UNLABELLED: Mucormycosis is a life-threatening infection associated with high morbidity and mortality. Rapid and accurate diagnosis is essential for improving patient outcomes. Conventional diagnostic methods, such as histopathology and culture, are limited by low sensitivity and prolonged turnaround times, while commercial polymerase chain reaction (PCR) assays are costly and may lack specific genus or species targets. Here, we present a novel molecular diagnostic workflow to facilitate the rapid detection of Mucorales directly from clinical specimens. This workflow integrates two in-house in
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The co-infection of Leishmania donovani the etiological agent of visceral leishmaniasis (VL) and Human Immunodeficiency Virus-1 (HIV-1) poses a significant public health challenge, especially in regions where these pathogens have geographical overlaps. Individuals with this coinfection often have severe morbidity and mortality. Diagnosis of VL-HIV coinfections can be challenging due to atypical clinical presentations and overlapping manifestations with other infections. Serological diagnosis of VL is often poor, due to low humoral response in HIV-infected individuals characterized by reduced a
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian metapneumovirus (aMPV) represents a significant threat to the poultry industry, exhibiting a high degree of genetic diversity. Of these, the aMPV types A (aMPV-A), B (aMPV-B) and C (aMPV-C) are frequently detected in Chinese waterfowl and live poultry markets. Therefore, the rapid and accurate identification of these subtypes is of paramount importance in order to halt the spread of the disease. In this study, we have developed a multiplex real-time PCR assay endowed with the capacity to simultaneously discriminate aMPV-A, aMPV-B, and aMPV-C. This method demonstrates remarkable specifici
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative PCR (qPCR) is the gold standard for detection and quantitation of known DNA targets, but the scarcity of spectrally distinct fluorophores and filter sets limits the number of detectable targets. Here, we introduce color cycle multiplex amplification (CCMA) to significantly increase the number of detectable DNA targets in a single qPCR reaction using standard instrumentation. In CCMA, presence of one DNA target species results in a pre-programmed pattern of fluorescence increases. This pattern is distinguished by cycle thresholds (Cts) through rationally designed delays in amplific
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In the past, various efforts have been made to investigate diagnostic tools for periprosthetic-joint-infection (PJI). It is little-known about the diagnostic utility of polymerase-chain-reaction (PCR) in this context, especially concerning the role of multiplex-PCR assays comparing with conventional tissue culture.
OBJECTIVE: Evaluation of an automated-multiplex-PCR cartridge system for patients with suspicion of PJI in comparison with conventional microbiological culture and 16S-rDNA-PCR.
METHODS: On suspicion of PJI synovial fluid specimen were taken preoperatively or periprost
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningitis-encephalitis can range from a mild, self limiting illness to a life threatening disease. Rapid microbial diagnosis allows for early targeted management. This study aimed to compare the BioFire FilmArray Meningitis/Encephalitis multiplex PCR panel (ME panel) to traditional testing algorithms for accuracy and turnaround time in the diagnosis of meningitis-encephalitis. From April to November 2018, cerebrospinal fluid (CSF) samples meeting existing laboratory testing criteria for suspected community acquired meningitis-encephalitis were tested on the ME panel and by routine laboratory
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foodborne pathogens continue to be a major health issue worldwide. Culture-dependent methodologies are still considered the gold-standard to perform pathogen detection and quantification. These methods present several drawbacks, such as being time-consuming and labor-intensive. The implementation of real-time PCR has allowed to overcome these limitations and even reduce costs associated with the analyses, due to the possibility of simultaneously and accurately detecting several pathogens in one single assay, with results comparable to those obtained by classical approaches. In this chapter a p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Arcobacter species are emerging food-borne and water-borne human pathogens associated mostly with food animals and their environment. The present study was aimed to isolate Arcobacter species from fish, shellfish and coastal water samples using two methods and to determine their genetic diversity. Of 201 samples of fish, shellfish and water samples analysed, 66 (32·8%) samples showed the presence of Arcobacter DNA from both Arcobacter enrichment broth and Bolton broth. Arcobacters were isolated from 58 (87·8%) and 38 (57·5%) of Arcobacter DNA-positive samples using Arcobacter blood
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: For the identification of bacterial pathogens, blood culture is still the gold standard diagnostic method. However, several disadvantages apply to blood cultures, such as time and rather large volumes of blood sample required. We have previously established an optimised multiplex real-time PCR method in order to diagnose bloodstream infections.
MATERIAL AND METHODS: In the present study, we evaluated the diagnostic performance of this optimised multiplex RT-PCR in blood samples collected from 110 septicaemia patients enrolled at the 108 Military Central Hospital, Hanoi, Vietnam.
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To better understand Escherichia coli O157:H7 on-farm transmission dynamics requires sensitive methods for quantification of a broad range of concentrations of target organisms. For this purpose, a multiplex real time PCR (qPCR) assay was developed for quantification of O157 E. coli from 1g fecal samples of cattle and other animal species, targeting the Shiga toxin genes (stx1 and stx2) and the O157 somatic antigen gene, per. The multiplex qPCR assay provided specific detection across a broad range of bacterial concentrations with a lower limit of detection (LOD) of 10(1) genome copies which i
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the use of multiplex polymerase chain reaction (PCR), using 4% polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) for the detection of BCR-ABL transcripts in Philadelphia-positive disease. Three out of 50 cases [two out of 37 chronic myeloid leukaemia (CML), one out of 13 acute lymphoblastic leukaemia (ALL)] possessed rare breakpoints; an e19a2 and e13a3 in CML and an e1a3 in the ALL. We suggest that multiplex PCR using 4% PAGE and optimized for smaller transcript detection may lead to a higher detection rate of rare BCR-ABL breakpoints. Multiplex PCR, however, failed to distinguish e13a2 fro…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Affordable molecular tools for SARS-CoV-2 surveillance are crucial, particularly in settings where access to advanced technologies is limited. This study aimed to validate a dual-purpose strategy based on conventional PCR and polyacrylamide gel electrophoresis for both diagnosis and lineage screening.
METHODS: Fifty-five nasopharyngeal swab samples were analyzed through RNA extraction, reverse transcription, and conventional PCR targeting the SARS-CoV-2 spike (S) gene. Amplicons were visualized on 6% polyacrylamide gels, and the diagnostic results were compared with those of RT‒qPCR.
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the prevalence of viral agents causing reproductive failure in pigs in Korea. In addition, two types of multiplex real-time PCR (mqPCR) were developed for the simultaneous detection of Aujeszky's disease virus (ADV) and porcine parvovirus (PPV) in mqPCR and encephalomyocarditis virus (EMCV) and Japanese encephalitis virus (JEV) in reverse transcription mqPCR (mRT-qPCR). A total of 150 aborted fetus samples collected from 2020 to 2022 were analyzed. Porcine reproductive and respiratory syndrome virus was the most prevalent (49/150 32.7%), followed by porcine circ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the presence of subclinical cranial nuchal bursitis and characterize its histopathologic features and association with Borrelia burgdorferi.
METHODS: This was a prospective descriptive cadaver study on a convenience population of horses in a B burgdorferi-endemic region (15 horses: 5 geldings and 10 mares of various breeds; 4 to 29 years old). Horses without history or clinical signs of cranial nuchal bursitis underwent euthanasia and tissue donation. Cranial nuchal bursa, synovial fluid, and nuchal ligament were collected postmortem. The bursa and ligament were eval
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma pneumoniae (M. pneumoniae) is a leading cause of community-acquired pneumonia, especially concerning for young children. Effective management and infection control necessitate rapid, convenient, and user-friendly methods for early diagnosis, including genotype and macrolide resistance monitoring during outbreaks. Current clinical methods are often time-consuming, complex, and lack the capability for simultaneous detection. To address these challenges, we developed a one-pot visual multiplex microfluidic digital polymerase chain reaction (MMDPCR) assay for the simultaneous detection
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian influenza A virus (AIV) and Newcastle disease virus (NDV) are among the most damaging pathogens of poultry, and AIV also carries zoonotic potential that places it within the One Health agenda. The two infections frequently produce overlapping clinical signs, so a method that detects both in a single reaction has clear practical value for surveillance. We developed a duplex one-step real-time reverse-transcription PCR (RT-qPCR) that detects AIV in the FAM channel and NDV in the ROX channel. Primers and hydrolysis probes were designed against conserved regions of the AIV nucleoprotein and
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnosis of amoebic liver abscess is challenging. A multiplex polymerase chain reaction panel, traditionally employed for the detection of enteric pathogens in stool, proved useful for the rapid diagnosis in 3 pediatric patients when used off-label on liver abscess fluid. While this approach enabled timely and targeted antiamoebic therapy, highlighting its potential in high-burden, resource-limited settings, it represents an unvalidated use of the technology that requires further investigation.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Community-acquired and nosocomial bacterial pneumonia are among the most common infectious diseases in Germany. Knowledge of possible pathogens and therapeutic implications thereof are essential to be able to provide adequate, differentiated antimicrobial therapy with the appropriate drugs, form of application, dose, and duration. New diagnostics that include multiplex polymerase chain reaction, correct interpretation of the biomarker procalcitonin, and treatment of multidrug-resistant bacteria are becoming increasingly import.
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our Australian hospital tested almost 22 000 symptomatic people over 11 weeks for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in a multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay. Following travel bans and physical distancing, SARS-CoV-2 and other respiratory viruses diagnoses fell dramatically. Increasing rhinovirus diagnoses as social control measures were relaxed may indirectly indicate an elevated risk of coronavirus disease 2019 (COVID-19) resurgence.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify gene mutation of a epidermolysis bullosa pruriginosa family.
METHODS: Polymerase chain reaction (PCR), DNA sequencing, multiplex PCR using allele-specific oligonucleotide primers.
RESULTS: A G6100A transition of COL7A1 was found in patients, resulting in G2034R substitution in type VII collagen. The mutation was not found in control normal individuals.
CONCLUSION: The mutation of G2034R is the underlying cause of epidermolysis bullosa pruriginosa in this family, not common polymorphism.
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.