Adverse outcomes including myocardial infarction (MI) and stroke render coronary artery disease (CAD) a leading cause of death worldwide. DNA methylation markers may alert such adversity ahead of the events. We profiled DNA methylation of blood leukocytes in 933 Chinese CAD patients with up-to-13-year follow-up from three centers, identifying 70 differentially methylated sites (DMPs) associated with future death. These DMPs correlated with inflammation markers, left ventricular functions and high-density lipoprotein cholesterol, and impacted gene expression in immune response and cellular scen…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to comprehensively characterize the DNA methylation profile in the sperm of patients with Kallmann syndrome (KS), providing new insights into the potential epigenetic mechanisms contributing to the pathogenesis of the disease.
METHODS: Sperm samples from patients with KS and healthy controls (HCs) were analyzed for DNA methylation patterns. Differentially methylated regions (DMRs) were identified, and the associated genes underwent enrichment analysis. Spermatogenesis-related genes were screened, analyzed for functional enrichment, and key genes were identified usin…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA), particularly seronegative disease, is difficult to diagnose early, which can delay treatment initiation. This study aims to develop a binary DNA methylation (DNAm)-based algorithm to diagnose RA.
METHODS: Three datasets (discovery, training, holdout) were constructed from DNAm profiles from 1366 persons (treatment-naïve RA, other inflammatory/autoimmune diseases, healthy individuals). DNAm features that differentiate RA from other inflammatory/autoimmune diseases and healthy individuals were identified using the discovery set. Our classification algorith…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer development and response to treatment are evolutionary processes1,2, but characterizing evolutionary dynamics at a clinically meaningful scale has remained challenging3. Here we develop a new methodology called EVOFLUx, based on natural DNA methylation barcodes fluctuating over time4, that quantitatively infers evolutionary dynamics using only a bulk tumour methylation profile as input. We apply EVOFLUx to 1,976 well-characterized lymphoid cancer samples spanning a broad spectrum of diseases and show that initial tumour growth rate, malignancy age and epimutation rates vary by orders of…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonresolving inflammation causes irreversible damage to periodontal ligament stem cells (PDLSCs) and impedes alveolar bone restoration. The … tome sequencing revealed the potential of fumarate in modulating epigenetics. Specifically, histone methylation typically suppresses the expression of genes related to osteogenesis. Fumarate was found to impede the osteogenic differentiation of PDLSCs that exhibited high levels of H3K9me3. Various techniques, including assay for transposase-accessible chromat …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA methylation and the machinery that regulates or "reads" its expression has recently been implicated in the pathogenesis of acute myeloid leukemia (AML) and other hematologic malignancies. Modulation of these epigenetic marks has started to become a reality as several companies around the world seek to leverage this knowledge therapeutically in the clinic. Although the bases of observed activity in AML have been described by numerous groups, the exact context in which these therapies will ultimately be used remains to be properly determined. While context is likely to be of great importance…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asthma is a chronic respiratory disease that is characterized by airway inflammation, excessive mucus production, and airway remodeling. Prevention and treatment for asthma is an urgent issue in clinical studies. In recent years, N6-methyladenosine methylation (m6A) has emerged as a promising regulatory approach involved in multiple diseases. ALKBH5 (alkB homolog 5) is a demethylase widely studied in disease pathologies. This work aimed to explore the regulatory mechanisms underlying the ALKBH5-regulated asthma. We established an interleukin-13 (IL-13)-stimulated cell model to mimic the in vit…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although cystoscopy is a reliable tool for detecting bladder cancer (BC) in patients with hematuria, it is invasive, costly and often unnecessary since most patients with hematuria do not have BC. Consequently, developing urinary biomarkers for non-invasive BC detection is a major clinical need. While DNA methylation markers hold promise, diagnostic performance can still be improved. We assessed 11 candidate methylation markers for urinary BC detection. Urine samples from 77 primary BC patients and 69 controls were used for marker selection and training, with independent validation conducted o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spermatogenesis is a highly regulated and complex process in which DNA methylation plays a crucial role. This study aimed to explore the differential methylation profiles in sperm DNA between patients with asthenospermia (AS) and healthy controls (HCs), those with oligoasthenospermia (OAS) and HCs, and patients with AS and those with OAS.
RESULTS: Semen samples and clinical data were collected from five patients with AS, five patients with OAS, and six age-matched HCs. Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) was performed to identify differentially methylated regions (D…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the monosomy 1p36 deletion syndrome, the role of DNA methylation in the genomic stability of the 1p36 region remains elusive. We hypothesize that changes in the methylation pattern at the 1p36 breakpoint hotspot region influenced the chromosomal breakage leading to terminal deletions. From the monosomy 1p36 material collection, four cases with 4.0 to 5.5 Mb terminal deletions and their parents were investigated. DNA samples were assessed by targeted bisulfite sequencing (NimbleGen SeqCap Epi) to examine DNA methylation status in the 1p36 hotspot region at single-base resolution as compared …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer testis antigens (CTAs) are a class of immune-stimulating antigens often overexpressed in many types of cancers. The usage of the CTAs as immunotherapy targets have been widely investigated in different cancers including melanoma, hematological malignancies, and colorectal cancer. Studies have indicated that the epigenetic regulation of the CTAs such as the methylation status may affect the expression of the CTAs. However, the report on the methylation status of the CTAs is conflicting. The general methylation profile of the CTAs, especially in colorectal cancer, is still elu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While extensive investigations have been devoted to the study of genetic pathways related to fatty liver diseases, much less is known about epigenetic mechanisms underlying these disorders. DNA methylation is an epigenetic link between environmental factors (e.g., diets) and complex diseases (e.g., non-alcoholic fatty liver disease). Here, it is aimed to study the role of DNA methylation in the regulation of hepatic lipid metabolism. A dynamic change in the DNA methylome in the liver of high-fat diet (HFD)-fed mice is discovered, including a marked increase in DNA methylation at the promoter o…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Specific, regulated modification of RNAs is important for proper gene expression1,2. tRNAs are rich with various chemical modifications that affect their stability and function3,4. 7-Methylguanosine (m7G) at tRNA position 46 is a conserved modification that modulates steady-state tRNA levels to affect cell growth5,6. The METTL1-WDR4 complex generates m7G46 in humans, and dysregulation of METTL1-WDR4 has been linked to brain malformation and multiple cancers7-22. Here we show how METTL1 and WDR4 cooperate to recognize RNA substrates and catalyse methylation. A crystal structure of METTL1-WDR4 a…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Friedreich ataxia (FRDA) is typically caused by homozygosity for an expanded GAA triplet-repeat (GAA-TRE) in intron 1 of the FXN … ypermethylated in cis with the GAA-TRE, effectively detects heterozygous GAA-TRE.
METHODS: FXN DNA methylation was assayed by targeted bisulfite deep sequencing using the Illumina platform.
RESULTS: FRDA-DMR methylation effectively identified a cohort of known heterozygous carriers of the GAA-TRE. In an individual with clinical features of FRDA, commercial …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In addition to genomic risk variants and environmental influences, increasing evidence suggests epigenetic modifications are important for orofacial development and their alterations can contribute to orofacial clefts. Ezh2 encodes a core catalytic component of the Polycomb repressive complex responsible for addition of methyl marks to Histone H3 as a mechanism of repressing target genes. The role of Ezh2 in orofacial clefts remains unknown.
AIMS: To investigate the epithelial role of Ezh2-dependent methylation in secondary palatogenesis.
METHODS: We used conditional gene-targeti…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The origin of microbial mercury methylation has long been a mystery. Here, we employed genome-resolved phylogenetic analyses to decipher the evolution of the mercury-methylating gene, hgcAB, constrain the ancestral origin of the hgc operon, and explain the distribution of hgc in Bacteria and Archaea. We infer the extent to which vertical inheritance and horizontal gene transfer have influenced the evolution of mercury methylators and hypothesize that evolution of this trait bestowed the ability to produce an antimicrobial compound (MeHg+) on a potentially resource-limited early Earth. We specu…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Functional somatic syndromes (FSS) are highly prevalent across all levels of health care. The fact that they are characterized by medically unexplained symptoms, such as fatigue and pain, raises the important question of their underlying pathophysiology. Psychosocial stress represents a significant factor in the development of FSS and can induce long-term modifications at the epigenetic level. The aim of this review was to systematically review, for the first time, whether individuals with FSS are characterized by specific alterations in DNA methylation.
METHODS: MEDLINE and PsycIN…
Систематический обзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone lysine methylation is a post-translational modification that plays a key role in the epigenetic regulation of a broad spectrum of biological processes. Moreover, the dysregulation of histone lysine methyltransferases (KMTs) has been implicated in the pathogenesis of several diseases particularly cancer. Due to their pathobiological importance, KMTs have garnered immense attention over the last decade as attractive therapeutic targets. These endeavors have culminated in tens of chemical probes that have been used to interrogate many aspects of histone lysine methylation. Besides, over a…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes (T2D) is a metabolic disease characterized by the development of β-cell dysfunction with hepatic, muscular and adipose tissue insulin resistance. Although the molecular mechanisms leading to its development are not entirely known, investigations of its causes reveal a multifactorial contribution to its development and progression in most cases. In addition, regulatory interactions mediated by epigenetic modifications such as DNA methylation, histone tail modifications and regulatory RNAs have been found to play a significant role in the etiology of T2D. In this chapter, we disc…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования