Ossifying fibroma (OF) and fibrous dysplasia (FD) are two fibro-osseous lesions with overlapping clinicopathological features, making diagnosis challenging. In this study, we applied a whole-genome shallow sequencing approach to facilitate differential diagnosis via precise profiling of copy number alterations (CNAs) using minute amounts of DNA extracted from morphologically correlated microdissected tissue samples. Freshly frozen tissue specimens from OF (n = 29) and FD (n = 28) patients were obtained for analysis. Lesion fibrous tissues and surrounding normal tissues were obtained by laser c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mesial temporal lobe epilepsy (MTLE) is a chronic neurological disorder affecting almost 40% of adult patients with epilepsy. Hippocampal sclerosis (HS) is a common histopathological abnormality found in patients with MTLE. HS is characterised by extensive neuronal loss in different hippocampus sub-regions. In this study, we used laser microdissection-based microproteomics to determine the protein abundances in different regions and layers of the hippocampus dentate gyrus (DG) in an electric stimulation rodent model which displays classical HS damage similar to that found in patients with MTLE
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathophysiology of congenital cystic adenomatoid malformations (CCAM) of the lung remains poorly understood.
AIM: This study aimed to identify more precisely the molecular mechanisms limited to a compartment of lung tissue, through a transcriptomic analysis of the epithelium of macrocystic forms.
METHODS: Tissue fragments displaying CCAM were obtained during planned surgical resections. Epithelial mRNA was obtained from cystic and normal areas after laser capture microdissection (LCM). Transcriptomic analyses were performed and the results were confirmed by RT-PCR and immunoh
Клиническое исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The peri-implant epithelium (PIE) plays an important role in the prevention against initial stage of inflammation. To minimize the risk of peri-implantitis, it is necessary to understand the biological characteristics of the PIE. The aim of this study was to investigate the characteristic gene expression profile of PIE as compared to junctional epithelium (JE) using laser microdissection and microarray analysis.
METHODS: Left upper first molars of 4-week-old rat were extracted, and titanium alloy implants were placed. Four weeks after surgery, samples were harvested by laser micro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The relationship between chromosomal instability and integration of the human papillomavirus (HPV) DNA into the host genome is not well understood. We found that chromosomal instability increases with HPV integration and diagnosis. However, chromosomal instability could occur without HPV integration.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Follicular lymphoma, the most common indolent lymphoma, is clinically heterogeneous. CDKN2A encodes the tumor suppressors p16(INK4a) and p14(ARF) and frequently suffers deleterious alterations in cancer. We investigated the hypothesis that deletion or hypermethylation of CDKN2A might identify follicular lymphoma cases with distinct clinical or pathologic features potentially amenable to tailored clinical management.
EXPERIMENTAL DESIGN: Deletion of CDKN2A was detected in pretreatment biopsy specimens using a single nucleotide polymorphism-based approach or endpoint PCR, and methylati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Central nervous system (CNS) inflammation is a key factor in multiple sclerosis (MS). Invasion of peripheral immune cells into the CNS resulting from an unknown signal or combination of signals results in activation of resident immune cells and the hallmark feature of the disease: demyelinating lesions. These lesion sites are an amalgam of reactive peripheral and central immune cells, astrocytes, damaged and dying oligodendrocytes, and injured neurons and axons. Sustained inflammation affects cells directly located within the lesion site and further abnormalities are apparent diffusely through
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study is to better understand the pathogenesis of early equine osteochondrosis (OC) by identifying differences in gene and protein expression of extracellular matrix components and regulators in normal and diseased cartilage and bone, focusing on the osteochondral junction and cells surrounding the cartilage canals. We expected to find an upregulation of matrix metalloproteinases and a decrease in extracellular matrix constituent expression along the osteochondral junction and cells surrounding the cartilage canals in OC samples. Paraffin-embedded osteochondral samples (6
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OLP is a relatively common immune-mediated mucosal condition with a predilection for middle-aged women. Although classified as a premalignant condition, this classification remains controversial. Using stringent diagnostic criteria, some authors have found that OLP patients are not at increased risk for oral SCC. Credible but limited genetic evidence also indicates that epithelial tissues from OLP patients diagnosed using stringent criteria differs from premalignant or malignant oral lesions but is similar to epithelium from benign oral lesions. To further investigate this genetic line of evid
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is established that primary malignant melanomas (pMM) can be infiltrated by T-cell populations with predominantly one T-cell clone. As pMM generally express multiple tumor-associated antigens (TAA), here we used laser-capture microdissection (LCM) to isolate different tumor-infiltrating lymphocyte (TIL) clusters in order to determine whether pMM are infiltrated only by one single clone or whether the TAA may attract various T-cell populations. As T-cell receptor (TCR) clonality is a useful tool for the demonstration of specific T-cell clones, we analyzed 56 pMM, three cutaneous melanoma met
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conjunctival mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma is an extranodal marginal zone B-cell lymphoma that is characterized by an exaggerated clonal expansion of B cells, which implicate a pathological proliferative response to antigen(s) including bacteria. Helicobacter pylori (H. pylori) infection is recognized as one of the causative agents of gastric MALT lymphoma; however, it has not been reported in extra gastric MALT lymphoma. We studied 5 patients (4 adults and 1 child) with salmon-colored conjunctival lesions. One patient also had a history of abnormal bone marrow biopsy a yea
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adamantinomatous craniopharyngiomas (ACPs) are clinically challenging tumours, the majority of which have activating mutations in CTNNB1. They are histologically complex, showing cystic and solid components, the latter comprised of different morphological cell types (e.g. β-catenin-accumulating cluster cells and palisading epithelium), surrounded by a florid glial reaction with immune cells. Here, we have carried out RNA sequencing on 18 ACP samples and integrated these data with an existing ACP transcriptomic dataset. No studies so far have examined the patterns of gene expression within the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human doublecortin (DCX) mutations are associated with severe brain malformations leading to aberrant neuron positioning (heterotopia), intellectual disability and epilepsy. The Dcx protein plays a key role in neuronal migration, and hippocampal pyramidal neurons in Dcx knockout (KO) mice are disorganized. The single CA3 pyramidal cell layer observed in wild type (WT) is present as two abnormal layers in the KO, and CA3 KO pyramidal neurons are more excitable than WT. Dcx KO mice also exhibit spontaneous epileptic activity originating in the hippocampus. It is unknown, however, how hyperexcita
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: During pneumonic plague, the bacterium Yersinia pestis elicits the development of inflammatory lung lesions that continue to expand throughout infection. This lesion development and persistence are poorly understood. Here, we examine spatially distinct regions of lung lesions using laser capture microdissection and transcriptome sequencing (RNA-seq) analysis to identify transcriptional differences between lesion microenvironments. We show that cellular pathways involved in leukocyte migration and apoptosis are downregulated in the center of lung lesions compared to the periphery. P
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serous endometrial intraepithelial carcinoma is often associated with extrauterine disease. It is currently unclear where does the extrauterine disease come from. This study addressed this issue. A total of 135 samples from 21 serous endometrial intraepithelial carcinoma patients were studied. Cellular lineage relationships between intrauterine and extrauterine serous carcinomas were determined by TP53-mutation analysis and correlated to the clinicopathologic features. There were three conditions contributing the extrauterine disease: metastasis from serous endometrial intraepithelial carcinom
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In murine neurocysticercosis (NCC), caused by infection with the parasite Mesocestoides corti, the breakdown of the Blood Brain Barrier (BBB) and associated leukocyte infiltration into the CNS is dependent on the anatomical location and type of vascular bed. Prior studies of NCC show that the BBB comprised of pial vessels are most affected in comparison to the BBB associated with the vasculature of other compartments, particularly parenchymal vessels. Herein, we describe a comprehensive study to characterize infection-induced changes in the genome wide gene expression of pial vessels using las
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increased microvessel density contributes to abnormal BM and spleen microenvironment in myelofibrosis (MF). Taking advantage of the JAK2V617F mutation as a marker of malignancy, in the present study, we investigated whether splenic endothelial cells (ECs) obtained from capillaries by laser microdissection or from fresh spleen tissue by cell culture or cell sorting harbored such mutation in patients bearing the mutation in their granulocytes and undergoing splenectomy for therapeutical reasons. To extend the analysis to the ECs of large vessels, endothelial tissue from the splenic vein was also
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prior work in animal models implicates abnormalities of adenosine metabolism in astrocytes as a possible pathophysiological mechanism underlying the symptoms of schizophrenia. In the present study, we sought to reverse-translate these findings back to the human brain in schizophrenia, focusing on the following questions: (1) Which components of the adenosine system are dysregulated in schizophrenia, and (2) are these changes limited to astrocytes? To address these questions, we captured enriched populations of DLPFC pyramidal neurons and astrocytes from schizophrenia and control subjects using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alterations in the mitochondrial genome have been chronicled in most solid tumors, including breast cancer. The intent of this paper is to compare and document somatic mitochondrial D-loop mutations in paired samples of ductal carcinoma in situ (DCIS) and invasive breast cancer (IBC) indicating a potential breast ductal epithelial cancerization field effect. Paired samples of these histopathologies were laser-captured microdissected (LCM) from biopsy, lumpectomy, and mastectomy tissues. Blood samples were collected as germplasm control references. For each patient, hypervariable region 1 (HV1)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mastocytosis is characterized by focal heterotypic clusters of mast cells and lymphocytes in the bone marrow and by a somatically acquired activating Kit mutation, D816V. The relationship of the occurrence of this mutation to the heterotypic clusters of mast cells and lymphocytes in bone marrow is unknown. We hypothesized that these two unique features of mastocytosis were related. To explore this hypothesis, laser capture microdissected mast cells, B cells, and T cells, from both lesional and non-lesional areas of bone marrow biopsy tissues from patients with mastocytosis, were examined for t
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования