Papaver setigerum is an annual herb that is closely related to the opium poppy, P. somniferum. Genetic resources for P. setigerum are scarce. In the present study, we assembled the complete chloroplast (cp) genome of P. setigerum based on genome skimming data, and we conducted comparative cp genome analyses to study the evolutionary pattern in Papaveraceae. The cp genome of P. setigerum is 152,862 bp in length with a typical quadripartite structure. Comparative analyses revealed no gene rearrangement in the Papaveraceae family, although differences were evident in genome size, gene losses, as …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the tremendous progress made in recent years in assembling the human genome, tandemly repeated DNA elements remain poorly characterized. These sequences account for the vast majority of methylated sites in the human genome and their methylated state is necessary for this repetitive DNA to function properly and to maintain genome integrity. Furthermore, recent advances highlight the emerging role of these sequences in regulating the functions of the human genome and its variability during evolution, among individuals, or in disease susceptibility. In addition, a number of inherited rare
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus anthracis is the causative agent of anthrax and is classified as a 'Category A' biological weapon. Six complete genomes of B. anthr … ong to the A cluster. We estimated that the B. anthracis pan-genome has 2893 core genes (99% of the genome size) and 85 accessory genes. We validated the hypothesis that B. anthracis has a closed pan-genome and found that the three African strains carry the two plasmids associated with bacterial virulence. The pan-genome nature of B. anthracis confirms its la …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpesviruses, which are important pathogens for both animals and humans, have large and complex genomes with a coding capacity for up to 225 open reading frames (ORFs). Due to the large genome size and the slow replication kinetics in vitro of some herpesviruses, mutagenesis of viral genes in the context of the viral genome by conventional recombination methods in cell culture has been difficult. Given that mutagenesis of viral genes is the basic strategy to investigate function, many of the herpesvirus ORFs could not be defined functionally. Recently, a completely new approach for the constr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella typhi is the only species of Salmonella which grows exclusively in humans, in whom it causes enteric typhoid fever. Strains of S. typhi show very little variation in electrophoretic types, restriction fragment length polymorphisms, cell envelope proteins, and intervening sequences, but the same strains are very heterogeneous for ribotypes which are detected with the restriction endonuclease PstI. In addition, the genome of S. typhi has been proven to undergo genomic rearrangement due to homologous recombination between the seven copies of rrn genes. The relationship between ribotype
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Distinguishing paracentric inversions (PAIs) from chromosomal insertions has traditionally relied on fluorescent in situ hybridization (FISH) techniques, but recent advancements in high-throughput sequencing have enabled the use of genome sequencing for such differentiation. In this study, we present a 38-year-old male carrier of a paracentric inversion on chromosome 2q, inv (2)(q31.2q34), whose partner experienced recurrent miscarriages.
MATERIAL AND METHODS: FISH analysis confirmed the inversion, and genome sequencing was employed for detailed characterization.
RESULTS: Preim
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegalovirus (CMV) has a number of interesting properties that qualifies it as a vector for gene transfer. Especially appealing is the ability of the CMV genome to persist in hematopoietic progenitor cells and the packaging capacity of the viral capsid that accommodates a DNA genome of 230 kbp. In order to exploit the packaging capacity of the CMV capsid we investigated whether the principles of an amplicon vector can be applied to CMV. Amplicons are herpesviral vectors, which contain only the cis-active sequences required for replication and packaging of the vector genome. For construction
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Individuals born of consanguineous union have segments of their genomes that are homozygous as a result of inheriting identical ancestral genomic segments through both parents. One consequence of this is an increased incidence of recessive disease within these sibships. Theoretical calculations predict that 6% (1/16) of the genome of a child of first cousins will be homozygous and that the average homozygous segment will be 20 cM in size. We assessed whether these predictions held true in populations that have preferred consanguineous marriage for many generations. We found that in individuals
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system, belonging to the type II CRISPR/Cas system, is an effective gene-editing tool widely used in different organisms, but the size of Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9) is quite large (4.3 kb), which is not convenient for vector delivery. In this study, we used a codon-optimized Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9) system to edit the tyrosinase (tyr), oculocutaneous albinism II (oca2), and paired box 6.1 (pax6.1) genes in the fish model medaka(Oryzias latipes), in which the size of Sa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydiosis, an infection caused by several Chlamydia species, has been reported in Nile, saltwater, and Siamese crocodiles. Despite its widespread reports in various countries, including Thailand, genetic information on Chlamydia species remains limited. This study presents a whole-genome-based characterization of Siamese crocodile-isolated Chlamydia. The results showed that Siamese crocodile Chlamydia contained a single circular chromosome with a size of 1.22-1.23 Mbp and a plasmid with a size of 7.7-8.0 kbp. A plasmid containing eight coding sequences (CDSs) was grouped in a β lineage. A c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neolissochilus pnar, identified as the world's largest cave fish, belongs to the family Cyprinidae and is endemic to one of India's biodiversity hotspots, specifically in the limestones caves of Meghalaya, India. This species is notably different from its closely related counterpart, Neolissochilus hexastichus, primarily in its lack of pigmentation and the absence or reduction of eyes. While juvenile N. pnar may have small or reduced eyes, adults exhibit a absence of external ocular features. Thus, genome sequence resources of this species would be an effective tool for bioprospecting and mini
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Johnsongrass [Sorghum halepense (L.) Pers.] is an allopolyploid, rhizomatous, perennial grass species and one of the most troublesome weeds in global agriculture. We assembled the first Johnsongrass genome to clarify poorly understood genetic factors influencing variable rates of crop-wild hybridization with cultivated sorghum [S. bicolor (L.) Moench]. The draft genome assembly has a total size of 3.26 Gb and BUSCO completeness of 95.3%. We also report the first evolutionary analysis of INHIBITION OF ALIEN POLLEN (IAP), the only known cross-(in)compatibility locus in the genus. Our results rev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study presents the draft genome sequence of Staphylococcus saprophyticus strain 3M isolated from a cow with subclinical mastitis (SCM) in Kiruhura district, Uganda and explores the isolates resistance and virulence potential.
DATA DESCRIPTION: The assembled genome size was 2,791,445 bp with a 33% GC, 13 Contigs, Contig N50 2,589,240, Contig L50 1 and 2,791,440x Genome coverage. Check M analysis revealed 68.25% completeness. Average Nucleotide Identity (ANI) analysis revealed Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15,305 = NCTC 7292(GCA_006094355.1) as the close…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mosquito Aedes aegypti is the primary vector for several medically significant arboviruses, including dengue, Zika, chikungunya, and yellow fever. Studying the genetic diversity of Ae. aegypti is crucial for understanding its evolutionary history, population dynamics, and the effectiveness of vector control methods. Due to the large genome size of Ae. aegypti, whole-genome sequencing (WGS) is often cost-prohibitive for large-scale studies. Recent advances in reduced-representation methods, aiming to reduce costs by sequencing only a small portion of the genome, provide cost-effective alter…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the current study, we presented the genome sequence and taxonomic classification of the new extensively drug-resistant (XDR) Salmonella enterica serovar Typhi strain JRCGR-ST-AK02. Its genome size was found to be 4,780,534 bp, containing 4864 genes. Taxonomic classification was performed based on the Average Nucleotide Identity (ANI), Genome-to-Genome Distance Calculator (GGDC) and Average Amino Acid Identity (AAI) analysis. Pan-genome analysis revealed 34,4915 core genes, which are predominantly involved in general functions and carbohydrate metabolism. We used a subtractive genomics appro…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hymenolepis nana, commonly known as the dwarf tapeworm, is one of the most common tapeworms of humans and rodents and can cause hymenolepiasis. Although this zoonotic tapeworm is of socio-economic significance in many countries of the world, its genetics, systematics, epidemiology, and biology are poorly understood. In the present study, we sequenced and characterized the complete mitochondrial (mt) genome of H. nana. The mt genome is 13,764 bp in size and encodes 36 genes, including 12 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA, and 22 transfer RNA genes. All genes are transcribed in the same dire
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The fungus Marssonina brunnea is a causal pathogen of Marssonina leaf spot that devastates poplar plantations by defoliating susceptible trees before normal fall leaf drop.
RESULTS: We sequence the genome of M. brunnea with a size of 52 Mb assembled into 89 scaffolds, representing the first sequenced Dermateaceae genome. By inoculating this fungus onto a poplar hybrid clone, we investigate how M. brunnea interacts and co-evolves with its host to colonize poplar leaves. While a handful of virulence genes in M. brunnea, mostly from the LysM family, are detected to up-regulate during
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comparative cytogenetic analysis was performed with four alloplasmic recombinant (Hordeum vulgare)-Triticum aestivum lines differing in morphological traits, number of seeds per spike, and seed plumpness. None of the lines displayed introgression of the barley genetic material: the karyotypes included only common wheat chromosomes. Two lines, 79(B) and 79(D), were cytogenetically stable. Plants of lines 79(A) and 79(C) displayed a high frequency of unbalanced chromosome aberrations, including dicentric and polycentric chromosomes, terminal deletions varying in size, acentric fragments, and mul
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio spp. are Gram-negative bacteria found in marine ecosystems. Non-cholera Vibrio spp. can cause gastrointestinal infections and can also lead to wound infections through exposure to contaminated seawater. Vibrio infections are increasingly documented from the Baltic Sea due to extended warm weather periods. We describe the first isolation of Vibrio fluvialis from a wound infection acquired by an impalement injury in the shallow waters of the Baltic Sea. The severe infection required amputation of the third toe. Whole genome sequencing of the isolate was performed and revealed a genome con
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nonsyndromic cleft palate only (nsCPO) is a common and multifactorial form of orofacial clefting. In contrast to successes achieved for the other common form of orofacial clefting, that is, nonsyndromic cleft lip with/without cleft palate (nsCL/P), genome wide association studies (GWAS) of nsCPO have identified only one genome wide significant locus. Aim of the present study was to investigate whether common variants contribute to nsCPO and, if so, to identify novel risk loci.
METHODS: We genotyped 33 SNPs at 27 candidate loci from 2 previously published nsCPO GWAS in an independe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования