BACKGROUND: The spectrum of causal variants, mechanisms, and immunologic gene networks that influence pediatric atopic traits is not completely understood. Human genetic variation associated with transcript abundance (expression quantitative trait loci [eQTLs]) can help to advance our understanding, yet prior work has focused on profiling immune cell populations collected from peripheral blood primarily in adult populations, leaving tissue-resident lymphocytes collected from children uncharacterized.
OBJECTIVE: We sought to characterize gene expression of 4 populations of tonsil-derived immun…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA markers associated with quantitative trait loci (QTL) affecting host tolerance to gastrointestinal (GI) parasite infection are ideal targets for marker-assisted selection. However, few studies in cattle have attempted to identify this type of QTL due to the difficulty of generating accurate phenotypic data from a resource population with adequate statistical power for detection. For this effort, we amassed fecal egg count (FEC) measures from annual natural field challenges with GI nematodes that spanned 12 different contemporary groups of Angus calves (1992-2000) derived from a closed bree…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fish pasteurellosis is a bacterial disease causing important losses in farmed fish, including gilthead sea bream, a teleost fish of great relevance in marine aquaculture. We report in this study a QTL analysis for resistance to fish pasteurellosis in this species. An experimental population of 500 offspring originating from eight sires and six dams in a single mass-spawning event was subjected to a disease challenge with Photobacterium damselae subsp. piscicida (Phdp), the causative agent of fish pasteurellosis. A total of 151 microsatellite loci were genotyped in the experimental population,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mosquito Aedes aegypti is the most important vector of yellow fever and dengue fever flaviviruses. Ae. aegypti eradication campaigns have not been sustainable and there are no effective vaccines for dengue viruses. Alternative control strategies may depend upon identification of mosquito genes that condition flavivirus susceptibility and may ultimately provide clues for interrupting transmission. Quantitative trait loci affecting the ability of Ae. aegypti to develop a dengue-2 infection in the midgut have been mapped previously. Herein we report on QTL that determine whether mosquitoes wi…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alport syndrome is a human hereditary glomerulonephritis which results in end-stage renal failure (ESRF) in most cases. It is caused by muta … ing also underlie the differences in disease progression. We attempted to map the modifier genes as quantitative trait loci (QTLs) using age at ESRF as the quantitative trait. Genome scans were performed on mice at the two extremes in a cohort of mutant F1 x C57BL/6J backcross mice. Analysis with Map Manager QT revealed QTLs linked to markers on chromosomes 9 and 16. A m …
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of tongue carcinomas (TCs) induced by oral administration of 4-nitroquinoline 1-oxide in rats is strain dependent. The inbred Dark-Agouti (DA) strain showed a much higher susceptibility to large mass-forming infiltrative TCs than did the Wistar-Furth (WF) strain. Our previous study (M. Kitano et al, Jpn. J. Cancer Res., 87: 1097-1101, 1996) on crosses between these two strains postulated a dominant susceptibility gene in DA and a dominant resistance gene in WF rats. The present study mapped these loci by analyzing the backcrosses to each parent with simple sequence repeat polymor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spectrum of causal variants, mechanisms, and immunologic gene networks that influence pediatric atopic traits are not completely understood. Human genetic variation associated with transcript abundance (eQTLs) can help to advance our understanding, yet prior work has focused on profiling immune cell populations collected from peripheral blood primarily in adult populations, leaving uncharacterized tissue-resident lymphocytes collected from children. Here, we paired genotyping with gene expression profiling across four populations of tonsil-derived immune cell types - including previously u
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer of unknown primary (CUP) constitutes between 2% and 5% of human malignancies and is among the most common causes of cancer death in t … any cases are never assigned a specific diagnosis. Recent studies identified subsets of methylation quantitative trait loci (mQTLs) unique to specific organs, which could help increase classifier accuracy while requiring fewer samples. We performed a retrospective genome-wide methylation analysis of 759 carcinoma samples from formalin-fixed paraffin-embedded tissue sampl …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: No opioid receptor, mu 1 (OPRM1) gene polymorphisms, including the functional single nucleotide polymorphism (SNP) rs1799971, ha … icans and African Americans of the BrainCloud cohort. We then tested the 16 putative cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) SNPs for association with heroin addiction in the Urban Health Study and two replication cohorts, totaling 16,729 European Americans, African Americans, and Australians of European ancestry.
RESULTS: Four putative cis-eQTL SNPs were sign …
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Serum lipids are associated with many serious cardiovascular diseases and obesity problems. Many quantitative trait loci (QTL) have been reported in the pig mostly for performance traits but very few for the serum lipid traits. In contrast, remarkable numbers of QTL are mapped for serum lipids in humans and mice. Therefore, the objective of this research was to investigate the chromosomal regions influencing the serum level of the total cholesterol (CT), triglyceride (TG), high density protein cholesterol (HDL) and low density protein cholesterol (LDL) in pigs. For this purpose, a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent Spontaneous Abortion (RSA) is a frequent pathology affecting 1 to 5% of couples. In approximately 50 % of cases, the aetiology is … ulting from the interaction of genetic, epigenetic and environmental factors. Herein, we identified Quantitative Trait Loci (QTL) associated with diverse embryonic lethality phenotypes and the subsequent embryonic resorption in 39 inter-specific recombinant congenic mice strains, using in vivo ultrasound bio-microscopy. The short chromosomal intervals related to the phen …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymorphisms in the prion protein gene are known to affect prion disease incubation times and susceptibility in humans and mice. However, s … 11, and 12; composite interval mapping suggests that each of these regions includes multiple linked quantitative trait loci. Suggestive evidence for linkage was obtained on chromosomes 6 and 7. The sequence conservation between the mouse and human genome suggests that identification of mouse prion susceptibility alleles may have direct relevance to understanding human su …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Barbiturate dependence is associated with the development of physiological dependence (withdrawal), tolerance, or a maladaptive pattern of drug use. Analysis of strain and individual differences with animal models for physiological dependence liability are useful means to identify potential genetic determinants of liability in humans. Behavioral and quantitative trait locus (QTL) mapping analyses were conducted with mice that are resistant versus sensitive to pentobarbital withdrawal. With a multistage genetic mapping strategy, a pentobarbital withdrawal QTL (Pbw1) was mapped to the distal reg
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone fractures at the end of lay are a significant problem in egg-laying strains of hens. The objective of the current study was to identify quantitative trait loci (QTL) associated with bone mineralization and strength in a chicken resource population. Layer (White Leghorn hens) and broiler (Cobb-Cobb roosters) lines were crossed to generate an F2 population of 508 hens over seven hatches, and 26 traits related to bone integrity, including bone mineral density (BMD) and content (BMC), were measured. Genotypes of 120 microsatellite markers on 28 autosomal groups were determined, and interval m…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Understanding the influence of genetic variants on DNA methylation is fundamental for the interpretation of epigenomic data in the context of disease. There is a need for systematic approaches not only for determining methylation quantitative trait loci (methQTL), but also for discriminating general from cell type-specific effects.
RESULTS: Here, we present a two-step computational framework MAGAR ( https://bioconductor.org/packages/MAGAR ), which fully supports the identification of methQTLs from matched genotyping and DNA methylation data, and additionally allows for illuminatin…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: Addiction vulnerability involves complex gene X environment interactions leading to a pathological response to drugs. Identification of the genes involved in these interactions is an important step in understanding the underlying neurobiology and rarely have such analyses examined sex-specific influences. To dissect this interaction, we examined the impact of prenatal stress (PNS) on cocaine responsiveness in male and female mice of the BXD recombinant inbred panel.
EXPERIMENTAL APPROACH: BXD strains were subjected to timed mating and assigned to PNS or control groups.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mosquito Aedes aegypti is the principal vector of dengue and yellow fever flaviviruses. Permethrin is an insecticide used to suppress Ae. aegypti adult populations but metabolic and target site resistance to pyrethroids has evolved in many locations worldwide. Quantitative trait loci (QTL) controlling permethrin survival in Ae. aegypti were mapped in an F(3) advanced intercross line. Parents came from a collection of mosquitoes from Isla Mujeres, México, that had been selected for permethrin resistance for two generations and a reference permethrin-susceptible strain originally from New Or…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In our previous study, Dark-Agouti (DA) rats were found to be highly susceptible to 4-nitroquinoline 1-oxide (4NQO)-induced tongue carcinoma (TC), whereas Wistar / Furth (WF) rats were barely susceptible. Interval mapping analysis of reciprocal backcross rats showed two quantitative trait loci (QTL) on rat chromosomes (RNO) 1 and 19. In the present study, a composite interval mapping analysis was applied to 4NQO-induced TC in 130 (DA x WF) F2 rats, demonstrating five independent QTL, Tongue squamous cell carcinoma 1 - 5 (Tscc1 - 5), responsible for phenotypic differences in the size and number…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Differential sensitivity to the stimulant effects of ethanol on locomotor activity is determined in part by genetic differences. Among inbred strains of mice, moderate doses of ethanol (1-2 g/kg) stimulate locomotor activity in some strains, e.g., the DBA/2J (D2), but only mildly affect activity in other strains, e.g., C57BL/6J (B6) (Crabbe et al., 1982, 1983; Crabbe, 1986; Dudek and Phillips, 1990; Dudek et al., 1991; Dudek and Tritto, 1994). Quantitative trait loci (QTL) for the acute ethanol (1.5 g/kg) locomotor response has been identified in the BXD recombinant inbred (RI) series (N = 25 …
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Compared with C57BL/6J-A(y)/a, KK-A(y)/a mice have yellow fur that is markedly darker. Furthermore, there is a considerable variation in the tone of color with a continuous range in F(2) progeny produced from C57BL/6J females and KK-A(y)/a males. The aims of this study are to reveal the phenotypic differences between the two A(y) congenic strains and to elucidate the genetic factors responsible for the sooty yellow pigmentation in the KK background. On the basis of a chemical analysis, the sootiness in KK-A(y)/a was the result of increased eumelanin (PTCA) and decreased pheomelanin (AHP). A st
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.