Eukaryotic cells have separate genomes in the nucleus and mitochondria. Mitochondrial DNA is transcribed bi-directionally to generate mitochondrial RNA (mtRNA) and dsRNA as a by-product of this transcription. We demonstrate that mtRNA transcription and degradation are increased in AML (Acute Myeloid Leukemia) cells and stem cells resulting in higher rates of mtRNA turnover. We discover that the mitochondrial degradosome, SUV3 and PNPase, is upregulated in AML cells and stem cells and functionally important for degradation of mtRNA and mitochondrial dsRNA (double stranded RNA) in AML. Depleting
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A wealth of experimental data on the mechanism of the picornavirus genome replication has accumulated. Not infrequently, however, conclusions derived from these data appear to contradict each other. On the one hand, initiation of a complementary RNA strand can be demonstrated to occur in a solution containing only the poliovirus RNA polymerase, VPg, uridine triphosphate, poly(A) template and appropriate ions. On the other hand, convincing experiments suggest that efficient initiation of a viral complementary RNA strand requires complex cis-acting signals on the viral RNA template, additional v
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Located at the 30 kb genomic region between complement factor B and component C4 are four ubiquitously expressed genes RD, SKI2W, DOM3Z and RP1. Besides RP1, the protein products of the other three genes each has highly conserved homologues or related proteins in lower eukaryotes, contains leucine zipper motifs for protein interaction, and plays important roles related to RNA metabolism. RD is a subunit of the negative transcription elongation factor, critical for the regulation of gene expression. It has an RNA recognition motif and 24 copies of Arg-Asp (RD) repeats. Ski2w is a nucleolar and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Effective T cell responses against pathogens require a rapid yet tightly controlled remodeling of the proteome, and RNA binding proteins (RBPs) are key in this process. For instance, the RBP ZFP36L1 prevents excessive protein production and thereby limits immunopathology. ZFP36L1 is primarily known to mediate mRNA decay, but it can also regulate other processes. How its mode of action relates to its interaction partners is, however, not well-understood. Here, we mapped the ZFP36L1 interactome in primary human T cells. Using proximity labeling, we identified known and new interactors that regul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myeloid leukemia (AML) with rearrangement of the mixed lineage leukemia gene expresses MLL-AF9 fusion protein, a transcription factor that impairs differentiation and drives expansion of leukemic cells. In this work, the zinc finger protein "growth factor independent 1" together with the histone methyltransferase LSD1 is revealed to occupy the promoter and regulate the expression of the lncRNA ELDR (EGFR [epidermal growth factor receptor] long non-coding downstream RNA) in the rearranged Mixed Lineage Leukemia (MLL) (MLL-r) AML cell line THP-1. Forced ELDR overexpression enhanced the gro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-induced cardiomyopathy (SICM) is a severe complication of sepsis, in which mitochondrial dysfunction contributes to poor outcomes. DEAD-box helicase 17 (Ddx17), a member of the DEAD-box RNA helicase family, is known to regulate mitochondrial function, but its role in SICM remains unclear. In this study, mice with cardiomyocyte-specific Ddx17 knockdown (Ddx17-cKD) and overexpression (Ddx17-OE) were generated, and sepsis models were established using cecal ligation and puncture. Mechanistic findings were further validated in vitro using immunoprecipitation and dual-luciferase assays. Ddx1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Upstream frameshift 1 (UPF1) is an RNA helicase involved in a number of mRNA regulatory processes including nonsense-mediated decay. Mutations in the UPF1 locus that reduce its expression have been associated with adenosquamous carcinoma of the pancreas, a particularly aggressive form of the disease. To determine the effect of Upf1 suppression in a murine model of pancreatic adenocarcinoma, we silenced with shRNA Upf1 in cells derived from an autochthonous tumor in an LSL-KrasG12D/+; Trp53R172H/+; Pdx-1Cre/+ mouse (KPC) and orthotopically implanted these cells in the pancreas of C57BL/6 mice.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The predominant motor neuron disease in infants and adults is spinal muscular atrophy (SMA) and amyotrophic lateral sclerosis (ALS), respectively. SMA is caused by insufficient levels of the Survival Motor Neuron (SMN) protein, which operates as part of the multiprotein SMN complex that includes the DEAD-box RNA helicase Gemin3/DDX20/DP103. C9orf72, SOD1, TDP-43 and FUS are ranked as the four major genes causing familial ALS. Accumulating evidence has revealed a surprising molecular overlap between SMA and ALS. Here, we ask the question of whether Drosophila can also be exploited to study shar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human motor neuron degenerative disease spinal muscular atrophy with respiratory distress type 1 (SMARD1) is caused by loss of function mutations of immunoglobulin mu-binding protein 2 (IGHMBP2), a protein of unknown function that contains DNA/RNA helicase and nucleic acid-binding domains. Reduced IGHMBP2 protein levels in neuromuscular degeneration (nmd) mice, the mouse model of SMARD1, lead to motor neuron degeneration. We report the biochemical characterization of IGHMBP2 and the isolation of a modifier locus that rescues the phenotype and motor neuron degeneration of nmd mice. We find
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The murine gene CHD1 (MmCHD1) was previously isolated in a search for proteins that bound a DNA promoter element. The presence of chromo (chromatin organization modifier) domains and an SNF2-related helicase/ATPase domain led to speculation that this gene regulated chromatin structure or gene transcription. This study describes the cloning and characterization of three novel human genes related to MmCHD1. Examination of sequence databases produced several more related genes, most of which were not known to be similar to MmCHD1, yielding a total of 12 highly conserved CHD genes from organisms a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To identify potential regulators of Hox gene expression in mice, we have screened for genes highly related to brahma (brm), an activator of homeotic gene expression in Drosophila. We have cloned a murine gene, brg1, which, like brm, encodes a member of the DEGH protein family, suggesting that brg1 may be a DNA-dependent ATPase or a helicase. brg1 also contains a bromodomain which may be involved in transactivation. Although the sequences of a number of mammalian genes similar to Drosophila brm have been reported, they are related to brm only within specific portions of the putative helicase re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia with oculomotor apraxia 2 (AOA-2) and amyotrophic lateral sclerosis (ALS4) are neurological disorders caused by mutations in the gene encoding for senataxin (SETX), a putative RNA:DNA helicase involved in transcription and in the maintenance of genome integrity. Here, using ChIP followed by high throughput sequencing (ChIP-seq), we report that senataxin is recruited at DNA double-strand breaks (DSBs) when they occur in transcriptionally active loci. Genome-wide mapping unveiled that RNA:DNA hybrids accumulate on DSB-flanking chromatin but display a narrow, DSB-induced, depletion near DN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DDX3X is a multifunctional DEAD-box RNA helicase with important roles in translation initiation and antiviral innate immune signaling, yet it is currently unknown whether viral infection affects its interactions with host RNAs. Here, we define the transcriptome-wide binding landscape of endogenous DDX3X in Sendai virus-infected human cells using PAR-CLIP. We show that DDX3X maintains its preference for GC-rich, highly structured 5'UTR regions during infection, but acquires a distinct set of infection-induced targets, including IFNB1 and multiple interferon-stimulated genes. We demonstrate that
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUPV3L1 encodes a helicase that is mainly localized in the mitochondria. It has been shown in vitro to possess both double-stranded RNA and DNA unwinding activity that is ATP-dependent. Here we report the first two patients for this gene who presented with a homozygous preliminary stop codon resulting in a C-terminal truncation of the SUPV3L1 protein. They presented with a characteristic phenotype of neurodegenerative nature with progressive spastic paraparesis, growth restriction, hypopigmentation, and predisposition to autoimmune disease. Ophthalmological examination showed severe photophobi
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) recently caused a pandemic outbreak called coronavirus disease 2019 (COVID-19). This disease has initially been reported in China and also now it is expeditiously spreading around the globe directly among individuals through coughing and sneezing. Since it is a newly emerging viral disease and obviously there is a lack of anti-SARS-CoV-2 therapeutic agents, it is urgently required to develop an effective anti-SARS-CoV-2-agent.Through recent advancements in computational biology and biological assays, several natural compounds and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVES: Polioviruses are the causative agent of paralytic poliomyelitis. Attenuated polioviruses (Sabin oral poliovirus vac … ed host innate immune responses and compared the role of toll like receptors (TLRs) and cytoplasmic RNA helicases in cultured human neuronal cells (SK-N-SH) infected with Sabin PV and wild PV.
RESULTS: Human neuronal cells expressed very low levels of TLRs constitutively. Sabin PV infection induced significantly higher expression of TLR3, TLR7 and melanoma dif …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new picorna-like virus was identified in grapevines from a 21-year-old 'Tempanillo' block in eastern Oregon exhibiting leaf chlorosis and interveinal reddening, through the high-throughput sequencing (HTS) of the total RNA. This new virus was named grapevine-associated picorna-like virus (GaPLV). GaPLV has a monopartite, positive-sense, single-stranded RNA genome of 9021-nt, with a single open reading frame encoding a polyprotein that encompasses an RNA dependent RNA polymerase (RdRP), a helicase, a chymotrypsin-like protease, and three capsid proteins. The arrangement of these conserved dom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The wild tea species Camellia taliensis is an important genetic resource and a close relative of cultivated tea plants. In this study, metatranscriptomic sequencing of asymptomatic leaves of C. taliensis led to the identification of a previously undescribed virus. This virus, which is tentatively named as Camellia taliensis betaflexivirus 1 (CtBV1), possesses a monopartite positive-sense RNA genome of 6,564 nucleotides (nt). The genome contains two overlapping open reading frames (ORFs), flanked by a 37-nt 5′ untranslated region (UTR) and a 128-nt 3′ UTR. The larger ORF encodes a polyprotein c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-binding proteins (RBPs) critically regulate post-transcriptional gene expression, yet their roles in chemotherapy resistance remain underexplored. Here, through a targeted siRNA screen of 40 RBM family members, we identified RNA-binding motif protein 8 A (RBM8A) as central orchestrator of oxaliplatin-induced DNA damage in gastric cancer (GC). Functional studies demonstrated that RBM8A promotes tumor proliferation and chemoresistance by recruiting the RNA helicase eIF4A3 to stabilize epidermal growth factor receptor (EGFR) mRNA, shielding it from exonucleolytic degradation. This stabilizati
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural killer (NK) cells are innate lymphocytes that rapidly respond to inflammatory cytokines during infection, but the mechanisms underlying such swift responses remain incompletely understood. Here, we investigated the RNA polymerase II (Pol II) dynamics during rapid cytokine-induced activation in NK cells. Brief exposure to the proinflammatory cytokine interleukin-12 (IL-12) elicited rapid, genome-wide redistribution of Pol II within minutes, with increased promoter-proximal Pol II pausing at effector loci including Ifng. This IL-12-induced Pol II reorganization was mediated by the transc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования