Trichinella spiralis mainly dwells in the muscle tissue of its host and is the main causative agent of trichinellosis in humans. Nitric oxide (NO), an important intracellular signaling molecule that may restrict pathogen growth in infected hosts, has been known for its anti-pathogenic activity, including resistance to T. spiralis. Herein, we applied label-free analysis to investigate the effect of sodium nitroprusside (SNP, a NO donor compound) on the proteome of T. spiralis muscle larvae (ML), followed by Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway cluster an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human eye is built from several specialized tissues which direct, capture and pre-process information to provide vision. The gene expression of the different eye tissues has been extensively profiled with RNA-seq across numerous studies. Large consortium projects have also used RNA-seq to study gene expression patterning across many different human tissues, minus the eye. There has not been an integrated study of expression patterns from multiple eye tissues compared with other human body tissues. We have collated all publicly available healthy human eye RNA-seq datasets as well as dozens
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis is a major pathological feature of chronic liver diseases, including liver cancer. MicroRNAs (miRNAs), small noncoding RNAs, regulate gene expression posttranscriptionally and play important roles in various kinds of diseases; however, miRNA-associated hepatic fibrogenesis and its acting mechanisms are poorly investigated. Therefore, we performed an miRNA microarray in the fibrotic livers of Mus musculus treated with carbon-tetrachloride (CCl₄) and analyzed the biological functions engaged by the target genes of differentially-expressed miRNAs through gene ontology (GO) and in-d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Food-borne nematodes of the genus Anisakis are responsible for a wide range of illnesses (= anisakiasis), from self-limiting gastrointestinal forms to severe systemic allergic reactions, which are often misdiagnosed and under-reported. In order to enhance and refine current diagnostic tools for anisakiasis, knowledge of the whole spectrum of parasite molecules transcribed and expressed by this parasite, including those acting as potential allergens, is necessary.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: In this study, we employ high-throughput (Illumina) sequencing and bioinformatics to ch
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alcoholic hepatitis (AH) is an acute manifestation of alcoholic liver disease with high mortality rates.
OBJECTIVES: Our aim was to study the molecular mechanisms of AH.
MATERIALS AND METHODS: The differentially expressed genes (DEGs) in liver between AH and control cases were identified by analyzing the GSE28619 microarray data using t-test. The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathways and Gene Ontology (GO) enrichment analyses were performed using DAVID online tool. The protein-protein interaction (PPI) network was constructed using Search Tool for the Retrieval
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growing body of transcriptomic, proteomic, metabolomic and genomic data generated from disease states provides a great opportunity to improve our current understanding of the molecular mechanisms driving diseases and shared between diseases. The use of both clinical and molecular phenotypes will lead to better disease understanding and classification. In this study, we set out to gain novel insights into diseases and their relationships by utilising knowledge gained from system-level molecular data. We integrated different types of biological data including genome-wide association studies
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: The polycystic ovary syndrome (PCOS) is frequently associated with visceral obesity, suggesting that omental adipose tissue might play an important role in the pathogenesis of the syndrome.
OBJECTIVE: The objective was to study the expression profiles of omental fat biopsy samples obtained from morbidly obese women with or without PCOS at the time of bariatric surgery.
DESIGN: This was a case-control study.
SETTINGS: We conducted the study in an academic hospital.
PATIENTS: Eight PCOS patients and seven nonhyperandrogenic women submitted to bariatric surgery because of morbid obes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Depigmentation of specific areas of the skin is a persistent and long-lasting dermatologic disorder known as vitiligo, stemming from the impairment and disruption of melanocytes both structurally and functionally, leading to the loss of pigmentation in those regions.
AIM: Our objective was to identify the pivotal genes and upstream regulators, transcription factors (TFs), microRNAs (miRNAs), and pathways implicated in the pathogenesis of vitiligo.
METHODS: An integrated analysis was conducted using microarray datasets on vitiligo obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) da
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) release volatile organic compounds (VOCs), which promote plant growth.
RESULTS: A potential PGPR strain GX14001 was isolated from marine samples, and the VOCs produced by GX14001 significantly promoted tobacco (Nicotiana benthamiana) growth in a plate experiment. Based on 16S rRNA sequence alignment and physiological and biochemical characterization, GX14001 was identified as Microbacterium aurantiacum. Comparative transcriptome analysis was conducted between GX14001 VOCs-treated tobacco and the control; it was found that 1286 genes were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multidimensional nature of obsessive-compulsive disorder (OCD) has been consistently reported. Clinical and biological characteristics have been associated with OCD dimensions in different ways. Studies suggest the existence of specific genetic bases for the different OCD dimensions. In this study, we analyze the genomic markers, genes, gene ontology and biological pathways associated with the presence of aggressive/checking, symmetry/order, contamination/cleaning, hoarding, and sexual/religious symptoms, as assessed via the Dimensional Yale-Brown Obsessive Compulsive Scale (DY-BOCS) in 39
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study performed the first microarray analysis of long-noncoding RNA (lncRNA) and mRNA expression profiles in human steroid-induced avascular necrosis of the femoral head (SAVNFH). Expression levels of lncRNAs and mRNAs in three human SAVNFH samples and three human femoral head fracture samples (controls) were detected using third-generation lncRNA microarrays (KangChen Biotech, Shanghai, China). The fold change, false discovery rate, and P value were utilized to filter genes with significant differential expression in the SAVNFH samples compared with the control samples. In total, there w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intervention for patients with symptomatic varicose veins is largely driven by a combination of symptoms, the magnitude of venous reflux, clinical severity scoring algorithms, and unresponsiveness to conservative medical therapy. Our goal was to evaluate biological features of superficial veins from patients with symptomatic varicose veins, comparing these to healthy veins for biological insight into the progression of superficial vein disease.
METHODS: RNA was extracted from incompetent great saphenous veins at the time of phlebectomy and compared with residual healthy superficia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pulmonary infections caused by nontuberculous mycobacteria (NTM), particularly Mycobacterium avium complex (MAC), are increasingly recognized as an important clinical entity, yet distinguishing active pulmonary disease from asymptomatic colonization remains challenging because current diagnosis relies on composite criteria. In this study, we aimed to identify blood transcriptomic signatures that discriminate MAC pulmonary disease (MAC-PD) from pulmonary colonization (MAC-PC) and to evaluate their potential as candidate biomarkers. MAC-positive patients from two medical centres in Taiwan were e
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In 1990, David Barker proposed that prenatal nutrition is directly linked to adult cardiovascular disease. Since then, the relationship between adult cardiovascular risk, metabolic syndrome and birth weight has been widely documented. Here, we used the TruSeq Methyl Capture EPIC platform to compare the methylation patterns in cord blood from large for gestational age (LGA) vs adequate for gestational age (AGA) newborns from the LARGAN cohort.
RESULTS: We found 1672 differentially methylated CpGs (DMCs) with a nominal p < 0.05 and 48 differentially methylated regions (DMRs) with a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Astragalus membranaceus (AM, family: Leguminosae) exerts significant therapeutic effect on gastric ulcer (GU); however, there are scarce studies on its molecular mechanism against GU. This study aims to explore the key ingredients, key targets, and potential mechanisms of AM in the treatment of GU by utilizing network pharmacology and molecular docking.
METHODS: Several public databases were used to predict the targets of AM and GU, respectively, and the drug and disease targets were intersected to obtain the common targets. Next, the key ingredients and key targets were identifie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mycosis fungoides (MF) is the most common T-cell lymphoma, with indolent biologic behavior in the early stage and features of invasive in the tumor stage. The diagnosis of MF is still ambiguous and difficult. We focused on the proteomic profiling change in the pathogenesis of early MF and identified candidate biomarkers for early diagnosis.
METHODS: We collected peripheral blood samples of MF patients and healthy individuals (HI) performed proteomic profiling analysis using isobaric tags for relative and absolute quantification (iTRAQ) platform. Differently expressed proteins (DEPs)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In conducting genome-wide association studies (GWAS), analytical approaches leveraging biological information may further understanding of the pathophysiology of clinical traits. To discover novel associations with estimated glomerular filtration rate (eGFR), a measure of kidney function, we developed a strategy for integrating prior biological knowledge into the existing GWAS data for eGFR from the CKDGen Consortium. Our strategy focuses on single nucleotide polymorphism (SNPs) in genes that are connected by functional evidence, determined by literature mining and gene ontology (GO) hierarchi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the pathogenesis mechanism of hypertrophic scar (HS) and the effective means for its clinical treatment, the difference of the gene expressions between HS and normal skin was compared.
METHODS: The differentially expressed genes between HS and normal skin were obtained by mining PubMed. The dysregulated genes in HS were analyzed by a series of bioinformatics methods, including protein-protein interaction networks, pathways, Gene Ontology and functional annotation clustering analysis.
RESULTS: A total of 55 dysregulated genes in HS was identified (46 up-regulated genes a
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic is caused by the novel coronavirus that has spread rapidly around the world, leading to high mortality because of multiple organ dysfunction; however, its underlying molecular mechanism is unknown. To determine the molecular mechanism of multiple organ dysfunction, a bioinformatics analysis method based on a time-order gene co-expression network (TO-GCN) was performed. First, gene expression profiles were downloaded from the gene expression omnibus database (GSE161200), and a TO-GCN was constructed using the breadth-first search (BFS) algorithm to i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIGHLIGHTS: Systems-level bioinformatics delineates the molecular architecture of AF without overt comorbidity.Network analysis reveals a highly interconnected ion-channel-centered interactome.DMNC topology prioritizes 10 mechanistically relevant hub genes governing atrial electrophysiology.Sodium and potassium channel modulators emerge as dominant drivers of arrhythmogenic susceptibility.These findings establish a molecular framework for precision stratification in isolated AF.
BACKGROUND: Atrial fibrillation (AF) is the most common sustained cardiac arrhythmia and is associated with substan
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования