Mutations in the cytosine-5 RNA methyltransferase NSun2 cause microcephaly and other neurological abnormalities in mice and human. How post-transcriptional methylation contributes to the human disease is currently unknown. By comparing gene expression data with global cytosine-5 RNA methylomes in patient fibroblasts and NSun2-deficient mice, we find that loss of cytosine-5 RNA methylation increases the angiogenin-mediated endonucleolytic cleavage of transfer RNAs (tRNA) leading to an accumulation of 5' tRNA-derived small RNA fragments. Accumulation of 5' tRNA fragments in the absence of NSun2
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transfer RNA-mediated posttranslational protein modification by arginine has been demonstrated in vitro in axoplasm extruded from the giant axons of squid and in injured and regenerating vertebrate nerves. In nerve and axoplasm, the highest activity is found in a fraction of a 150,000 × g supernatant containing high molecular weight protein/RNA complexes but lacking molecules of <5 kDa. Arginylation (and protein modification by other amino acids) is not found in more purified, reconstituted fractions. The data are interpreted as indicating that it is critical to recover the reaction components
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TAR RNA is a potential target for AIDS therapy. Ligand-based virtual screening was performed to retrieve novel scaffolds for RNA-binding molecules capable of inhibiting the Tat-TAR interaction, which is essential for HIV replication. We used a "fuzzy" pharmacophore approach (SQUID) and an alignment-free pharmacophore method (CATS3D) to carry out virtual screening of a vendor database of small molecules and to perform "scaffold-hopping". A small subset of 19 candidate molecules were experimentally tested for TAR RNA binding in a fluorescence resonance energy transfer (FRET) assay. Both methods
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mRNA modification N6 -methyladenosine (m6 A) is associated with multiple roles in cell function and disease. The methyltransferases METTL3-METTL14 and METTL16 act as "writers" for different target transcripts and sequence motifs. The modification is perceived by dedicated "reader" and "eraser" proteins, but not by polymerases. We report that METTL3-14 shows remarkable cosubstrate promiscuity, enabling sequence-specific internal labeling of RNA without additional guide RNAs. The transfer of ortho-nitrobenzyl and 6-nitropiperonyl groups allowed enzymatic photocaging of RNA in the consensus m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The first post-transcriptional step in mammalian mitochondrial gene expression, required for the synthesis of the 13 polypeptides encoded in mitochondrial DNA (mtDNA), is endonucleolytic cleavage of the primary polycistronic transcripts. Excision of the mtDNA-encoded transfer RNAs (tRNAs) releases most mature RNAs; however, processing of three noncanonical messenger RNAs (mRNAs) not flanked by tRNAs (CO1, CO3, and CYB) requires FASTKD5. To investigate the molecular mechanism involved, we created knockout human cell lines to use as assay systems. The absence of FASTKD5 produced a severe OXPHOS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is emerging evidence that mitochondria can move between cells, particularly from immune cells into cancers. Recent work from Zhang et al. in Cancer Cell employs single-cell RNA- and mitochondrial DNA-sequencing in co-culture experiments and patient tumor samples to detect mitochondrial transfer. However, the mechanisms, scale, and implications remain uncertain.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An essential step in the life cycle of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) is the packaging of tRNA3Lys during viral assembly. This step, which requires the assembly of a ternary complex consisting of GagPol, mitochondrial lysyl-tRNA synthetase, and tRNA3Lys, is essential for the production of infectious viruses. Indeed, it allows the initiation of reverse transcription in the particles. In this work, we used an in vitro assay to isolate molecules from a chemical library that disrupt the interaction between the integrase domain of GagPol and mitochondrial lysyl-tRNA synthetase. The thr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benign symmetric lipomatosis, also called Madelung's disease, is characterized by lipomata and fatty infiltrations. Involvement of the nervous system has occasionally been described, mitochondrial dysfunctions have been suggested. We report a 55 year old male suffering from benign symmetric lipomatosis with associated axonal neuropathy and hyperlipoproteinemia. He showed a remarkable phenotype of neuropathy i.e. no sensory disturbance, ubiquitous fasciculations and muscle cramps, furthermore reduced COX activity and abnormalities in specific mitochondrial tRNA regions.
Клинический случайПисьмо в редакциюКомментарийПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Several families have been described in which an A to G transition mutation at position 3243 (A3243G) of the mitochondrial DNA (mtDNA) is associated with focal and segmental glomerulosclerosis (FSGS). However, the prevalence, clinical features, and pathophysiology of FSGS carrying mtDNA mutations are largely undefined.
METHODS: Among 11 biopsy-proven primary FSGS patients of unknown etiology, we examined seven FSGS patients to determine whether any of the clinical and pathological features of FSGS were associated with an A3243G mtDNA mutation. In four subjects in whom the A3243G m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A number of point mutations in human mitochondrial (mt) tRNA genes are correlated with a variety of neuromuscular and other severe disorders including encephalopathies, myopathies, cardiopathies and diabetes. The complexity of the genotype/phenotype relationships, the diversity of possible molecular impacts of the different mutations at the tRNA structure/function levels, and the exponential discovery of new mutations call for the search for unifying features. Here, the basic features (at the levels of primary and secondary structure) of 68 'pathogenic' mutations are compared with those of 64
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the genus Flavobacterium occur in a variety of ecological niches and represent an interesting diversity of lifestyles. Flavobacterium branchiophilum is the main causative agent of bacterial gill disease, a severe condition affecting various cultured freshwater fish species worldwide, in particular salmonids in Canada and Japan. We report here the complete genome sequence of strain FL-15 isolated from a diseased sheatfish (Silurus glanis) in Hungary. The analysis of the F. branchiophilum genome revealed putative mechanisms of pathogenicity strikingly different from those of the other
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite redundant cellular pathways to minimize translational errors, errors in protein synthesis are common. Pathways and mechanisms to minimize errors are classified as pre-ribosomal or ribosomal. Pre-ribosomal pathways are primarily concerned with the appropriate charging of tRNAs with their cognate amino acids. By contrast, the ribosomal decoding center is considered 'blind' to mischarged tRNAs since these have cognate codon•anti-codon pairing. Here, we identified that in mycobacteria, deletion of the 16S ribosomal RNA methyltransferase gidB led to increased ribosomal discrimination of mis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Context-dependent alternative splicing plays a critical role in disease pathogenesis and organ development, but its complex regulation remains challenging to predict. Here, to address this, we developed HELIX, a hierarchical deep learning framework that integrates pre-mRNA sequence and RNA-binding protein expression profiles to predict tissue- and condition-specific splicing patterns and transcript isoform usage simultaneously. By leveraging both short-read and long-read RNA sequencing data during training, HELIX achieves greater accuracy than existing splicing prediction models and convention
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetes mellitus is a complex, multifactorial metabolic disorder characterized by chronic hyperglycemia and progressive organ dysfunction. Conventional diagnostic and prognostic markers such as fasting glucose and glycated hemoglobin provide limited insight into disease heterogeneity, early molecular changes, and individualized risk of complications. In recent years, RNA-based biomarkers have emerged as powerful tools for capturing dynamic regulatory processes underlying diabetes onset, progression, and therapeutic response. These biomarkers include messenger RNAs (mRNAs), microRNAs (miRNAs),
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylguanosine capping, a post-transcriptional modification of the 5' terminus of RNA polymerase II transcripts, influences RNA function, stability, and protein synthesis. Previously, we identified the cap modification in specific transfer RNA (tRNA) precursors (pre-tRNAs) transcribed by RNA polymerase III in Saccharomyces cerevisiae, and demonstrated that pre-tRNA capping prevents 5' exonucleolytic degradation of pre-tRNAs. Herein, we comprehensively mapped pre-tRNA capping and found that nearly all pre-tRNAs undergo cap modification. This analysis enabled precise determination of transcript
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human mitochondrial DNA (mtDNA) is a 16.9 kbp double-stranded, circular DNA, encoding subunits of the oxidative phosphorylation electron transfer chain and essential RNAs for mitochondrial protein translation. The minimal human mtDNA replisome is composed of the DNA helicase Twinkle, DNA polymerase γ, and mitochondrial single-stranded DNA-binding protein. While the mitochondrial RNA transcription is carried out by mitochondrial RNA polymerase, mitochondrial transcription factors TFAM and TFB2M, and a transcription elongation factor, TEFM, both RNA transcriptions, and DNA replication machinerie
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CLP1 was the first mammalian RNA kinase to be identified. However, determining its in vivo function has been elusive. Here we generated kinase-dead Clp1 (Clp1(K/K)) mice that show a progressive loss of spinal motor neurons associated with axonal degeneration in the peripheral nerves and denervation of neuromuscular junctions, resulting in impaired motor function, muscle weakness, paralysis and fatal respiratory failure. Transgenic rescue experiments show that CLP1 functions in motor neurons. Mechanistically, loss of CLP1 activity results in accumulation of a novel set of small RNA fragments, d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent development of methods to transfer, mutate, or ablate genes in vivo has provided renal investigators and physicians with powerful tools to explore normal renal physiology, the pathophysiological basis of renal disease, and potential therapeutic interventions. The use of transgenic and knockout mice to produce gain-of-function and loss-of-function mutations, and to create animal models of human hereditary renal diseases, permits unprecedented versatility and power of experimental design. Conditional and inducible gene targeting methods to control the temporal and spatial expression o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondria are dynamic organelles essential for neuronal survival and synaptic function, and their dysfunction is a key consequence of excitotoxicity following traumatic brain injury (TBI). While intercellular mitochondrial transfer and exogenous mitochondrial transplantation have emerged as mechanisms to restore cellular bioenergetics, its in vivo relevance in the central nervous system remains incompletely understood. Here, we used astrocyte and neuron-specific mitochondrial reporters (GFP or Dendra2) in mice to assess cell-type-specific mitochondrial morphology, bioenergetics, and transfe
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования