BACKGROUND: High-pathogenic Y. enterocolitica ssp. enterocolitica caused several human outbreaks in Northern America. In contrast, low pathogenic Y. enterocolitica ssp. palearctica serobiotype O:3/4 is responsible for sporadic cases worldwide with asymptomatic pigs being the main source of infection. Genomes of three Y. enterocolitica ssp. palearctica serobiotype O:3/4 human isolates (including the completely sequenced Y11 German DSMZ type strain) were compared to the high-pathogenic Y. enterocolitica ssp. enterocolitica 8081 O:8/1B to address the peculiarities of the O:3/4 group.
RESULTS: Mo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) is a highly diverse pathogen that frequently establishes a chronic long-term infection, but the origins and drivers of HCV diversity in the human population remain unclear. Previously unidentified strains of HCV genotype 6 (gt6) were recently discovered in chronically infected individuals of the Li ethnic group living in Baisha County, Hainan Island, China. The Li community, who were early settlers on Hainan Island, has a distinct host genetic background and cultural identity compared to other ethnic groups on the island and mainland China. In this report, we generated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Insecticide resistance in the housefly, Musca domestica, has been investigated for more than 60 years. It will enter a new era after the recent publication of the housefly genome and the development of multiple next generation sequencing technologies. The genetic background of the xenobiotic response can now be investigated in greater detail. Here, we investigate the 454-pyrosequencing transcriptome of the spinosad-resistant 791spin strain in relation to the housefly genome with focus on P450 genes.
RESULTS: The de novo assembly of clean reads gave 35,834 contigs consisting of 21,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter baumannii has emerged as one of the most challenging opportunistic pathogens in modern healthcare due to its remarkable abilit … including carbapenemases, aminoglycoside-modifying enzymes, efflux pumps, and resistance-associated genomic islands. Particular attention is given to the complex and sometimes discordant relationship between genotype and phenotype, where the presence of resistance genes does not always translate directly into phenotypic resistance due to regulatory mechanisms, ge …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mountain systems are natural laboratories for evolution, where rugged topography and ecological heterogeneity restrict gene flow. In the Hen … intersection of the top 1% relative (F st) and absolute (D xy) divergence windows identified 5 core genomic islands, notably highlighting the DNA repair gene MGMT as a key candidate for environmental adaptation. Concurrently, functional enrichment of the broader top 1% F st regions indicated an overrepresentation of pathways associated with synaptic and neuromodu …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Mycoplasma hominis is one of the smallest free-living opportunistic human pathogens responsible for a diverse range of infection … ng sequences and a G + C content of 26.8%. Several antimicrobial resistance genes, virulence genes, genomic islands and insertion sequences were identified in the genome. Phylogenetic analysis showed that the strains retrieved from NCBI as well as M. hominis MH-1 were not epidemiologically related. The closest relative of M. hominis MH-1 was recovered from the US …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies, caused by rabies virus, is a severe public health problem in the Philippines, where animal rabies epidemiology had been extensively investigated, but little is known about the national epidemiologic situations since 2010. Here, we report a 12-year nationwide animal rabies surveillance with systematic phylogenetic analysis, in which 353 whole genomes of rabies viruses collected from animal rabies cases between 2018 and 2022 were obtained. The phylogenetic and spatial-temporal evolutionary analyses showed that rabies viruses in the Philippines were exclusively classified into the SEA4 su
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Caprine theileriosis is an economically important tick-borne disease caused by various Theileria species, particularly Theileria lestoquardi, Theileria luwenshuni, and Theileria uilenbergi, in goats (Capra hircus). Goat farming plays an economically and culturally important role on Tarama Island, Okinawa, Japan. Because goats on the island are mainly managed under an extensive grazing system, tick infestation is common. However, Theileria infections have not previously been investigated in goats on Tarama Island. To address this, archived DNA samples prepared from blood collected from 44 goats
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Napoli (S. Napoli) is among the top serovars causing human infections in Italy, although it is relatively uncommon in other European countries; it is mainly isolated from humans and the environment, but neither the reservoir nor its route of infection are clearly defined. This serovar is characterized by high genomic diversity, and molecular evidences revealed important similarities with typhoidal serovars.
RESULTS: 179 S. Napoli genomes as well as 239 genomes of typhoidal and non-typhoidal serovars were analyzed in a comparative genomic
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxiella burnetii is a pathogen causing Q fever in domestic animals and humans. Seabirds have been implicated as possible reservoirs of this bacterium in the Arabian Gulf and in the Western Indian Ocean. Recently, Coxiella species closely related to C. burnetii was detected from ticks collected from oil rigs used as roosting areas by Socotra Cormorants (Phalacrocorax nigrogularis) in the western Arabian Gulf. We collected ticks from the largest breeding colony of Socotra Cormorants in the United Arab Emirates on the eastern extreme of the species' breeding range to determine the prevalence of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fryns syndrome is a lethal autosomal recessive syndrome which includes congenital diaphragmatic hernia (CDH), pulmonary hypoplasia, cranio-facial manifestations including a coarse face, a cleft palate / lip and cloudy corneae, distal limb hypoplasia and internal malformations including central nervous system, cardiovascular, gastrointestinal, urogenital and skeletal anomalies.
CASES REPORT: We report on 3 patients with Fryns syndrome in the french Indian Ocean islands (La Réunion and Mayotte islands). Pregnancies were complicated by polyhydramnios. All patients had coarse face, cl
Клинический случайАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A gene for autosomal dominant, juvenile-onset, primary open angle glaucoma (GLCIA) has been previously mapped to 1q21-31 in several Caucasian pedigrees. We studied two Hispanic families with this disease to determine if their disease genes also map to this region. Individuals were considered as being affected if they had 1OP > 30 mmHg (without treatment) and glaucomatous optic nerve damage or visual field defects. Persons older than 40 years with intraocular pressures < or = 21 mmHg and no evidence of optic nerve damage or visual field loss were scored as unaffected. Individuals not falling in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We describe the virulence factors of a methicillin-sensitive Staphylococcus aureus sequence type (ST) 45 strain, MCRF184, (spa type t917), that caused severe necrotizing fasciitis in a 72-year-old diabetic male. The genome of MCRF184 possesses three genomic islands: a relatively large type III νSaα with 42 open reading frames (ORFs) that includes superantigen- and lipoprotein-like genes, a truncated νSaβ that consists mostly of the enterotoxin gene cluster (egc), and a νSaγ island with 18 ORFs including α-toxin. Additionally, the genome has two phage-related regions: phage φSa3 wit…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We conducted a survey for malaria diagnosis and treatment in four primary schools in Flores Island, one of the Indonesian Islands with an area of 17000 km(2) and a population of 1.8 million. Of those examined, 24.4% were diagnosed as having malaria (90/363) and administered medicine immediately. A glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) test was performed at the same time, and 16 persons (4.4%) were diagnosed as G6PD deficient. Eleven persons consented to analysis of the G6PD genome. We analyzed these subjects and found one case of G6PD Vanua Lava (383T>C), five cases of G6PD Coimbra (592C>T)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide comparisons of populations are widely used to explore the patterns of nucleotide diversity and sequence divergence to provide knowledge on how natural selection and genetic drift affect the genome. In this study we have compared whole-genome sequencing data from Atlantic and Pacific herring, two sister species that diverged about 2 million years ago, to explore the pattern of genetic differentiation between the two species.
RESULTS: The genome comparison of the two species revealed high genome-wide differentiation but with islands of remarkably low genetic differentiat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multidrug-resistant (MDR) bacteria commonly harbor highly complex genomes enriched with mobile elements and resistance islands, which are challenging to resolve using short-read sequencing. Here, we evaluated CycloneSEQ, a newly developed Chinese nanopore sequencing platform, for MDR genome reconstruction. Long-read-only assemblies generated near-complete genomes, while hybrid assemblies achieved accuracy exceeding 99.99%. CycloneSEQ effectively resolved complex structures, including tandem repeats within ARG-bearing regions. Notably, updated sequencing chemistry improved single-read accuracy
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence and spread of tmexCD-toprJ have greatly weakened the function of tigecycline. Although studies have demonstrated the significance of Proteus as carriers for tmexCD-toprJ, the epidemic mechanism and characteristics of tmexCD-toprJ in Proteus remain unclear. Herein, we deciphered that the umuC gene in VRIII of SXT/R391 ICEs was a hotspot for the integration of tmexCD3-toprJ1b-bearing mobile genetic elements by genomic analysis. The mobilization and dissemination of tmexCD3-toprJ1b in Proteus were mediated by highly prevalent ICEs. Furthermore, the co-occurrence of tmexCD3-toprJ1b-b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudolactococcus laudensis (formerly named Lactococcus laudensis) is an emerging lactic acid bacterium first isolated from raw milk in 2015 … starter strains showed markedly elevated numbers of insertion sequences, pseudogenes, plasmids and genomic islands relative to MCRI-603, which was plasmid-free and carried very few insertion sequence elements or genomic islands. DSM 28961 displayed pseudogene count similar to the dairy starter strains but markedly fewer transposases. These patterns are consisten …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-typhoidal Salmonella (NTS) are foodborne pathogens that are responsible for self-limiting gastroenteritis in humans. The present study aims at the molecular characterisation and comparative genomics of Salmonella enterica serovar Senftenberg strain P5558 isolated from the pus samples of a patient suffering from stump infection. The isolate was subjected to serotyping and antimicrobial susceptibility test to understand the phenotypical characteristics. Whole genome sequencing (WGS) was carried out and comparative genomics using computational tools showed the antimicrobial resistance and vir
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dichloromethane (CH(2)Cl(2) , DCM) is a chlorinated solvent mainly produced by industry, and a common pollutant. Some aerobic methylotrophic bacteria are able to grow with this chlorinated methane as their sole carbon and energy source, using a DCM dehalogenase/glutathione S-transferase encoded by dcmA to transform DCM into two molecules of HCl and one molecule of formaldehyde, a toxic intermediate of methylotrophic metabolism. In Methylobacterium extorquens DM4 of known genome sequence, dcmA lies on a 126 kb dcm genomic island not found so far in other DCM-dechlorinating strains. An experimen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования