Coat color variation is a key phenotypic trait in domestic animals. Among the genetic factors involved, the KIT gene has frequently been associated with pigmentation diversity across species. In cattle, spotting or piebald phenotypes have been linked to variation in the genomic region encompassing KIT, but the identification of causal variants was not always possible. This is largely due to the regulatory nature of the underlying variants and the structural complexity of this genomic region, which remains difficult to investigate with linear reference genome-based approaches. In the present st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Adolescent depression is characterized by diverse symptom trajectories over time and has a strong genetic influence. Research has determined genetic overlap between depression and other psychiatric conditions; investigating the shared genetic architecture of heterogeneous depression trajectories is crucial for understanding disease etiology, prediction, and early intervention.
OBJECTIVE: To investigate univariate and multivariate genetic risk for adolescent depression trajectories and assess generalizability across ancestries.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: This cohort study
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) is a leading cause of global morbidity and mortality, but its genetic architecture remains incompletely understood. This study aims to uncover novel genetic insights into ASCVD through multivariate genomic analysis and molecular structure predictions.
METHODS: We analysed genomic data from over 3.8 million individuals across various ASCVD phenotypes, including coronary heart disease, stroke, transient ischemic attack, peripheral artery disease and abdominal aortic aneurysm. Advanced tools such as Genomic Structural Equation Modeling,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Basal metabolic rate (BMR) is implicated in age-related phenotypes, and presbyopia represents a hallmark of ocular ageing. However, the association between BMR and presbyopia remains underexplored. Therefore, using a two-sample Mendelian randomisation (MR) approach, the present study aimed to evaluate the potential causal relationship between BMR and presbyopia in individuals of European ancestry. Methods: Instrumental variables comprised single-nucleotide polymorphisms associated with BMR at genome-wide significance (p < 5.0 × 10-8), derived from genome-wide association
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid diseases are common and highly heritable. We performed a meta-analysis of genome-wide association studies from 19 biobanks for five thyroid diseases: thyroid cancer (ThC), benign nodular goiter, Graves' disease, lymphocytic thyroiditis and primary hypothyroidism. We analyzed genetic association data from ~2.9 million genomes and identified 313 known and 570 new independent loci linked to thyroid diseases. We discovered genetic correlations between ThC, benign nodular goiter and autoimmune thyroid diseases (rg = 0.16-0.97). Telomere maintenance genes contributed to benign and malignant
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Hepatocellular carcinoma (HCC) arises through heterogeneous pathways involving chronic hepatitis B virus infection, hepatitis C virus infection, alcohol-related liver disease, metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease, fibrosis, cirrhosis, and environmental exposures. Genome-wide association studies (GWASs) have identified host germline loci associated with HCC susceptibility, but interpretation is complicated by aetiology, ancestry, liver disease stage, and the definition of controls. This narrative review examines current GWAS evidence for HCC, with emph
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Observational studies link psychiatric disorders to Alzheimer disease (AD), but whether these associations are causal remains unclear due to confounding and reverse causality. We aimed to dissect these relationships using genetic evidence. We performed a two-sample Mendelian randomization (MR) study to assess the causal effects of 7 psychiatric and neurodevelopmental disorders on AD and its subtypes. The primary analysis utilized the inverse-variance weighted (IVW) method, supported by comprehensive sensitivity analyses (MR Steiger test, MR-Egger, and MR-PRESSO) and a supplementary analysis ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sweet osmanthus (Osmanthus fragrans), a traditional ornamental plant in China, exhibits substantial variation in autumn flowering time, which significantly affects landscape application and cultivation efficiency. Here, we performed a genome-wide association study on 127 resequenced accessions classified into early, intermediate, and late flowering types, using a set of 2,325,410 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and 246,824 structural variants (SVs). By integrating SNP/insertion and deletion (Indel) and SV data with weighted gene co-expression network analysis, machine learning, and geno
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Within the WHO framework of genomic epidemiological surveillance of tuberculosis, we have developed a panel of primers and TaqMan probes for PCR-based identification of SNPs in major epidemiological genotypes of Mycobacterium tuberculosis responsible for the spread of MDR/XDR strains in North Eurasia. Validation was performed on a dataset of 590 randomly selected strains circulating in the Krasnoyarsk Krai and Irkutsk region in 2021-2025. We identified 308 and 164 Beijing (L2) strains in the Krasnoyarsk and Irkutsk regions, respectively. The identified Beijing (L2) genotypes included B0/W148 (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica subspecies enterica serovar Mississippi (S. Mississippi) is a polyphyletic serovar endemic in Australia, New Zealand, the United Kingdom, and the United States. From 2018 to 2024, it was the 13th most frequently reported clinical Salmonella serovar in the United States. Its incidence in the United States is geographically focused within the Southeast, with 78% of US cases in that region. The objective of this study was to determine the phylogeographical patterns of clinical S. Mississippi in the southeastern United States using sequenced clinical isolate data and metadata f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder, with dysregulated lipid metabolism and immune dysfunction. However, it remains unclear whether immune phenotypes mediate the relationship between lipidomes and PCOS.
METHODS: A two-step Mendelian Randomization analysis was employed to explore the causal relationship between plasma lipidomes and PCOS and to investigate the mediating role of immune cells. A total of 179 plasma lipidomes and 731 immune phenotypes were analyzed. We used single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with plasma lipidome levels as instrum
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polymorphisms in the XRCC3 gene, a key component of homologous recombination repair, have been studied for their potential role in thyroid cancer susceptibility. However, published findings remain inconsistent across populations and genetic variants. This meta-analysis aimed to clarify the associations between XRCC3 polymorphisms and thyroid cancer risk, with emphasis on variant- and ethnicity-specific effects.
METHODS: A systematic search of PubMed, EMBASE, Scopus, CNKI, and other databases up to July 10, 2025 identified case-control studies reporting genotype distributions of XR
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to elucidate the impact of population immunity on the regional evolution of SARS-CoV-2. A total of 3701 wastewater SARS-CoV-2 concentration values and 168 wastewater whole genomes of SARS-CoV-2 were obtained in Beijing over 11 months following the implementation of the "dynamic zero-COVID" policy adjustments in December 2022. The findings indicate that the number of variant strains identified through wastewater surveillance was 2.46 times greater than that detected by clinical monitoring, with single nucleotide polymorphisms showing an increase of up to 7.14 times. This enhance
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundMultiple studies have shown metabolites may have potential effects on Charcot foot. However, the Mendelian randomization method has not yet explored the relationship between metabolites and Charcot foot.MethodsWe selected genetic variants from the publicly available Genome-wide Association Studies (GWAS) summary database to represent 1400 metabolites described in recent research. Mendelian randomization (MR) analysis was carried out to examine the relationships between these metabolites and Charcot foot. Significant single nucleotide polymorphism (SNP) data associated with exposure w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Detecting high-order epistatic interactions in genome-wide association studies (GWAS) is essential for understanding complex diseases, yet most existing approaches are limited to pairwise interactions. We propose GPBSO (Gene Pool-Based Brain Storm Optimization for Epistasis Detection), a novel stochastic framework that integrates Brain Storm Optimization with a dynamic gene pool to efficiently explore high-order SNP combinations. Methods: Epistasis is evaluated using the k2 Bayesian network scoring criterion and the G-test, with iterative updates to the gene matrix enhan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Multiple myeloma (MM) is a hematologic malignancy closely associated with diets and metabolic disorders, showing an increasing incidence trend. Genome-wide association studies (GWAS) contribute to exploring the causal relationships between diets, metabolites, and MM, thereby revealing biological mechanisms underlying cancer progression. Methods: This study included large-scale GWAS data for two diets, four metabolomics, and MM. The two-sample Mendelian randomization (MR) analysis was conducted to assess causalities between these dietary patterns, metabolites, and MM. The MR analysi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cannabis is one of the most commonly used drugs in the world, and use is trending alarmingly higher. We aimed to examine the genetic basis of cannabis lifetime use (CanLU) and its genetic relationships with a variety of psychiatric- and physical health-related phenotypes. We conducted a multi-ancestral genome-wide association study (GWAS) of CanLU using data from All of Us in five genetic populations. We meta-analyzed the results of EUR participants with previously published CanLU data (total effective sample size: 258,823), and conducted a set of post-GWAS analyses, including genetic correlat
СтатьяМетаанализПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumothorax, a common pleural disease, has an unclear pathogenesis. Observational studies suggest that inflammation may directly or indirectly contribute to the development of pneumothorax.
OBJECTIVES: To investigate the causal relationship between circulating inflammatory proteins and pneumothorax using Mendelian randomization (MR) analysis.
METHODS: We conducted a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis by combining genome-wide association study (GWAS) data on 91 circulating inflammatory proteins with pneumothorax GWAS data. Five MR methods were applied: Inverse Varia
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: This study aims to investigate the causal relationships between 12 micronutrients and common chronic respiratory diseases, revealing whether these nutrients play a causative role in either preventing or exacerbating these conditions. Methods: We employed a bidirectional two-sample Mendelian randomization (MR) approach to explore the causal relationships between micronutrients and chronic respiratory diseases. Data were sourced from the IEU GWAS database, with micronutrients serving as exposure variables and chronic respiratory diseases as outcome variables for causal assessment. Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore the possible causal link between stable angina pectoris (SAP) and gastric cancer (GC) through Mendelian randomization analysis. We used data from genome-wide association studies (GWAS) statistical datasets, with SAP and GC screened as relevant instrumental variables for exposure factors, respectively. To evaluate the causal link between SAP and GC, a two-sample bidirectional Mendelian randomization analysis was conducted, leveraging genetic variants as instrumental variables. In addition, effects of horizontal pleiotropy were evaluated using MR-PRESSO and MR-Egger intercept analysis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.