High-throughput computational screening (HTCS) has revolutionized the drug discovery process by enabling the rapid identification and optimization of potential lead compounds. Leveraging the power of advanced algorithms, machine learning, and molecular simulations, HTCS facilitates the efficient exploration of vast chemical spaces, significantly accelerating early-stage drug discovery. The time, cost, and labor in the case of traditional experimental approaches are reduced by the ability to virtually screen millions of compounds for biological activity. This paradigm shift is also facilitated
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While quantum computing algorithms have been widely applied for electronic structure calculations, applications to molecular dynamics remain scarce. Complex and varied landscapes of molecular potential energy surfaces give rise to vibrational states with a wide range of properties, making it difficult to construct a general representation of ro-vibrational states by a quantum computer with a limited number of qubits and gates. Another challenge is the exponential growth of the computational complexity - for example, the number of terms required to expand a general Hamiltonian in Pauli strings
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interaction of three complexes [Zn(II), Cu(II), and V(IV)] derived from an asymmetric bidentate Schiff-base ligand with DNA and HSA was studied using fluorescence quenching, UV-Vis spectroscopy, viscosity measurements, and computational methods [molecular docking and our Own N-layered Integrated molecular Orbital and molecular Mechanics (ONIOM)]. The obtained results revealed that the DNA and HSA affinities for binding of the synthesized compounds follow as V(IV) > Zn(II) > Cu(II) and Zn(II) > V(IV) > Cu(II), respectively. The distance between these compounds and HSA was obtained based on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prediction of immunogenicity is a substantial barrier in vaccine design. Here, a molecular dynamics approach to assessing the immunogenicity of nanoparticles based on structure is presented. Molecular properties of epitopes on nonenveloped viral particles are quantified via a set of metrics. One such metric, epitope fluctuation (and implied flexibility), is shown to be inversely correlated with immunogenicity for each of a broad spectrum of nonenveloped viruses. The molecular metrics and experimentally determined immunogenicities for these viruses are archived in the open-source vaccine comput
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Окисляющий стресс является одним из основных факторов патогенеза иммунных заболеваний в результате его воздействия на клеточный метаболизм, митохондриальную функцию, иммунную сигнализацию и воспалительную травму тканей. Разрушение гомеостазиса способствует метаболическому перепрограммированию и постоянной активации врожденной и адаптивной иммунной реакции, что способствует прогрессированию заболеваний через многочисленные подстрекательские и аутоиммунные расстройства. Последние достижения в области высокопроизводительных молекулярных технологий привели к созданию крупномасштабных многомерных н
СтатьяОбзорПолный текст найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Healthy skin is essential for balanced health. Currently, skin diseases are considered a major global health issue, impacting individuals of all ages. Skin conditions can vary broadly, ranging from common issues like acne and eczema to more serious diseases such as psoriasis, melanoma, and other types of skin cancer. In recent years, computational methods have appeared as powerful tools for explaining the lurking mechanisms of skin diseases and the advancement of the discovery regarding updated therapeutics. This review spotlights the notable researches that have been performed in using comput
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global minima of molecular clusters are one of the acute and long-standing problems in the computational chemistry domain. It is important to understand the lowest energy geometry isomer of a given compound for further investigation of physical and chemical properties. The exponential growth of local minima with increasing cluster size makes the problem more relevant. The existing ab initio methods are accurate but very expensive in terms of computational resources. It opens the gap to find more efficient and reliable solutions for rapid exploration. On the other side, neural network potential
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variational quantum eigensolvers (VQEs) are among the most promising quantum algorithms for solving electronic structure problems in quantum chemistry, particularly during the noisy intermediate-scale quantum (NISQ) era. In this study, we investigate the capabilities and limitations of VQE algorithms implemented on current quantum hardware for determining molecular ground-state energies, focusing on the adaptive derivative-assembled pseudo-Trotter ansatz VQE (ADAPT-VQE). To address the significant computational challenges posed by molecular Hamiltonians, we explore various well known strategie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prediction of absorption and emission spectra is a crucial task in chemistry and materials science, traditionally addressed with computational methods, such as density functional theory (DFT). While DFT can deliver with high accuracy, its substantial computational cost and long run times hinder its scalability for large molecular systems. In this study, we present an efficient graph neural network (GNN)-based approach for predicting optical properties. Our method combines molecular graph representations with molecular fingerprints, allowing the model to capture detailed structural and elec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellulose nanofibers (CNFs) are emerging as promising candidate materials for drug delivery systems due to their biocompatibility, large surface area, and structural versatility. Their capacity to encapsulate a variety of therapeutic compounds enables controlled and targeted release, although performance depends on formulation and surface characteristics. This structured narrative review article focuses on recent experimental and computational research on CNFs as drug carriers and their roles in small molecule loading, sustained release, and targeting strategies. In addition to CNF-based syste
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial simulated communication networks inspired by molecular communication in organisms use biological and chemical molecules as information carriers to realize information transmission. However, the design of programmable, multiplexed and general simulation models remains challenging. Here, we develop a DNA nanostructure recognition-based artificial molecular communication network (DR-AMCN), in which rectangular DNA origami nanostructures serve as nodes and their recognition as edges. After the implementation of DR-AMCN with various communication mechanisms including serial, parallel, or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The continued progression of chronic lung disease despite current treatment options has led to the increasing evaluation of molecular imaging tools for diagnosis, treatment planning, drug discovery, and therapy monitoring. Concurrently the development of multimodality positron emission tomography (PET) / computed tomography (CT), single-photon emission computed tomography (SPECT)/CT, and magnetic resonance imaging (MRI)/PET scanners has opened the potential for more sophisticated imaging biomarker probes. Here we review the potential uses of multimodality imaging tools, the established uses of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study employed a combined computational and experimental approach to investigate the molecular recognition mechanism of 4-methylphenol by human olfactory receptor hOR9Q2. The strategy integrated molecular docking using BIOVIA Discovery Studio, structural modeling of hOR9Q2 based on the AlphaFold2-predicted, molecular dynamics simulations with GROMACS software employing the AMBER14SB force field, and systematic site-directed mutagenesis validation. Computational simulations revealed that the binding cavity formed by transmembrane domains TM3, TM5, and TM6 serves as the key interaction regi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BC) remains a major disease burden in terms of incidence, morbidity, mortality, and economic cost. Deciphering the intrinsic molecular subtypes and identification of key drivers of BC has yielded successful novel therapeutic strategies. Advances in computational and digital pathology are reshaping the field of anatomical pathology. This review offers an update on the most relevant computational algorithms in digital pathology that have been proposed to enhance BC management. These tools promise to enhance diagnostics, staging, and grading accuracy and streamline efficiency whil
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All-component molecular dynamics studies were used to probe a library of oseltamivir molecularly imprinted polymer prepolymerization mixtures. Polymers included one of five functional monomers (acrylamide, hydroxyethylmethacrylate, methacrylic acid, 2-(triflouromethyl)acrylic acid, 4-vinylpyridine) and one of three porogens (acetonitrile, chloroform, methanol) combined with the crosslinking agent ethylene glycol dimethacrylate and initiator 2,2'-azobis(2-methylpropionitrile). Polymers were characterized by nitrogen gas sorption measurements and SEM, and affinity studies performed using radioli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To biologically evaluate a series of hydrazide derivatives of mefenamic acid as anti-urease agents, elucidating their mechanism of action through integrated computational and experimental approaches.
METHOD: The inhibitory mechanism was interpreted through comprehensive computational studies: molecular docking to identify binding modes within the catalytic site of H. pylori urease (PDB: 4UBP), Density Functional Theory (DFT) calculations to evaluate global chemical reactivity and frontier molecular orbitals (FMOs), and Molecular Dynamics (MD) simulations to confirm complex stability. Pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA therapeutics are increasingly moving from empirical screening towards rational, computation-guided design. Recent advances in RNA language models, generative models and structure-aware learning have improved sequence representation, candidate generation and structure-constrained optimization. However, favourable molecular properties do not necessarily translate into desirable biological performance, because therapeutic outcomes also depend on modality-specific mechanisms, delivery and exposure, molecular interactions, cellular state, immune responses and network-level adaptation. Here, we
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid emergence of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii has become a major health concern, primarily driven by the dissemination of class D β-lactamases, particularly OXA-23, which compromise the efficacy of last-line β-lactam antibiotics. Drug repurposing combined with structure-based computational approaches provides a promising strategy for accelerating the discovery of novel therapeutic candidates against multidrug-resistant pathogens. This study aimed to identify FDA-approved non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDS) with potential inhibitory activity against OXA-23 β-lac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Breast cancer remains one of the leading causes of cancer-related mortality among women worldwide. Tumor angiogenesis plays a crucial role in breast cancer progression, making angiogenesis-associated pathways attractive therapeutic targets. Computational drug discovery approaches, including virtual high-throughput screening (VHTS), molecular docking, molecular dynamics simulations, and binding free energy calculations, have emerged as valuable tools for identifying and optimizing anticancer compounds. This review evaluates the application of these computational techniques in the disco
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial intelligence (AI) has demonstrated remarkable potential in reshaping modern drug discovery, yet its widespread adoption is hindered by fragmented tools, high technical barriers, and the lack of user-friendly interfaces. Here, we present WeMol, an AI-driven one-stop molecular computing platform designed to streamline early-stage drug discovery. WeMol integrates a series of modules, covering molecular similarity search, structure-based and AI-enhanced docking, ADMET prediction, molecular generation, and molecular dynamics simulations. The platform features a zero-code, cloud-based int
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования