Epigenetic responses to cannabis use could link cannabis use to health problems. We examined the DNA-methylation profiles of long-term cannabis users in midlife, re-evaluating a set of 246 cannabis-associated methylation markers that were previously identified in other studies. Data were from the Dunedin Study, a five-decade longitudinal study of a birth cohort (analytic n = 787). Peripheral whole blood was drawn when the cohort was age 45, and DNA methylation was assayed using the EPIC 850 K BeadChip. Analyses compared long-term cannabis users with non-users and, for a benchmark comparison, l…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenome-wide association studies (EWAS) have identified CpG sites associated with HIV infection in blood cells in bulk, which offer limited knowledge of cell-type specific methylation patterns associated with HIV infection. In this study, we aim to identify differentially methylated CpG sites for HIV infection in immune cell types: CD4+ T-cells, CD8+ T-cells, B cells, Natural Killer (NK) cells, and monocytes.
METHODS: Applying a computational deconvolution method, we performed a cell-type based EWAS for HIV infection in three independent cohorts (Ntotal = 1,382). DNA methylation…
МетаанализСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aberrant DNA methylation occurs commonly during pathogenesis of neuroimmunological diseases and is of clinical value in various encephalitis subtypes. However, knowledge of the impact of DNA methylation changes on pathogenesis of leucine-rich glioma-inactivated 1 (LGI1) antibody encephalitis remains limited.
METHODS: A total of 44 cytokines and 10 immune checkpoint moleculars (ICMs) in the serum of patients with LGI1 encephalitis and healthy donors (HDs) were measured to evaluate the association of them with clinical parameters. Genome-wide DNA methylation profiles were performed …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Covering: 2021 to 2026Methyltransferases (MTs) using S-adenosyl-L-methionine (SAM) and its analogs enable highly selective alkylation reacti … gonality in complex reaction mixtures. Together, these advances extend transferase chemistry beyond methylation, opening new avenues in biocatalysis, drug discovery, synthetic-method development, and synthetic biology.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In eukaryotic ribosomes, ∼2% of RNA nucleotides undergo 2'-O-methylation, a conserved cellular mechanism thought to be critical for maintaining and regulating translation. Here, we use ribosome profiling, translation assays, proteomics, and high-resolution structural analyses to show that loss of native 2'-O-methylation in yeast ribosomes disproportionally affects the translation of ribosomal protein transcripts, driven by changes in codon usage and recognition of structured RNA. Translation reprogramming by the hypomethylated ribosomes is supported by reduced thermostability and high-resoluti…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: DNA methylation is a crucial epigenetic modification regulating gene expression, essential for embryonic development, cellular differentiation, and disease susceptibility. Aberrant methylation is associated with cancer, neurodegenerative and cardiovascular diseases, and imprinting disorders, highlighting the need for reliable biomarkers.
AREAS COVERED: This review summarizes six widely used DNA methylation analysis techniques: Methylation-Specific PCR (MSP), quantitative (qMSP), Methylation-Specific MLPA (MS- MLPA), Methylation-Sensitive High-Resolution Melting (MS-HRM), pyroseq…
СтатьяОбзорСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
mRNA plays a pivotal role in cellular processes of genetic information transfer, and post-transcriptional modifications of its nucleotides enable regulation of these processes with each particular mRNA. m5C methylation is a specific RNA modification that is rather common in tRNA, rRNA, lncRNA and other types of non-coding RNAs, whereas in mRNA it is found not very often. However, the functioning of m5C-methylated mRNAs differs from the non-methylated ones quite dramatically. Of the eight m5C RNA methyltransferases in humans, only two, NSUN2 and NSUN6, were found to be capable of modifying the …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic aging clocks based on DNA methylation patterns across the genome have emerged as a potential biomarker for risk of age-related diseases, like Alzheimer's disease (AD), and environmental and social stressors. However, methylation clocks have not been comprehensively validated in genetically diverse individuals. Here, we evaluate a set of first-, second-, and third-generation methylation clocks in 621 AD patients and matched controls from African American, Hispanic, and White cohorts. The clocks are less accurate at predicting age in genetically admixed cohorts compared to the White c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein arginine methylation (ArgMet) plays a crucial role in the regulation of cellular processes, including transcription, RNA processing, signal transduction, and DNA damage response. However, the mechanisms linking protein ArgMet dynamics to (patho)physiology remain unclear due to the lack of global analysis methods. In this chapter, we present a robust protocol for the quantification of global protein ArgMet, including asymmetric dimethylarginine, symmetric dimethylarginine, and monomethylarginine. After isolation of proteins from biological fluids, tissues, or cell lysates, a straightfor…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) RNA methylation plays a crucial role in tumorigenesis. However, the specific role of m6A modifications in the malignant progression of papillary thyroid carcinoma (PTC) without autoimmune thyroid disease (AITD) remains unclear. We analyzed a randomly selected subset of three pairs from a total cohort of 26 pairs of cancerous and para-cancerous tissues from patients with PTC without AITD to investigate global m6A levels and the gene expression of key factors driving m6A methylation. Our results revealed a significant increase in global m6A methylation in cancerous tissu…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The "Magic Methyl Effect" stands for the welcoming effect of the methyl group in enhancing the potency of drug precursors. To date, no catalytic chemical route for methylation of aryl halides that excludes organometallic species is known. In this report, we introduce an organometallic-free cross electrophile methylation of aryl halides based on the generation of a methyl anion achieved under chemical conditions. It successfully methylated several strong bonds, such as CAr-Br, CAr-Cl, and CAr-F. This catalytic protocol was further diversified by preparing methyl derivatives of various clinicall…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Catechyl (C) lignin, a linear homopolymer restricted to seed coats of a limited number of plant species, has favorable properties for chemic … and laccase (ChLAC8) with substrate preference for the caffeyl moiety. How the loss of monolignol O-methylation is regulated is not understood. We reconstructed coexpression networks of the above enzymes with transcription factor (TF) candidates based on RNA sequencing data. Using a dual-luciferase reporter assay, we identified ChMYB20 as an activator of the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA), the most common degenerative joint disease worldwide, currently lacks effective disease-modifying therapies that can halt its progression. This therapeutic challenge stems from the complexity of multiple pathological mechanisms, including chondrocyte metabolic imbalance, inflammatory responses, and extracellular matrix (ECM) degradation. In recent years, epigenetics, particularly reversible methylation modifications, has provided a new perspective for understanding OA.
MAIN BODY: This review systematically analyzes the multi-dimensional methylation regulatory …
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) RNA modifications and reovirus infections have recently been implicated in the development of celiac disease. While viral infections are known to alter the RNA modification machinery of the host, their interplay in autoimmune tissue damage remains unexplored. In this study we employed an in vitro model combining a viral mimic with gliadin peptides to simulate celiac disease conditions, alongside the analysis of serum and intestinal biopsies from controls and patients to investigate the link between m6A methylation and viral infections in inducing autoimmune inflammatio…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Based on seminal work in placental species (eutherians)1-10, a paradigm of mammalian development has emerged wherein the genome-wide erasure of parental DNA methylation is required for embryogenesis. Whether such DNA methylation reprogramming is, in fact, conserved in other mammals is unknown. Here, to resolve this point, we generated base-resolution DNA methylation maps in gametes, embryos and adult tissues of a marsupial, the opossum Monodelphis domestica, revealing variations from the eutherian-derived model. The difference in DNA methylation level between oocytes and sperm is less pronounc…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Rec8 gene is specifically expressed in fetal and adult gonads. Although the importance of REC8 in gametogenesis is widely acknowledged, … in the testes but hypermethylated in other tissues. Interestingly, correlation analysis between CpG methylation status and Rec8 mRNA expression levels showed that methylation of CpGs 10 to 19 was negatively correlated with Rec8 mRNA expression levels (Pearson's r = -0.991, P = 0.009). Furthermore, RNA-Seq data and bioinformatic analyses suggested that the spe …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The absolute number of rDNA transcription units (TU) can vary by about one order of ten among individuals. Apart from extensive rDNA copy nu … of relaxation/breakdown of the CN control system. The amplified copies were inactivated by promoter methylation and, thus, the number of active CN was largely independent from absolute CN. Collectively, our data suggest that with some notable exceptions absolute and even more active rDNA CN are maintained during development and differentiation in different ti …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic processes, such as DNA methylation, show potential as biological markers and mechanisms underlying gene-environment interplay in the prediction of mental health and other brain-based phenotypes. However, little is known about how peripheral epigenetic patterns relate to individual differences in the brain itself. An increasingly popular approach to address this is by combining epigenetic and neuroimaging data; yet, research in this area is almost entirely comprised of cross-sectional studies in adults. To bridge this gap, we established the Methylation, Imaging and NeuroDevelopment …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is a type of hematological cancer that arises from uncontrolled proliferation of plasma cells. In addition to frequent genetic mutations, malignant plasma cells are characterized by alterations to the epigenome. Myeloma cells display a genome-wide loss of DNA methylation and a corresponding increase in 'active' chromatin modifications. The dramatic epigenetic remodeling that occurs in cancer genomes is associated with loss of silencing at transposable elements, which can impact genome regulation. Through paired epigenome and transcriptome profiling of patient derived MM s…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of DNA methylation in the process of biological aging is a particularly active area of research, where methylation changes may be a consequence or a driver in the deviation between biological and chronological age. We employ a scoping review strategy to analyze the results of 435 relevant research papers, 167 of which employed methylation-based strategies to interrogate biological age. Our work details the progression and refinement of these strategies over time, as well as the development of novel methylation-based clocks and algorithmic methods. Our chosen review strategy allows for…
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования