In this review, the current status of genomic and proteomic research on Giardia is examined in terms of evolutionary biology, phylogenetic relationships and taxonomy. The review also describes how characterising genetic variation in Giardia from numerous hosts and endemic areas has provided a better understanding of life cycle patterns, transmission and the epidemiology of Giardia infections in humans, domestic animals and wildlife. Some progress has been made in relating genomic information to the phenotype of Giardia, and as a consequence, new information has been obtained on aspects of deve
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics has recently emerged as a powerful approach both for discovering biomarkers as well as for understanding the physiopathology of unclear gynecological-obstetrical disorders. Currently, several biological fluids and fetal tissues were successfully tested, including maternal plasma, amniotic fluid, cervical-vaginal fluid, urine, saliva, placental trophoblast, amnio-chorionic membranes and cord blood. The potential of proteomics on the polycystic ovary syndrome (PCOS) involves biomarkers discovery for a more accurate diagnosis of the syndrome and identification, within the patients with…
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the last few years, a growing interest has arisen in the application of proteomic analysis to rheumatic disease. Sjögren's syndrome is a systemic disease that affects exocrine glands directly, and is therefore expected to influence the composition of the whole human saliva and lachrymal fluid. Therefore, a rising number of studies have been performed in an attempt to characterize the salivary and lachrymal protein profiles of patients with Sjögren's syndrome by using a proteomic approach. This review summarizes the state of the art and the potential application of proteomics in the systemat…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pituitary is the master endocrine gland responsible for the regulation of various physiologic and metabolic processes. Proteomics offers an efficient means for a comprehensive analysis of pituitary protein expression. This paper reports on the application of proteomics for the mapping of major proteins in a normal (control) pituitary. Pituitary proteins were separated by two-dimensional gel electrophoresis with immobilized pH 3-10 gradient strips. Major protein spots that were visualized in the two-dimensional gel by silver staining were excised, and the proteins in these spots were digest…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in data acquisition tools, particularly mass spectrometry-based techniques, have made high-throughput methods like proteomics and phosphoproteomics increasingly accessible. However, the volume and complexity of the data require specialized computational tools for analysis and interpretation to extract meaningful insights. Here, we describe the use of rROMA software to analyze pathway and kinase activity in proteomic and phosphoproteomic datasets. rROMA is an open-source package available on Github at: www.github.com/sysbio-curie/rROMA . As a case study, we applied rROMA to breast canc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Late-onset neonatal sepsis (LONS) is a major cause of morbidity and mortality in preterm infants, but early diagnosis remains di … imulated in vitro with E. coli and S. epidermidis. Protein expression was quantified using targeted proteomics.
RESULTS: Fifteen neonates with LONS, eight controls, and ten in vitro stimulation samples were included. Sixty-six proteins showed altered expression during LONS. Upregulated proteins were predominantly cytokines and chemokines, whereas downregula …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry is the dominant technology in the field of proteomics, enabling high-throughput analysis of the protein content of complex biological samples. Due to the complexity of the instrumentation and resulting data, sophisticated computational methods are required for the processing and interpretation of acquired mass spectra. Machine learning has shown great promise to improve the analysis of mass spectrometry data, with numerous purpose-built methods for improving specific steps in the data acquisition and analysis pipeline reaching widespread adoption. Each of these tasks rely on …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is characterized by substantial heterogeneity in both clinical phenotype and risk of adverse o … with potential diagnostic and prognostic utility. These findings highlight the potential for plasma proteomics to improve risk prediction and provide insight into HCM pathobiology.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertension is a major global health burden and a leading driver of cardiovascular disease, yet reliable blood-based biomarkers for early disease are still limited. We combined plasma proteomics with explainable machine learning to identify circulating proteins associated with stage 1 hypertension in the Qatar Biobank. Proteomic profiles from 778 participants (554 controls and 224 stage 1 hypertension cases) were analyzed; 1305 proteins were tested for differential expression with adjustment for age and sex, and top features were prioritized before training predictive models. Among the evalua…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Citrullination is a post-translational modification implicated in autoimmune and inflammatory diseases, yet its low abundance and lack of effective enrichment tools have limited proteome-wide analysis. Here, we develop a robust chemical proteomics workflow with improved specificity and throughput. This method builds upon glyoxal-based derivatization and incorporates a cleavable biotin linker for efficient peptide enrichment, release, and identification via mass spectrometry. Benchmarking demonstrates a > 10-fold increase in the detection of citrullinated peptides at sub-0.1% abundance. Applyin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quinazolinones have been recently recognized as valuable scaffolds for developing novel therapeutic opportunities. They indeed exhibit struc … he most active one. Consequently, its interactome has been characterized by a label-free functional proteomics-based platform coupling drug affinity responsive target stability (DARTS) and targeted limited proteolysis-multiple reaction monitoring-mass spectrometry (t-LiP-MRM-MS). This multifaced strategy has been employed to reveal few subunits of the 26S pr …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In acute myeloid leukemia (AML), the insertion site of internal tandem duplications (ITDs) within the FLT3 gene critically determines the sensitivity to tyrosine kinase inhibitors (TKIs). Despite recent advances, patients harboring ITDs in the tyrosine kinase domain (TKD) still lack effective therapeutic options. To elucidate the molecular basis underlying the differential TKI sensitivity of FLT3-ITD cells, we integrated high-resolution mass spectrometry-based (phospho)proteomics with subcellular fractionation. Our analysis revealed that midostaurin induces the subcellular redistribution of ap…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myelodysplastic neoplasms (MDS) are clonal hematopoietic disorders defined by ineffective hematopoiesis, cytopenias, and variable risk of progression to acute myeloid leukemia. Although genomic and epigenomic studies have provided insight into disease pathogenesis, reliable biomarkers for diagnosis and prognosis remain limited. Proteomics offers an important advantage because it reflects the functional protein state and captures post-translational modifications, making it highly relevant for risk assessment and therapy guidance. Recent studies have identified several groups of candidate biomar…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molar root-incisor malformation (MRIM) is characterized by abnormalities in the root and pulpal floor, which may lead to dental complications. However, research on MRIM remains limited and is largely confined to case-based observations. Therefore, this study aimed to characterize the morphology and proteomic profile of the cervical mineralized diaphragm (CMD) in MRIM. Extracted MRIM-affected teeth (n = 11) from 6 patients and extracted third molars as controls (n = 11) were collected. Two MRIM-affected teeth and two control teeth were subjected to micro-computed tomography and scanning electro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Plasma proteins reflect the combined influence of both internal and external factors, making proteomics-based aging clocks a promising approach for quantifying the aging process.
OBJECTIVE: This study aims to develop and validate a novel proteomics-based aging clock by integrating plasma proteomics with composite biomarkers.
METHODS: We used a prospective cohort of 37,433 participants (median follow-up: 164.73 months) from the UK Biobank (UKB) with Olink Explore data. We calculated biological age (PhenoAge) and used the Boruta-SHAP (SHapley Additive exPlanations) algorithm to s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Immune checkpoint inhibitors (ICIs) have transformed cancer outcomes but may be associated with an increased risk of myocardial infarction and ischemic stroke. Whether this risk is mediated by inflammatory plaque activation and whether coadministered vascular endothelial growth factor inhibitors (VEGFIs) modify the effect remain unresolved.
OBJECTIVE: To prospectively characterize the arterial and systemic inflammatory outcomes associated with ICIs, VEGFIs, and combined ICIs plus VEGFIs in patients with cancer.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: This prospective longitudinal coho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rapidly progressive pneumoconiosis (RPP) is an aggressive subtype of pneumoconiosis characterized by persistent pulmonary inflam … m 15 RPP patients and 13 non-RPP controls were analyzed by data-independent acquisition (DIA)-based proteomics. Differential expression analysis, protein-protein interaction network analysis, and random forest machine learning were performed for identifying RPP-associated proteins. Subsequently, the least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) reg …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With advanced mass spectrometry (MS)-based proteomics, genome-scale proteome coverage can be achieved from bulk tissues. However, such bulk measurement lacks spatial resolution and obscures tissue heterogeneity, precluding proteome mapping of tissue microenvironment. Here we report an integrated wet collection of single microscale tissue voxels and Surfactant-assisted One-Pot voxel processing method termed wcSOP for robust label-free single voxel proteomics. wcSOP capitalizes on buffer droplet-assisted wet collection of single voxels dissected by LCM to the tube cap and SOP voxel processing in…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schirmer strips are widely regarded as the gold standard for tear fluid collection. However, their use presents several challenges for proteomic analysis. Here, we present a protocol for extracting tear proteins from Schirmer strips. We describe steps for acquisition and handling of strips, extraction buffer preparation, strip preparation, and protein extraction. This protocol is designed to improve protein yield and facilitate proteomic workflows and is adaptable for various protein-based studies, particularly in the context of ocular disease research and diagnostics.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysregulated proteome in the retina represents a promising avenue for discovering novel therapeutic targets and noninvasive diagnostic biomarkers for neurodegenerative diseases with ocular manifestations. Advanced mass spectrometry-based proteomics techniques have shown considerable potential in investigating the retinal proteome in diseases such as glaucoma, age-related macular degeneration, diabetic retinopathy, retinitis pigmentosa, as well as Alzheimer's disease, amyotrophic lateral sclerosis, and Parkinson's disease. Recent proteomics innovations are overcoming challenges such as limited …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования