O2-evolving chlorite dismutases (Clds) fall into two subfamilies, which efficiently convert ClO2- to O2 and Cl-. The Cld from Dechloromonas aromatica (DaCld) represents the chlorite-decomposing homopentameric enzymes found in perchlorate- and chlorate-respiring bacteria. The Cld from the Gram-negative human pathogen Klebsiella pneumoniae (KpCld) is representative of the second subfamily, comprising homodimeric enzymes having truncated N-termini. Here steric and nonbonding properties of the DaCld and KpCld active sites have been probed via kinetic, thermodynamic, and spectroscopic behaviors of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metallo-β-lactamases (MBLs) are zinc ion dependent enzymes that are responsible for the emergence and spread of β-lactam resistance among bacterial pathogens. There are uncharacterized putative MBLs in the environment and their emergence is major interference in the generation of universal MBL inhibitors so it is important to identify and characterize novel MBLs. In this study two novel MBLs from Luteimonas sp. J29 and Pseudoxanthomonas mexicana were identified using B3 MBLs as query in BLAST database search. 3D models of putative MBLs generated by SWISS-MODEL server taking AIM-1 as a structur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonheme oxoiron(IV) complexes can serve as synthons for generating heterobimetallic oxo-bridged dimetal complexes by reaction with divalent metal complexes. The formation of FeIII-O-CrIII and FeIII-O-MnIII complexes is described herein. The latter complexes may serve as models for the FeIII-X-MnIII active sites of an emerging class of Fe/Mn enzymes represented by the Class 1c ribonucleotide reductase from Chlamydia trachomatis and the R2-like ligand-binding oxidase (R2lox) found in Mycobacterium tuberculosis. These synthetic complexes have been characterized by UV-Vis, resonance Raman, and X-r
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metallo-β-lactamases are important as a major source of resistance of pathogenic bacteria to the widely used β-lactam antibiotics. They show considerable diversity in terms of sequence and are grouped into three subclasses, B1, B2 and B3, which share a common overall fold. In each case the active enzyme has binding sites for two zinc ions in close proximity, although the amino-acid residues which coordinate the metals vary from one subclass to another. In subclasses B1 and B3, there has been controversy about whether both zinc ions are required for activity, but the most recent evidence indica
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Rv2416c gene of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) encodes the enhanced intracellular survival (Eis) protein that enhances intracellular survival of the pathogen in host macrophages during infection. The Mtb Eis protein is released into the cytoplasm of the phagocyte during intracellular infection and modulates the host immune response. It also contributes to drug resistance by acetylating multiple amine groups of aminoglycosides. Interestingly, the nonpathogenic M. smegmatis (Msm) contains a homologous eis gene (MSMEG_3513). The overall structures of Mtb Eis and Msm Eis are highly similar t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The active site of the [Fe]-hydrogenase features an iron(II) centre bearing cis carbonyl groups and a chelating pyridine-acyl ligand. Reproducing these unusual features in synthetic models is an intriguing challenge, which will allow both better understanding of the enzymatic system and more fundamental insight into the coordination modes of iron. By using the carbamoyl group as a surrogate for acyl, we have been able to synthesize a range of ferracyclic complexes. Initial reaction of Fe(CO)4Br2 with 2-aminopyridine yields a complex bearing a labile solvent molecule, which can be replaced by s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Both HIV-1 integrase (IN) and the central catalytic domain of IN (IN-CCD) catalyze the disintegration reaction in vitro. In this study, IN and IN-CCD proteins were expressed and purified, and a high-throughput format enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was developed for the disintegration reaction. IN exhibited a marked preference for Mn(2+) over Mg(2+) as the divalent cation cofactor in disintegration. Baicalein, a known IN inhibitor, was found to be an IN-CCD inhibitor. The assay is sensitive and specific for the study of disintegration reaction as well as for the in vitro identificati…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sphingobium chlorophenolicum completely mineralizes PCP (pentachlorophenol). Two GSTs (glutathione transferases), PcpC and PcpF, are involved in the degradation. PcpC uses GSH to reduce TeCH (tetrachloro-p-hydroquinone) to TriCH (trichloro-p-hydroquinone) and then to DiCH (dichloro-p-hydroquinone) during PCP degradation. However, oxidatively damaged PcpC produces GS-TriCH (S-glutathionyl-TriCH) and GS-DiCH (S-glutathionyl-TriCH) conjugates. PcpF converts the conjugates into TriCH and DiCH, re-entering the degradation pathway. PcpF was further characterized in the present study. It catalysed GS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brown spiders have world-wide distribution and are the cause of health problems known as loxoscelism. Necrotic cutaneous lesions surrounding … n chelators significantly inhibited hemolysis evoked by phospholipase-D, which has magnesium at the catalytic domain. Chelators were more effective than PMSF (serine-protease inhibitor) that had no effect on hemolysis. By site-directed mutation at catalytic domain (histidine 12 by alanine), hemolysis and morphologic changes of erythrocytes (but not the toxin's abi …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubiquitin-fold modifier 1 (Ufm1)-specific protease 2 (UfSP2) is a cysteine protease that is responsible for the release of Ufm1 from Ufm1-conjugated cellular proteins, as well as for the generation of mature Ufm1 from its precursor. The 2.6 Å resolution crystal structure of mouse UfSP2 reveals that it is composed of two domains. The C-terminal catalytic domain is similar to UfSP1 with Cys(294), Asp(418), His(420), Tyr(282), and a regulatory loop participating in catalysis. The novel N-terminal domain shows a unique structure and plays a role in the recognition of its cellular substrate C20orf1…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the phosphoinositide-3-kinase-related kinase (PIKK) family, which includes mTOR, ATM, ATR, and hSMG-1, play important roles in regulating the cellular response to environmental stimuli. Despite the similarity of their catalytic domain to that of phosphoinositide-3-kinase, these extremely large (>250 kDa) polypeptides function as serine/threonine protein kinases. The catalytic activities of these PIKK family members can now be measured in immune-complex kinase assays. This assay involves isolation of the kinase by immunoprecipitation and the in vitro phosphorylation of a specific sub…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elemental sulfur reduction is a key process in anaerobic ecosystems and the global sulfur cycle. Although elemental sulfur serves as a terminal electron acceptor in microbial respiration, the molecular basis is unclear. Here, we identify a conserved multiheme cytochrome c selenoprotein essential for sulfur reduction in a sulfur-respiring bacterium. Structural and biochemical analyses show that the enzyme forms a tetramer, with each subunit containing five hemes and one selenocysteine residue. The enzyme catalyzes polysulfide reduction at an active site, where a cysteine coordinates the heme ir
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extensive use of polyethylene terephthalate (PET) has resulted in severe environmental pollution and ecological stress. Despite advances in PET recycling, current processes struggle to achieve high product value, as the complete conversion to terephthalic acid remains energetically demanding and economically inefficient. The catalytic promiscuity inherent in natural enzyme evolution holds great promise for providing novel candidates to accelerate PET biodegradation and upcycling. Herein, we report for the first time that the acyltransferase metA from Mycobacterium tuberculosis (MtMetA) cat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, there has been growing interest in the function and physiological importance of human TANGO2 (transport and Golgi organization 2 homolog), particularly whether it acts as a heme-trafficking protein. To address this question, we experimentally determined the three-dimensional structure of TANGO2. Our crystallographic analysis indicates that interactions between heme and TANGO2 are nonspecific. Structural comparison of the TANGO2 crystal structure with known cysteine Ntn-hydrolases allowed us to identify a putative active site, catalytic residues and a substrate-binding cavity that cor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The acquisition of iron is critical for the survival and the virulence of numerous infectious pathogens, and most bacteria acquire ferrous iron (Fe2+) by utilizing the ferrous iron transport (Feo) system. FeoB is the main component of this system and its function is regulated by its soluble cytosolic domain, termed NFeoB. We have recently begun to define the structure and the mechanism of the Feo system from the bacterium Vibrio cholerae, the causative agent of the disease cholera. However, major structural gaps in our understanding of the nucleotide-promiscuous V. cholerae NFeoB still exist.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Related to the inactive form of nitrile hydratase, NHase, that contains Fe(NO) within tripeptide N2S2 binding environment, the NO transfer reactivity of (bis-mercaptoethane diazacycloheptane)Fe(NO) and (bis-mercaptoethane diazadimethylethane)Fe(NO) is compared to Co(NO) analogs. Acceptors of NO include cobalt octaethylporphyrin and the [(N2S2)M] dimeric precursors in the synthesis of the Fe(NO) and Co(NO) biomimetics. Qualitative rates are augmented by a definitive kinetic study finding that rates of NO transfer from (N2S2)M(NO) to [(N2S2)M']2 are dependent on M and M' as well as the hydrocarb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soluble guanylate cyclases are gas-sensing enzymes in eukaryotes that catalyze the formation of cyclic GMP from GTP. While commonly studied … ess NO (relative to the heme concentration). Additionally, two different variants of the C-terminal catalytic domain of Cf sGC1 (sGC1-CAT) were expressed and characterized. The Kd for sGC1-CAT dimerization was 1.8 ± 0.4 μM, compared to the estimated nanomolar affinity of the full-length Cf sGC1 construct. This implies that the N-terminal domains influence enzyme d …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants of human CDC14A (cell division cycle 14A) are associated either with nonsyndromic deafness DFNB32 or hearing impairment infertile male syndrome (HIIMS). The 623-residue CDC14A protein has two globular domains (residues 17-152 and 217-325) and a 278-residue C-terminal intrinsically disordered region (IDR). To date, 16 recessive variants of human CDC14A are associated with hearing loss. Variants affecting the globular N-terminal domains of human CDC14A are associated with HIIMS, whereas mutations in the IDR cause nonsyndromic deafness DFNB32. Here, we tested the hypothesis th
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenylyl Cyclase isoform 1 (AC1), responsible for synthesizing the signaling molecule cyclic adenosine monophosphate (cAMP), is key in synaptic plasticity, long-term chronic pain syndromes, osteosarcoma-associated pain, and drug abuse. The protein calmodulin (CaM) and the small molecule forskolin (Fsk) stimulate AC1 to form a catalytic site for ATP catalysis; however, molecular AC1 structural changes triggered by CaM and Fsk remain poorly understood. This study developed a computational model for AC1-cofactor complexes and used all-atom molecular dynamics (MD) simulations to determine how CaM
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования