Rift Valley fever virus (RVFV) is a member of the genus Phlebovirus within the family Bunyaviridae. It is a mosquito-borne zoonotic agent that can cause hemorrhagic fever in humans. The enveloped RVFV virions are known to be covered by capsomers of the glycoproteins G(N) and G(C), organized on a T=12 icosahedral lattice. However, the structural units forming the RVFV capsomers have not been determined. Conflicting biochemical results for another phlebovirus (Uukuniemi virus) have indicated the existence of either G(N) and G(C) homodimers or G(N)-G(C) heterodimers in virions. Here, we have stud
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryogenic electron tomography (cryo-ET) enables three-dimensional visualization of cellular structures and macromolecular assemblies in near-native states. However, tomographic reconstructions and segmented models can be difficult to interpret without effective visualization tools that place structural features within their broader cellular context. This protocol describes a workflow for integrating cryo-ET segmentations with illustrative three-dimensional models in Blender 5.2, a free and open-source platform for modeling, rendering, and animation. The workflow includes preparing segmented vo
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dynamics and physical state of chromatin are crucial in regulating gene expression, DNA replication, and repair. Intrinsically disordered histone tails were previously recognized as key modulators of chromatin states. However, detailed atomistic mechanisms by which histone tail dynamics are associated with chromatin compaction and higher-order chromatin organization remain poorly understood. In this work, we combine extensive all-atom molecular dynamics simulations of tri-nucleosomes with varying linker lengths and cryo-electron tomography (cryo-ET) of native nucleosome arrays. Our approach of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photosystem II (PS II) is a large membrane-bound pigment-protein complex responsible for extracting electrons and protons from water during photosynthesis and releasing molecular oxygen into the atmosphere. While light is required to drive the photochemical reactions, high light and high temperature can be damaging to PS II. To gain insight into potential structural consequences of such conditions, we performed an exploratory study where isolated PS II complexes (C2S2) from Arabidopsis thaliana were exposed to high light and elevated temperature and employed cryo-electron microscopy for struct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus (DENV) continues to impose a global health burden, and virus-like particles (VLPs) are promising vaccine candidates, owing to their ability to elicit broadly neutralizing antibodies. However, the lack of nanoscale structural insights into the VLP maturation process has limited rational engineering. Here, we report the cryo-electron microscopy (cryo-EM) structure of immature DENV serotype 2 VLPs, revealing prM-E spikes arrayed on a T = 1 shell, consistent with mature DENV-2 VLPs and distinct from the virion, which exhibits a T = 3 icosahedral lattice. To connect the experimentally
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide synthase (NOS) is a widely studied multidomain redox enzyme that produces the key signaling molecule and cytotoxic agent nitric oxide (NO) for functions that range from mammalian vasodilation to prokaryotic antibiotic resistance. NOS enzymes from metazoans and cyanobacteria rely on dynamic associations of their oxygenase and coupled diflavin reductase domains that have largely evaded detailed structural characterization. Cryo-electron microscopy studies of a representative dimeric six-domain Synechococcus NOS reveal the architecture of the full-length enzyme, which contains an unu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophages are increasingly considered viable alternatives to antibiotics for controlling aquaculture pathogens, yet the structural basis of siphophage infection in aquatic bacteria remains largely unexplored. Here, we present the near-atomic-resolution cryo-electron microscopy structure of Avs-1, a siphophage infecting the freshwater aquaculture pathogen Aeromonas veronii. The capsid reconstruction at 2.98 Å and spike structure at 3.58 Å reveal a virion architecture broadly conserved among lambda-like siphophages, including an HK97-fold capsid, a canonical portal-neck complex, and a tail
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryo-electron microscopy (CryoEM) has revolutionized structural biology, establishing itself as a versatile and powerful technique for determining protein structures at near-atomic resolution. Compared to X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR), it enables the study of proteins across a broad molecular weight range in their native state and captures multiple conformational states without requiring crystallization or large amounts of sample. The protocol described herein focuses on the eukaryotic chaperonin CCT (Chaperonin Containing TCP-1), a 1 MDa protein complex whose flex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Collagen, the major structural protein in the animal extracellular matrix, forms a triple helix that resists proteolysis and requires specialised enzymes for degradation. Flesh-eating bacteria secrete collagenases that unwind the collagen triple helix and processively trim Gly-X-Y triplet repeats, yet the molecular basis of this process has remained obscure. Here, cryo-electron microscopy reveals how Hathewaya histolytica collagenase ColH engages its substrate and exploits the helix's architecture for catalysis. ColH encircles a single collagen triple helix in a closed-ring conformation and, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many antibiotics are ineffective against the Gram-negative pathogen Pseudomonas aeruginosa because of intrinsic defence mechanisms, such as the impermeable bacterial outer membrane. Here, we show that protein antibiotics called L-type pyocins kill P. aeruginosa by inhibiting the β-barrel assembly machinery (BAM) complex at the cell surface, halting outer-membrane protein assembly. Using single-particle cryo-electron microscopy, we show that L-type pyocins bind a surface-exposed region of BamA and deploy a C-terminal peptide that competitively inhibits the BAM complex, demonstrating that cell e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arabidopsis PHOSPHATE 1 (AtPHO1) and its closest homologue AtPHO1;H1 are phosphate transporters that load phosphate into the xylem vessel for root-to-shoot translocation. AtPHO1 and AtPHO1;H1 are prototypical members of the unique SPX-EXS family, whose structural and molecular mechanisms remain elusive. In this study, we determined the cryogenic electron microscopy structure of AtPHO1;H1 binding with inorganic phosphate (Pi) and inositol hexakisphosphate in a closed conformation. Further molecular dynamic simulation and AlphaFold prediction support an open conformation. AtPHO1;H1 forms a domai
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid fibrils adopt diverse structural polymorphs linked to disease-specific phenotypes, but the thermodynamic principles guiding their formation and maturation remain unclear. Here, we apply energetic profiling to structural time series from cryo-EM datasets of IAPP, tau, and α-synuclein to decode the principles governing fibril maturation and polymorphic divergence. By mapping residue-level free energy contributions across experimentally resolved assembly pathways, we reconstruct their maturation trajectories and find that amyloid assembly is anchored by aggregation-prone regions that serv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Schlafen (SLFN) family of proteins are a group of DNA/RNA processing enzymes with emerging importance in human health and disease, where their functions are implicated in a variety of immunological and anti-tumor processes. Here, we present the cryo-electron microscopy structure of full-length human SLFN14, a member with antiviral activity and linked to an inherited bleeding disorder. SLFN14 is composed of an RNase domain, a SWADL domain, and a two-lobe helicase domain. SLFN14 exhibited strong RNase activity over different substrates, and the positively charged patches at the valley of the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In many proteinopathies, the relative conformations of amyloid fibrils versus smaller oligomers remain unclear. Most tissue-derived isolates of infectious prion protein (PrP) prions are predominantly fibrillar. A few studies have asserted that prion amyloid fibrils efficiently disassemble into dimeric to tetrameric "elemental bricks" under certain detergent or chaotropic conditions, but our companion paper provides strong evidence to the contrary. Given our difficulties in isolating detectable amounts of small oligomeric (2-4-mer) prions, we performed molecular dynamics simulations to test the
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Cryogenic electron microscopy (cryo-EM) is a core experimental technique used to determine the structure of macromolecules such as proteins. However, the effectiveness of cryo-EM is often hindered by the noise and missing density values in cryo-EM density maps caused by experimental conditions such as low contrast and conformational heterogeneity. Although various global and local map-sharpening techniques are widely employed to improve cryo-EM density maps, it is still challenging to efficiently improve their quality for building better protein structures from them.
RESULTS: In t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global resurgence of multidrug-resistant Salmonella species, responsible for millions of annual infections, underscores the urgent need for alternative antimicrobial strategies, such as phage therapy. Microviridae phages offer a promising model for studying phage-host interactions with their unique structural and infection mechanisms. Here, we identify two Microviridae phages, PJNS001 and PJNS002, with different host receptor dependencies, and determine their cryo-EM structures at 2.68 Å and 2.59 Å resolution, respectively. These icosahedral capsids with T = 1 symmetry exhibit a unique ver
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pendrin (SLC26A4) is an anion exchanger that mediates bicarbonate (HCO3-) exchange for chloride (Cl-) and is crucial for maintaining pH and salt homeostasis in the kidney, lung, and cochlea. Pendrin also exports iodide (I-) in the thyroid gland. Pendrin mutations in humans lead to Pendred syndrome, causing hearing loss and goiter. Inhibition of pendrin is a validated approach for attenuating airway hyperresponsiveness in asthma and for treating hypertension. However, the mechanism of anion exchange and its inhibition by drugs remains poorly understood. We applied cryo-electron microscopy to de
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomes catalyze protein synthesis by cycling through various functional states. These states have been extensively characterized in vitro, but their distribution in actively translating human cells remains elusive. We used a cryo-electron tomography-based approach and resolved ribosome structures inside human cells with high resolution. These structures revealed the distribution of functional states of the elongation cycle, a Z transfer RNA binding site, and the dynamics of ribosome expansion segments. Ribosome structures from cells treated with Homoharringtonine, a drug used against chroni
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human α-synuclein protein, identified as one of the main markers of Parkinson's disease, is a 140-amino acid thermostable protein that can easily be overexpressed in E. coli. The purification protocol determines the ability of the protein to assemble into amyloid fibrils of well-defined structures. Here, we describe the purification and assembly protocols to obtain three well-characterized amyloid forms (ribbon, fibrils, and fibril-91) used to assess their activity in biochemical and cellular assays or to investigate their atomic structure by cryo-electron microscopy and solid-state NMR.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variants of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) are emerging rapidly and offer surfaces that are optimized for recognition of host cell membranes while also evading antibodies arising from vaccinations and previous infections. Host cell infection is a multi-step process in which spike heads engage lipid bilayers and one or more angiotensin-converting enzyme 2 (ACE-2) receptors. Here, the membrane binding surfaces of Omicron subvariants are compared using cryo-electron microscopy (cEM) structures of spike trimers from BA.2, BA.2.12.1, BA.2.13, BA.2.75, BA.3, BA.4, and B
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования