PURPOSE: CONCORDE is the first phase I drug-radiotherapy (RT) combination platform in non-small-cell lung cancer, designed to assess multiple different DNA damage response inhibitors in combination with radical thoracic RT. Time-to-event continuous reassessment method (TiTE-CRM) methodology will inform dose escalation individually for each different DNA damage response inhibitor-RT combination and a randomized calibration arm will aid attribution of toxicities. We report in detail the novel statistical design and implementation of the TiTE-CRM in the CONCORDE trial.
METHODS: Statistical param
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of vulvar lichen sclerosus (LS) remains unclear; however, alterations in cutaneous and gut microbiota may be contributing to the pathogenesis of this inflammatory condition. To explore this hypothesis, we conducted a pilot case-control study, obtaining dermal swab and stool samples from prepubertal girls with vulvar LS (n = 5), girls with nonspecific vulvovaginitis (n = 5), and healthy controls (n = 3). Samples (n = 56) were subjected to total DNA extractions. Resulting DNA was purified, subjected to PCR (targeting the V3V4 region of the 16S rRNA gene), sequenced, and analyzed usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The purpose of this study is to evaluate the sensitivity and specificity of free circulating DNA (FCDNA) as a biomarker in patients suffering from colorectal cancer (CRC), investigating both its prognostic value correlated with stage of disease and its potential role in early recurrence diagnosis.
METHODS: The quantification of plasma DNA was achieved through the use of real time quantitative polymerase chain reaction (PCR) amplification of the RNAse P gene. The study enrolled patients undergoing surgery for primary CRC, at different stages of disease; samples were collected befor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: This study investigated variations in DNA methylation patterns associated with chronic pain and propensity for recurrent pressure injuries (PrI) in persons with spinal cord injury (SCI).
METHODS: Whole blood was collected from 81 individuals with SCI. DNA methylation was quantified using Illumina genome-wide arrays (EPIC and EPICv2). Comprehensive clinical profiles collected included secondary health complications, in particular current PrI and chronic pain. Relationships between recurrent PrI and chronic pain and whether the co-occurrence of both traits was mediated by
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances, including the human genome project and numerous studies of cancer and other diseases, have shown that the genetic code is not simply limited to the sequence of the four bases of DNA but also includes epigenetic programming, heritable changes that affect gene expression [Riggs A, Martinssen R, Russo V (2007) Introduction. In: Riggs A, Martinssen R, Russo V (eds) Epigenetics mechanisms of gene regulation. Cold Spring Harbor Press, New York]. The science of epigenetics is important in understanding many diseases and biological processes, including in identifying the causes of dis
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new test for pathogenic Leptospira isolates, based on RAPD-PCR and high-resolution melt (HRM) analysis (which measures the melting temperature of amplicons in real time, using a fluorescent DNA-binding dye), has recently been developed. A characteristic profile of the amplicons can be used to define serovars or detect genotypes. Ten serovars, of leptospires from the species Leptospira interrogans (serovars Australis, Robinsoni, Hardjo, Pomona, Zanoni, Copenhageni and Szwajizak), L. borgpetersenii (serovar Arborea), L. kirschneri (serovar Cynopteri) and L. weilii (serovar Celledoni), were typ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To develop a PCR gel analysis method for assessing the bacterial bioburden in orthokeratology contact lens (OK) case fluid determined by culture.
METHODS: A prospective study with the participation of 41 OK wearers (20 girls, 21 boys) was performed. The mean OK-wearing experience was 3.5±1.9 years. PCR was used to assess the bacterial bioburden (colony-forming units per milliliter) of OK after removal and soaking in the storage case for 6 h. The signal intensity of the PCR bands was analyzed after grayscale image transformation. The difference (cPCR-d) and ratio (cPCR-r) between a PC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: During virion maturation, HIV-1 capsid protein assembles into a conical core containing the viral ribonucleoprotein (vRNP) complex, thought to be composed mainly of the viral RNA and nucleocapsid protein (NC). After infection, the viral RNA is reverse transcribed into double-stranded DNA, which is then incorporated into host chromosomes by integrase (IN) catalysis. Certain IN mutations (class II) and antiviral drugs (allosteric IN inhibitors [ALLINIs]) adversely affect maturation, resulting in virions that contain "eccentric condensates," electron-dense aggregates located outside s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Recent studies demonstrated a critical role of hip articular cartilage destruction in the development of osteonecrosis of the femoral head (ONFH). The aim of this study was to characterize the genome-wide DNA methylation profile of hip cartilage obtained from patients with ONFH and healthy subjects.
METHODS: Hip articular cartilage specimens were collected from 15 ONFH patients (including 11 males and 4 females) and 15 control subjects (including 11 males and 4 females) with femoral neck fracture. The average ages of the ONFH patients and control subjects were 50.27 ± 5.27 years an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: Aberrant DNA methylation plays a crucial role in the tumorigenesis of differentiated thyroid cancer (DTC); nevertheless, the factors leading to the local and regional recurrence of DTC are not well understood. This study aimed to establish the connection between DNA methylation-driven genes and the recurrence of DTC. Methods: RNA sequencing profiles and DNA methylation profiles of DTC were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. Combined application of the methylmix R package and univariate Cox regression analyses were used to screen and distinguish prognosis-related
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral manipulation of cellular proteins allows viruses to suppress host defenses and generate infectious progeny. Due to the linear double-stranded DNA nature of the adenovirus genome, the cellular DNA damage response (DDR) is considered a barrier to successful infection. The adenovirus genome is packaged with protein VII, a virally encoded histone-like core protein that is suggested to protect incoming viral genomes from detection by the cellular DNA damage machinery. We showed that protein VII localizes to host chromatin during infection, leading us to hypothesize that protein VII may affect
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alzheimer's disease (AD) is the most common neurodegenerative disease affecting the elderly, with its diagnosis at early stages crucial for effective intervention. Recent evidence increasingly supports the role of epigenetic alterations in AD pathogenesis, highlighting the need for innovative biomarkers that reflect these changes. This study aimed to characterize the genome-wide DNA methylation profiles of cell-free DNA in peripheral blood for potential biomarkers associated with AD.
METHODS: The Illumina Infinium array was utilized to detect the methylation patterns of circulatin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND CONTEXT: Emerging evidence suggests that abnormal DNA methylation patterns may play a role in the progression of adolescent idiopathic scoliosis (AIS). However, the mechanisms underlying the influence of DNA methylation on curve severity remain largely unknown.
PURPOSE: To characterize the DNA methylation profiles associated with the curve severity of AIS.
STUDY DESIGN: Retrospective study with prospectively collected clinical data and blood samples.
METHODS: A total of 7 AIS monozygotic twin pairs discordant for curve severity were included. Genome-wide methylation profile from
СтатьяTwin StudyПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ageing is associated with DNA methylation changes in all human tissues, and epigenetic markers can estimate chronological age based on DNA methylation patterns across tissues. However, the construction of the original pan-tissue epigenetic clock did not include skeletal muscle samples and hence exhibited a strong deviation between DNA methylation and chronological age in this tissue.
METHODS: To address this, we developed a more accurate, muscle-specific epigenetic clock based on the genome-wide DNA methylation data of 682 skeletal muscle samples from 12 independent datasets (18-8
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Morphogenesis of herpesvirus particles is highly conserved; however, the capsid assembly and genome packaging of human cytomegalovirus (HCMV) exhibit unique features. Examples of these include the essential role of the small capsid protein (SCP) and the existence of the β-herpesvirus-specific capsid-associated protein pp150. SCP and pp150, as well as the UL77 and UL93 proteins, are important capsid constituents, yet their precise mechanism of action is elusive. Here, we analyzed how deletion of the open reading frames (ORFs) encoding pUL77, pUL93, pp150, or SCP affects the protein composition
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetics studies mechanisms such as DNA methylation, histone modifications, non-coding RNAs, and alternative polyadenylation that can modify gene activity without changing the underlying DNA nucleotide base-pair structure. Because these changes are reversible, they have potential in developing novel therapeutics. Currently, seven pharmaceutical agents targeting epigenetic changes are FDA approved and commercially available for treatment of certain cancers. However, studies investigating epigenetics in chronic rhinosinusitis (CRS) have not been undertaken previously in the United
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: The study was conducted to investigate the frequency of MED12 gene (rs5030619) mutations and to evaluate DNA methylation patterns in uterine leiomyomas among women at a tertiary care hospital in Karachi, Pakistan. Methods: In this cross-sectional study, 200 women with uterine fibroids and 50 controls were recruited from tertiary care hospitals after ethical approval. Baseline data and history were collected. Serum levels of estradiol, progesterone, and FSH were measured. Genomic DNA was extracted from fibroid and myometrial tissues and analyzed using allele-specific PCR for MED12 ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helper-dependent adenoviral vectors (HDAdVs), which lack all viral coding sequences, enable the delivery of up to 35 kilobases (kb) of therapeutic DNA into target cells. This large packaging capacity facilitates the transfer of complex, large, or even multiple transgenes. Despite the technical complexity of their production, HDAdVs have been extensively evaluated in numerous preclinical studies, and several clinical trials have recently been initiated. This review provides a comprehensive, state-of-the-art overview of recent advances in the HDAdVs technology. It summarizes key strategies for v
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel lytic bacteriophage, PSA-KC1, was isolated from wastewater. In this study, the whole genome of the bacteriophage PSA-KC1 was analyzed, and its lytic properties were assessed. PSA-KC1 has a linear double-stranded DNA genome with a total length of 43,237 base pairs and a GC content of 53.6%. In total, 65 genes were predicted, 46 of which were assigned functions as structural proteins involved in genome replication, packaging or phage lysis. PSA-KC1 belongs to the genus Septimatrevirus under the Caudoviricetes class. The aim of this study was to investigate the efficacy of the lytic bacte
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenovirus vectors have become an important class of vaccines with the recent approval of Ebola and COVID-19 products. In-process quality at … l ultracentrifugation preparations of ChAdOx1 virus. The L1 52/55k viral protein is associated with DNA packaging and is cleaved during viral maturation, so it may be a marker for infective particles. TEM and LC-MS peptide mapping are promising higher-resolution analytical characterization tools to help differentiate between relative proportions of empty, non-i …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования