BACKGROUND: Senescence plays a critical role in prostate cancer, influencing disease onset and progression. However, the alterations of senescence-associated genes during prostate cancer progression and their potential value in predicting disease advancement remain to be further elucidated.
METHODS: 117 machine learning methods were applied to construct the senescence-related gene signature (SRGS). Temporal trajectory analysis based on bulk and single-cell transcriptomic datasets was performed to link SRGS with prostate cancer progression. Functional validations of PCNA were conducted both in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute myocarditis (AM), particularly fulminant myocarditis (FM), is an infrequent but life-threatening cardiac inflammation, with limited effective precision-targeted treatments available. This urgent clinical challenge has prompted further investigations into the mechanisms underlying this pathology to develop novel therapeutic approaches.
METHODS: We enrolled 40 patients diagnosed with AM (24 mild, 16 fulminant) between December 2022 and November 2023. Using a multi-omics approach, we analyzed peripheral blood mononuclear cells and plasma, integrating single-cell RNA sequencing,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pediatric acute respiratory distress syndrome (PARDS), often triggered by viral infections, is a life-threatening condition. Despite its severity, children demonstrate significantly better survival rates and superior lung repair compared to adults. However, the mechanisms underlying this age-specific advantage remain incompletely understood. PATIENTS AND METHODS: We conducted a pilot multi-omics study of influenza-associated PARDS integrating single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of pediatric lung tissue and bronchoalveolar lavage fluid (BALF), spatial transcriptomics, and plasma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stomach adenocarcinoma (STAD), the most prevalent histological subtype of gastric cancer, exhibits high heterogeneity and poor prognosis, posing significant therapeutic challenges. Parthanatos, a distinct form of regulated cell death mediated by poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1), has been implicated in tumor biology and therapeutic resistance; however, the role of parthanatos-associated genes (PRGs) in STAD remains largely unexplored. In this study, we performed a comprehensive multi-omics analysis integrating transcriptomic, genomic, and clinical data from public databases to delineate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysosomes play a crucial role in regulating the growth, invasion and metastasis of different tumour types. However, the specific function of lysosomes in hepatocellular carcinoma (HCC) remains uncertain. We retrieved gene expression and clinical data from the TCGA and GEO databases for HCC samples and established a new lysosome-associated prognostic therapeutic index (LAPTI) based on lysosome-related genes through machine learning. We then systematically analysed clinical characteristics, functional enrichment, tumour immune microenvironment, molecular docking, chemotherapy response and immuno
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic architecture of Parkinson's disease (PD) is complex and multiple brain cell subtypes are involved in the neuropathological progression of the disease. Here we aimed to advance our understanding of PD genetic complexity at a cell subtype precision level. Using parallel single-nucleus (sn)RNA-seq and snATAC-seq analyses we simultaneously profiled the transcriptomic and chromatin accessibility landscapes in temporal cortex tissues from 12 PD compared to 12 control subjects at a granular single cell resolution. An integrative bioinformatic pipeline was developed and applied for the ana
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the progression of proliferative vitreoretinopathy (PVR) following ocular trauma, previously quiescent retinal pigment epithelial (RPE) cells transition into a state of rapid proliferation, migration, and secretion. The elusive molecular mechanisms behind these changes have hindered the development of effective pharmacological treatments, presenting a pressing clinical challenge. In this study, by monitoring the dynamic changes in chromatin accessibility and various histone modifications, we chart the comprehensive epigenetic landscape of RPE cells in male mice subjected to traumatic PV
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis results in critical organ failure, considerable global mortality, and poses treatment obstacles. The primary issue with its pathophysiology is the improper functioning of the immune system in two phases: initially, there is excessive inflammation, followed by insufficient inflammation. This has generated interest in immunotherapy to restore the immune system to its normal state. This bibliometric analysis mapped the evolving research landscape of sepsis immunotherapy.
METHODS: Articles and reviews related to sepsis immunotherapy, published between January 1, 2000, and Decem
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer is a common and high-mortality cancer that develops from colorectal adenomas and has a complex process of onset and progression. The CPT1C gene has been found to have a potential oncogenic role in a variety of cancers, but its role in colorectal adenocarcinoma is unclear. The aim of this study was to investigate the expression changes of CPT1C gene in colorectal adenocarcinoma and its clinical significance. Gene expression data from the GEO database were analyzed using machine learning to assess CPT1C differential expression between colorectal adenocarcinoma and adenoma patie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung adenocarcinoma (LUAD) remains a leading cause of cancer-related mortality worldwide. Although the transcription-export (TREX) complex plays a central role in RNA maturation and nuclear export, the clinical and biological relevance of individual THO Complex Subunit (including THOC1, THOC2, THOC3, THOC5, THOC6, and THOC7) in LUAD is not well defined. We performed integrative analyses combining bulk transcriptomics from TCGA/GTEx and independent GEO cohorts, survival modeling, DNA methylation profiling, protein-level annotation from public resources, protein-protein interaction network analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Kawasaki disease (KD) is classified as a "WenBing" syndrome in traditional Chinese medicine (TCM), characterized by systemic inflammation and vasculitis. Jiawei Baihu Tang (JWBHT) is an optimized herbal formulation derived from the classical Baihu Tang (BHT), a renowned ancient TCM prescription traditionally used to treat WenBing syndromes by clearing heat, reducing fever, and promoting body fluid production. However, the precise pharmacological mechanisms underlying JWBHT's intervention effects remain largely unexplored. We aimed to assess the protective effects of JWBHT on coronary
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ketogenic diet (KD) has demonstrated anti-proliferative effects across multiple tumor types, yet the underlying metabolic and transcriptomic mechanisms remain incompletely understood. This study employed integrated multi-omics analysis combining targeted metabolomics and RNA sequencing to elucidate KD-induced metabolic reprogramming in BRAF/NRAS wild-type, BRAF mutant, and NRAS mutant melanoma xenografts, which showed delayed tumor growth when treated with the KD. Despite pronounced metabolic and transcriptional heterogeneity across models with minimal overlap in individual KD-responsive g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: The role of overall dietary diversity in type 2 diabetes (T2D) risk remains uncertain, and the potential associations involving the gut microbiota and metabolism are poorly understood. We therefore aimed to elucidate the associations between dietary diversity and T2D development and to explore the roles of gut microbiota and metabolism in two large-scale Chinese cohorts. Methods: This study included 8103 participants aged 18-80 years from the WELL-China cohort as the discovery cohort and 2020 from the Lanxi cohort as the validation cohort. Dietary diversity score (DDS) was calculat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The TITANIA (mulTi omIcs daTa cANcer dIagnostics therApies) study is an international collaboration to generate high-quality multi-omics cancer profiles. We conducted an exploratory investigation within this framework to understand the molecular basis of lymphovascular invasion (LVI), a critical determinant of metastatic potential in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). We analyzed 31 ccRCC specimens (11 LVI+, 20 LVI-) from the National Cancer Center Hospital East using whole-genome sequencing, RNA sequencing, and proteomic profiling. Our findings were integrated with public single-cell RN
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The coexistence of heart failure (HF) and renal insufficiency, termed cardiorenal syndrome (CRS), significantly increases mortality in HF patients. Although gut microbiota-host metabolic interactions contribute to the pathology of both conditions, their regulatory mechanisms in CRS remain unclear. METHODS: This cross-sectional study enrolled 451 subjects from two medical institutions across different regions of China, comprising 155 patients with CRS, 225 with HF alone, and 71 controls. Using integrated metabolomics and 16S rRNA sequencing, we compared 801 serum metabolites, 36,956
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Dosiomics and radiomics elaborate the low-and high-order features extracted from images to predict clinical outcomes. Whole-brain radiotherapy (WBRT) has been widely used in patients with diffuse brain metastases of small cell lung cancer (SCLC). The objective of this study is to ascertain the predictors of treatment response in patients with SCLC treated with WBRT. Furthermore, the study seeks to develop accurate machine learning models to predict the radiotherapy response of WBRT.
MATERIALS AND METHODS: This study retrospectively enrolled BM patients who received whole brain irra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study characterized gut microbial composition and fecal metabolomic profiles in hospitalized patients with Staphylococcus aureus infection (SAI) and explored their associations with inflammatory and organ-function indicators.
METHODS: This single-center exploratory observational study included 16 hospitalized patients with microbiologically confirmed and clinically adjudicated SAI and 10 healthy controls (HCs). The first qualified fecal sample was collected within 7 days after microbiological confirmation. Fifteen patients had received antimicrobial treatment before samplin
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Brain metastases (BM) remain the leading cause of death in patients with lung adenocarcinoma (LUAD) despite the availability of comprehensive therapeutics. This study aimed to systematically identify crucial genes associated with BM in patients with LUAD, and develop a heuristic search algorithm combining information filtering and multiple stepwise regression to construct a multi-layered transcription factor regulatory network.
METHODS: We used the mRNA expression profiles of primary tumours derived from LUAD patients with different organ metastasis and adjacent normal tissue samp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Han-Duo-Re-Shao Decoction (HDRSD), a traditional Korean medicine, effectively treats cold-pattern allergic rhinitis (AR). Its mechanism is rooted in addressing the lung-spleen-kidney qi-yang deficiency triad, which heightens rhinitis susceptibility. Guided by the principle of 'warming yang to dissipate cold', HDRSD fortifies body resistance and applies the 'cultivating earth to generate metal' theory to nourish the lungs. This study integrates ethnopharmacology with network pharmacology to elucidate HDRSD's "multi-component, multi-target, multi-pathway" mechanis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Hepatocellular carcinoma (HCC) is an extremely heterogeneous malignancy with a poor prognosis, highlighting the need to target specific vulnerabilities within the tumor during treatment.
OBJECTIVES: This study employs multi-omics analysis techniques to provide novel insights into personalized therapeutic strategies for HCC patients.
METHODS: We performed proteomic and transcriptomic sequencing on 178 and 94 clinical samples of primary HCC without prior treatment, respectively. We employed an unbiased Kinome CRISPR-Cas9 library screening approach to systematically evaluate and i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.