Detection of gene mutations is central to molecular diagnostics. The conventional detection methods that employ DNA capture probes are widely used, yet they may suffer from non-specific signals, difficulties in single nucleobase mismatch discrimination, and nuclease-induced degradation of the DNA capture probe. Herein, a strategy for detection of nucleic acid sequences using the nuclease-resistant morpholino oligonucleotide (MO) capture probe is reported. Since, spherical NPs offer increased surface area, thus increasing the total number of capture probe available for target recognition, MO pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA damage and repair is a fundamental process that plays an important role in cancer treatment. Base excision repair (BER) is a major repair pathway that often leads to drug resistance in DNA-targeted cancer chemotherapy. In order to measure BER, we have developed a near infrared (NIR) fluorescent probe. This probe binds to a key intermediate, termed apurinic/apyrimidinic (AP) site, in the BER pathway where DNA damage and repair occurs. We have developed an assay to show the efficacy of the probe binding to AP sites and have shown that it can distinguish AP sites in DNA extract from chemother
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 7-kb linear plasmid, harbored by a URA5 transformant, hybridized to all the chromosomes of Cryptococcus neoformans separated by contour-clamped homogeneous electric field electrophoresis. Its linear maintenance was determined to have been facilitated by the presence of telomere-like sequences at its free ends. Hybridization of this plasmid to AccI-digested genomic DNAs of 26 C. neoformans strains generated 21 unique DNA fingerprints. The DNA fingerprints of isolates within the same serotype were more similar to one another than to those from different serotypes. An acapsular clinical isolate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe the use of a DNA probe for genotyping clinical isolates of Haemophilus influenzae. The probe, containing capsulation genes, differentiates between the six Haemophilus serotypes in a Southern blotting procedure. It also hybridizes with a distinctive pattern to DNA from capsule-deficient mutants of serotype b strains, while failing to hybridize to DNA from typical clinical isolates of non-serotypable H. influenzae. The probe can thus resolve issues of serotyping uncertainty such as arise, for example, when capsulate strains are found to have lost reactivity with serotyping reagents a
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A fragment of the gene for cytolysin has been cloned. The product of the gene has been earlier identified as an immunoserological marker of Legionella pneumophila. Clones were selected by immunodetection of cytolysin gene product expression. An EcoRI 3.8 kb fragment of the genomic DNA from Legionella pneumophila strain Philadelphia-1 was used as a DNA probe that hybridized with the bacterial colonies of 20 Legionella pneumophila strains but not with the colonies of 10 other Legionella species or 8 other bacterial genera. The cloned fragment has been shown to be unique for Legionella pneumophil
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to create a rDNA probe for plague agent (Yersinia pestis) double-stranded DNA fragments complementary to 5'-region of 16S rRNA were synthetized with the help of reverse transcriptase. The fragments were cloned into plasmid vector pUC19 in Escherichia coli. To select plasmids with specific for Y. pestis sequences, recombinant clones and plasmids purified from them were cross-hybridized to [gamma-32 P]-labelled 16S rRNA of E. coli and Y. pestis. As was shown after sequencing of recombinant plasmids, those that did not hybridize to 16S rRNA of E. coli carried a DNA copy of variable regio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study was undertaken to identify a DNA sequence that could be used to facilitate the diagnostic identification of Salmonella typhi, the causative agent of typhoid fever. All virulent S. typhi strains encode a relatively unique capsular antigen termed the virulence (Vi) antigen. Two distinct genetic loci, viaA and viaB, are involved in the synthesis of this antigen. The structural genes, located at viaB, were considered as a possible specific DNA probe. The viaB locus, contained in a recombinant cosmid, was subcloned to various plasmid vectors for this purpose. Selected viaB-region DNA fra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Investigations into the biophysical properties of single molecules traditionally involve well defined in vitro systems where parameters such as solvent viscosity and applied forces are known a priori. These systems provide means to develop models describing the polymers response to a variety of conditions, including the entropically driven relaxation of a stretched biopolymer upon release of the tension inducing force. While these techniques have proven instrumental for recent advancements in the fields of polymer physics and biophysics, how applicable they are to life inside the cell remains
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We review studies from our laboratories using different molecular tools to characterize the ancestry of Brazilians in reference to their Amerindian, European and African roots. Initially we used uniparental DNA markers to investigate the contribution of distinct Y chromosome and mitochondrial DNA lineages to present-day populations. High levels of genetic admixture and strong directional mating between European males and Amerindian and African females were unraveled. We next analyzed different types of biparental autosomal polymorphisms. Especially useful was a set of 40 insertion-deletion pol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichomoniasis is one of the most widespread sexually transmitted diseases in the world. Diagnosis can be achieved by several methods, such as direct microscopic observation of vaginal discharge, cell culture, and immunological techniques. A 2.3-kb Trichomonas vaginalis DNA fragment present in strains from diverse geographic areas was cloned and used as a probe to detect T. vaginalis DNA in vaginal discharge by a dot blot hybridization technique. This probe was specific for T. vaginalis DNA. It recognized strains from two regions in Italy (Sardinia, Piemonte) and from Mozambique (Africa). In a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 5 kb Haemophilus influenzae DNA fragment involved in penicillin-binding proteins expression was used as a probe for specific detection of H. influenzae strains. The 32p-labeled probe specificity was assessed by hybridization to bacterial dots and 75 strains were tested. All H. influenzae (18) and H. aegyptius (1) strains reacted very strongly with the probe. The H. influenzae serotypes tested (a, b, and non-typable strains) did not differ in their hybridization. Some hybridization was also found with the 12 other Haemophilus species tested as well as other Pasteurellaceae such as Actinobacil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ninety-six biopsy specimens were collected for studying the association of specific sequences of HPV DNA with genital warts, precancerous lesions and invasive cervical cancer. Using DNA probes labeled with biotin, 17 of the 22 (77.27%) specimens showing condyloma and 1 of the 14 (7.14%) specimens displaying subclinical papillomavirus infection (SPI) of cervix were found to be positive for HPV 6/11; 4 of 23 (17.39%) specimens of squamous epithelial cervical cancer and 2 of the 23 (8.70%) specimens of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) were positive for HPV 16/18. All the 14 specimens of c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA forms four-stranded G-quadruplex (G4) structures in guanine-rich regions of the genome, regulating various biological functions, including stalling replication and modulating gene expression at both transcription and translation levels. Thus, investigating the folding, dynamics, and subcellular localization of G4s using small-molecule probes is useful to understand their biological functions. In this study, we report a series of fluorescent probes based on β-carboline that emit upon binding to G4 DNA structures. The lead probe BCC exhibits up to an ∼18-fold fluorescence enhancement (40% qu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes epidemic clone II (ECII) strains have been responsible for two major multistate outbreaks of food-borne listeriosis in the United States, but their prevalence and ecology remain poorly understood. In this study, we describe DNA probes that unambiguously identify this clonal group. These probes were able to differentiate ECII strains of outbreak, sporadic, or environmental origin from other L. monocytogenes strains of the same serotype (4b).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A genomic DNA library of Haemophilus paragallinarum strain Modesto was created. Screening of this library identified four clones that reacte … , there was 100% agreement between culture and the direct HPG-2 PCR for the 36 swabs processed. The DNA probes and PCR tests appear to be useful diagnostic tools for the detection of infectious coryza. The tests can be used as confirmatory tests following the isolation of a hemophilic organism. As well, the HPG-2 PCR test appears to be a potential alternativ …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fewer than 10(5) elementary bodies of Chlamydia psittaci could be detected by using DNA hybridisation with a plasmid probe specific for avian chlamydial strains. PCR amplification of chlamydial DNA using primers specific for conserved regions of the major outer membrane protein gene enabled the detection of fewer than 10 elementary bodies. DNA could be amplified from 22 of the 24 chlamydial strains tested including avian, feline, ovine, caprine, koala and lymphogranuloma venereum strains.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Like most hematologic malignancies, solid cancers may be associated with non-random chromosomal abnormalities. Heterogeneity in the cell population in solid cancers and the chromosomal variations occurring among primary, explant, and passaged cells of a given tumor, however, present a major difficulty in assessment of their cytogenetic changes. Alternative approaches to identifying specific somatic changes in subtypes of solid cancers, without cell culture manipulations, must be developed. This report describes preliminary evidence indicating that oligonucleotide probes, homologous to short ta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study describes the use of ribosomal DNA probes to identify the species of individual mosquitoes in the Anopheles gambiae complex, a group of six morphologically identical mosquito species among which are two of the principal vectors of malaria in Africa. The DNA probes are sequences of DNA derived from the ribosomal genes of An. gambiae. Each probe reveals a different sized restriction enzyme fragment specific to each of the five species in the complex that were examined in this study: An. gambiae, An. arabiensis, An. quadriannulatus, An. melas and An. merus. The probes detect highly rep…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter serves as a practical guide to designing and synthesizing reactive DNA probes for site-selective covalent cross-linking with proteins. By using enzymatic incorporation of modified nucleotides, researchers can create probes that selectively target amino acid residues such as cysteine, lysine, arginine, and tryptophan. The approach exploits the proximity effect for precise, reagent-free cross-linking under mild conditions, making it a powerful tool for mapping protein-DNA interactions and enabling stable bioconjugation for applications in chemical biology, diagnostics, and therapeut…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Naphthalimide-based fluorescent probes (NAN0-N3 and NAN6-N3) were developed with dual locked fluorescence. Here, ≥1.9 × 10-2 mM of H2S and ≥2.2 × 10-2 μg mL-1 of DNA could unlock a highly sensitive off-on fluorescence response through synergistic changes of the molecular structure and conformation. As such, the probes could monitor DNA damage induced by the overexpression of H2S, and were able to evaluate the degree of apoptosis of living cells mediated by H2S-induced mtDNA or nDNA damage.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования