Rice (Oryza sativa L.) is a major staple crop worldwide, and its germination (plumule) and seedling stages are susceptible to submergence stress, which leads to impaired germination and yield reduction. Identifying submergence tolerance genes is one of the most effective strategies to address this problem. To identify quantitative trait loci (QTLs) associated with submergence tolerance at the plumule and seedling stages in rice, we used an indica rice cultivar 'HZ', a japonica cultivar 'Nekken2', and 120 recombinant inbred lines (RILs) derived from the cross between them in this study. Traits …
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Perilla (Perilla frutescens) is an important oilseed crop in East Asia with high nutritional and economic value. Seed size and seed coat color are key agronomic traits influencing yield, oil quality, and market preference. However, genetic studies in perilla remain limited by small population sizes and low-throughput phenotyping, restricting their application in breeding.
RESULTS: A large-scale genome-wide association study (GWAS) was conducted by integrating high-throughput image-based phenotyping in a panel of 493 perilla accessions. Measurements of seed morphology, including ar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is linked to sleep disorders in previous report, but the potential roles of specific genes remain unclear. This study aimed to dissect different subtype-specific genetic associations and their underlying mechanisms. A multi-omics Summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) approach was performed to identify potential causal links between mitochondrial function-related genes and sleep disorders. We integrated GWAS data from FinnGen database (the discovery set), independent GWAS datasets (covering different sleep-disorder subtypes and used for validation), and cis-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fruit branch is a critical determinant of plant architecture in cotton, and its length optimization is pivotal for high-density planting and mechanical harvesting. However, the genetic mechanisms governing fruit branch length (FBL) are not fully elucidated. In this study, an F2 population was generated from two contrasting upland cotton cultivars, Blanco3363 (BL, compact) and Sanjiang (SJ, loose). Using two different methodologies of bulked-segregant analysis (BSA)-seq, we identified three stable overlapping QTLs on chromosomes A08 (119.8-122.46 Mb), D01 (7.51-10.10 Mb), and D09 (16.33-18.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant architecture results from the integration of developmental regulatory networks and environmental signaling pathways. In soybean, the erect growth habit of cultivated soybean (Glycine max) contrasts markedly with the vine growth habit (VGH) of wild soybean (Glycine soja). However, the genetic and transcriptional mechanisms underlying this divergence in gibberellin-mediated stem elongation remain poorly understood. Therefore, this study aims to investigate the genetic, transcriptional, and hormonal basis underlying the differences in growth habit between Williams 82 (erect growth habit) an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rising prevalence of diabetes mellitus, especially among populations with high rice consumption, underscores the need for functional staple crops with a low glycemic index (GI). This review examines the molecular and genetic factors influencing low-GI traits in rice, highlighting the importance of diversity within Indian landraces. Traditional cultivars like Mappillai Samba, Karuppu Kavuni and Kattuyanam contains high level of Resistant starch, dietary fiber and bioactive phytochemicals. The Waxy (Wx) gene, which codes for granule-bound starch synthase I (GBSSI), is very important for cont
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stomata of plants track the immediate demand for carbon dioxide for photosynthesis while limiting transpirational water loss. Solitary stomatal patterns are common, yet some land plants develop noncontiguous stomatal clustering, where 2 or more stomata occur in groups and overlay a single air cavity. Clustering improves stomatal efficiency, reduces plant water use, and increases resilience to environment stress. How cluster development and physiology interact and integrate with the environment are open questions. Here we used TESSERA, a deep-learning platform for stomatal detection with an int
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein S-palmitoylation regulates protein localization, stability, and signaling and has emerging roles in bone-cell biology. We investigated whether genetically predicted expression of palmitoylation-related genes is associated with osteoporosis risk and explored circulating metabolites as candidate mediators. We performed a 2-sample Mendelian randomization (MR) study using cis-expression quantitative trait locus instruments for 22 palmitoylation-related genes, FinnGen R10 osteoporosis data (8017 cases and 391,037 controls), and 1400 circulating metabolite traits (1091 metabolites and 309 me
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Migraine is a highly prevalent, heritable neurological disorder with a marked female predominance, indicating substantial hormon … ed genes through chemical-gene interaction network analysis, followed by integration of multi-omics quantitative trait loci datasets (eQTL, sQTL, mQTL, and pQTL) to derive genetic instruments. Summary data-based Mendelian randomization (SMR) was performed to assess the effects of genetically predicted molecular traits on migraine risk using genome-wide association study …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Small effective population size and the disproportionately large use of few genetically superior bulls in artificial insemination lead to extensive runs of homozygosity and an increased risk of homozygosity for deleterious alleles in domestic cattle, which may cause inbreeding depression. The adverse effects of inbreeding on phenotypic performance are well established, but the genetic variants contributing to inbreeding depression remain largely unknown. This study aimed to analyse the impacts of inbreeding on stature (measured as height at the sacral bone) in a cohort of 15,306 Br
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interstitial lung disease (ILD) is a progressive fibrotic condition that markedly reduces survival and increases mortality rates in patients with rheumatoid arthritis (RA). Currently, the treatment of RA-ILD remains highly challenging. This study aims to identify potential therapeutic targets for RA-ILD through a systematic druggable genome-wide Mendelian randomization (MR) analysis. We performed a genome-wide MR analysis by integrating expression quantitative trait loci (eQLT) of 6888 druggable genes and genetic summary statistics from a genome-wide association study of RA-ILD. A colocalizati…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Caraway (Carum carvi L.) is a major essential oil crop with biennial and annual flowering types. As basic research resource, we developed a draft genome assembly using long-read ONT sequencing and provide a structural and functional gene annotation for an annual caraway inbred line. To elucidate the genetic control of flowering, a genotyping-by-sequencing (GBS) was conducted for an F2 population (N = 187) generating 731 strictly filtered SNPs. A linkage map was constructed spanning 663 cM across 10 linkage groups with in total 634 (full map) or 259 (thinned map) SNPs. Contrary to its dominance
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation plays a crucial role in gene expression and tumorigenesis. Most pan-cancer resources primarily focus on genetic variants and their association with gene expression without clearly demonstrating how methylation itself regulates gene activity and clinical features. To address this gap, we developed Onco-eQTM, a web-based database that links DNA methylation at CpG sites to gene regulation and multiple functional and clinical layers across 27 cancer types. These layers include miRNA regulation and biological pathways, as well as immune cell infiltration and predicted drug response,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rumination time (RT) in dairy cattle is a crucial indicator of health, production, reproduction, and greenhouse gas emissions. With moderate heritability estimates for RT, there is potential for further analyses regarding the genetic architecture of the trait. To identify genomic regions associated with RT, we conducted a GWAS on SNPs in a cohort of 452 mid-first-lactation Canadian Holstein cows, followed by the annotation of genes and enrichment analyses of QTL. Animals were genotyped using a medium-density SNP panel (50K). Quality control measures were used to remove markers residing on nona
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The occurrence and progression of cardiac conduction disorder (CCD) pose a significant threat to people's health. However, current pharmacological treatments for CCD are relatively limited, with few mechanistic studies and intervention strategies.
METHODS: We derived protein quantitative trait loci from two comprehensive databases: UKBPPP and deCODE Health study. Genetic associations with CCD and its subsets were obtained from the FinnGen R11 database. Summary-data-based Mendelian randomization and colocalization analyses were conducted to identify potential protein targets. Pheno…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is a complex biological process driven by genetic and immune-mediated mechanisms, yet the causal roles of immune-cell-specific gene regulation remain unclear. In this study, we integrate single-cell expression quantitative trait loci (sc-eQTL) data with Mendelian randomization (MR) and colocalization analyses to identify immune-mediated regulatory mechanisms and therapeutic targets for aging. Using data from 14 immune cell types, we systematically evaluated 8733 eGenes for causal effects on telomere length (TL), facial aging (FA), and frailty index (FI). We identified 27 immune-cell-spec…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Achalasia (AC) is an esophageal dyskinetic disorder characterized by loss of function of ganglion cells of the intermuscular ple … localization analysis of the data from the genome-wide association study (GWAS) of blood expression quantitative trait loci (eQTL) and AC, so as to identify genes that are highly associated with AC, and screened them in combination with differential genes analyzed by transcriptome sequencing data. In addition, phenotype-wide studies, enrichment analysis, protein network …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Trigeminal neuralgia (TN) is a neurological disorder affecting the maxillofacial region. Current treatment relies on pharmacothe … athophysiology of TN. METHODS: We employed two TWAS frameworks to integrate multi-tissue expression quantitative trait loci (eQTL) data from GTEx v8 with a TN genome-wide association study (GWAS). Candidate loci were systematically validated through a multi-tiered analytical cascade, encompassing MR, summary-based MR (SMR), Bayesian co-localization, and replication acros …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Integrating multi-layered information can enhance the accuracy of genomic prediction for complex traits. However, the improvement and application of effective strategies for genomic prediction (GP) using multi-omics data remains challenging.
METHODS: We generated 11 feature sets for sequencing variants from genomics, transcriptomics, metabolomics, and epigenetics data in beef cattle, then we assessed the contribution of functional variants using genomic restricted maximum likelihood (GREML). We next estimated and ranked variant scores for 43 economically important traits, and comp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: African cattle represent a unique resource of genetic diversity in response to adaptation to numerous environmental challenges. … ome sequence data of eight indigenous African cattle breeds in combination with gene expression and quantitative trait loci (QTL) databases to characterise genomic targets of artificial selection and environmental adaptation and to identify the underlying functional candidate genes. In general, the trait-association analyses of selection signatures suggest the innate and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования