Trichloroethylene (TCE), a common environmental contaminant, causes hepatocellular carcinoma in mice but not in rats. To understand the mechanisms of the species-specific hepatocarcinogenecity of TCE, we examined the methylation status of DNA in the liver of rats exposed to TCE at 0 or 1000 mg/kg b.w. for 5 days using MeDIP-chip, bisulfite sequencing, COBRA, and LC-MS/MS. The related mRNA expression levels were measured by qPCR. Although no global DNA methylation change was detected, 806 genes were hypermethylated and 186 genes were hypomethylated. The genes with hypermethylated DNA were enric
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously isolated subtracted cDNA clones for genes having increased expression in Tsc2 gene mutant (Eker) rat renal carcinomas (RCs). Among them, fra-1 encoding a transcriptional factor activator protein 1 (AP-1) was identified. We have therefore investigated whether other members of the AP-1 transcription factor family might also be involved in renal carcinogenesis in the Eker rat model. In the present study, overexpression of fra-1, fra-2, c-jun, junB, and junD mRNAs was demonstrated in RCs by Northern blot analysis. Interestingly, AP-1 proteins were highly expressed even in the earlies
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Androgenetic alopecia (AGA) is associated with follicular miniaturization, oxidative stress, and microinflammation. Hydroxytyrosol (HT) has antioxidant and anti-inflammatory activities, but its mechanisms in AGA remain unclear. Differentially expressed genes (DEGs) from GSE212301 were intersected with predicted HT targets to identify candidate targets. Enrichment analysis, PPI-based hub gene screening, molecular docking, and molecular dynamics (MD) simulations were performed. A total of 506 DEGs and 24 HT-related AGA candidate targets were identified. These targets were enriched in inflammatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acrylamide (ACR) is a common food and environmental contaminant with potential carcinogenicity, but its molecular role in the development of breast cancer (BC) remains unclear. This study employed a network toxicology and molecular docking strategy to explore the potential association between ACR exposure and BC. Differentially expressed genes were first identified by comparing gene expression profiles between breast cancer and normal tissues. BC-related targets were then screened through integrated analysis of multiple databases and intersected with ACR-associated targets, resulting in 49 sha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrazine (ATZ) is the second most used herbicide against broadleaf and grassy weeds worldwide. ATZ persists in soil and water due to its long half-life, and is considered an endocrine disrupting chemical for humans. Epidemiological studies have indicated an intimate relationship between ATZ and the pathogenesis of prostate cancer (PCa). However, the underlying toxicological mechanisms remain barely elucidated. Leveraging the CTD, GeneCards, OMIM, PharmGKB, and TTD databases, we identified 154 target genes associated with ATZ exposure and PCa. Using STRING and Cytoscape tools, a PPI network was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myelination of the peripheral nervous system is required for axonal function and long term stability. After peripheral nerve injury, Schwann cells transition from axon myelination to a demyelinated state that supports neuronal survival and ultimately remyelination of axons. Reprogramming of gene expression patterns during development and injury responses is shaped by the actions of distal regulatory elements that integrate the actions of multiple transcription factors. We used ChIP-seq to measure changes in histone H3K27 acetylation, a mark of active enhancers, to identify enhancers in myelina
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute kidney injury (AKI) is a frequent and severe complication following aortic dissection repair surgery that utilizes deep hypothermic circulatory arrest (DHCA). This study aimed to identify key hub genes and elucidate the molecular pathways involved in DHCA-associated AKI (DHCA-AKI).
METHODS: A rat model of DHCA was established, and kidney tissues were harvested for high-throughput transcriptome sequencing. Differentially expressed genes (DEGs) between DHCA and control groups were identified using three independent analytical methods (DESeq2, limma, edgeR). Hub genes were subs
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) is the causative agent of a fatal malignancy known as adult T-cell leukemia (ATL). One way to address the pathology of the disease lies on conducting research with a molecular approach. In addition to the analysis of ATL-relevant signaling pathways, understanding the regulation of important and relevant transcription factors allows researchers to reach this fundamental objective. HTLV-1 encodes for two oncoproteins, Tax and HTLV-1 basic leucine-zipper factor, which play significant roles in the cellular transformation and the activation of the host's
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endothelin-1 (ET-1), a powerful vasoconstrictor peptide, is produced by activated hepatic stellate cells (HSC) and promotes cell proliferation, fibrogenesis, and contraction, the latter of which has been thought to be mechanistically linked to portal hypertension in cirrhosis. Interferon-γ (IFNγ), a Th1 cytokine produced by T cells, inhibits stellate cell proliferation, fibrogenesis, and muscle-specific gene expression. Whether IFNγ-induced inhibitory effects are linked to regulation of ET-1 expression in activated stellate cells remains unknown. Here we examined IFNγ's effects on preproET-1 m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Observational studies link hyperthyroidism to increased prostate cancer (PCa) risk, but causality and mechanisms remain unclear. Graves' disease (GD), the primary cause of hyperthyroidism, involves chronic immune dysregulation that may influence PCa through shared immune pathways.
METHODS: We performed bidirectional two-sample Mendelian randomization (MR) using IEU Open GWAS data, then integrated differential expression analysis, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), and machine learning on Gene Expression Omnibus (GEO) datasets to identify shared gene, validated b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcopenia and osteoporosis share pathophysiological links, but their co-occurrence mechanisms remain unclear. This study aimed to identify molecular mediators of their co-development using bioinformatics. Datasets for sarcopenia (GSE56815) and osteoporosis (GSE9103) were retrieved from GEO. Differentially expressed genes (DEGs) were analysed via edgeR and limma. Gene ontology (GO), Kyoto encyclopaedia of genes and genomes (KEGG) and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) identified shared pathways and hub genes. Protein-protein interaction (PPI) networks were constructed using S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have used cDNA arrays to investigate gene expression patterns in peripheral blood mononuclear cells from patients with leukemic forms of cutaneous T cell lymphoma, primarily Sezary syndrome (SS). When expression data for patients with high blood tumor burden (Sezary cells >60% of the lymphocytes) and healthy controls are compared by Student's t test, at P < 0.01, we find 385 genes to be differentially expressed. Highly overexpressed genes include Th2 cells-specific transcription factors Gata-3 and Jun B, as well as integrin beta1, proteoglycan 2, the RhoB oncogene, and dual specificity phos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: Gastric cancer (GC) is a major global health concern, ranking as the fifth most commonly diagnosed cancer. New treatment strategies like chemoprevention with oxaliplatin (OXA) are emerging, but safety data for GC patients are limited. This in silico study aimed to predict potential paradoxical effects of OXA treatment in GC patients using computational analysis.
EXPERIMENTAL APPROACH: RNA-sequencing data from GSE26942, GSE66229, and TCGA-STAD datasets were analyzed. Differential gene expression was identified using GEO2R and DESeq2. Pathway enrichment and protein-prote
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal Cord Injury (SCI) impacts neural function and regeneration. This study aimed to identify key axon regeneration genes in SCI and their correlations with immune infiltration and SCI subtyping.
METHODS: Gene expression profiles of 30 sham-operated mice and 29 SCI mice were obtained from GSE5296, GSE47681, and GSE93561 datasets. A PPI network of axon regeneration genes was constructed. Consensus clustering classified SCI subtypes. Differential expression analysis identified genes associated with SCI and its subtypes. Immune infiltration was assessed. WGCNA identified key genes.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In clinical practice, the limited efficacy of standard comprehensive therapy for advanced bladder cancer and the lack of targeted treatment options are well recognized. Targeting abnormal epigenetic modifications in tumors has shown considerable potential in cancer therapy. Through drug screening in tumor organoids, we identified that ML324, a histone lysine demethylase 4A (KDM4A) inhibitor, exhibits potent antitumor effects in both in vitro and in vivo cancer models. Mechanistically, Kdm4a demethylates H3K9me3, leading to chromatin opening and increased accessibility of Gabpa to the squalene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The causative gene of Fukuyama congenital muscular dystrophy (fukutin) is involved in formation of the basement membrane through glycosylation of alpha-dystroglycan. However, there are other proposed functions that have not been fully understood. Using cultured astrocytes (1321N1), we found nuclear localization of fukutin and a positive relationship between fukutin expression and cell proliferation. Among potential proteins regulating cell proliferation, we focused on cyclin D1, by reverse-transcription polymerase chain reaction, Western blotting, immunocytochemistry, enzyme-linked immunosorbe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence has indicated that abnormal microRNAs (miRNAs) participated in carcinogenesis and tumor progression in hepatocellular carcinoma (HCC). Better understanding the association between miRNAs and HCC may contribute to discover novel therapeutic approaches for diagnosis and treatments. In the current study, we have shown that miR-1204 level was elevated in HCC tissues and cell lines, which was associated with malignant clinical features, including large tumor size and advanced TNM stage. Furthermore, gain-or loss-of function assays demonstrated that miR-1204 promoted cell prolifera
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОтозванная публикацияПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of acute cyanide intoxication on levels of transcriptional regulatory proteins Fos and c-Jun in rat cortex, hippocampus, cerebellum and brain stem was studied. Western blot analysis showed a differential effect of cyanide on Fos levels in the selected brain areas. The most prominent changes were seen 60 min. following ip. injection of KCN in all brain areas except the brain stem, which showed the maximal change 120 min. following cyanide. Fos levels were doubled in cortex and cerebellum and decreased to below 70% of the control levels in hippocampus. Levels of c-Jun were not altered
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Little knowledge about long non-coding RNAs(lncRNAs) in nasopharyngeal carcinoma (NPC) has been acquired. Methods: Next-generation sequencing was applied in 7 cases of NPC tissues and 7 cases of normal tissues in nasopharynx. PLEX, CNCI and CPAT soft-wares were used to predict novel lncRNAs. Real-time Quantitative PCR (qPCR) further validated the data in 20 cases of NPC tissues and 14 cases of normal tissues. Then the cis-regulators and trans-regulators and potential biological functions together with pathways were predicted by Bioinformatics. Results: Totally, 4248 novel lncRNAs w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA) is an inherited neuromuscular disorder caused by a polyglutamine (polyQ) repeat expansion in the androgen receptor (AR). PolyQ-AR neurotoxicity may involve generation of an N-terminal truncation fragment, as such peptides occur in SBMA patients and mouse models. To elucidate the basis of SBMA, we expressed N-terminal truncated AR in motor neuron-derived cells and primary cortical neurons. Accumulation of polyQ-AR truncation fragments in the cytosol resulted in neurodegeneration and apoptotic, caspase-dependent cell death. Using primary neurons from mic
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования