Clinically heterogeneous spectrum and molecular phenotypes of inflammatory bowel disease (IBD) remain to be comprehensively elucidated. This exploratory multi-omics study investigated the serum molecular profiles of Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), in association with elevated fecal calprotectin and disease activity states. The serum proteome, metabolome, and lipidome of 75 treated IBD patients were profiled. Single- and multi-omic data analysis was performed to determine differential analytes and integrative biosignatures for biological interpretations. We found that chronic
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is the second most common age-related neurodegenerative disease after Alzheimer's disease. Despite numerous studies, specific age-related factors remain unidentified. This study employed a multi-omics approach to investigate the link between PD and aging. We integrated blood gene expression profiles, expression quantitative trait loci, genome-wide association studies, predictive models, and conducted clinical validation.By analyzing PD datasets, a total of 953 differentially expressed genes (DEGs) and 10 intersecting aging differentially expressed genes (ADEGs) were id
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron deficiency is a common nutritional issue that seriously affects male reproductive health. Lotus root polysaccharide iron (LRPF), a novel nutritional supplement, may ameliorate the damage caused by iron deficiency, however, the mechanism is unclear. In this study, we comprehensively determined the benefits of LRPF on reproduction in iron-deficient mice by integrating transcriptomics, microbiomics and serum metabolomics. Microbiomics showed that LRPF could restore changes to the intestinal microbiota caused by iron deficiency. Metabolomics results showed that LRPF stabilised steroid hormone
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Individuals living with obesity are differentially susceptible to cardiometabolic diseases. We hypothesized that an integrative multi-omics approach might improve identification of subgroups of individuals with obesity who have distinct cardiometabolic disease patterns.
METHODS: We performed machine learning-based, integrative unsupervised clustering to identify proteomics- and metabolomics-defined subpopulations of individuals living with obesity (BMI ≥ 30 kg/m2), leveraging data from 243 individuals in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA) cohort. Omics that contribute
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Adrenocortical carcinoma (ACC) afflicts both pediatric and adult populations and is characterized by dismal prognosis and elevated mortality. Given the inconsistent therapeutic benefits and significant side effects associated with the conventional chemotherapy agent, mitotane, and the nascent stage of immunotherapy and targeted treatments, there is an urgent need to identify novel prognostic biomarkers and therapeutic targets in ACC.
METHODS: Utilizing multi-omic datasets from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the Gene Expression Omnibus (GEO), we employed Weighted Gene Co-expressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impact of phenotypic, clonal, and functional heterogeneity of chimeric antigen receptor (CAR)-T cells on clinical outcome remains understudied. Here, we integrate clonal kinetics with transcriptomic heterogeneity resolved by single-cell omics to interrogate cellular dynamics of non-transduced (CARneg) and transduced (CARpos) T cells, in the infusion product (IP) and at the CAR-T cell expansion peak in five B cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) patients treated with CD19CAR-T cells (varni-cel). We identify significant differences in cellular dynamics in response to therapy. CARpos T c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tobacco carcinogens are recognized as critical hazard factors for bladder tumorigenesis, affecting the prognosis of patients through aromatic amines components. However, the specific function of tobacco carcinogens and systematic assessment models in the prognosis of bladder cancer remains poorly elucidated. We retrieved bladder cancer specific tobacco carcinogens-related genes from Comparative Toxicogenomic Database, our Nanjing Bladder Cancer cohort and TCGA database. Gene×Gene interaction method was utilized to establish a prognostic signature. Integrative assessment of immunogenomics, tumo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human embryonic bone and joint formation is determined by coordinated differentiation of progenitors in the nascent skeleton. The cell states, epigenetic processes and key regulatory factors that underlie lineage commitment of these cells remain elusive. Here we applied paired transcriptional and epigenetic profiling of approximately 336,000 nucleus droplets and spatial transcriptomics to establish a multi-omic atlas of human embryonic joint and cranium development between 5 and 11 weeks after conception. Using combined modelling of transcriptional and epigenetic data, we characterized regiona
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hydroxytyrosol (HT), as the main compound in olive leaves with its potential ability to cross blood-brain barrier (BBB), has exhibited the advantaged antidepressant effect. However, no information is available regarding the brain regional uptake of HT, as well the underlying antidepressant mechanism remains unclear.
PURPOSE: To comprehensively reveal the brain uptake of HT and its specific mechanism on the accompanying antidepressant activity.
STUDY DESIGN AND METHODS: The BBB penetration and brain regional distribution of HT in the normal and chronic unpredictable mild stress (C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Based on gut microbiota and serum untargeted metabolomics analyses, this study investigated changes in gut microbiota structure and serum metabolic profiles in children infected with human parainfluenza virus (HPIV). By integrating multi-omics data, we aimed to explore interactions between gut dysbiosis and serum metabolic disorders, and their potential roles in HPIV pathogenesis, to provide preliminary evidence for microbiota--targeted and metabolic intervention strategies.
METHODS: Clinical data and laboratory results were collected from 230 hospitalized children (<14 years) with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is increasingly recognized as a metabolic disorder, with dysregulated lipid metabolism emerging as a key factor in its pathogenesis. However, the precise mechanisms underlying this relationship remain unclear. We employed a summary data-based Mendelian randomization (SMR) approach to investigate the potential causal relationships between lipid metabolism-related genes and PCOS. First, we integrated PCOS genome-wide association study (GWAS) data from the Finngen_R11_E4_PCOS cohort with three layers of blood-based molecular quantitative trait loci (QT
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) are persistent environmental pollutants increasingly linked to human disease. Perfluorohexanesulfonic acid (PFHxS), a widespread PFAS detected in human serum, has an uncharacterized role in gastric cancer (GC), one of the leading causes of cancer mortality worldwide. Here, we employed an integrated multi-omics approach combining network toxicology, large-scale transcriptomic analyses from TCGA and GEO cohorts, single-cell RNA sequencing, and molecular simulations, followed by in vitro and in vivo validation at environmentally relevant concentrations.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Obesity-driven metabolic disorders involve pathological remodeling of white adipose tissue (WAT), wherein fibroblasts coordinate fibrosis and inflammation. This study aimed to characterize fibroblast transcriptional heterogeneity, identify fibrosis-inflammation mediators, and discover diagnostic and therapeutic targets.
METHODS: Single-cell (GSE155960) and bulk (GSE205668) RNA-seq datasets from human WAT were integrated. Cell-cell communication was inferred using CellChat, and fibroblast gene co-expression modules were built via high-density weighted gene co-expression network ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drought stress is a major constraint in jujube production. Although abscisic acid (ABA) and cytokinin exert opposing effects on plant growth, recent findings revealed that their combined application enhanced drought tolerance in jujube; however, the underlying mechanism remains elusive. In this study, three exogenous treatments were applied to sour jujube seedlings under drought stress: 5 mg L-1 ABA, a cytokinin mixture of 50 mg L-1 6-benzylaminopurine (6-BA) and 100 mg L-1 kinetin (KT), and a combined ABA and cytokinins solution. Transcriptomic and metabolomic analyses were integrated to eluc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Increasing evidence suggests that pathological damage in Parkinson's disease (PD) involves the cerebellum, thus resulting in structural and functional alterations. However, whether these alterations predict the progression of cognitive impairment in PD remains unclear.
METHODS: We recruited 30 healthy controls and 72 PD patients across different cognitive states with available plasma biomarker data. We used voxel-based morphometry to identify cerebellar atrophy and subsequently performed seed-based whole-brain voxel-wise Granger causality analysis (GCA) on these regions to map cer
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Babaodan (BBD), a traditional Chinese medicine formula with a history of clinical use, has been extensively applied in the treatment of various hepatic disorders, but its multi-target mechanisms of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease (MAFLD) remain unclear and limit its scientific development.
AIM OF THE STUDY: This study aimed to reveal the systems pharmacology of BBD in MAFLD, going beyond phenomenological descriptions to identify its key mechanistic axis and tissue-level therapeutic effects.
MATERIALS AND METHODS: We employed an integrative
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Atrial fibrillation (AF) is the most common and clinically significant arrhythmia requiring treatment. Although an imbalance between the sympathetic and vagal branches of autonomic nervous system (ANS) is known to trigger and sustain AF, the underlying mechanisms remain incompletely understood. Furthermore, there are yet no clinically authorized antiarrhythmic drugs currently targeting the modulation of ANS.
METHODS: Targeted LC-MS/MS profiling of plasma 39 neurotransmitters was conducted in a clinical cohort. To identify shared mechanisms, atrial transcriptomes and a sympatheti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autoimmune gastritis (AIG) is a chronic immune-mediated atrophic disease that can induce cancer-related epithelial remodeling, although its association with gastric adenocarcinoma depends on histological and clinical modifiers. Gastric cancer (GC) progression is shaped by the tumor microenvironment (TME), including cancer-associated fibroblasts (CAFs), myeloid cells, and extracellular matrix (ECM) remodeling. Whether AIG-related mucosal remodeling shares stromal programs with GC-associated stromal-myeloid niches remains unclear.
METHODS: We integrated one AIG bulk-transcriptomic c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Walnut (Juglans regia) is an economically significant woody oil tree species widely cultivated in China. However, its production is increasingly threatened by extreme low-temperature events, such as unseasonal frosts and late-spring cold. Salicylic acid (SA) is a key phytohormone known to enhance cold tolerance in plants, yet its underlying mechanism in walnut remains unclear. In this study, we present the first integrated analysis combining physiological measurements, transcriptomics, and metabolomics to investigate how exogenous SA improves cold tolerance in walnut leaves. Our results showed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gallbladder cancer (GBC) is a highly aggressive malignancy with dismal outcomes. To dissect its molecular characteristics and identify potential therapeutic avenues, we performed proteogenomic characterization of 195 tumors and 135 adjacent non-cancerous gallbladder tissues. Integrative analyses highlighted TP53 and ELF3 mutations as key drivers disrupting signaling and metabolism. ErbB2 amplification, a pivotal genomic event, was associated with reduced canonical PI3K/AKT and RAS/MAPK/ERK signaling yet enhanced proliferative activity. We discovered potential gain-of-function mutations in ErbB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования