BACKGROUND: Hidradenitis suppurativa (HS) is a chronic inflammatory skin disease defined by recurrent nodules, tunnels and scarring involving the intertriginous regions. Recent next-generation sequencing (NGS) studies suggest genera such as Prevotella spp., Peptoniphilus spp. and Porphyromonas spp. are associated with chronic and early HS lesions. However, a systematic investigation of the bacterial microbiome in HS tunnels remains unexplored using NGS.
OBJECTIVE: We aimed to investigate the bacterial composition of the luminal white gelatinous material found in HS tunnels using NGS.
METHODS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease is a neurodegenerative disorder and the most common and devastating form of dementia. It affects mainly older people, accounting for 50-80% of dementia cases. The age is the main associated risk factor and based on the onset age, early-onset (EOAD) or late-onset (LOAD) forms are distinguished. AD has a strong impact both on the life-style of patients and their families and on the society, due to the high costs related to social and medical care. So far, despite the great advances in understanding of the AD pathogenesis, there is no a cure for this form of dementia and curre
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Massively parallel sequencing technologies such as exome sequencing are increasingly applied across medicine. Connaughton et al. report a high diagnostic yield of exome sequencing among adults with hereditary nephropathy or nephropathy of unknown cause. Their findings support broader use of genomic sequencing in nephrology and highlight key associated questions, including how to identify those patients for whom testing is indicated, pinpoint pathogenic variants, and balance the resultant health care benefits and clinical follow-up burden.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаКомментарийПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary tubulopathies are rare diseases with unknown prevalence in adults. Often diagnosed in childhood, hereditary tubulopathies can nevertheless be evoked in adults. Precise diagnosis can be difficult or delayed due to insidious development of symptoms, comorbidities and polypharmacy. Here we evaluated the diagnostic value of a specific panel of known genes implicated in tubulopathies in adult patients and compared to our data obtained in children. To do this we analyzed 1033 non-related adult patients of which 744 had a clinical diagnosis of tubulopathy and 289 had a diagnosis of familia
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are a class of short-chain RNA molecules of ~22 nucleotides in length and regulate gene expression at posttranscriptional levels by interacting with mRNAs. Although many miRNAs have been identified, the expression and function of miRNAs in the pituitary gland of sheep are still unclear. In this study, the identity and abundance of miRNAs were determined in the sheep pituitary gland of prenatal and postnatal stages. We showed that 107 miRNAs are significantly (P<0.05) differentially expressed in pituitary glands between the prenatal and postnatal stages, and 44 new miRNA cand
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study is focused on the identification of the faecal virome of healthy chickens raised in high-density, export-driven poultry farms in Brazil. Following high-throughput sequencing, a total of 7743 de novo-assembled contigs were constructed and compared with known nucleotide/amino acid sequences from the GenBank database. Analyses with blastx revealed that 279 contigs (4 %) were related to sequences of eukaryotic viruses. Viral genome sequences (total or partial) indicative of members of recognized viral families, including Adenoviridae, Caliciviridae, Circoviridae, Parvoviridae, Picobirna
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysferlin-deficient limb girdle muscular dystrophy type 2B, distal Miyoshi myopathy, and other less frequent phenotypes are a group of recessive disorders called dysferlinopathies. They are characterized by wide clinical heterogeneity. To diagnose dysferlinopathy, a clinical neuromuscular workup, including electrophysiological and muscle imaging investigations, is essential to support subsequent laboratory testing. Increased serum creatine kinase levels, distal or proximal muscle weakness, and myalgia with onset in the second or third decades are the main clinical features of the disease. In m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid low-cost whole-genome sequencing (WGS) is revolutionizing microbiology; however, complementary advances in accessible, reproducible, and rapid analysis techniques are required to realize the potential of these data. Here, investigations of the genus Neisseria illustrated the gene-by-gene conceptual approach to the organization and analysis of WGS data. Using the gene and its link to phenotype as a starting point, the BIGSdb database, which powers the PubMLST databases, enables the assembly of large open-access collections of annotated genomes that provide insight into the evolution of th
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine circovirus type 2 (PCV2) is the essential etiological infectious agent of PCV2-systemic disease and has been associated with other swine diseases, all of them collectively known as porcine circovirus diseases. MicroRNAs (miRNAs) are a new class of small non-coding RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally. miRNAs play an increasing role in many biological processes. The study of miRNA-mediated host-pathogen interactions has emerged in the last decade due to the important role that miRNAs play in antiviral defense. The objective of this study was to identify the miRNA ex
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichomonas vaginalis colonizes the human urogenital tract and causes trichomoniasis, the most common nonviral sexually transmitted disease. Currently, 5-nitroimidazoles are the only recommended drugs for treating trichomoniasis. However, increased resistance of the parasite to 5-nitroimidazoles has emerged as a highly problematic public health issue. Hence, it is essential to identify alternative chemotherapeutic agents against refractory trichomoniasis. Tetracycline (TET) is a broad-spectrum antibiotic with activity against several protozoan parasites, but the mode of action of TET in parasi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We used high throughput sequencing to examine the structure and composition of the T cell receptor β chain in Common Variable Immune Deficiency (CVID). TCRβ CDR3 regions were amplified and sequenced from genomic DNA of 44 adult CVID subjects and 22 healthy adults, using a high-throughput multiplex PCR. CVID TCRs had significantly less junctional diversity, fewer n-nucleotide insertions and deletions, and completely lacked a population of highly modified TCRs, with 13 or more V-gene nucleotide deletions, seen in healthy controls. The CVID CDR3 sequences were significantly more clonal than contr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole-genome sequencing (WGS) has become the key approach for molecular surveillance of Listeria monocytogenes. Genome comparison analysis can reveal transmission routes that cannot be found with classic epidemiology. A widespread standard for use in genome comparison analysis involves data from short-read sequencing, generated on Illumina or Ion Torrent devices. To date, little is known about the compatibility of data from both platforms. This knowledge is essential when it comes to the central analysis of data, for example, in the case of outbreaks. We used WGS data from 47 L. monocytogenes
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: EpicPCR links functional genes to taxonomic markers at the single-cell level and has become an important method in microbial ecology and antimicrobial resistance research. However, the lack of missing standardized data analysis workflows limits reproducibility and comparability across studies. Existing analyses are often based on custom, unpublished scripts, complicating cross-study benchmarking and reuse.
RESULTS: We present ERMA, an open-source, Snakemake-based pipeline that enables an automated, standardized, reproducible, and scalable epicPCR data analysis with minimal user in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The widespread use of next-generation sequencing in clinical practice has generated vast numbers of genetic variants from both inherited disorders and tumor profiling, many classified as variants of uncertain significance (VUS). These uncertain variants limit the clinical utility of genomic testing by constraining risk assessment, diagnosis, and treatment selection. Multiplexed Assays of Variant Effect (MAVEs) provide scalable, high-throughput functional data for variant characterization and are recognized by ACMG/AMP guidelines as valid evidence for clinical classification. However, existing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Encephalitis and meningitis are neurological emergencies in which delayed diagnosis may lead to severe neurological sequelae, necessitating accurate and rapid etiological identification. In recent years, metagenomic next-generation sequencing (mNGS), which enables comprehensive analysis of microbial genomes without prespecified hypotheses, has attracted increasing attention. Its clinical application in neuroinfectious diseases has contributed to improved diagnostic yield and the detection of rare pathogens. In particular, mNGS has been shown to be useful in clinically challenging situations su
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiomics, next-generation, and long-read sequencing approaches have transformed the practice of medical genetics. Complex cases often require several person-hours to make sense of the tens of thousands to millions of variants and biochemical patterns in each patient. Availability of massive datasets challenges traditional analytical and interpretive approaches. Artificial intelligence offers powerful ways to handle the growing volume and complexity of genomic and phenotypic data in clinical genetics. It is already influencing several areas of practice, including variant prioritization and in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with cancer treatment-related lung injury (CTLI) frequently present with non-specific respiratory symptoms and radiological changes that closely mimic infectious pneumonia or tumor progression, presenting a significant challenge for a definitive diagnosis. Traditional diagnostic processes, mainly evaluated through blood biomarkers and standard microbial cultures, usually cannot make a clear diagnosis and take too much time. Here, we present a comprehensive protocol to diagnose CTLI by combining bronchoalveolar lavage fluid (BALF) cytological analysis with metagenomic next-generation s
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput sequencing has transformed clinical diagnostics of rare diseases (RD), cancer and infectious diseases by enabling the identification of disease-causing genetic alterations and facilitating individualised treatment and care. In response to these advances, Genomic Medicine Sweden (GMS) was established in 2017 as a national collaborative effort to accelerate implementation of genomics-based precision medicine within Sweden's regionally organized, publicly funded healthcare system. GMS brings together the seven university healthcare regions and their associated medical faculties, i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor next-generation sequencing (NGS) is widely used to refine diagnosis and identify therapy targets. However, reporting criteria, schemas, and formats vary greatly, which can affect uniformity of clinical cancer care. With the aim of promoting harmonization, the current state of NGS reporting practices was profiled across Genomics Organization for Academic Laboratories members. The assessment included a group landscape analysis to refine topics followed by a survey of member laboratories and post-survey discussions. A total of 28 surveys covering hematology and/or solid tumor panels from 21
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Revista brasileira de parasitologia veterinaria = Brazilian journal of veterinary parasitology : Orgao Oficial do Colegio Brasileiro de Parasitologia Veterinaria2026eng
Advances in molecular technologies have revolutionized veterinary parasitology, providing highly sensitive and specific tools for the detection, characterization, and surveillance of parasites in domestic and wildlife species. Approaches such as next-generation sequencing, metabarcoding, and metagenomics have significantly enhanced the ability to identify previously unknown or uncultivable species, detect complex coinfections, and deepen our understanding of parasite genetic diversity, evolution, and population dynamics. Beyond their impact on laboratory diagnostics, these tools have proven es
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования