Serum prostate-specific antigen (PSA) is widely used for prostate cancer screening. While the genetics of PSA levels have been studied to enhance screening accuracy, the genetic basis of PSA velocity, the rate of PSA change over time, remains unclear. The Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian (PLCO) Cancer Screening Trial, a large, randomized study with longitudinal PSA data (15,260 cancer-free males, averaging 5.34 samples per subject) and genome-wide genotype data, provides a unique opportunity to estimate PSA velocity heritability. We developed a mixed model to jointly estimate the herita
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in cellular imaging technologies, especially those based on fluorescence in situ hybridization (FISH), now allow detailed visualization of the spatial organization of human or bacterial cells. Quantifying this spatial organization is crucial for understanding the function of multicellular tissues or biofilms, with implications for human health and disease. To address the need for better methods to achieve such quantification, we propose a flexible multivariate point process model that characterizes and estimates complex spatial interactions among multiple cell types. The proposed Baye
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accelerometer studies typically include repeated 24-h observations over several days and more recently have collected information on participants for weeks, months, or years. Meanwhile, there is growing evidence to suggest that components of physical activity beyond average or expected values are important for quantifying and understanding activity. Motivated by these emerging aspects, we introduce Multilevel Functional Quantile Principal Component Analysis (MFQPCA), a novel dimension-reduction technique that extends Functional Quantile Principal Component Analysis to hierarchical functional d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Existing approaches to modelling antibody concentration data are mostly based on finite mixture models that rely on the assumption that individuals can be divided into 2 distinct groups: seronegative and seropositive. Here, we challenge this dichotomous modelling assumption and propose a latent variable modelling framework in which the immune status of each individual is represented along a continuum of latent seroreactivity, ranging from minimal to strong immune activation. This formulation provides greater flexibility in capturing age-related changes in antibody distributions while preservin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Egocentric-network randomized trials (ENRTs) are increasingly used to estimate causal effects under interference when measuring complete sociocentric network data is infeasible. ENRTs rely on egocentric network sampling, where a set of egos is first sampled, and each ego recruits a subset of its neighbors as alters. Treatments are then randomized across egos. While the observed ego-networks are disjoint by design, the underlying population network may contain edges connecting them, leading to contamination. Under a design-based framework, we show that the Horvitz-Thompson estimators of direct
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWASs) have highlighted the importance of pleiotropy in human diseases, where one gene can impact 2 or more unrelated traits. Examining shared genetic risk factors across multiple diseases can enhance our understanding of these conditions by pinpointing new genes and biological pathways involved. Furthermore, with an increasing wealth of GWAS summary statistics available to the scientific community, leveraging these findings across multiple phenotypes could unveil novel pleiotropic associations. Existing selection methods examine pleiotropic associations one by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The preclinical stage of many neurodegenerative diseases can span decades before symptoms become apparent. Understanding the sequence of preclinical biomarker changes provides a critical opportunity for early diagnosis and effective intervention prior to significant loss of patients' brain functions. The main challenge to early detection lies in the absence of direct observation of the disease state and the considerable variability in both biomarkers and disease dynamics among individuals. Recent research hypothesized the existence of subgroups with distinct biomarker patterns due to co-morbid
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Computed tomography (CT) has been a powerful diagnostic tool since its emergence in the 1970s. Using CT data, 3D structures of human internal organs and tissues, such as blood vessels, can be reconstructed using professional software. This 3D reconstruction is crucial for surgical operations and can serve as a vivid medical teaching example. However, traditional 3D reconstruction heavily relies on manual operations, which are time-consuming, subjective, and require substantial experience. To address this problem, we develop a novel semiparametric Gaussian mixture model tailored for the 3D reco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An N-of-1 trial is a multiple crossover trial conducted in a single individual to provide evidence to directly inform personalized treatment decisions. Advances in wearable devices greatly improved the feasibility of adopting these trials to identify optimal individual treatment plans, particularly when treatments differ among individuals and responses are highly heterogeneous. Our work was motivated by the I-STOP-AFib Study, which examined the impact of different triggers on atrial fibrillation (AF) occurrence. We described a causal framework for "N-of-1" trial using potential treatment selec
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For a comprehensive understanding of the effect of a given treatment on an outcome of interest, quantification of individual treatment heterogeneity is essential, alongside estimation of the average causal effect. However, even in randomized controlled trials, quantities such as the probability of benefit or the probability of harm are not identifiable, since multiple potential outcomes cannot be observed simultaneously for the same individual. We propose a sensitivity analysis for the probability of benefit in randomized controlled trial settings with a binary treatment and a binary outcome,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In life history analysis of data from cohort studies, it is important to address the process by which participants are identified and selected. Many health studies select or enrol individuals based on whether they have experienced certain health related events, for example, disease diagnosis or some complication from disease. Standard methods of analysis rely on assumptions concerning the independence of selection and a person's prospective life history process, given their prior history. Violations of such assumptions are common, however, and can bias estimation of process features. This has
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goal of radiation therapy for cancer is to deliver prescribed radiation dose to the tumor while minimizing dose to the surrounding healthy tissues. To evaluate treatment plans, the dose distribution to healthy organs is commonly summarized as dose-volume histograms (DVHs). Normal tissue complication probability (NTCP) modeling has centered around making patient-level risk predictions with features extracted from the DVHs, but few have considered adapting a causal framework to evaluate the safety of alternative treatment plans. We propose causal estimands for NTCP based on deterministic and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Univariate zero-inflated models are increasingly being used to account for excess zeros in spatio-temporal infectious disease counts. However, the multivariate case is challenging due to the need to account for correlations across space, time and disease in both the count and zero-inflated components of the model. We are interested in comparing the transmission dynamics of several co-circulating infectious diseases across space and time, where some of the diseases can be absent for long periods. We first assume there is a baseline disease that is well-established and always present in the regi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rich longitudinal individual level data available from electronic health records (EHRs) can be used to examine treatment effect heterogeneity. However, estimating treatment effects using EHR data poses several challenges, including time-varying confounding, repeated and temporally non-aligned measurements of covariates, treatment assignments and outcomes, and loss-to-follow-up due to dropout. Here, we develop the subgroup discovery for longitudinal data algorithm, a tree-based algorithm for discovering subgroups with heterogeneous treatment effects using longitudinal data by combining the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An important task in survival analysis is choosing a structure for the relationship between covariates of interest and the time-to-event outcome. For example, the accelerated failure time (AFT) model structures each covariate effect as a constant multiplicative shift in the outcome distribution across all survival quantiles. Though parsimonious, this structure cannot detect or capture effects that differ across quantiles of the distribution, a limitation that is analogous to only permitting proportional hazards in the Cox model. To address this, we propose a general framework for quantile-vary
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combination antiretroviral therapy (ART) with at least three different drugs has become the standard of care for people with HIV (PWH) due to its exceptional effectiveness in viral suppression. However, many ART drugs have been reported to associate with neuropsychiatric adverse effects including depression, especially when certain genetic polymorphisms exist. Pharmacogenetics is an important consideration for administering combination ART as it may influence drug efficacy and increase risk for neuropsychiatric conditions. Large-scale longitudinal HIV databases provide researchers opportunitie
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asthma is a disease characterized by chronic airway hyperresponsiveness and inflammation, with signs of variable airflow limitation and impaired lung function leading to respiratory symptoms such as shortness of breath, chest tightness and cough. Eosinophilic asthma is a distinct phenotype that affects more than half of patients diagnosed with severe asthma. It can be effectively treated with monoclonal antibodies targeting specific immunological signaling pathways that fuel the inflammation underlying the disease, particularly Interleukin-5 (IL-5), a cytokine that plays a crucial role in asth
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapidly detecting problems in the quality of care is of utmost importance for the well-being of patients. Without proper inspection schemes, such problems can go undetected for years. Cumulative sum (CUSUM) charts have proven to be useful for quality control, yet available methodology for survival outcomes is limited. The few available continuous time inspection charts usually require the researcher to specify an expected increase in the failure rate in advance, thereby requiring prior knowledge about the problem at hand. Misspecifying parameters can lead to false positive alerts and large det
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We introduce a multilevel functional Beta model to quantify the blood glucose levels measured by continuous glucose monitors for multiple days in study participants with type 2 diabetes mellitus. The model estimates the subject-specific marginal quantiles, quantifies the within- and between-subject variability, and produces interpretable parameters of blood glucose dynamics as a function of time from the actigraphy-estimated sleep onset. Results are validated via simulations and by studying the association between the estimated model parameters and hemoglobin A1c, the gold standard for assessi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In studies of maternal exposure to air pollution, a children's health outcome is regressed on exposures observed during pregnancy. The distributed lag nonlinear model (DLNM) is a statistical method commonly implemented to estimate an exposure-time-response function when it is postulated the exposure effect is nonlinear. Previous implementations of the DLNM estimate an exposure-time-response surface parameterized with a bivariate basis expansion. However, basis functions such as splines assume smoothness across the entire exposure-time-response surface, which may be unrealistic in settings wher
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.