Antibody diversity is generated through stochastic rearrangement of the immunoglobulin heavy chain locus (Igh) involving the recombination o … n spatially proximal genomic elements. The loop anchor CTCF modestly constrained population-average chromatin motion, whereas cohesin-mediated loops established large-scale confinement and reinforced self-similarity of VH-DHJH motion across spatial and temporal scales. Quantitative scaling arguments for first-passage times revealed that encounter frequencie …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KAT6A (MOZ) and KAT6B (QKF/MORF) are related histone lysine acetyltransferases (KATs) that have a high degree of functional redundancy during development. In the absence of KAT6A, embryos undergo an anterior homeotic transformation of the axial skeleton, develop an interrupted aortic arch, have ventricular septal defects and fail to form definitive hematopoietic stem cells. KAT6B has roles in brain, skeletal and hematopoietic system development. Because loss of KAT6A leads to highly penetrant phenotypes, this allows us to determine whether the acetylation function is essential for all activiti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis is a key pathological process in the progression of chronic liver disease to cirrhosis and hepatocellular carcinoma, with core features including hepatic stellate cells (HSCs) activation and extracellular matrix (ECM) deposition. Nonetheless, the precise spatiotemporal regulatory mechanisms of its gene expression have not been fully clarified. Interestingly, chromatin accessibility, as a core level of epigenetic regulation, directly determines the expression "switch" of fibrosis-related genes by dynamically altering the chromatin open state, which is closely related to key patho…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic regulation is essential for development and adaptation across eukaryotes. However, a comprehensive overview of the molecular framework of chromatin-mediated regulation, particularly in non-model organisms, is lacking. Here, we present a systematic proteomic characterization of the chromatin domains in P. falciparum, an ancient human pathogen with a unique genome composition and epigenetic blueprint. We adapted and employed three proximity-labeling approaches to provide a high-confidence and comprehensive proteome of heterochromatin, euchromatin, and (peri)centromeric chromatin compr…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancer (EC) is the most common gynecological malignancy in developed countries. Risk factors for EC include metabolic alteration … by microRNA action, but transcriptional impairment also has a profound impact. Here, we review how chromatin modifications change the expression of genes whose impaired function is directly related to EC etiopathogenesis. Chromatin modification plays a central role in EC. The modification of chromatin structure alters the accessibility of genes to transcri …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sister-chromatid cohesion mediated by the cohesin complex is critical for accurate chromosome segregation during mitosis. A key aspect of this process is the protection of cohesin at mitotic centromeres to resist spindle pulling-forces until anaphase onset. However, the mechanisms that prevent cohesin removal by its release-factor Wapl at centromeres remain incompletely understood. In this study, we identify ATRX, a chromatin remodeler of the SWI/SNF family, as a new binding protein of the cohesin complex. ATRX directly interacts with the cohesin accessory subunit Pds5B, antagonizing Wapl bind…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin structure plays a central role in defining cell identity by regulating gene expression. During development, shifts in chromatin structure facilitate changes in gene expression needed to specify distinct cell types. To understand how changes in chromatin structure influence the developmental trajectory of neural progenitor cells, we developed CUT&TIME, a technique that uses a hyperactive 6-methyl adenosine (6mA) methyltransferase pulsed in living cells to map historical chromatin accessibility genome-wide in single cells. We show that CUT&TIME produces a record of the chromatin landsc…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cytomegalovirus extensively alters nuclear organization and the cellular transcriptome, yet understanding of these genome-wide events remains relatively limited. Here, chromatin conformation capture (Hi-C) revealed how cytomegalovirus alters chromosome organization at both large- and small-scales. Nascent transcriptomics further revealed how transcriptional changes correlate with genomic reorganization, while also uncovering infection-induced transcriptional dysregulation that contributes to the induction of neuronal gene signatures in infected fibroblasts. Combining Hi-C and Cleavage Un…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with protean manifestations. There is little understanding of why so … inical subsets.
RESULTS: We examined 20 patients with SLE and 8 controls and found that individual chromatin marks varied considerably across T cells, B cells, and monocytes. When pathways were examined, there was far more concordance with conservation of TNF, IL-2/STAT5, and KRAS pathways across multiple cell types and ChIP data sets. Patients with cutane …
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular identity is determined through complex patterns of gene expression. Chromatin, the dynamic structure containing genetic information, is regulated through epigenetic modulators, mainly by the histone code. One of the main challenges for the cell is maintaining functionality and identity, despite the accumulation of DNA damage throughout the aging process. Replicative cells can remain in a senescent state or develop a malign cancer phenotype. In contrast, post-mitotic cells such as pyramidal neurons maintain extraordinary functionality despite advanced age, but they lose their identity.…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antiretroviral therapy (ART) lowers human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) viral load to undetectable levels, but does not eliminate th … ctivate HIV-1 transcription. In this current work, we examine the effect of RUNX1 inhibition on the chromatin state of the integrated HIV-1 LTR. Using chromatin immunoprecipitation (ChIP), we found that Ro5-3335 significantly increased the occupancy of STAT5 at the HIV-1 LTR. We also screened other BDZs for their ability to regulate HIV-1 transcription and …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Limited information is available on abiotic stress-mediated alterations of chromatin conformation influencing gene expression in plants. In order to characterize the effect of abiotic stresses on changes in chromatin conformation, we employed FAIRE-seq (formaldehyde-assisted isolation of regulatory element sequencing) and DNase-seq to isolate accessible regions of chromatin from Arabidopsis thaliana seedlings exposed to either heat, cold, salt, or drought stress. Approximately 25% of regions in the Arabidopsis genome were captured as open chromatin, the majority of which included promoters and…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We propose a comprehensive mathematical model to study the dynamics of ionizing radiation induced Ataxia-telangiectasia mutated (ATM) activation that consists of ATM activation through dual mechanisms: the initiative activation pathway triggered by the DNA damage-induced local chromatin relaxation and the primary activation pathway consisting of a self-activation loop by interplay with chromatin relaxation. The model is expressed as a series of biochemical reactions, governed by a system of differential equations and analyzed by dynamical systems techniques. Radiation induced double strand bre…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl CpG binding protein 2 (MeCP2) was first identified as a nuclear protein with a transcriptional repressor role that recognizes DNA met … requirement for MeCP2 in adult brain function. We focus on the emerging view that MeCP2 is a global chromatin organizer. Finally, we discuss how the individual functions of MeCP2 in neurodevelopment and adulthood are linked to its role as a chromatin regulator.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
At the nuclear periphery, the genome is anchored to A- and B-type nuclear lamins in the form of heterochromatic lamina-associated domains. A-type lamins also associate with chromatin in the nuclear interior, away from the peripheral nuclear lamina. This nucleoplasmic lamin A environment tends to be euchromatic, suggesting distinct roles of lamin A in the regulation of gene expression in peripheral and more central regions of the nucleus. The hot-spot lamin A R482W mutation causing familial partial lipodystrophy of Dunnigan-type (FPLD2), affects lamin A association with chromatin at the nuclear…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
From an epigenetic perspective, the genomic chromatin organization of neurons exhibits unique features when compared to somatic cells. Methyl CpG binding protein 2 (MeCP2), through its ability to bind to methylated DNA, seems to be a major player in regulating such unusual organization. An important contribution to this uniqueness stems from the intrinsically disordered nature of this highly abundant chromosomal protein in neurons. Upon its binding to methylated/hydroxymethylated DNA, MeCP2 is able to recruit a plethora of interacting protein and RNA partners. The final outcome is a highly spe…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The list of Mendelian disorders of the epigenetic machinery has expanded rapidly during the last 5 years. A few missense variants in the chromatin remodeler CHD1 have been found in several large-scale sequencing efforts focused on uncovering the genetic aetiology of autism.
OBJECTIVES: To explore whether variants in CHD1 are associated with a human phenotype.
METHODS: We used GeneMatcher to identify other physicians caring for patients with variants in CHD1. We also explored the epigenetic consequences of one of these variants in cultured fibroblasts.
RESULTS: Here we describe s…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies in neurons indicate that the large-scale chromatin architectural framework, including chromosome territories or lamina-associated chromatin, undergoes dynamic changes that represent an emergent level of regulation of neuronal gene-expression. This phenomenon has been implicated in neuronal differentiation, long-term potentiation, seizures, and disorders of neural plasticity such as Rett syndrome and epilepsy.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the ultrastructural conformation changes of the chromatin in blood leukocytes of bipolar patients, versus normal controls, by using the phosphotungstic acid-hematoxylin (PTAH) block-staining method, modified for electron microscopy, and the immunohistochemical localization of the histone H1, by the immunogold method. These two methods are basically complementary. If histone H1 immunolabeling is used, it shows that the immunogold labeling on chromatin is different in the three phases of the illness, i.e., high in normothymia and low in depression as well as in mania. How…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in schizophrenia (SZ) research indicate that the telencephalic gamma-aminobutyric acid (GABA)ergic neurotransmission deficit associated with this psychiatric disorder probably is mediated by the hypermethylation of the glutamic acid decarboxylase 67 (GAD(67)), reelin and other GABAergic promoters. A pharmacological strategy to reduce the hypermethylation of GABAergic promoters is to induce a DNA-cytosine demethylation by altering the chromatin remodeling with valproate (VPA). When co-administered with VPA, the clinical efficacy of atypical antipsychotics is enhanced. This promp…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования