Retinal pigment epithelium (RPE) degeneration is a major cause of vision loss in multiple retinal diseases, including age-related macular degeneration, Bietti crystalline dystrophy and Stargardt disease. Induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived RPE cells hold promise for regenerative therapies. B27- and KSR-based media are among the most commonly used for RPE culture; however, how these culture conditions shape RPE cell identity and features remain incompletely understood. Here, we performed comprehensive transcriptomic and metabolomic profiling of iPSC-derived RPE cells cultured in B27 or
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salicylate reliably induces tinnitus, yet its systemic effects on the central auditory and limbic systems remain incompletely characterized. Through integrated transcriptomic and metabolomic profiling of the rat cochlear nucleus and hippocampus, we observed pronounced region-specific remodeling following chronic tinnitus-inducing salicylate treatment. All differential and enrichment analyses were filtered using a nominal p-value cutoff (p < 0.05) without multiple-testing correction; thus, the findings should be interpreted as exploratory. We identified 150 differentially expressed genes (DEGs)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol-related liver disease (ALD) is a major cause of liver-related morbidity and mortality worldwide, yet the associations linking alcohol-induced gut microbial alterations to metabolic remodeling and hepatocyte dysfunction remain incompletely understood. Here, we applied an integrative multi-omics strategy combining untargeted fecal metabolomics, shotgun metagenomics, mouse liver bulk RNA sequencing, and reanalysis of publicly available human hepatic single-cell and bulk transcriptomic datasets to characterize alcohol exposure-associated gut-liver immunometabolic features. In a mouse model
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP) is a common inflammatory disease with complex pathogenesis. This study aims to screen out key molecular markers and potential therapeutic targets through multi-omics data integration.
METHODS: Single-cell RNA sequencing data (GSE276503) and transcriptome data (GSE136825, GSE179265) from the GEO database were integrated. Quality control, normalization, clustering, annotation, multi-omics Integration and in Vitro Validation were performed.
RESULTS: 4460 differentially expressed genes and 732 hub genes were identified. MR yielded 167
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Cellular heterogeneity limits causal inference in complex diseases. We applied an established cell-type-stratified Mendelian randomization (csMR) framework, originally developed by Hao et al. (2024), to investigate whether lipid phenotypes affect kidney disease through distinct brain cell populations, extended by a proteome-wide mediation component. Methods: Using Bayesian colocalization (posterior probability of hypothesis 4 [PPH4], ≥0.8) and multidimensional instrumental variable selection, we evaluated cell-type-stratified MR-supported associations of five lipid traits across te
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Migraine is a complex neurovascular disorder in which immune signaling intersects with vascular and neural circuits, yet the tissue and cell-type context of common genetic risk remains incompletely defined. We integrated large-scale migraine genome-wide association study (GWAS) summary statistics with Genotype-Tissue Expression (GTEx) v8 expression and splicing quantitative trait loci (eQTLs and sQTLs), Bayesian co-localization, single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from migraine cases and controls, a healthy single-cell multi-omics atlas (assay for transposa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gestational diabetes mellitus (GDM) and hypertensive disorders of pregnancy (HDP) are common metabolic complications during pregnancy. GDM is an independent risk factor for HDP, while HDP is a major contributor to maternal and perinatal morbidity and mortality. Reliable early tools for identifying women with GDM who are at risk of subsequently developing HDP remain limited. This study aimed to integrate metabolomic, lipidomic, and clinical data to identify reproducible candidate biomarkers associated with subsequently diagnosed HDP in women with GDM and to characterize the accompan
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) patients with Clonorchis sinensis (Cs) infection tend to exhibit a poorer prognosis compared to those without infection. Nevertheless, the molecular mechanisms underlying Cs-associated HCC, particularly those linked to metastatic progression, remain poorly understood. This study therefore seeks to elucidate the role of C. sinensis infection in promoting metastasis.
METHODS: Through a clinical retrospective analysis, we compared overall survival and metastasis incidence between HCC patients with and without Cs infection. To explore the underlying mech
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic hepatitis B virus (HBV) infection is a major etiology of hepatocellular carcinoma (HCC), with cancer stem cells (CSCs) playing a critical role in tumor progression and therapeutic resistance. However, the specific mechanisms linking HBV infection to stemness features in HBV-associated HCC (HBV-HCC) remain incompletely defined. To identify potential regulators, we conducted an integrated in silico multi-omics analysis using single-cell and bulk transcriptomic datasets. Comparative stemness scoring across major cell populations prioritized the endothelial compartment for further analysis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemotherapy remains the primary treatment for pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), but most patients ultimately develop resistance. Here, we established 260 pancreatic cancer organoid lines, followed by extensive multi-omics profiling and therapeutic sensitivity assessments. Integrated analyses uncovered 6 novel coding and 35 noncoding driver candidates. We discovered 2,794 multi-omics features associated with drug sensitivity and 322 features linked to radiation sensitivity. Pharmacogenomic analyses revealed that chemoresistant organoids exhibited enrichment in protein glycosylation and
СтатьяКлиническое исследование II фазыПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The limited response rates of immune checkpoint inhibitors in biliary tract cancers (BTC) highlight the need for effective biomarkers to optimize patient selection.
METHODS: Baseline tumor tissues from 125 patients with advanced BTC treated with first-line chemoimmunotherapy (chemoIO) were analyzed using targeted DNA sequencing and bulk RNA sequencing. In vitro and in vivo experiments were conducted to investigate the role of identified biomarkers in BTC.
RESULTS: Mutations in TP53, BRCA2, cytokine genes, and high tumor mutation burden were significantly associated with treatment
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most common endocrine carcinoma in recent years, necessitating more precise risk stratification to accurately identify low-risk patients. Although preliminary evidence exists, studies on lysosomes in PTC are limited. This study utilized multi-omics data from the TCGA database to comprehensively investigate the genomic and biological characteristics of lysosomes in PTC patients and identify lysosome-associated genes (LAGs) linked to PTC prognosis. We developed a LAG scoring system for risk stratification based on the expression levels of risk coefficient
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The endometrium is a proliferative tissue controlled by the menstrual cycle. Endometrial hyperplasia (EH) is a type of neoplastic disease that may develop into endometrial hyperplasia with atypia (EHA) or endometrial adenocarcinoma (EA). We performed a multi-omics analysis of a collection of endometrial tissues with four different proliferative statuses from two independent cohorts of patients. A positive association between the level of glutamine and malignancy, as well as addiction of EHA/EA neoplasms to glutamine, was identified. Further investigation revealed the dual mechanism by which gl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Hepatocellular carcinoma (HCC) exhibits substantial morphological and biological heterogeneity. Clinical and molecular relevance of the infiltrative subtype remains poorly defined in the context of cancer immunotherapy. We aimed to evaluate the prognostic impact and molecular features of infiltrative HCC in patients treated with first-line atezolizumab plus bevacizumab (Ate/Bev).
METHODS: We included 307 patients with advanced HCC treated with Ate/Bev and classified them into four gross morphological types based on imaging. Multi-omics profiling was conducted on tumor samples
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Perfluorooctane sulphonate (PFOS) is a persistent environmental contaminant with well-documented hepatotoxic properties. Nicotinamide, the amide derivative of vitamin B3, is widely utilized as a nutritional supplement and exerts multiple biological benefits. Nonetheless, its potential protective effects against PFOS-induced hepatotoxicity have not yet been reported. Methods: Male mice were administered PFOS (10 mg kg-1) or vehicle by gavage for 28 days. Transcriptomics, proteomics, machine learning, and network topology algorithms were integrated to identify candidate biomarkers. U
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: COVID-19 has caused over 7 million deaths worldwide since its onset in 2019, and the virus remains a significant health threat. Identifying sensitive and specific biomarkers, along with elucidating immune-mediated mechanisms, is essential for improving the diagnosis, treatment, and prevention of COVID-19. To predict key molecular markers of COVID-19 using an established multi-omics framework combined with machine learning models.
METHODS: We conducted an integrated analysis of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), bulk RNA sequencing, and proteomics data to identify critical b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Tumor Metabolic Behavior modulates the immunosuppressive microenvironment through multiple pathways, thereby compromising anti-tumor immune responses. To date, there have been limited studies assessing the role of metabolic plasticity or immunometabolism in the tumor microenvironment (TME) during metastasis. Notably, emerging evidence suggests the presence of an immunosuppressive niche in brain metastases. This research aims to delineate distinct metabolic signatures in brain metastatic, investigate the impact of tumor-associated glycolysis on the development of brain metastases in lu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Benign prostatic hyperplasia (BPH) is a prevalent age-associated urological disorder marked by excessive proliferation of epithelial and stromal cells within the prostate. Resveratrol (Res), a naturally occurring polyphenol, has shown potential in treating various inflammatory and hyperproliferative disorders, yet its pharmacological mechanisms in BPH remain unclear.
PURPOSE: This study sought to comprehensively identify the therapeutic targets and signaling pathways underlying the protective effects of Res against BPH by combining network pharmacology, multi-omics analyses, molec
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Red blood cells (RBCs), essential for oxygen transport and carbon dioxide removal, are pivotal for maintaining systemic metabolic homeostasis. However, global blood shortages and limitations in current transfusion practices underscore the urgent need for alternative sources, such as in vitro-generated RBCs. Among these, induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived RBCs have gained attention for their potential patient-specific, pathogen-free, and immunologically compatible solutions. Yet, conventional assays of RBC function provide only a partial view of the complex molecular progr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging and cognitive impairment increase the risk for Alzheimer's disease (AD), and growing evidence suggests that transposable elements (TEs) in the genome play a role in aging and AD. The mechanisms of TE dysregulation in this context are unclear, but one possibility is that epigenetic changes, including DNA hypomethylation and/or reduced chromatin structure, underlie age- and AD-related TE activity. Therefore, the purpose of the present study was to generate a resource for studying TE epigenetics in aging and AD, and to use it to determine if epigenetically dysregulated TEs are related to ag
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования