed by assessment of therapeutic efficacy. Motor function recovery was quantified using the Beattie, Bresnahan and Basso (BBB) score, electrophysiological measurements, footprint analysis, a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Codonopsis pilosula (CP) is a traditional Chinese medicine used to tonify qi and strengthen the spleen, with reported anti-inflammatory effects. However, its efficacy and mechanisms in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) remain unclear.
AIM OF THE STUDY: The purpose of this study was to systematically investigate the therapeutic efficacy of CP against COPD in rats through an integration of network pharmacology and multi-omics, thereby providing experimental evidence for elucidating the underlying mechanisms through which CP exerts its therapeutic effec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Chemotherapy-induced mucositis (CIM) causes severe gastrointestinal symptoms in cancer patients. Magnoliae Officinalis Cortex, a traditional medicine, has demonstrated therapeutic promise in mitigating intestinal mucositis and gastrointestinal disorders, with advantages including marked efficacy and low adverse effect profiles compared to conventional pharmacotherapies. However, the therapeutic potential and mechanisms of the volatile oil of Magnoliae Officinalis Cortex (MagO) against CIM remain elusive. This study aimed to investigate the protective effects and mechanisms of MagO aga
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования