Adenosine-to-inosine RNA editing is essential to prevent undesired immune activation. This diverse process alters the genetic content of the RNA and may recode proteins, change splice sites and miRNA targets, and mimic genomic mutations. Recent studies have associated or implicated aberrant editing with pathological conditions, including cancer, autoimmune diseases, and neurological and psychiatric conditions. RNA editing patterns in cardiovascular tissues have not been investigated systematically so far, and little is known about its potential role in cardiac diseases. Some hints suggest robu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein structure prediction with neural networks is a powerful new method for linking protein sequence, structure, and function, but structures have generally been predicted for only a single isoform of each gene, neglecting splice variants. To investigate the structural implications of alternative splicing, we used AlphaFold2 to predict the structures of more than 11,000 human isoforms. We employed multiple metrics to identify splicing-induced structural alterations, including template matching score, secondary structure composition, surface charge distribution, radius of gyration, accessibi
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the clinical presentation and genetic screening of a 31-year-old man with dilatation of the aortic root and ascending aorta and a positive family history for aortic dissection and sudden death. A novel heterozygous variant in a splice acceptor site (c.1600-1G>T) of TGFβR2 gene was identified by using a targeted multi-gene panel analysis. Bioinformatics tools predicted that the c.1600-1G>T variant is pathogenic by altering acceptor splice site at - 1 position affecting pre-mRNA splicing. These data confirm that the diverging splicing in the TGF-β pathway genes may be an important proc
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ichthyosis follicularis, alopecia and photophobia (IFAP) syndrome is an X-linked genodermatosis with congenital atrichia being the most prominent feature. Recently, we have shown that functional deficiency of MBTPS2 (membrane-bound transcription factor protease site 2) - a zinc metalloprotease essential for cholesterol homeostasis and endoplasmic reticulum stress response - causes the disease. Here, we present results obtained by analysing two intronic MBTPS2 mutations, c.671-9T>G and c.225-6T>A, using in silico and cell-based splicing assays. Accordingly, the c.225-6T>A transversion generated
Письмо в редакциюПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cerebellar ataxia, mental retardation, and disequilibrium syndrome type 4 (CAMRQ4) is a rare autosomal recessive neurological disorder caused by biallelic variants in the ATP8A2 gene. It is characterized by severe psychomotor impairment, hypotonia or spasticity, and intellectual disability. Despite increasing case reports, the full phenotypic spectrum remain incompletely defined.
METHODS: We report the case of a 7-year-old girl born to consanguineous parents, presenting with severe psychomotor delay, quadriplegia, and craniofacial dysmorphisms. Whole exome sequencing identified a
СтатьяСистематический обзорКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The paired-domain transcription factor paired box gene 6 (PAX6) causes a wide spectrum of ocular developmental anomalies, including congenital aniridia, Peters anomaly and microphthalmia. Here, we aimed to functionally assess the involvement of seven potentially non-canonical splicing variants on missplicing of exon 6, which represents the main hotspot region for loss-of-function PAX6 variants.
METHODS: By locus-specific analysis of PAX6 using Sanger and/or targeted next-generation sequencing, we screened a Spanish cohort of 106 patients with PAX6-related diseases. Functional spli
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The activity of synthetic antisense oligonucleotides (splicomers) designed to block pre-mRNA splicing at specific exons has been demonstrated in a number of model systems, including constitutively spliced exons in mouse dystrophin RNA. Splicomer reagents directed to Duchenne muscular dystrophy (DMD) RNAs might thus circumvent nonsense or frame-shifting mutations, leading to therapeutic expression of partially functional dystrophin, as occurs in the milder, allelic (Becker) form of the disease (BMD).
METHODS: Functional and hybridisation array screens have been used to select optim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dual-specificity protein kinase CLK4 plays a pivotal role in regulating alternative mRNA splicing, DNA repair, and various cellular processes through precise phosphorylation. In this study, we analyzed 3825 global human cellular phosphoproteome studies, identifying 430 qualitative profiles and 55 quantitative differential datasets featuring high-confidence Class-1 phosphosites (localization probability ≥ 75%; A-score ≥ 13). Notably, S136 and S138 emerged as predominant phosphorylation sites outside the kinase domain. These sites showed frequent detection and differential expression in liver, l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study reports a family with chronically abnormal blood liver function tests (LFT) and congenital hypofibrinogenemia. The proposita had cirrhosis initially related to alcohol abuse and chronic viral hepatitis C (HCV), but abnormal LFT persisted even when alcohol intake was stopped and despite HCV treatment was efficient based on serum RNA negative testing.
RESULTS: Needle biopsy specimens of the proposita and her brother showed eosinophilic intra-cytoplasmic inclusions that reacted strongly with fibrinogen antisera on direct immunofluorescence. Electron microscopic examinati
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing is a finely regulated process which defines the final maturation of pre-mRNAs. Modulation of trans-acting spliceosome proteins changes specific patterns of splicing and contributes to the development of diseases. During Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) disease progression, loss of nuclear trans-acting splicing protein TDP43 leads to accumulation of cryptic exons in mRNAs, which inhibits expression of proteins and aggravates the disease. One of the affected genes is DNAJC5, which codes for a protein responsible for clearance of misfolded proteins in the cytoplasm. We fir
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The craniofacial disorder mandibulofacial dysostosis Guion-Almeida type is caused by haploinsufficiency of the U5 snRNP gene EFTUD2/SNU114. However, it is unclear how reduced expression of this core pre-mRNA splicing factor leads to craniofacial defects. Here we use a CRISPR-Cas9 nickase strategy to generate a human EFTUD2-knockdown cell line and show that reduced expression of EFTUD2 leads to diminished proliferative ability of these cells, increased sensitivity to endoplasmic reticulum (ER) stress and the mis-expression of several genes involved in the ER stress response. RNA-Seq analysis of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Growing oocytes accumulate maternal mRNA to support subsequent meiotic maturation and maternal-to-zygotic transition. However, the regulatory mechanisms governing the fate of these maternal mRNAs remain largely unknown. Here, we identified heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M (hnRNPM) as a critical regulator of pre-mRNA alternative splicing during mouse oocyte development. Genetic ablation of hnRNPM leads to severe cytoplasmic defects, meiotic arrest, and complete female infertility. Using SCAN-seq, we uncovered novel transcript isoforms and systematically characterized hnRNPM-regulated a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the early step of RNA splicing, U2AF1 and U2AF2 form a heterodimer that binds to the 3' exon-intron junction to define the 3' splice site. Mutations of U2AF1 dysregulate the splicing process and are frequently observed in subtypes of hematological neoplasms. No potent inhibitor of U2AF1 has been reported. Here, we report on the development of AP232 that targets the U2 auxiliary homology motif (UHM) of U2AF1, based on our previously reported SF153. We showed that AP232 had a 31-fold improvement in IC50 over SF153 against U2AF1 and demonstrated a 3-24-fold selectivity against other UHM protei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The calcium voltage-gated channel subunit alpha1 F (CACNA1F) gene-related retinal disorders have overlapping clinical symptoms and no definitive genotype-phenotype correlation, posing a challenge for diagnosis.
METHODS: A comprehensive ocular examination was offered to a 6-year-old boy and his elder brother from a Chinese family. Exome sequencing and Sanger sequencing were applied to the family quads. A minigene assay was used to detect the aberrant splicing.
RESULTS: The 6-year-old boy presented with low visual acuity, congenital nystagmus, and reduced photopic and scotopic resp
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital atransferrinemia is an extremely rare autosomal recessive disorder resulting in the complete absence or extremely reduced amount of transferrin. In this study, we describe the first case of congenital atransferrinemia in Tunisia and the 18th patient in the reported data. The patient was referred to our hospital to explore a severe hypochromic and microcytic anemia. The laboratory evaluation including hematological and biochemical examination was performed in the proband and her parents. All exons of the transferrin gene were PCR amplified. The products were screened for mutations by
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal recessive woolly hair (ARWH) is characterized by short and tightly curled scalp hair without any obvious complications. The disease is known to be caused by either lipase H (LIPH) or LPAR6 genes. Proteins encoded by these two genes are closely related to each other in a lipid-signaling pathway that is believed to play crucial roles in hair follicle development and hair growth. In the Japanese population, most affected individuals with ARWH have been shown to carry two prevalent founder mutations in the LIPH gene, c.736T>A (p.Cys246Ser) and c.742C>A (p.His248Asn), while other LIPH mut
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic hyalinosis is a rare autosomal recessive inheritance disease characterized by accumulation of amorphous, unidentified hyaline material in skin and other organs, which leads to papulonodular skin lesions, gingival hypertrophy, flexion contractures of the joints, and large subcutaneous tumors. It is composed of 2 allelic syndromes, infantile systemic hyalinosis and juvenile hyaline fibromatosis. Here we describe a patient with juvenile hyaline fibromatosis confirmed by clinical and histopathologic findings, and genetic analysis, which revealed a novel homozygous splice site mutation IVS
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sialidosis is a lysosomal storage disease characterized by accumulation of sialylated oligosaccharides in tissues, blood and urine and is caused by mutations in the gene for lysosomal alpha-neuraminidase (NEU1). There is wide variability in the age of onset and severity of symptoms in sialidosis. We report here a case of sialidosis due to novel mutations in NEU1 presenting as severe nonimmune hydrops fetalis.
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cellular protein, previously described as p35/38, binds to the complementary (-)-strand of the leader RNA and intergenic (IG) sequence of mouse hepatitis virus (MHV) RNA. The extent of the binding of this protein to IG sites correlates with the efficiency of the subgenomic mRNA transcription from that IG site, suggesting that it is a requisite transcription factor. We have purified this protein and determined by partial peptide sequencing that it is heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) A1, an abundant, primarily nuclear protein. hnRNP A1 shuttles between the nucleus and cytoplasm
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования