Platinum resistance remains a major obstacle to effective treatment and improved prognosis in ovarian cancer. Although 5-methylcytosine (m5C) RNA modification has been implicated in chemoresistance, its precise functional role in ovarian cancer remains unclear. In this study, we integrated RNA-Seq and single-cell transcriptomic data from cisplatin-resistant ovarian cancer cell lines and patient samples, identifying the m5C reader protein ALYREF as a key regulator of platinum resistance. Functional studies using ALYREF and NSUN2 knockdown, overexpression, and mutant constructs-combined with mul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite advances in therapy, lung adenocarcinoma (LUAD) remains a leading cause of cancer mortality. Angiogenesis and immune evasion critically influence LUAD progression and treatment resistance, yet epithelial-derived regulatory mechanisms and causal genes remain unclear.
METHODS: We employed single-cell transcriptomics (scRNA-seq) to identify angiogenesis-related epithelial-specific genes in LUAD. Mendelian randomization (MR) analyses utilizing large-scale genomic databases (eQTLGen, FinnGen) established genetic causality. A prognostic risk model was developed and validated usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tertiary lymphoid structures (TLSs) are lymphoid structures found in non-lymphoid tissues, which have been involved in the pathogenesis of multiple chronic diseases including tumors. TLSs are associated with better prognosis and response to immunotherapy in most types of tumors. However, what their associations with prognosis and the exact roles of TLS-related genes in gallbladder cancer (GBC) are still unclear. Here, we investigated the associations of TLS with the prognosis in 85 patients with GBC. Our results showed that the presence of intra-tumoral TLS was negatively associated with T sta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The precise molecular mechanisms through which gut microbiota mediate the antihypertensive effects of probiotic fermented milk (PFM) remain largely unexplored. This study aimed to elucidate these mechanisms by employing a multi-omics approach, combined with metagenomic deep sequencing technology, non-targeted metabolomics technology, and antibody chip protein detection technology to elucidate the potential mechanisms behind the antihypertensive effects of milk fermented by Lactiplantibacillus plantarum SR37-3 (PFM-SR37-3) in spontaneously hypertensive rats (SHR). Our findings demonstrate that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental pollutants, including volatile organic compounds (VOCs), are increasingly linked to chronic kidney disease (CKD), yet this association in hypertensive populations is not well understood. This study used data from the National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES) 2011-2018 to explore the association between VOC exposure and CKD in 1159 hypertensive adults (representing 33.6 million people). Sixteen urinary metabolites of VOC exposure (mVOCs) were analyzed with multiple statistical methods like logistic regression and weighted quantile sum (WQS) regression, alongside ma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Therapeutic apheresis and dialysis : official peer-reviewed journal of the International Society for Apheresis, the Japanese Society for Apheresis, the Japanese Society for Dialysis Therapy2025eng
OBJECTIVE: The present study aims to explore the role of nafamostat mesylate (NM) in ischemia-reperfusion (I/R)-induced acute kidney injury (AKI).
METHODS: Twenty-one male rats were randomly divided into three groups: sham, I/R, and I/R + NM groups. Acute renal I/R injury models were created in the I/R and I/R + NM groups by right nephrectomy and clamping the left renal pedicle for 45 min. Rats in the I/R + NM group were intraperitoneally injected with 0.75 mg/kg of NM before modeling. Blood and kidney specimens were collected at 24 h after model establishment. RNA sequencing (RNA-seq), KEGG
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Traumatic brain injury (TBI) is increasingly recognized as a systemic inflammatory disorder, with neutrophils playing a critical role in secondary injury. However, the phenotypic heterogeneity and clinical significance of neutrophil subsets in the early TBI immune landscape remain unclear, limiting their utility in nursing prognostic assessment and individualized care planning.
METHODS: We performed an integrated multi-omics analysis-combining single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), bulk transcriptomics, and proteomics-to dissect neutrophil diversity post-TBI. A distinct SLFN4+ ne
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-induced lung injury is driven by pathological remodeling of pulmonary microvascular endothelial cells (PMVECs), yet the metabolic underpinnings of endothelial dysfunction remain poorly understood. Using single-cell multi-omics analysis of PMVECs from septic patients, we identified profound metabolic reprogramming dominated by glycolysis upregulation, orchestrated through the HIF-1/PI3K-Akt signaling axis. Integrated bioinformatics (Seurat/WGCNA) and experimental validation in a murine sepsis model revealed that SLC2A1-mediated glycolytic flux sustains PMVEC dysfunction, exacerbating tis
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The causal role of cellular senescence in preeclampsia pathogenesis is not fully established. This study aimed to systematically prioritize key senescence-related genes potentially driving preeclampsia using a Mendelian randomization (MR) framework.
RESULTS: We integrated genome-wide association studies (GWAS) of preeclampsia with expression, methylation, and proteomic quantitative trait loci (eQTLs/mQTLs/pQTLs) data for 866 senescence-related genes. Summary-data-based MR (SMR) coupled with the HEIDI (Heterogeneity in Dependent Instruments) test were used to assess causal associat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acetaminophen (APAP) overdose is a known cause of acute kidney injury, yet the underlying molecular mechanisms remain incompletely understood. In this study, we conducted integrated transcriptomic, proteomic, and phosphoproteomic analyses of kidney tissues from mice with early-stage APAP-induced nephrotoxicity and corresponding controls. A total of 884 genes related to 13 distinct forms of programmed cell death (PCD)-including alkaliptosis, apoptosis, autophagy, cuproptosis, disulfidptosis, entotic cell death, ferroptosis, lysosome-dependent cell death, necroptosis, netotic cell death, oxeipto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis is a common metabolic bone disease with aging, characterized by low bone mineral density (BMD) and higher fragility fracture risk. Although current pharmacological interventions provide therapeutic benefits, long-term use is limited by side effects and comorbidities. In this study, we employed driver signaling network identification (DSNI) and drug functional networks (DFN) to identify repurposable drugs from the Library of Integrated Network-Based Cellular Signatures. We constructed osteoporosis driver signaling networks (ODSN) using multi-omics data and developed DFN based on dr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tumor Necrosis Factor Alpha is a known pro-inflammatory cytokine that plays a key role in the pathogenesis of rheumatoid arthritis. Anti-cytokine therapies targeting Tumor Necrosis Factor Alpha have greatly succeeded in treating rheumatoid arthritis in many patients. Despite these developments, many of the mechanisms of Tumor Necrosis Factor Alpha action have yet to be uncovered.
METHODS: In this study, we incubated PBMCs from healthy donors and rheumatoid arthritis patients with Tumor Necrosis Factor Alpha and then performed their single-cell multi-omics analysis via BD Rhapsod
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex autoimmune disorder characterized by immune dysregulation. The role of palmitoylation in regulating immune responses and its contribution to SLE pathogenesis remains insufficiently understood.
METHODS: We conducted a multi-omics analysis using the GSE61635 dataset to identify differentially expressed genes (DEGs) in SLE. Palmitoylation-related genes (PRGs) were identified through differential expression analysis, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), and machine learning models. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intervertebral disc degeneration (IDD) is a prevalent and multifactorial musculoskeletal disorder driven by complex genetic predispositions and dysregulated molecular pathways. While genetic contributions to IDD are widely recognized, the functional roles and therapeutic potential of specific causal genes remain incompletely characterized. To systematically identify novel and robust therapeutic targets, we performed an integrated multi-omics analysis. This approach integrated Mendelian randomization (MR) using large-scale GWAS summary statistics with QTL data, scRNA-seq, and bulk RNA-seq to pr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type 1 myocardial infarction (T1MI) is an acute ischemic event triggered by the rupture of a coronary atherosclerotic plaque. The pathogenesis of T1MI is highly complex, involving disturbances in iron metabolism, cell apoptosis, immune activation, and inflammatory responses. In recent years, ferritinophagy, a novel autophagic mechanism regulating iron homeostasis, has attracted increasing attention for its role in cardiovascular diseases. However, its precise involvement in T1MI remains to be fully elucidated. This study aims to systematically analyse the mechanism of ferritinophag
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is considerable evidence implicating maternal immune activation (MIA) and cytokine dysregulation in the pathophysiology of Autism. However, cytokines, due to their lack of specificity are unlikely to translate clinically as prognostic biomarkers. Our aim was to explore the perinatal molecular pathways dysregulated in umbilical cord blood, which precede a diagnosis of childhood Autism, and ascertain whether these putative biomarkers persisted into pre-pubertal childhood. In a cohort of 2137 mother-infant dyads, we conducted a nested case-control study in the BASELINE Birth Cohort. Proteom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The genetic architecture of essential tremor (ET) remains incompletely understood. A key challenge is translating genome-wide association study (GWAS) loci into specific effector genes to elucidate disease mechanisms and develop targeted therapies.
OBJECTIVE: To implement a multistage computational framework to prioritize high-confidence candidate genes for ET and to assess these predictions against publicly available, patient-derived transcriptomic data.
METHODS: We employed a convergent evidence strategy to prioritize genes, integrating cross-tissue (UTMOST) and tissue-specific
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP) is a multifaceted inflammatory condition that significantly affects patients clinically. It is vital to comprehend the basic molecular mechanisms and to discover new biomarkers. This research combines multi-omics data, molecular docking, and dynamic simulations to investigate gene functions and possible biomarkers related to CRSwNP. Initially, we discovered 555 differentially expressed genes (DEGs) induced by alpha-toxin (Hla) and 8119 DEGs associated with CRSwNP obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Utilizing GO/KEGG enrich
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Radiation-induced skin injury is a significant concern in nuclear accidents and cancer radiotherapy (RT). Skin damage ranges from mild erythema to severe ulceration, which significantly affects the patients' quality of life. While previous studies have highlighted the role of the apoptotic pathway, its precise mechanism in radiation-induced skin damage remains unclear.
METHOD: First, single-cell RNA and RNA-seq datasets were searched using the Gene Expression Omnibus (GEO) database, and further subgroup analysis of fibroblast skin cells, pseudotime analysis, and cell-cell communic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inborn errors of immunity (IEI), a diverse group of rare inborn disorders involving over 500 genes, pose diagnostic challenges despite next-generation sequencing advancements. Accurate molecular diagnosis is crucial for personalized treatment. This study aimed to assess the complementary role of genome and transcriptome sequencing in improving diagnostic yield for inborn errors of immunity. A cohort of 37 suspected IEI cases mainly consisting of predominantly primarily antibody deficiency (PAD) (27/37) underwent genome and transcriptome sequencing. We validated transcriptome sequencing analysi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.