BACKGROUND AND AIMS: Chronic HEV infections remain a serious problem in immunocompromised patients, as specifically approved antiviral drugs … terize viral population dynamics in study participants. Subsequently, we used an HEV-based reporter replicon system to investigate sofosbuvir sensitivity in high-frequency variants. Most patients had heterogenous HEV populations, suggesting high adaptability to treatment-related selection pressures. We identified numerous amino acid alterations emerging du …
Многоцентровое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human respiratory syncytial virus (hRSV) infection is a leading cause of severe respiratory tract infections. Effective, directly acting antivirals against hRSV are not available. We aimed to discover new and chemically diverse candidates to enrich the hRSV drug development pipeline. We used a two-step screen that interrogates compound efficacy after primary infection and a consecutive virus passaging. We resynthesized selected hit molecules and profiled their activities with hRSV lentiviral pseudotype cell entry, replicon, and time-of-addition assays. The breadth of antiviral activity was tes…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 50 Salmonella enterica strains were isolated from clinical samples from 2009 to 2012 and analyzed for the presence of virulence g … M-1, SHV-1, and qnrB1 in one strain; and SHV-1 and sulI genes in one strain together. Plasmid-based replicon typing assay revealed that all 50 strains carried FIIS, 13 carried I1, 1 carried I2, 4 carried P, 1 carried A/C, and 4 carried X1 replicon. PFGE was used to type 46 of the 50 strains and classify them into 22 major groups, 33 pulsotypes, and 8 major …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The study investigated the presence of CTX-M-15 type extended spectrum beta-lactamases (ESBL), compared their genetic arrangemen … olecular environments surrounding blaCTX-M and plasmid types were investigated by PCR and PCR-based replicon typing respectively. Transformation was carried out to assess plasmid transfer. Southern blotting was conducted to localize the blaCTX-M-15 genes. DNA fingerprinting was performed by ERIC-PCR.
RESULTS: Prevalence of ESBL was found to be 40.8% (103/ …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the study was to conduct a comprehensive molecular characterization of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli collected from Pakistan. Genetic relatedness among 98 ESBL-producing E. coli was measured by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The presence of genes encoding ESBLs, virulence factors (VFs), 16S rRNA methylases, plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) encoding elements, plasmid replicon types, phylogenetic groups of E. coli, prevalence of the worldwide disseminated clone E. coli ST131, and phylogrouping of CTX-M enzymes was investigated by…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterobacteriaceae, carrying the New Delhi metallo-β-lactamase-1 (NDM-1) gene (bla (NDM-1)), have emerged and posed a threat since 2006. In … xin B, and colistin. It possessed at least eight plasmids; of those, a 74-kb plasmid (pKPJ1) of the replicon FIIA carried bla (NDM-1) and was conjugally transferred to E. coli strains, with a 71-kb transferable azithromycin-resistant (mphA (+)) plasmid of the replicon F (pKPJ2), as a large (145-kb) plasmid (pKPJF100) through a transposition event. In addit …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The factors that regulate lymphocyte traffic in chronic hepatitis C (CHC) are not completely defined. Interferon (IFN)-inducible T cell alph … rmore, transfection of Huh-7 cells with either poly(I:C) or HCV RNA representing the HCV subgenomic replicon induced I-TAC mRNA expression. HCV replication was also found to modulate I-TAC expression, with stimulation of Huh-7 cells harboring either the HCV subgenomic or genomic replicon showing significantly increased synergistic effects compared with tho …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmid content in 242 Yersinia pestis strains from various natural plague foci of the U.S.S.R. and other countries was studied. Of these strains, 172 (71%) were shown to carry three plasmids described previously of about 6, 45-50 and 60 MDa, respectively. Twenty strains (8%) from different foci harboured additional cryptic plasmids, most often of about 20 mDa in size. Plasmid pPst displayed considerable constancy of its molecular mass. On the contrary, size variations of pCad (45-49 MDa) and, especially, pFra (60-190 MDa) were found. Molecular mass of these plasmids correlated with the host s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Of 20 Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing Escherichia coli isolates identified at hospitals in western Pennsylvania, 60% belonged to the epidemic ST131-fimH30 subclone. IncFIIk was the most common replicon type for the blaKPC-carrying plasmids (n = 8). All IncFIIk plasmids possessed a scaffold similar to that of pKpQIL, and seven of them were borne by ST131-fimH30 isolates. IncN plasmids conferred resistance to trimethoprim-sulfamethoxazole, and IncA/C plasmids conferred resistance to gentamicin. Three blaKPC-carrying plasmids (IncA/C and IncN) possessed blaSHV-7/12 and qnrA1 o…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cronobacter sakazakii is an opportunistic foodborne pathogen associated with severe infections in infants, linked to powdered infant formula (PIF) and related products. We conducted genomic profiling of C. sakazakii (n=209) from infant and toddler food in the United States, comprising all publicly available genomes for this source, through the integration of antimicrobial resistance (AMR) gene (ARG), plasmid replicon, virulence gene, phylogenetic, and pan-genome analyses. We further applied a machine learning (ML)-driven isolation source classification approach based on pan-genome features to …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contaminated household water in peri-urban communities is a reservoir for virulent Escherichia coli, but its role in the environmental transmission of antibiotic resistance genes (ARGs) remains poorly understood. This study characterized E. coli from household water and additionally aimed to investigate the transmissibility of ARGs from drug-resistant isolates. Twenty-five E. coli isolates from thirteen household well water sources were tested for resistance to 14 antibiotics by disc diffusion and whole-genome sequenced using the Illumina platform. The ARGs and plasmid replicon types were resp…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the introduction of effective treatments for hepatitis C in clinics, issues remain regarding the liver disease induced by chronic he … V strains JFH1 and DBN3a. The impact of HCV on peroxisomal functions was assessed using sub-genomic replicons. An increase of ROS was measured in peroxisomes of replicon-containing cells, correlated with a significant decrease of catalase activity with the DBN3a strain. In contrast, HCV replication had little to no impact on cytoplasmic and mitochondrial R …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study describes the first isolation of multidrug-resistant (MDR) Klebsiella pneumoniae ST16, Escherichia coli ST131 (Esc), and Enterobac … d with ISEcp1. In Esc, the AMR gene blaTEM-1B and virulence gene traT were found on an IncF plasmid replicon. In K. pneumoniae the AMR genes sul1 and tetB present on IncR plasmid replicons and were associated with the insertion sequence IS6100. In Kp5, blaLAP-2 and qnrS1 coexisted and were flanked by ISEcl. AMR gene clusters, conferring resistance to multi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our previous studies revealed that duck Tembusu virus (DTMUV) NS2A inhibited IFNβ signaling pathway by competitively binding to STING with TBK1, leading to reducing the phosphorylation of TBK1. Herein, we found that the 114-143 aa region of NS2A is critical for its interaction with STING and suppression of STING-mediated IFNβ signaling. We further identified the amino acids at positions L129, N130, L139, R140 and F143 of NS2A critical for NS2A-STING interaction. Subsequently, single residue substitution in the NS2A protein was introduced into the DTMUV replicon and infectious clone. The replic…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica is common foodborne pathogen that generates both enteric and systemic infections in hosts. Antibiotic resistance is comm … databases. Metal and antibiotic resistance genes were identified in the genomes as well as plasmid replicons. Co-occurrent genes were identified by constructing a co-occurrence matrix and grouping said matrix using k-means clustering. Three groups of co-occurrent genes were identified using k-means clustering. Group 1 was comprised of the pco and sil oper …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amphihevir, a benzofuran derivative, is the first reported NS4B inhibitor that has advanced to clinical trials (currently in Phase Ib). Here, we report the results of a preclinical study of its potency, toxicity, selectivity, DMPK, and safety profiles. Amphihevir displayed good antiviral activities against genotype 1a (EC50=0.34 nM) and genotype 1b (EC50=1.97 nM) replicons and evident cytotoxicity in twelve strains of cell lines derived from animals and humans. Amphihevir was found to be inactive against other viruses, human kinases, and GPCRs, which implies its good selectivity. A 9-day long-…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increased incidence of antibiotic-resistant Enterobacteriaceae is a public health problem worldwide. The aim of this study was to analyz … o K. oxytoca, four E. fergusonii, and two E. coli). The IncFIIs, IncF, IncFIB, IncK, IncP, and IncX replicons were detected among these beta-lactamase Enterobacteriaceae producers. The blaKPC-2, tetA, sul3, qnrB, and cmlA determinants were co-transferred by conjugation from K. oxytoca strain to E. coli J153, in association with IncK and IncF replicons. Our …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The mcr-1 gene has been widely reported in both bacterial chromosomes and plasmids, while its stability in these genetic materia … the chromosome of a clinical Escherichia coli strain. The plasmid was found to comprise the IncFIB replicon and a phage-like replicon, as well as two integrons that harboured various mobile elements and resistance genes including mcr-1, floR, blaTEM-1b and strAB. Both plasmid-borne and chromosomal Tn6330 transposons could be re-organized into a circular i …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated 247 Escherichia coli isolates collected from four cattle farms to characterize aminoglycoside-modifying enzyme (AME) genes, their plasmid replicons and transferability. Out of 247 isolates a high number of isolates (total 202; 81.78%) were found to be resistant to various antibiotics by disc diffusion. Of the 247 strains, 139 (56.3%) were resistant to streptomycin, and other antibiotic resistances followed as tetracycline (12.15%), ampicillin (7%), chloramphenicol (5.7%) and trimethoprim-sulfamethoxazole (0.8%). Among 247 isolates B1 was the predominant phylogenetic gro…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV) is the causative agent of hepatitis E in humans and a member of the genusOrthohepevirusin the familyHepeviridae HEV infections are the common cause of acute hepatitis but can also take chronic courses. Ribavirin is the treatment of choice for most patients, and type I interferon (IFN) has been evaluated in a few infected transplant patientsin vivo In this study, the antiviral effects of different exogenously administered interferons were investigated by using state-of-the-art subgenomic replicon and full-length HEV genome cell culture models. Hepatitis C virus (HCV) sub…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования