Accidents with the caterpillar Lonomia obliqua are often associated with a coagulation disorder and hemorrhagic syndrome in humans. In the present study, we have constructed cDNA libraries from two venomous structures of the caterpillar, namely the tegument and the bristle. High-throughput sequencing and bioinformatics analyses were performed in parallel. Over one thousand cDNAs were obtained and clustered to produce a database of 538 contigs and singletons (clusters) for the tegument library and 368 for the bristle library. We have thus identified dozens of full-length cDNAs coding for protei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A number of techniques have been developed as primary screens to scan for DNA sequence variants, including denaturing gradient gel electrophoresis, denaturing high-performance liquid chromatography, single-strand conformation polymorphism and heteroduplex analysis. Variant alleles detected by these assays are subsequently characterised by DNA sequencing. Sequencing itself is rarely used as a primary screen because of labour intensity, cost, and, upon automation, occasional inaccuracy in identifying heterozygous sites. We have previously developed an approach based on coupling long-distance PCR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Similarity of sequences is a key mathematical notion for Classification and Phylogenetic studies in Biology. It is currently primarily handled using alignments. However, the alignment methods seem inadequate for post-genomic studies since they do not scale well with data set size and they seem to be confined only to genomic and proteomic sequences. Therefore, alignment-free similarity measures are actively pursued. Among those, USM (Universal Similarity Metric) has gained prominence. It is based on the deep theory of Kolmogorov Complexity and universality is its most novel striking
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene for the most common and severe form of autosomal dominant polycystic kidney disease, PKD1, encodes a 14 kb mRNA that is predicted to result in an integral membrane protein of 4302 amino acids. The major challenge faced by researchers attempting to complete mutation analysis of the PKD1 gene has been the presence of several homologous loci also located on chromosome 16. Because the sequence of PKD1 and its homologs is nearly identical in the 5' region of the gene, most traditional approaches to mutation analysis cannot distinguish sequence variants occurring uniquely in PKD1. Therefore
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two Cryptosporidium isolates from separate infants suffering from diarrhea were obtained from a hospital in Zhengzhou, China and were genotyped by PCR amplification and sequence analysis of the small-subunit ribosomal RNA (rRNA) (SSU rRNA), 70-kDa heat shock protein (HSP70), and actin genes. Further subtyping was performed by PCR amplification and sequence analysis of the 60-kDa glycoprotein (gp60) gene. Both the isolates were identified as Cryptosporidium hominis subtype IdA21, a rare subtype previously found only in a human immunodeficiency virus-infected child in South Africa and another ch
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Flagellar secretion systems are utilized by a wide variety of bacteria to construct the flagellum, a conserved apparatus that allows for migration towards non-hostile, nutrient rich environments. Chlamydia pneumoniae is an obligate, intracellular pathogen whose genome contains at least three orthologs of flagellar proteins, namely FliI, FlhA and FliF, but the role of these proteins remains unknown.
RESULTS: Full length FliI, and fragments of FlhA, FliF, and FliI, were cloned and expressed as either GST or His tagged proteins in E. coli. The GST-tagged full length FliI protein was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA sequences encoding beta-keratin have been obtained from Marsh Mugger (Crocodylus palustris) and Orinoco Crocodiles (Crocodylus intermedius). Through the deduced amino acid sequence, these proteins are rich in glycine, proline and serine. The central region of the proteins are composed of two beta-folded regions and show a high degree of identity with beta-keratins of aves and squamates. This central part is thought to be the site of polymerization to build the framework of beta-keratin filaments. It is believed that the beta-keratins in reptiles and birds share a common ancestry. Near
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in genetic analysis technology have enabled a surprising progress in genetic diagnosis in the field of neurological disease research. High-throughput molecular biology techniques, such as microarrays and next-generation sequencing, are the major contributors to this progress and to new discoveries. Charcot-Marie-Tooth disease (CMT), a known hereditary motor and sensory neuropathy, is clinically and genetically heterogeneous. Genetic studies have revealed at least 35 disease causing-genes responsible for Charcot-Marie-Tooth disease. Genetic studies have revealed that abnormaliti
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fasciolosis is an important foodborne, zoonotic disease of livestock and humans, with global annual health and economic losses estimated at several billion US$. Fasciola hepatica is the major species in temperate regions, while F. gigantica dominates in the tropics. In the absence of commercially available vaccines to control fasciolosis, increasing reports of resistance to current chemotherapeutic strategies and the spread of fasciolosis into new areas, new functional genomics approaches are being used to identify potential new drug targets and vaccine candidates. The glutathione transferase
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the circulation of rabies virus in Ukraine, 78 rabies virus isolates were acquired from 14 states in 2002 and 2008-2010 for characterization. Partial sequences of nucleoprotein (359 nt) and glycoprotein (344 nt) genes were compared with those from neighbouring countries. The analysis identified 39 unique nucleoprotein genes and two geographically distinct RV variants belonging to the cosmopolitan lineage. The Ukrainian samples were similar to the North-East European lineage (NEE) (n = 19) and Russian group C (n = 20). The group C viruses were mainly isolated in Eastern Ukraine,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cDNAs for Machado-Joseph disease protein 1 homolog (MJD1), cell division control protein 42 homolog precursor(CDC42) and necdin (NECD) genes of pig were amplified using the reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) based on the conserved coding sequence information of the MJD1, CDC42, and NECD genes from mouse and other mammals and the referenced porcine EST sequence information. Tissue expression analysis showed the swine MJD1, CDC42, and NECD genes were obviously differentially expressed in different tissues including muscle, heart, liver, backfat, kidney, lung, small inte
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxocariasis, caused by the dog roundworm Toxocara canis, is a globally distributed zoonotic parasitic disease that poses a significant threat to veterinary and public health. The ubiquitin plus an L40 ribosomal protein (UBQ-2) in parasites plays a crucial role in protein degradation and meiotic divisions, thereby affecting parasite development, survival, and parasite-host interactions. In this study, we identified for the first time a full-length cDNA encoding the UBQ-2 protein from the T. canis-omic dataset, called Tcubq-2. After cloning and sequencing, we conducted sequence analysis and str
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The FAR proteins of nematodes are small ( approximately 20 kDa), helix-rich, fatty acid and retinol-binding (FAR) proteins that appear to be confined to nematodes. We have carried out a comparative sequence and biochemical analysis of selected FAR proteins often species of filarial parasites (from the genera Onchocerca, Brugia, Wuchereria, Loa, Acanthocheilonema and Litomosoides). The sequences fall into two main groups corresponding broadly to the onchocercal and lymphatic filariasis parasites, and only those with unsheathed microfilariae were found to produce glycosylated FAR proteins. The p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2) is caused by expansion of a CAG trinucleotide repeat located in the coding region of the human SCA2 gene. Sequence analysis revealed that SCA2 is a novel gene of unknown function. In order to provide insights into the molecular mechanisms of pathogenesis of SCA2 and to identify conserved domains, we isolated and characterized the mouse homolog of the SCA2 gene. Sequence and amino acid analysis revealed 89% identity at the nucleotide and 91% identity at the amino acid level. However, there was no extended polyglutamine tract in the mouse SCA2 cDNA, suggestin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virion infectivity factor (Vif), an accessory protein of HIV-1 (human immunodeficiency virus type 1), antagonizes host APOBEC3 protein (apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 3) or A3 via proteasomal degradation, facilitating viral replication. HLA (Human leukocyte antigens) alleles, host restriction factors, and error-prone reverse transcription contribute to the global polymorphic dynamics of HIV, impacting effective vaccine design. Our computational analysis of over 50,000 HIV-1 M vif sequences from the Los Alamos National Laboratory (LANL) database (1998-2021) revealed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transport and targeting of glutelin and prolamine mRNAs to distinct subdomains of the cortical endoplasmic reticulum is a model for mRNA localization in plants. This process requires a number of RNA-binding proteins (RBPs) that recognize and bind to mRNA cis-localization (zipcode) elements to form messenger ribonucleoprotein complexes, which then transport the RNAs to their destination sites at the cortical endoplasmic reticulum. Here, we present evidence that the rice (Oryza sativa) RNA-binding protein, RBP-L, like its interacting RBP-P partner, specifically binds to glutelin and prolamin
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The relationship between developmental genes and phenotypic variation is of central interest in evolutionary biology. An excellent example is the role of Hox genes in the anteroposterior regionalization of the vertebral column in vertebrates. Archosaurs (crocodiles, dinosaurs including birds) are highly variable both in vertebral morphology and number. Nevertheless, functionally equivalent Hox genes are active in the axial skeleton during embryonic development, indicating that the morphological variation across taxa is likely owing to modifications in the pattern of Hox gene expression. By usi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Proteins belonging to the serine protease inhibitor (serpin) superfamily play essential physiological roles in many organisms. In pathogens, serpins are thought to have evolved specifically to limit host immune responses by interfering with the host immune-stimulatory signals. Serpins are less well characterised in parasitic helminths, although some are thought to be involved in mechanisms associated with host immune modulation. In this study, we cloned and partially characterised a secretory serpin from Schistosoma japonicum termed SjB6, these findings provide the basis for possib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hespintor is an unknown function protein that was got from hepatoblastoma cell lines HepG2 by suppression subtractive hybridization technique (SSH), sequence analysis showed that the protein is a new member of secretory type of Kazal type serine protease inhibitor (Serpin) family, and has high homology with esophageal cancer related gene 2 (ECRG2). The coding sequence of Hespintor's Kazal domain was subcloned into prokaryotic expression vector pET-40b(+), then transformed into Rosetta (DE3). A recombinant protein about 42 kDa in the form of inclusion body was optimization expressed by inducing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moraxella bovis pili have been shown to play a major role in both infectivity and protective immunity of bovine infectious keratoconjunctivitis. Sonicated M. bovis DNA from the piliated strain EPP63 was inserted into the vector lambda gt11 with EcoRI linkers. Recombinant phage were screened with an oligonucleotide probe based on the amino-terminal portion of the DNA sequence of a Neisseria gonorrhoeae pilin gene. Two candidate phages produced a protein that comigrated with EPP63 beta pilin in sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gels and bound anti-pilus antisera. The 1.9-kilobase insert from
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.