Follicular lymphoma (FL) is the most common indolent type of B-cell non-Hodgkin lymphoma. Advances in treatment have improved overall survival, but early relapse or transformation to aggressive disease is associated with inferior outcome. To identify early genetic events and track tumor clonal evolution, we performed multi-omics analysis of 94 longitudinal biopsies from 44 FL patients; 22 with transformation (tFL) and 22 with relapse without transformation (nFL). Deep whole-exome sequencing confirmed recurrent mutations in genes encoding epigenetic regulators (CREBBP, KMT2D, EZH2, EP300), with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus-associated gastric cancer (EBVaGC) accounts for ~9% to 10% of gastric cancers worldwide and is defined by a distinctive m … V)-specific treatments available. Using an FDA-approved inhibitor to target hypermethylated DNA and multiomics approach to study the cellular response, we uncovered epigenetically altered transcriptional networks that may be further exploited to improve potential therapy. Among the pathways disrupted, retinoic acid signaling is of particular interest, as ret …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anti-infective drugs have profoundly transformed the history of medicine. Yet, with the presence of approximately 4.1-5 million interindivid … tionability. Greater inclusion of previously underrepresented populations, coupled with integrative multiomics approaches powered by artificial intelligence and machine learning, could accelerate PGx biomarker identification, validation, and integration into personalized patient care. SIGNIFICANCE STATEMENT: Rapid and effective deployment of anti-infective d …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thermal variability associated with climate change is an increasing constraint for finfish aquaculture because water temperature directly af … or marine carnivores, repeated temperature fluctuation, post-stress recovery, disease challenge and multiomics integration. Therefore, the findings should be interpreted as a structured evidence map rather than universal formulation guidance. Future studies should use standardized thermal-challenge protocols, dose-response designs, clear tank-level experimen …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Compared with conventional chemotherapy, pembrolizumab-based chemoimmunotherapy (Pembro) and nivolumab plus ipilimumab with or w … FS: 12.4 vs 6.6; restricted mean survival time (RMST)Nivo+Ipi/RMSTPembro (24 months)=1.5; p=0.049). Multiomics analysis using 152 NSCLC samples showed that tumors with low TPS/high IC scores exhibited an activated tumor immune microenvironment comparable to that of tumors with high TPS. However, these tumors had significantly highest tumor mutation burden (T …
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Decompensated liver cirrhosis (DLC) is characterized by severe liver dysfunction and immune dysregulation, posing significant treatment chal … 10⁷, 1.0 × 10⁸, 1.5 × 10⁸, and 2.0 × 10⁸ cells. Patients were followed up on Days 3, 7, 14, and 28. Multiomics analyses, including single-cell RNA sequencing and cytometry by time of flight, were conducted to perform exploratory mechanistic analyses investigating immune cell dynamics and dose-dependent responses. Building on these findings, Phase Ib included …
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypermobile Ehlers-Danlos syndrome (hEDS) and hypermobility spectrum disorders (HSD) are clinically defined connective tissue conditions lacking molecular biomarkers. We tested whether their transcriptomic convergence extends to miRNA-mediated post-transcriptional regulation. miRNome sequencing was performed in cultured dermal fibroblasts from 12 individuals with hEDS, 12 with HSD, and 24 controls. Twenty-five differentially expressed miRNAs (DE-miRNAs) were assessed by qPCR in pooled discovery material and an independent pooled cohort. No miRNA met differential-expression threshold in the dir
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer (OC) is one of the most aggressive gynecological malignancies worldwide. The tumor microenvironment and transcriptomic alterations play important roles in OC progression and therapeutic response. Integrative bulk and single-cell transcriptomic analyses may facilitate the identification of prognostic biomarkers and potential therapeutic targets. Multi-Omic datasets from TCGA and GEO were analyzed. Immune-related genes were first integrated with survival information and screened using a random survival forest model to identify five core genes. GO/KEGG analyses were performed on di
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic cancer (PC) exhibits dismal outcomes and an immune-excluded microenvironment that blunts immunotherapy. Robust, immune-anchored biomarkers are needed to stratify risk and inform treatment design.
METHODS: We integrated The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Genotype-Tissue Expression (GTEx) dataset and validated findings in Gene Expression Omnibus (GEO) dataset (GSE57495). Immune infiltration, survival modeling, pathway activity, tumor microenvironment, and immunotherapy responses were analyzed. Single-cell RNA sequencing (GSE212966) informed CD4⁺ T-cell differentially expr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor-associated macrophages (TAMs) are key regulators of the metastatic immune microenvironment, yet the specific TAM subsets that drive immune suppression and tumor progression in colorectal cancer liver metastasis (CRLM) remain poorly defined. Here, we integrated CyTOF, single-cell and spatial transcriptomics, bulk RNA sequencing, and lipidomics to identify a distinct population of lipid-laden, immunosuppressive TREM2+ TAMs enriched in CRLM. These cells exhibited high expression of lipid metabolism-related genes, including APOE, LIPA, and GPNMB, and accumulated abundant intracellular lipid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is implicated in asthma pathogenesis, but causal roles of mitochondrial-related genes in paediatric asthma remain unclear. We performed a multi-omics Mendelian randomization study integrating GWAS data from paediatric asthma cohorts with blood-based methylation quantitative trait loci (mQTLs), expression QTLs (eQTLs) and protein QTLs (pQTLs) datasets. Causal inference was assessed using Summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) and HEIDI testing, complemented by colocalization analysis. Findings were validated in independent cohorts and evaluated for tissue spe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
tRNA-derived small RNAs (tsRNAs) are small single-stranded RNAs cleaved from precursor and mature tRNAs. Aberrant expression of tsRNAs has been reported in multiple cancers, suggesting their potential as novel biomarkers and therapeutic targets. However, the role of tsRNAs in nasopharyngeal carcinoma (NPC) remains unclear. This study aimed to investigate tsRNA expression profiles in serum exosomes of NPC and explore the function of dysregulated tsRNAs. Serum samples from 30 NPC patients and 30 healthy controls, as well as 10 pairs of NPC tumor and adjacent normal tissues were collected. Serum
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer’s Disease represents the most significant form of neurodegenerative disease worldwide with progressive dementia and synaptic dysfunction. Though the accumulation of β-amyloid and hyperphosphorylated tau protein is the most observed pathological feature of AD, the emergence of ribosomal dysfunction and oxidative stress has recently gained interest. In this study, we conducted a comprehensive multi-omics investigation, which included transcriptomic, proteomic, and lipidomic analyses, on cortical region from 5xFAD mice, a transgenic model of AD. Gene and protein expression analysis demo
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atherosclerosis (AS) is a chronic vascular disease and the principal cause leading to ischemic cardiomyopathy (ICM). It involves complex metabolic dysregulation beyond the resolution of single-omics. Emerging evidence implicates arginine-proline metabolism (APM) in driving inflammation and impairing efferocytosis, yet the cellular basis of plaque instability remains elusive.
METHODS: We employed a five-stage analytical framework. First, metabolomic profiling revealed shared pathways between AS and ICM. Second, single-cell RNA sequencing identified APM-enriched macrophage subtypes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigated molecular drivers of AD-associated peripheral immune dysregulation to identify pathogenic genes and therapeutic targets for precision diagnosis and intervention.
METHODS: A large-scale GWAS meta-analysis (n = 894,710) was performed, followed by two-sample Mendelian randomization (MR) using multi-tissue cis-eQTL data to identify putative causal genes. Immune response differential genes (IRDGs) were defined from AD peripheral blood transcriptomes and the MSigDB database. A three-step summary-data-based MR framework integrating blood cis-eQTLs and cis-mQTLs was
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: While microRNA (miR) expression profiling has identified potential biomarkers in patients with COVID-19, the regulatory mechanisms by which miRs modulate disease severity remain poorly characterized. We performed integrated miR-proteome analysis to elucidate mechanistic relationships between miR regulation and COVID-19 severity.
METHOD: Deidentified plasma samples from 93 participants with acute COVID-19 were categorized by severity using a 12-point symptom scoring system: mild (0-1), moderate (2-4), and severe (5-12). miR and proteomic profiles were analyzed using univariate st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interferon system, first discovered in chicken embryonated eggs, plays a pivotal role in defending vertebrates against pathogens, yet comprehensive multi-omics analyses of immune responses in avian species remain scarce. In this study, we employed an integrative approach combining RNA-Seq transcriptomics with SILAC-based quantitative proteomics to characterize global changes in gene and protein expression following immune stimulation in DF-1 chicken fibroblasts. Cells were treated with three distinct immune stimuli: chicken type I interferon, the synthetic double-stranded RNA (dsRNA) analo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The filamentous fungus Trichoderma reesei is a major industrial source of holocellulolytic enzymes, and its response to complex carbon sources is regulated by nutrient-sensing mechanisms, including the cyclic adenosine monophosphate (cAMP)-protein kinase A (PKA) signaling pathway. Here, we integrated transcriptomics, quantitative proteomics, and phosphoproteomics to analyze PKAc1-associated responses in the parental strain QM9414 and a Δpkac1 strain cultivated under glucose or sugarcane bagasse conditions. Deletion of pkac1 was associated with altered growth-related phenotypes and reduced extr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute kidney injury (AKI) lacks disease-modifying therapies, partly because cell type-specific injury programs remain incompletely resolved and tissue mechanisms are not readily translated into clinically accessible biomarkers. We constructed a cross-scale, multi-omics atlas to prioritize candidate regulator linking renal injury circuitry with urine-detectable signals. Human single-cell, bulk, and spatial transcriptomics were integrated with mouse renal ischemia-reperfusion injury (RIRI) kidney proteomics and clinical urine proteomics. Overlap of differentially expressed genes and differential
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transarterial chemoembolization (TACE) is a standard treatment for intermediate-stage hepatocellular carcinoma (HCC), but response is highly variable. The systemic metabolic impact of TACE and its connection to tumor-intrinsic factors governing efficacy remain poorly understood. We hypothesized that by comparing host fecal metabolomics with tumor transcriptomics, we could identify convergent pathways suggestive of a gut-liver axis signature of TACE response.
METHODS: We performed untargeted fecal metabolomics in a prospective paired cohort of 30 HCC patients sampled before TACE an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования