BACKGROUND: Ulcerative colitis (UC) is a chronic relapsing inflammatory bowel disease characterized by persistent mucosal inflammation and epithelial barrier disruption. Emerging evidence suggests that metabolic reprogramming plays a pivotal role in regulating immune responses and epithelial homeostasis in UC. However, the key metabolic-immune regulatory genes and their cellular mechanisms remain poorly defined.
METHODS: We integrated publicly available genome-wide association study (GWAS) summary statistics for UC (n = 394,626), along with expression quantitative trait loci (eQTL) resources
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The scarcity of reliable biomarkers and predictive models for platinum resistance in lung adenocarcinoma (LUAD) poses a significant clinical challenge. This study endeavors to identify molecular subtypes related to platinum resistance and construct a robust predictive model through multi-omics techniques. We performed integrative analysis of public datasets using advanced bioinformatics strategies, including spatial transcriptome deconvolution and consensus clustering. Bulk RNA deconvolution analysis was conducted to characterize tumor microenvironment heterogeneity. Feature selection was perf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-small cell lung cancer (NSCLC) is often presented as a success story for precision oncology, but that success remains uneven. Targeted agents and immune checkpoint inhibitors have changed treatment for molecularly defined or immune-responsive tumors, yet many patients relapse as resistant clones emerge, tumor cells shift state, and local immune pressure changes across the lesion. Bulk genomic and transcriptomic assays have been useful for clinical stratification, but they average signals across mixed cell populations and therefore miss rare resistant cells, transient drug-tolerant states,
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic determinants are central to ulcerative colitis (UC) pathogenesis, yet their identification via single-cell transcriptomics and clinical translation remains incomplete. We integrated GWAS-eQTL data with UC-related differentially expressed genes (DEGs) to screen causal genes, mapped them in single-cell datasets, and prioritized Epoxide Hydrolase 2 (EPHX2) due to the key role of intestinal epithelial cells (IECs) in UC. Colitis mouse and in vitro inflammation models were used to validate EPHX2 expression. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) and functional assays explored its role in mecha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioma stem cells (GSCs) drive tumor heterogeneity, therapy resistance, and immunosuppression. This study identified molecular subtypes of glioma based on stemness-related genes and validated a key hub gene through bioinformatics and experiments. A stemness gene set was compiled from single-cell data, GeneCards, and MSigDB. Consensus clustering (NMF) on 157 glioma samples from GSE4290 revealed two subtypes (C1 and C2), with C1 showing higher stemness scores. C1 exhibited enriched DNA repair, proliferation, and metabolic pathways, plus greater temozolomide (TMZ) resistance and M2 macrophage inf
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometriosis (EMS) is a common gynecological disease that seriously affects women's health and quality of life. However, the detailed dynamic cellular and molecular mechanisms underlying EMS pathogenesis remain largely unknown. This study establishes a novel diagnostic model to distinguish ectopic endometrium (EC) from eutopic endometrium (EU) samples. This study elucidated the critical role of low-density lipoprotein receptor-related protein 1 (LRP1) in EMS pathogenesis through integrated multi-omics analyses. Our comprehensive approach began with merging three GEO datasets (GSE7305, GSE1169
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Diabetic macrovascular complications continue to drive substantial morbidity, yet early detection tools and deeper mechanistic understanding remain scarce. This study aimed to pinpoint circulating protein biomarkers for diabetic macrovascular complications while elucidating their biological significance.
METHODS: We combined proteome-wide Mendelian randomization (MR), Cox proportional hazards regression, and proteome-wide association study (PWAS) to rank priority proteins. From these prioritized proteins, we constructed a machine learning-derived protein risk score. Functional enri
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effects of dietary rumen-protected glucose (RPG) supplementation on Dumengsa sheep growth performance, meat quality, and transcriptomic and metabolomic profiling are reported. Twelve sheep were randomly assigned to a control (basal diet, n = 6) or RPG (basal diet +1.0% RPG, n = 6) group for 100 d. RPG increased serum malondialdehyde (P = 0.015) and cholesterol (P = 0.046) concentrations, enhanced intramuscular fat content (P = 0.016), and tended to produce lower meat lightness (P = 0.072), redness (P = 0.053), and hue angle (P = 0.072) values. In total, 319 differentially expressed genes a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
India is undergoing a rapid demographic transition, with its elderly population projected to exceed 347 million by 2050. Although aging is the primary risk factor for multiple chronic diseases, most biological age (BA) models have been developed for Western populations, with limited applicability to Indian demographics. The BHARAT study (Biomarkers of Healthy Aging, Resilience, Adversity, and Transitions) aims to develop and validate composite signatures of aging in the Indian population by integrating multi-omics, biochemical, clinical, and lifestyle data. The BHARAT study is a multi-center,
СтатьяНаблюдательное исследованиеМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background & Purpose: While inflammation and oxidative stress contribute to renal injury, evidence linking dietary inflammatory/antioxidant potential to chronic kidney disease (CKD) incidence remains limited. We investigated associations of the Energy-adjusted Dietary Inflammatory Index (E-DII) and the Composite Dietary Antioxidant Index (CDAI) with CKD risk across Cardiovascular-Kidney-Metabolic (CKM) stages, and elucidated underlying mechanisms through multi-omics profiling. Methods: in this prospective analysis of 179 493 UK Biobank participants, dietary indices were derived from 24 hour re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dibutyl phthalate (DBP), a widespread environmental contaminant, induces hepatotoxicity. While the gut-liver axis is implicated, the specific role of gut microbiota, particularly key beneficial genera, remains obscure.
OBJECTIVE: This study aimed to elucidate whether Lactobacillus depletion is a central event in DBP-induced gut-liver axis disruption and to evaluate the therapeutic potential of probiotic intervention.
METHODS: Mice were exposed to DBP (0, 50, 100, 200 mg/kg/day) for 28 days. An intervention group received DBP (100 mg/kg/day) co-administered with Lactobacillus rham
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we systematically investigated bladder cancer-related gene signatures using a toxicogenomics-informed framework, with particular attention to genes associated with lactylation-related pathways. Multi-omics data from the Gene Expression Omnibus (GEO) and The Cancer Genome Atlas (TCGA) were integrated, and Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA), a toxicology database, and lactylation-related gene sets were combined for intersection screening. Machine learning algorithms, including LASSO, SVM, and random forest, were then applied to identify key genes. Four prioritize
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of multidrug-resistant Pseudomonas strains poses a serious threat to public health. Essential oil components, such as thymol (TH), exhibit potent antibacterial activity. However, the effects of continuous sublethal TH exposure and resulting changes to antibiotic susceptibility remain poorly understood. Here, we investigated a multi-resistant Pseudomonas psychrophila strain after TH adaptation using an integrated transcriptomic and metabolomic approach. Treatment with TH caused a significant decrease in MIC values for aminoglycosides (streptomycin, gentamicin, kanamycin) and tetra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute kidney injury (AKI) remains a major clinical challenge lacking effective pharmacological interventions. Ferroptosis has emerged as a critical mechanism contributing to renal tubular injury. While p-coumaric acid (pCA), a natural phenolic compound, has been reported to exert renoprotective effects, its regulatory role in ferroptosis, particularly under different pathological contexts of AKI, remains incompletely understood.
METHODS: A folic acid (FA, 250 mg/kg)-induced AKI model was established in mice treated with pCA (10 and 50 mg/kg). Renal function, histopathology, inflam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Musculoskeletal injuries comprise a growing source of disability worldwide, and the recovery of muscle strength following injury is a critical determinant of patient reported outcomes. Females experience exacerbated muscle atrophy, poorer outcomes, and higher re-injury rates, necessitating a comprehensive interrogation of sex-specific skeletal muscle differences. Our purpose in the current study was to perform an unbiased transcriptomic profiling of muscle samples to identify putative sex-specific molecular targets to enhance recovery in patients who underwent anterior cruciate lig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the potential role of the environmental pollutant tris(2-butoxyethyl) phosphate (TBOEP) in the pathogenesis of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) and to elucidate its underlying molecular mechanisms.
METHODS: We employed an integrated multi-omics approach. First, a multidatabase strategy identified overlapping targets between TBOEP and MASLD, which were subjected to functional enrichment and protein-protein interaction (PPI) network analysis. Molecular docking was then used to predict binding affinities. Second, transcriptomic profiling
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aortic aneurysm (AA) is a life-threatening vascular disorder characterized by smooth muscle cell (SMC) phenotypic switching. However, SMC heterogeneity and the regulatory mechanisms underlying this transition remain incompletely understood.
METHODS: We integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing (scATAC-seq) data from healthy and AA-affected human aortic tissues to characterize SMC heterogeneity. Computational analyses, trajectory inference, and pathway enrichment analyses were performed. Key findings were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lgr5+ stem cells play crucial roles in maintaining intestinal epithelial cell homeostasis. However, the cellular heterogeneity and underlying regulatory programs of Lgr5+ small intestinal stem cells (ISCs) remain elusive. In this study, we profiled gene expression and chromatin accessibility of Lgr5+ ISCs at single-cell resolution to gain a deeper understanding of the lineage specification and early fate determining mechanisms. Our analysis identified a total of 6 subsets of Lgr5+ cell populations, which exhibited heterogeneity in gene expression and chromatin structure. We found that early fa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Down syndrome (DS), caused by trisomy of chromosome 21, is associated with a high prevalence of congenital non-autoimmune thyroid dysfunction, typically characterized by an elevated serum thyroid stimulating hormone (TSH) concentration. Early-life observational studies and fetal cordocentesis data, consistently reporting elevated TSH levels, suggest a developmental origin. However, the underlying pathophysiological mechanism remains unclear. This study aimed to investigate the molecular and developmental features underlying thyroid dysfunction in DS.
METHODS: Thyroid tissue of fet
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ulcerative colitis (UC) is a chronic inflammatory bowel disease with elusive etiology and limited therapeutic options, accompanied by potential side effects. In this study, to investigate the therapeutic potential of Antarctic krill oil (AKO) in a dextran sulfate sodium (DSS)-induced mouse colitis model, animal experiments, molecular assays, transcriptomics, metabolomics, and 16S rRNA gene sequencing were conducted. Our results revealed that supplementation of AKO significantly alleviated colitis symptoms, such as weight loss, and inflammatory responses. Moreover, multi-omics analyses demonstr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования