Background: Prostate cancer (PCa) is a leading cause of cancer-related mortality worldwide, highlighting the need for improved prognostic tools. The integration of artificial intelligence (AI) and machine learning (ML) with multi-omics data offers new opportunities for biomarker discovery and risk stratification. Methods: We integrated bulk transcriptomic data from GSE116918 (training, n = 248) and three cross-cohort consistency evaluation cohorts (TCGA-PRAD, GSE70769, GSE46602), focusing on 1087 epithelial-mesenchymal transition (EMT)-associated genes. Using consensus clustering, weighted gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Acute myeloid leukemia (AML) remains a therapeutic challenge due to its high relapse rate and limited treatment options. This study aimed to identify and validate novel circulating protein biomarkers with causal roles in AML pathogenesis using an integrative multi-omics approach.
METHODS: We performed proteome-wide Mendelian randomization (MR) analyses using protein quantitative trait locus (pQTL) data from two large-scale proteomic studies (deCODE and UK Biobank Pharma Proteomics Project) and genome-wide association study (GWAS) data from two cohorts (FinnGen and UK Biobank). S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Basement membranes (BMs) and tumor-associated macrophages (TAMs) are crucial stromal components in pancreatic cancer (PC), critically influencing disease progression. Bulk and single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data were acquired from publicly available databases. Through integration of multiple machine learning algorithms, we developed and validated a BM-related subtype and prognostic signature in PC cohorts. The expression profiles of BM-related genes in PC were verified using experimental approaches. We further investigated the functional mechanisms of a core gene in PC progression. Additional
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To enable early detection of pancreatic cancer from precancerous lesions, we analyze proteins and glycoproteins from 64 intraductal papillary mucinous neoplasms (IPMNs), 55 cyst fluid samples, 104 pancreatic ductal adenocarcinomas (PDACs), and various types of normal samples using mass spectrometry. High-grade IPMNs show enrichment of glycosylation level and tumor progression pathways compared to low-grade lesions. High-grade IPMN associated proteins, such as PLOD3, IRS2, LGALS9, and Trop-2, are identified and validated using immunolabeling and laser microdissection. Some high-grade associated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord injury (SCI) impairs the central nervous system and induces the myelin-sheath-deterioration because of reactive oxygen species (ROS), further hindering the recovery of function. Herein, the simultaneously emergency treatment and dynamic luminescence severity assessment (SETLSA) strategy is designed for SCI based on cerium (Ce)-doped upconversion antioxidant nanoenzymes (Ce@UCNP-BCH). Ce@UCNP-BCH can not only efficiently eliminate the SCI localized ROS, but dynamically monitor the oxidative state in the SCI repair process using a ratiometric luminescence signal. Moreover, the classi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying practical ways to counteract aging and associated degenerative disorders is urgently needed. We performed deep molecular profiling and functional assessments in aging male mice to show that glucagon-like peptide-1 receptor agonist (GLP-1RA) treatment broadly counteracts age-related changes. In mice treated with a GLP-1RA from 11 months for 30 weeks, we observed strong body-wide multi-omic age-counteracting effects and improved selected physical functions. Importantly, the effects were specific to aged mice, not young adults, and were attained with a relatively low dose that minimal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Donor-derived fecal microbiota treatments are efficacious in preventing recurrent Clostridioides difficile infection (rCDI), but they have inherently variable quality attributes, are difficult to scale and harbor the risk of pathogen transfer. In contrast, VE303 is a defined consortium of eight purified, clonal bacterial strains developed for prevention of rCDI. In the phase 2 CONSORTIUM study, high-dose VE303 was well tolerated and reduced the odds of rCDI by more than 80% compared to placebo. VE303 organisms robustly colonized the gut in the high-dose group and were among the top taxa associ
Клиническое исследование II фазыСтатьяМногоцентровое исследованиеРандомизированное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bisphenol F (BPF) is one of the main substitutes for Bisphenol A (BPA) and is widely used in the manufacture of household products. In addition, BPF threatens human health through environmental pollution and the food chain. However, the hepatotoxicity of BPF and its effects on glucose and lipid metabolism remain unclear. This study used male SD rats as an animal model to investigate the hepatotoxicity of BPF and its effects on glucose and lipid metabolism. The results of the HE staining, serum and liver biochemical indicators show that BPF can damage the basic structure of the liver, cause liv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroendocrine prostate cancer (NEPC), a subtype of prostate cancer (PCa) with poor prognosis and high heterogeneity, currently lacks accurate markers. This study aims to identify a robust NEPC classifier and provide new perspectives for resolving intra- tumoral heterogeneity. Multi-omics analysis included 19 bulk transcriptomics, 14 single-cell transcriptomics, 1 spatial transcriptomics, 16 published NE signatures and 10 cellular experiments combined with multiple machine learning algorithms to construct a novel NEPC classifier and classification. A comprehensive single-cell atlas of prostate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fatty-acid metabolism (FAM) is rewired in bladder cancer (BLCA), yet its impact on intratumoral diversity and patient outcome is unclear.
METHODS: To characterize FAM heterogeneity, we integrated spatial and single-cell transcriptomic approaches. We employed high-dimensional weighted correlation network analysis (hdWGCNA) alongside five distinct enrichment methods (ssGSEA, AddModuleScore, AUCell, singscore, and UCell) to identify modules with elevated FAM activity. Subsequently, machine learning algorithms were applied to bulk RNA sequencing datasets to pinpoint the key gene with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory viral co-infections in children with Mycoplasma pneumoniae pneumonia (MPP) are common and cause severe clinical manifestations. However, the exact pathogenic mechanisms of MPP co-infections are still unclear. In this study, we conducted a large-scale clinical analysis of 3106 MPP patients to characterize co-infection patterns. Subsequent metabolomics, microbiomics, and cytokines analyses of the bronchoalveolar lavage fluid from 73 MPP cases were performed. Patients were divided into groups with single Mycoplasma pneumoniae (MP) infection and co-infection (including co-adenovirus [c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AtNPR1 expression strengthens Fusarium wilt resistance in chickpea by activating SAR. Multi-omics analyses suggest CaDEAD-box20 as a candidate gene contributing to resistance through possible interaction with AtNPR1. Traditional breeding for broad-spectrum disease resistance in crops is often slow and resource-intensive, whereas genetic engineering provides a more precise and efficient alternative. To enhance resistance in chickpea (Cicer arietinum) against Fusarium oxysporum f. sp. ciceris, the causal agent of Fusarium wilt, we introduced the Arabidopsis NPR1 (AtNPR1) gene to activate systemi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune condition that impacts various organs. Given the intricate clinical progression of SLE, it is imperative to explore novel avenues for precise diagnosis and treatment.
METHODS: Peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were isolated from 6 SLE patients before and after treatment, 7 healthy controls and 7 disease controls. Assay for Transposase Accessible Chromatin with high throughput Sequencing (ATAC-seq) was used to analyze the chromatin accessibility signatures and RNA-seq was used to identify the differentially expressed genes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a complex autoimmune disease influenced by genetic and immune dysregulation. The causal roles of specific immune-related genes in RA pathogenesis remain incompletely understood.
METHODS: We conducted a large-scale genome-wide association study (GWAS) meta-analysis across three RA cohorts to identify genome-wide significant risk loci. Causal genes and proteins were prioritized by integrating these results with cis-eQTL and pQTL datasets using two-sample Mendelian randomization (MR) and summary-data-based MR (SMR). Cell-type-specific expression was asses
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peripheral facial paralysis (PFP) is a common neurological disorder characterized by facial-nerve dysfunction. Identifying therapeutic targets and understanding the molecular and cellular mechanisms underlying PFP are crucial for developing effective treatment strategies. This study combined Mendelian randomization (MR) analysis and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to explore potential therapeutic candidates and their roles in PFP pathophysiology. The MR analysis included 1925 publicly available plasma protein cis-heritability instruments. Instrumental variables were selected for MR anal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to explore the molecular characteristics of neutrophil extracellular traps (NETs) in chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP). Differentially expressed gene analysis, weighted gene co-expression network analysis, and machine learning algorithms identified three core NETs-associated genes: CXCR4, CYBB, and PTAFR, which were significantly upregulated in CRSwNP patients. The diagnostic performance of these genes was evaluated using receiver operating characteristic (ROC) curves, and their clinical relevance was validated using multicenter data. Immune infiltration analys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scalp seborrheic dermatitis (SD) and psoriasis (PSO) are prevalent chronic skin conditions with overlapping clinical manifestations, especially when confined to the scalp, which complicates differential diagnosis. This study integrates transcriptomic profiling and genetic association analyses to investigate potential causal links between SD and scalp PSO. Through RNA sequencing on lesional and non-lesional scalp samples from patients with SD and scalp PSO, as well as healthy controls, we found that seborrheic dermatitis may represent a risk factor for the progression to scalp PSO. Furthermore,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical cancer (CC) is a highly heterogeneous malignancy primarily driven by persistent infection with high-risk human papillomavirus (HPV). However, comprehensive analyses of heterogeneity in the immune microenvironment, particularly its spatial heterogeneity, between HPV-positive and HPV-negative CC remain limited, despite their critical clinical significance.
METHODS: We performed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomics (ST) sequencing on collected cervical cancer samples, integrating scRNA-seq, ST, and bulk RNA-seq to analyze distinct cell subtypes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Our previous studies have demonstrated that Qiangxin Bushen Decoction (QBD) exhibits therapeutic effects in heart failure patients complicated with renal insufficiency. However, the precise molecular pathways and pathophysiological mechanisms through which QBD ameliorates cardiorenal syndrome type II (CRS2) progression remain unclear.
PURPOSE: To explore the mechanism of QBD for the treatment of CRS2.
METHODS: UPLC-Q-TOF-MS was employed to explore comprehensive metabolite profiling from QBD samples. Network pharmacology, RNA-seq, and metabolomics were utilized to predict the bioa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The oral mucosa mirrors a range of latent systemic disorders, with potential clinical associations noted between autoimmune thyroid disease (AITD) and oral lichen planus (OLP). This study aims to explore the genetic relationship and underlying mechanisms mediating these conditions.
METHODS: A 2-step Mendelian randomization (MR) analysis was conducted to elucidate the genetic relationship and mediating factors between AITD and OLP. Linkage disequilibrium score regression was employed to assess heritability and genetic correlations among phenotypes, followed by genetic colocalization
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.