The continuous expansion of nosocomial infections around the globe has become a precarious situation. Key challenges include mounting dissemination of multiple resistances to antibiotics, the easy transmission and the growing mortality rates of hospital-acquired bacterial diseases. Thus, new ways to rapidly detect these infections are vital. Consequently, researchers around the globe pursue innovative approaches for point-of-care devices. In many cases the specific interaction of an antigen and a corresponding antibody is pivotal. However, the knowledge about suitable antigens is lacking. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysine β-hydroxybutyrylation (Kbhb) is a metabolite-derived post-translational modification of histone and non-histone proteins that couples β-hydroxybutyrate (BHB) availability to gene expression. Yet the transcription factors that govern the Kbhb substrate program in cancer remain unidentified. Existing studies have cataloged Kbhb-modified substrates or examined individual proteins, without identifying the transcriptional regulators of the program in a defined tumor context. Here, we performed network-based master regulator analysis (MRA), implemented in the viper package, on a molecular sig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholangiocarcinoma (CCA) is an epithelial bile duct cancer frequently found at an advanced stage, leading to poor response to current therapies. Although gemcitabine (GEM) and cisplatin (CIS) are the current gold-standard for treating unresectable CCA, GEM resistance often occurs. To predict the response to GEM, we evaluated chromosomal aberrations using a chromosome microarray, and their association with GEM response by histoculture drug response assay. Our findings revealed principal component analysis and orthogonal partial-least square discriminant analysis cross validated score plot betwe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anaplastic thyroid carcinoma (ATC) is among the most lethal thyroid malignancies, with poor clinical outcomes and limited treatment strategies. To gain insights into the molecular mechanisms involved in its progression, we performed an integrative bioinformatic analysis.
METHODS: We analyzed five microarray datasets from the GEO database to compare gene expression profiles between ATC samples and normal thyroid tissues. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using GEO2R, and overlapping genes across datasets were detected through Venn diagram analysis. Functional en
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) are more susceptible to liver ischemia-reperfusion injury (LIRI), complicating liver surgery outcomes. This study aimed to uncover shared hub genes and mechanisms linking LIRI and MASLD to enhance donor liver utilization and improve prognosis. Using liver transplantation and MASLD datasets from the Gene Expression Omnibus, we applied Linear Models for Microarray Data and weighted gene co-expression analysis to identify differentially expressed genes and key module genes. Further analysis involved Gene Ontology, KEGG
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inflammatory Bowel Disease (IBD), which includes Crohn's disease and ulcerative colitis, is associated with an increased risk of Acute Myocardial Infarction (AMI). The genetic mechanisms underlying this link are not well understood.
METHODS: We downloaded IBD and AMI-related microarray datasets from the NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) were identified and analyzed using enrichment analysis and Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA). Machine learning techniques, including LASSO, random forest, and Boruta, were employed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celastrol (CEL) is a natural pentacyclic triterpenoid demonstrating significant therapeutic properties against various diseases. However, the ambiguity of target information poses a significant challenge in transitioning CEL from a traditional remedy to a modern pharmaceutical agent. Recently, the emerging target discovery approaches of natural products have broadened extensive avenues for uncovering comprehensive target information of CEL and promoting its drug development. Herein, diverse target discovery strategies are overviewed for the pharmacological and toxicological studies of CEL, inc
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malfunctions of the complex interactions between embryo and components of decidua lead to recurrent implantation failure (RIF) and pre-eclampsia (PE). Developmental process regulatory HOX proteins (HOXA4,7,10,11) have been extensively studied to chalk reproductive immunology-related diseases with lesser-known effects of HOXA9, HOXA13, and their targets therein. Hence, functional enrichment and differential expression analysis of HOXA9 and HOXA13 targets were conducted to identify immunological markers in RIF and PE. 517 common transcription factors (CTFs) of HOXA9 and A13 were retrieved and su
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze the clinical characteristics and genetic variations observed in fetuses with CHARGE syndrome and identify the underlying genetic causes responsible for their multisystem malformations.
METHOD: Amniocentesis was performed on a fetus at 21+5 weeks of gestation with multiple systemic malformations. Amniotic fluid was collected for karyotype analysis, chromosomal microarray analysis (CMA), and whole-exome sequencing (WES).
RESULT: The fetal karyotype and CMA results were normal; WES analysis revealed a mutation at position 61654493 on chromosome 8, specifically at the 502nd…
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medication-related osteonecrosis of the jaw (MRONJ) is a serious adverse effect of antiresorptive and antiangiogenic therapies, yet its molecular mechanisms remain poorly defined. The present study employed an analysis of microarray data (GSE7116) from peripheral blood mononuclear cells of patients with multiple myeloma, myeloma patients with MRONJ, and healthy controls. Differentially expressed genes were identified using the limma package, followed by functional enrichment analysis, weighted gene co-expression network analysis, and LASSO regression and CytoHubba network ranking. The predicti
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To clarify the significance of mitochondria-related differentially expressed genes (MTDEGs) in UC carcinogenesis through a bioinformatics analysis and provide potential therapeutic targets for patients with UC associated colorectal cancer.
METHODS: Microarray GSE37283 was utilized to investigate differentially expressed genes (DEGs) in UC and UC with neoplasia (UCN). MTDEGs were identified by intersecting DEGs with human mitochondrial genes. Utilizing LASSO and random forest analyses, we identified three crucial genes. Subsequently, using ROC curve to investigate the predictive abili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastatic colorectal cancer (CRC) is still in need of effective treatments. This study applies a holistic approach to propose new targets for treatment of primary and liver metastatic CRC and investigates their therapeutic potential in-vitro. An integrative analysis of primary and metastatic CRC samples was implemented for alternative target and treatment proposals. Integrated microarray samples were grouped based on a co-expression network analysis. Significant gene modules correlated with primary CRC and metastatic phenotypes were identified. Network clustering and pathway enrichments were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circular RNAs (circRNAs) are a novel kind of non-coding RNAs proved to play crucial roles in the development of multiple diabetic complications. However, their expression and function in diabetes mellitus (DM)-impaired salivary glands are unknown.
RESULTS: By using microarray technology, 663 upregulated and 999 downregulated circRNAs companied with 813 upregulated and 525 downregulated mRNAs were identified in the parotid glands (PGs) of type2 DM mice under a 2-fold change and P < 0.05 cutoff criteria. Gene ontology (GO) and kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) analysis
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dupilumab has demonstrated efficacy in the treatment of atopic dermatitis. However, a subset of patients experiences ocular adverse events (OAEs), including conjunctivitis and dry eye syndrome, the pathological mechanisms of which are still unknown. In a bicentric study, we used DNA microarray analysis to compare the transcriptome of conjunctival cells of patients with atopic dermatitis collected by impression cytology before (M0) and 4 months after (M4) initiating dupilumab treatment. Thirty-six patients were included and divided in 2 groups according to their ophthalmological status at M4: 1…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive and irreversible neurodegenerative brain disorder with significant economic and societal impacts, whereas early AD diagnosis remains a considerable challenge. Here, a robust and convenient surface-enhanced Raman scattering (SERS) analysis platform was fabricated on a microarray chip to dissect the variation in serum composition for AD diagnosis, eliminating the invasive cerebrospinal fluid (CSF)-based and costly instrument-dependent diagnostic methods. AuNOs array prepared by self-assembly at liquid-liquid interface enabled the acquirement of SERS spec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral squamous cell carcinoma of the tongue (OTSCC) is the most common malignancy among oral squamous cell carcinomas and is frequently associated with an unfavorable prognosis. Local spread and distant metastasis are important causes of poor prognosis in OTSCC. Cortactin amplification and overexpression, a common molecular alteration in oral squamous cell carcinomas, have been linked to invasion and metastasis of tumor cells. However, the intra-tumor expression pattern and prognostic significance of cortactin in human papillomavirus (HPV) negative OTSCC is not fully investigated. Immunohistoch
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Floating-Harbor syndrome (FLHS) is a neurodevelopmental disorder (NDD) caused by truncating variants in exons 33 and 34 of the SNF2-related CREBBP activator protein gene (SRCAP). Truncating variants proximal to this location in SRCAP result in a non-FLHS SRCAP-associated NDD; an overlapping but distinct NDD characterized by developmental delay with or without intellectual disability (ID), hypotonia, normal stature, and behavioral and psychiatric issues. Here, we report a young woman who initially presented in childhood with significant delays in speech and mild ID. In young adulthood, she deve
Клинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory syncytial virus (RSV) is a major cause of acute lower respiratory infections in children, especially bronchiolitis. Our study aimed to identify the key genes and upstream transcription factors in RSV.
METHODS: To screen for RSV pathogenic genes, an integrated analysis was performed using the RSV microarray dataset in GEO. Functional annotation and potential pathways for differentially expressed genes (DEGs) were further explored by GO and KEGG enrichment analysis. We constructed the RSV-specific transcriptional regulatory network to identify key transcription factors f
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometriosis is a frequently occurring disease in women, which seriously affects their quality of life. However, its etiology and pathogenesis are still unclear.
METHODS: To identify key genes/pathways involved in the pathogenesis of endometriosis, we recruited 3 raw microarray datasets (GSE11691, GSE7305, and GSE12768) from Gene Expression Omnibus database (GEO), which contain endometriosis tissues and normal endometrial tissues. We then performed in-depth bioinformatic analysis to determine differentially expressed genes (DEGs), followed by gene ontology (GO), Hallmark pathway
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To clarify the early alterations of gene expression using a mouse model of glaucoma filtration surgery, we carried out microarray expression analysis. Using BALB/c mice, a filtration surgery model was made by incision of the limbal conjunctiva, followed by the insertion of a 33G needle tip into the anterior chamber, and 11-0 nylon sutures. Subgroups of mice were treated intraoperatively with 0.4 mg/ml mitomycin-C (MMC). At day 3 after surgery the bleb was maintained. The bleb region tissue was sampled 3 days after the filtration surgery, and gene expression analysis was carried out using a mou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.