We have shown that the characteristics of tissue trees obtained by the hierarchical cluster analysis of DNA microarray data suggest the cellular expression patterns of genes in the gene clusters [J. Neurosci. Res. 74 (2003) 818]. We here identified three gene clusters containing 11 genes as a potential pool of candidate genes related to somatosensation in cranial structures such as the face, oral cavity and pharynx. To obtain the cellular expression profiles, eight genes other than three genes analyzed previously were subjected to in situ hybridization analysis. The results show that all of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sandhoff disease is a lysosomal storage disorder characterized by the absence of beta-hexosaminidase and storage of G(M2) ganglioside and related glycolipids in the central nervous system. The glycolipid storage causes severe neurodegeneration through a poorly understood pathogenic mechanism. In symptomatic Sandhoff disease mice, apoptotic neuronal cell death was prominent in the caudal regions of the brain. cDNA microarray analysis to monitor gene expression during neuronal cell death revealed an upregulation of genes related to an inflammatory process dominated by activated microglia. Activa…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As vitiligo progresses, autophagy becomes more and more important.
OBJECTIVES: To validate potential genes associated with autophagy in vitiligo through bioinformatics analysis and experimental testing.
MATERIALS AND METHODS: Dataset GSE75819 of mRNA expression profiles was obtained from GEO. After data normalisation, gene set enrichment analyse enrichment analysis and abundance analysis of infiltrating immune cells were performed. A list of autophagy-related differentially expressed genes (ARDEGs) associated with vitiligo was generated using R software. Protein-protein interacti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein chips and arrays in parallel enable high-throughput protein detection in small-volume biological fluids, however, the limitations in sensitivity, dependence on expensive/bulky external equipment, and the need for specialized technical personnel have restricted their application in clinical and laboratory settings. Here, we present a droplet-based do-it-yourself (DBDIY) array on patterned plasmonic chips for high-throughput immunoassays, via confined droplets and plasmonic enhanced near-infrared (NIR) fluorescence. The assay allows equipment-free microarray fabrication and highly sensit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immunometabolic remodeling is central to sepsis, yet robust glycolysis-associated biomarkers and their cell-type context remain unclear.
METHODS: We integrated peripheral blood scRNA-seq (GSE175453) and a whole-blood microarray cohort (GSE100159). Glycolysis activity was scored by AUCell (HALLMARK_GLYCOLYSIS), hub genes were prioritized by LASSO/random forest/Boruta, communication was inferred by ligand-receptor analysis, and qRT-PCR was performed in CLP vs control mice.
RESULTS: Sepsis showed myeloid predominance and increased glycolysis scores, most evident in monocytes and pla
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma exhibits a broad spectrum of histopathologic variations, including rare forms with neural differentiation. Neurotropism in melanoma encompasses both perineural invasion and neural-like transformation, but the prognostic implications of these features remain uncertain. Although (peri)neural invasion is well documented, true neural differentiation in melanomas is exceedingly rare. In this study, we describe an unusual case of primary cutaneous malignant melanoma exhibiting extensive Wagner-Meissner-like bodies, a feature more commonly associated with benign neural tumors and nevi. In th
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The discovery of protective antigens remains a major bottleneck in bacterial vaccine development. To overcome this limitation, we present Functional Genomic Vaccinology (FGV), a high-throughput antigen discovery platform integrating genome-wide antigen prediction, proteome-scale screening, and experimental immunogenicity validation to identify protective bacterial antigens. Using FGV, 222 conserved S. pneumoniae proteins are expressed in vitro, incorporated into a protein microarray, and coupled to magnetic beads for mouse vaccination. Protein array analysis shows significant IgG responses in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To understand the prevalence of opportunistic bacterial pathogens in the bioaerosols, outdoor air-sampling was performed during the peak season of air pollution prior to the onslaught of the COVID-19 pandemic in the national capital of India, Delhi, during the month of November 2019. Employing a sophisticated plate exposure technique using the Merck Mas Eco-100 instrument, culturable bacterial samples were collected from six locations in Delhi. Among the identified bacterial samples, multiple species of the opportunistic pathogen Staphylococcus, namely, S. gallinarum, S. haemolyticus, and S. a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is implicated in numerous disorders, including type 2 diabetes, Alzheimer's disease and cancer. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are emerging as pivotal regulators of cellular energy metabolism, yet their roles remain largely unclear. In this study, we identify an lncRNA named linc-PMB, which is associated with mTOR and promotes mitochondrial biogenesis, through microarray analysis. We demonstrate that the knockdown of linc-PMB results in significantly impaired mitochondrial respiration and biogenesis, along with altered expressions of related genes. Conversely, overexp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer is a prevalent malignancy among women, yet the involvement of neutrophils in its tumor microenvironment remains insufficiently explored. This study utilized single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to delineate neutrophil subsets and elucidate their roles in disease progression and prognosis. Analysis of 20 cervical biopsy samples across different disease stages identified five neutrophil subsets (N0-N4), among which the N4 subset exhibited a marked increase during disease advancement. Spatial transcriptomics and tissue microarray analyses revealed that N4 neutrophils are enriche
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Head-to-head comparisons of nasopharyngeal swabs (NPS) and oropharyngeal swabs (OPS) for microbiological analysis in pediatric patients with acute respiratory tract infections (ARTI) remain limited. This study aimed to evaluate the concordance of NPS and OPS in identifying various etiologies among children with ARTI.
METHODS: Paired NPS and OPS samples were collected from 326 children with ARTI and analyzed for 15 respiratory pathogens using suspension microarray.
RESULTS: NPS demonstrated a higher overall microbiological yield than OPS (79 % vs. 73 %, P <0.05). The five most fre
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a novel homozygous intragenic deletion in the ALS2 gene in an 8-year-old boy with Infantile-onset Ascending Hereditary Spastic Paraplegia (IAHSP) and oculomotor apraxia, thereby contributing to the expanding genetic landscape of ALS2-related disorders. Comprehensive neurological evaluation, chromosomal microarray analysis (CMA), and trio-based whole exome sequencing (WES) were performed. CMA revealed a run of homozygosity (ROH) at 2q33.1. WES identified a homozygous deletion encompassing exons 24-25 of ALS2, inherited from heterozygous parents. This clinical phenotype was consisten…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ductal carcinoma in situ (DCIS) is a pre-invasive tumor that can progress to invasive breast cancer, a leading cause of cancer death. We generate a large-scale tissue microarray dataset of chromatin images, from 560 samples from 122 female patients in 3 disease stages and 11 phenotypic categories. Using representation learning on chromatin images alone, without multiplexed staining or high-throughput sequencing, we identify eight morphological cell states and tissue features marking DCIS. All cell states are observed in all disease stages with different proportions, indicating that cell states
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome 17q12 deletion syndrome (OMIM #614527) is a rare genetic disorder associated with a heterozygous 1.4-1.5 Mb deletion at chromosome 17q12, leading to a spectrum of clinical manifestations, including kidney abnormalities, neurodevelopmental delay, maturity-onset diabetes of the young type 5 (MODY5), and Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser (MRKH) syndrome. We present the case of a 14-year-old Korean female diagnosed with chromosome 17q12 deletion syndrome, confirmed by chromosomal microarray analysis. The patient exhibited MODY5 with pancreatic agenesis, MRKH syndrome, dysmorphic facial fea…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs play crucial regulatory roles in the progression of various cancers. Nevertheless, the underlying mechanisms of circRNAs in prostate cancer (PCa) proliferation and metastasis remain largely uncertain. Here, we performed circRNA microarray analyses to identify differentially expressed circRNAs in a normal prostate epithelial cell line and PCa cell lines. We found that hsa_circ_0063329 was significantly downregulated in PCa. A series of in vitro and in vivo functional assays showed that overexpression of hsa_circ_0063329 inhibits PCa cell progression, while silencing of hsa_circ_00
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fetal growth restriction (FGR) is defined as an ultrasound (US)-determined estimated fetal weight or abdominal circumference less than the 1 … by polyhydramnios and/or fetal anomalies, genetic testing should be obtained, including chromosomal microarray analysis. The timing of delivery strategy should be based on the severity of growth restriction and findings on fetal tests of well-being (eg, nonstress testing, umbilical artery Doppler velocimetry). No routine prevention strategies are recommended. However …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuropathy is a feature more frequently observed in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) than other tumors. Schwann cells, the most prevalent cell type in peripheral nerves, migrate toward tumor cells and associate with poor prognosis in PDAC. To unveil the effects of Schwann cells on the neuro-stroma niche, here we perform single-cell RNA-sequencing and microarray-based spatial transcriptome analysis of PDAC tissues. Results suggest that Schwann cells may drive tumor cells and cancer-associated fibroblasts (CAFs) to more malignant subtypes: basal-like and inflammatory CAFs (iCAFs), respect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trace metals are essential for various physiological processes, but their roles in innate immunity have not been fully explored. Here, we found that manganese (Mn) significantly enhanced DNA-mediated IFN-α, IFN-β, and IFN-λ1 production. Microarray analysis demonstrated Mn highly upregulated 351 genes, which were involved in multiple biological functions related to innate immune response. Moreover, we found that Mn2+ alone activates phosphorylation of TANK-binding kinase 1 (TBK1). Inhibiting ataxia telangiectasia mutated (ATM) kinase using ATM inhibitor or siRNA suppressed Mn-enhanced DNA-media…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the clinical features and genomic abnorm ality of a fetus enlarged multicystic dysplastic kidneys with oligohydramnios caused by NPHP3 gene mutation.
METHODS: The fetuse was found to have multicystic dysplastic kidneys with oligohydramnios upon ultrasonography during the second trimester. Following induced abortion, fetal tissue was collected for the extraction of DNA, chromosomal microarray analysis (CMA) and whole exome sequencing (WES). Sanger sequencing was used to verify the suspected variants in the family.
RESULTS: Antenatal ultrasound examination at 19 weeks sho…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To examine the diagnostic yield of trio exome sequencing in fetuses with multiple structural defects with no pathogenic findings in cytogenetic and microarray analyses.
METHODS: We recruited 51 fetuses with two or more defects, non-immune fetal hydrops or fetal akinesia deformation syndrome|or fetal akinesia deformation sequence (FADS). Trio exome sequencing was performed on DNA from chorionic villi samples and parental blood. Detection of genomic variation and prioritization of clinically relevant variants was performed according to in-house standard operating procedures.
RESULT
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.