BACKGROUND: Protein tyrosine phosphatases (PTPs) are pivotal in cellular signal transduction. Recent studies have identified protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1 (PTPN1), as a novel immune checkpoint. However, its effects and underlying mechanisms in hepatocellular carcinoma (HCC) remain underexplored. This study aims to elucidate the impact of PTPN1 on the prognosis of HCC patients, the tumor microenvironment (TME), and the biological behavior of HCC cells, with the goal of assessing its clinical potential in HCC.
METHODS: Expression profiles and clinical data for liver cancer p
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The Polo-like kinase (PLK) family contains five members, among which the former (PLK1-4) has prognostic value in colorectal cancer (CRC); however, since PLK5 was recently discovered, its related information is scarce. This study aimed to investigate the expression of PLK5 in CRC tissues versus adjacent nontumor tissues and its correlation with the characteristics and prognosis of CRC patients. METHODS: PLK5 expression was detected in 107 CRC tissues and 20 adjacent nontumor tissues via immunohistochemistry. CRC patient characteristics, relapse-free survival (RFS), and overall surviv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is an inflammatory disorder linked to increased oxidative stress. Oxidative phosphorylation (OXPHOS) and electron transport chain (ETC) activity in circulating neutrophils generate reactive oxygen species (ROS), potentially associated with disease exacerbation and cognitive impairment. This study aimed to identify OXPHOS-related hub genes in neutrophils, investigate COPD-associated network rewiring, and assess their associations with disease progression and neurodegeneration.
MATERIALS AND METHODS: Gene expression data from GSE278206
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is linked to sleep disorders in previous report, but the potential roles of specific genes remain unclear. This study aimed to dissect different subtype-specific genetic associations and their underlying mechanisms. A multi-omics Summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) approach was performed to identify potential causal links between mitochondrial function-related genes and sleep disorders. We integrated GWAS data from FinnGen database (the discovery set), independent GWAS datasets (covering different sleep-disorder subtypes and used for validation), and cis-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic retinopathy (DR), a common microvascular complication of diabetes mellitus, has been associated with ferroptosis-related pathological mechanisms. Evidence indicates that ferroptosis may contribute to retinal injury and disease progression. The present analysis aimed to characterize ferroptosis-associated cell subsets and their roles in the progression of DR.
METHOD: Single-cell RNA sequencing data derived from diabetic rat models of DR were obtained from the Gene Expression Omnibus database. A total of 464 ferroptosis-related genes were used to calculate ferroptosis score
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphonates are chemically distinctive natural products characterized by a stable carbon-phosphorus (C-P) bond and are traditionally associated with a limited number of well-studied bacterial genera. We performed comparative genome mining of four publicly available Chelatococcus asaccharovorans genomes along with related Chelatococcus species to investigate their potential for phosphonate biosynthesis. Genome analysis using antiSMASH identified putative phosphonate biosynthetic gene clusters (BGCs) in two of the four C. asaccharovorans strains, whereas no phosphonate BGCs were detected in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vascular dementia (VD) is a major cause of cognitive decline associated with cerebrovascular dysfunction, and effective therapeutic strategies remain limited. Ligusticum wallichii is a traditional medicinal herb with neuroprotective activity.
METHODS: This study investigated the protective effects of L. wallichii against VD by combining network pharmacology with experimental validation. Active constituents and putative targets of L. wallichii were identified using the TCMSP database and SwissTargetPrediction platform, whereas VD-related genes were collected from GeneCards, DisGeNE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Diabetic osteoporosis (DO) is a chronic consequence of diabetes mellitus marked by disrupted bone metabolism and elevated fracture risk, with no effective strategies currently available. Betulinic acid (BA) is a natural pentacyclic triterpenoid demonstrating anti-diabetic, anti-inflammatory, and osteoprotective effects. This research aimed to clarify the molecular mechanisms of BA in DO using network pharmacology, molecular docking, and molecular dynamics simulations.
METHODS: The drug-likeness and pharmacokinetic characteristics of BA were assessed using Swiss ADME, while ProTo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To figure out the role and molecular mechanism of SST in the progression of GC.
METHODS: GC microarray data GSE118916 were downloaded from the GEO database. Then, the module-related genes and differentially expressed genes (DEGs) in GC were respectively screened by weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) analysis and limma 3.62.2. The protein-protein interaction (PPI) network was constructed to identify the core genes. After ubibrowser1.0 prediction, interaction between MDM2 and SST was verified using co-immunoprecipitation (CoIP) assay and GST pull-down assay. The biologica
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cardiac hypertrophy is an adaptive or maladaptive response to physiological or pathological stimuli, with distinct functional outcomes. Metabolic reprogramming plays a key role in this process; however, the metabolism-associated genes underlying different remodeling patterns remain unclear.
METHODS: Transcriptomic microarray data related to cardiac hypertrophy (GSE776) were obtained from the Gene Expression Omnibus database. Differentially expressed genes (DEGs) were identified by comparing physiological (exercise-induced) and pathological (high-salt diet-induced) hypertrophy mode
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP) is a heterogeneous chronic inflammatory disease with unclear pathogenesis and a high recurrence rate. Inflammatory response-related genes (IRGs) play a key role in disease progression but remain to be further explored in CRSwNP.
METHODS: CRSwNP-related transcriptome datasets and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. IRGs were derived from the Molecular Signatures Database (MSigDB). Core genes were screened using weighted gene co-expression network analysis (WGCNA)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse-type gastric cancer (DGC), characterized by poorly cohesive cells within fibrotic stroma, is associated with advanced disease and poor prognosis. Here, to identify distinct biomarkers for DGC compared with intestinal-type gastric cancer, we constructed a comprehensive large-scale signaling network using RNA-sequencing data from three genomic databases (The Cancer Genome Atlas, GSE62254 and GSE26253), developed a mathematical model and conducted simulation analyses. For validation, we used tissue microarray blocks of gastric cancers with immunohistochemical staining, single-cell RNA seq
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a complex interrelationship between colorectal cancer (CRC) and ulcerative colitis (UC). This study aimed to identify key molecules and pathways involved in the co-occurrence of CRC and UC, as well as the role of oxidative stress in disease progression, through bioinformatics analysis of public RNA sequencing databases. We downloaded datasets from public repositories and conducted gene set enrichment analysis (GSEA), screening for oxidative stress-related differentially expressed genes (OXSRDEGs) to evaluate their diagnostic potential. Subsequently, we performed Gene Ontology (GO) ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
"Jiedu Tongluo Tiaoying Formula" (JDTLTYF) is a kind of traditional Chinese medicine (TCM) prescription for treating hyperthyroidism, which can effectively improve the condition of patients. The main active ingredients of JDTLTYF were collected from the traditional Chinese medicine systems pharmacology (TCMSP) database, and the target was predicted. Genes related to hyperthyroidism were identified using DisGeNET, GeneCards, and Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) databases. Protein-protein interaction (PPI) network and interaction network of "formula-herb-active ingredient-target genes"
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Current therapeutic strategies for neuropathic pain (NP) encompass pharmacological agents, physical modalities, psychological support, and interventional procedures, which aim to mitigate inflammation, enhance vascular perfusion in afflicted regions, and modulate immune responses. However, the heterogeneity of NP pathogenesis and individual variability often lead to inconsistent treatment outcomes.
METHODS: An integrative network pharmacology framework was employed to elucidate the mechanistic basis of Yanhusuo in NP management. NP patients were categorized via unsupervised cluste
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic, autoimmune disorder characterized by systemic inflammation and metabolic dysregulation. However, the mechanisms underlying metabolic reprogramming in RA peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) remain poorly understood. Therefore, we integrated proteomic and phosphoproteomic data from PBMCs of 96 RA patients and 90 healthy controls (HCs) with transcriptomic data from 113 RA patients and 54 HCs to identify differential proteins, key phosphorylation sites, kinase activity alterations, and transcription factor-target interactions. Potential therapeutic mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since the COVID-19 pandemic, a significant number of pediatric leukemia patients have shown to have also contracted COVID-19 several weeks or months prior to the development of their cancer. Current research indicates the expression of MDA5, encoded by IFIH1, is associated with increased immunity to COVID-19 in children. Children are also known to have a much lower risk of developing leukemia. Our hypothesis is that IFIH1 and its regulatory miRNAs are biomarkers associated with pediatric leukemia; the objective of our study is to identify genes, through miRNA targeting mechanisms, which may be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP) is an immunologic disease, and pyroptosis, an inflammation-based cellular death, strictly modulates CRSwNP pathology, whereas the pyroptosis genes and mechanisms involved in CRSwNP remain unclear. Herein, we explored disease biomarkers and potential therapeutic targets for pyroptosis and immune regulation in CRSwNP using bioinformatics analysis and tissue-based verification.
METHODS: We retrieved the transcriptional profiles of the high-throughput dataset GSE136825 from the Gene Expression Omnibus database, as well as 170 pyropto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer is a cancer that arises from the abnormal growth of cells in the colon or rectum. Osteosarcoma (OS) is a common primary bone tumor with high degree of malignancy. The configuration files for colorectal cancer dataset GSE142279 and OS datasets GSE197158 and GSE206448 were downloaded from Gene Expression Omnibus database using the platforms GPL20795, GPL20301, and GPL24676. Differentially expressed genes (DEGs) were screened and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) was performed. Construction and analysis of protein-protein interactions (PPI) network. Functional
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Coronary artery bypass graft (CABG) is generally used to treat complex coronary artery disease. Treatment success is affected by neointimal hyperplasia (NIH) of graft and anastomotic sites. Although sirolimus and rosuvastatin individually inhibit NIH progression, the efficacy of combination treatment remains unknown.
METHODS: We identified cross-targets associated with CABG, sirolimus, and rosuvastatin by using databases including DisGeNET and GeneCards. GO and KEGG pathway enrichment analyses were conducted using R studio, and target proteins were mapped in PPI networks using Met
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования