We have previously reported on mRNA expression of ERCC1, XPA and XPD in human ovarian cancer cells and tissues. Several factors can influence mRNA expression for any given gene. Alterations in gene copy number for ERCC1 and/or XPD have been reported to occur in malignant glioma specimens. Human ovarian cancer cell lines and tissues were therefore examined for evidence of altered gene copy number in selected genes within the nucleotide excision repair (NER) pathway. Six ovarian cancer cell lines were studied: A2780, A2780/CP70, SKOV3, MCAS, QvCar3 and Caov4. Cellular sensitivity to cisplatin va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human replication protein A (RPA) is composed of 70, 34 and 11 kDa subunits (p70, p34 and p11 respectively) and functions in all three major DNA metabolic processes: replication, repair and recombination. Recent deletion analysis demonstrated that the large subunit of RPA, p70, has multiple functional domains, including a DNA polymerase alpha-stimulation domain and a single-stranded DNA-binding domain. It also contains a putative metal-binding domain of the 4-cysteine type (Cys-Xaa4-Cys-Xaa13-Cys-Xaa2-Cys) that is highly conserved among eukaryotes. To study the role of this domain in DNA metab
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human repair proteins XPA and ERCC1 have been shown to be absolutely required for the incision step of nucleotide excision repair, and recently we identified an interaction between these two proteins both in vivo and in vitro (L. Li, S. J. Elledge, C. A. Peterson, E. S. Bales, and R. J. Legerski, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:5012-5016, 1994). In this report, we demonstrate the functional relevance of this interaction. The ERCC1-binding domain on XPA was previously mapped to a region containing two highly conserved XPA sequences, Gly-72 to Phe-75 and Glu-78 to Glu-84, which are termed the
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This prospective study aimed at investigating the role of immune-related gene expression (GATA3, METTL3, ERCC2, PD-L1 and IFN-γ) in the prediction of response to platinum-based neoadjuvant chemotherapy (NAC) in treatment of muscle-invasive bladder cancer (MIBC). A total of 112 patients received four cycles of systemic cisplatin-based NAC and then were subjected to radiological and histopathological evaluation through taking bladder biopsy before surgery. Quantitative real-time RT-PCR assessed GATA3, METTL3 and ERCC2 mRNA expression in tissue samples. Immunohistochemical (IHC) staining was done
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Mutations in the MAP kinase pathway (KRAS, NRAS, BRAF) are common in low grade serous ovarian carcinoma (LGSOC). The effect of these and other mutations on RNA transcription in this disease is poorly understood. Our objective was to describe patterns of somatic mutations and gene transcription in a racially diverse population with LGSOC.
METHODS: Utilizing an institutional tumor registry, patients with LGSOC were identified and charts were reviewed. RNA was extracted from available tumor tissue. Commercial tumor profiling results were analyzed with PanCancer pathway nanoString mRNA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA damage sensor XPC is involved in nucleotide excision repair. Here we show that in the absence of damage, XPC co-localizes with RNA polymerase II (Pol II) and active post-translational histone modifications marks on a subset of class II promoters in human fibroblasts. XPC depletion triggers specific gene down-expression due to a drop in the deposition of histone H3K9 acetylation mark and pre-initiation complex formation. XPC interacts with the histone acetyltransferase KAT2A and specifically triggers the recruitment of the KAT2A-containing ATAC complex to the promoters of down-expressed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kaposi's sarcoma (KS) as the most common AIDS-associated malignancy is etiologically caused by KS-associated herpesvirus (KSHV). KS is a highly disseminated and vascularized tumor. KSHV encodes 12 pre-microRNAs that yield 25 mature microRNAs (miRNAs), but their roles in KSHV-induced tumor metastasis and angiogenesis remain largely unclear. KSHV-encoded miR-K12-6 (miR-K6) can generate two mature miRNAs, miR-K6-5p and miR-K6-3p. Recently, we have shown that miR-K6-3p induced cell migration and angiogenesis via directly targeting SH3 domain binding glutamate-rich protein (SH3BGR). Here, by using
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: : A number of association studies have been carried out to investigate the relationship between genetic polymorphisms in DNA repair genes and response to radiotherapy-based multimodality treatment of patients with rectal cancer. However, their conclusions were inconsistent. The objective of the present study was to assess the role of DNA repair gene genetic polymorphisms in predicting genetic biomarkers of the response in rectal cancer patients treated with neoadjuvant chemoradiation.
MATERIALS AND METHODS: Studies were retrieved by searching the PubMed database, Cochrane Library,
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytokinesis-block micronucleus cytome (CBMNCyt) assay is a widely used technique for measuring DNA damage in human populations. The formation of micronuclei (MN) in dividing cells can result from chromosome breakage due to unrepaired or mis-repaired DNA lesions or chromosome malsegregation due to mitotic malfunction. The sensitivity of the MN assay to polymorphisms in various genes involved in DNA repair, activation/deactivation of carcinogens/chemicals/drugs/alcohol, folate metabolism pathway and micronutrient transport has been extensively reported in the literature. MN frequency is also
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
S23906 belongs to a novel class of alkylating anticancer agents forming bulky monofunctional DNA adducts. A unique feature of S23906 is its "helicase-like" activity leading to the destabilization of the surrounding duplex DNA. We here characterize the recognition and repair of S23906 adducts by the nucleotide excision repair (NER) machinery. All NER-deficient human cell lines tested showed increased sensitivity to S23906, which was particularly pronounced for cells deficient in XPC, CSB and XPA. In comparison, deficiencies in ERCC1 or XPF had lesser impact on the sensitivity to S23906. The sen
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Individual variations in the ability to cope with DNA damage by DNA repair may be essential for the response to chemotherapy, since cancer cells from patients with an effective DNA repair may survive treatment. We have studied the effect on time to treatment failure (TTF) and overall survival (OS) of polymorphism in the DNA repair genes ERCC1, ERCC2 and XRCC3, and in the apoptotic genes PPP1R13L and CD3EAP in 348 patients with multiple myeloma undergoing autologous bone marrow transplantation. Carriers of the variant C-allele of ERCC2 K751Q, the variant T-allele of XRCC3 T241M and the variant
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
XPA is a protein essential for nucleotide excision repair (NER) where it is thought to function in damage recognition/verification. We have proposed an additional role, that of a processivity factor, conferring a processive mechanism of action on XPF and XPG, the endonucleases, involved in NER. The present study was undertaken to examine the domain(s) in the XPA gene that are important for the ability of the XPA protein to function as a processivity factor. Using site-directed mutagenesis, mutations were created in several of the exons of XPA and mutant XPA proteins produced. The results showe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously investigated the role of polymorphic chemical metabolizing genes in the susceptibility to the development of lung cancer using 110 primary lung cancer patients and 119 matched smoker controls. Together with data from the present study on DNA repair genes, we did not observe significant associations between any single variant genotype for several DNA-repair and chemical-metabolizing genes (XPD [or ERCC2], XRCC1, XRCC3, GSTM1, GSTT1, MPO, and mEH [or EPHX1]) and lung cancer. In the present study, we have further evaluated a nested group of 79 patients and 69 matched controls,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymorphisms of the nucleotide excision repair gene XPD are candidates for influencing cancer susceptibility. To determine the effect of XPD genetic polymorphisms on the risk of esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) and its interaction with carcinogen exposure, XPD polymorphisms at codon 312 (Asp-->Asn) and codon 751 (Lys-->Gln) were determined in 135 ESCC patients and 152 normal controls. Polymorphism at codon 312 made no contribution to genetic risk for ESCC. Our results showed that there was a significant difference between frequencies for XPD 751 Gln/Gln genotype in ESCC patients (8.9
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this post-genomic era, the individualization of chemotherapy through the study of pharmacogenetics is becoming an ever attainable reality. Keys to individual variations in drug response and toxicity are being identified through the study of drug targets, metabolizing enzymes, efflux and DNA repair systems at the genomic, mRNA and protein levels. Several promising pharmacogenetic candidates with predictive and/or prognostic value have been identified. These candidates, along with others yet to be identified, could in the near future allow for the tailoring of therapy with an ever increasing
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blockage of transcription has been shown to induce the tumor suppressor p53 in human cells. We here show that RNA synthesis inhibitors blocking the phosphorylation of the carboxyl terminal domain (CTD) of RNA polymerase II, such as DRB and H7, induced rapid nuclear accumulation of p53 proteins that were not phosphorylated at ser15 or acetylated at lys382. In contrast, agents that inhibit the elongation phase of transcription, such as UV light, camptothecin or actinomycin D, induced the accumulation of nuclear p53 proteins that were modified at both of these sites. Furthermore, using a panel of
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously constructed the cell-free nucleotide excision repair (NER) assay system with UV-irradiated SV40 minichromosomes to analyze the mechanism of NER reaction on chromatin DNA. Here we investigate the factor that acts especially on nucleosomal DNA during the damage excision reaction, and reconstitute the damage excision reaction on SV40 minichromosomes. NER-proficient HeLa whole cell extracts were fractionated, and the amounts of known NER factors involved in the column fractions were determined by immunoblot analyses. The column fractions were quantitatively and systematically replace
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
US31 is a UV-sensitive mutant cell line (rodent complementation group 8) derived from a mouse T cell line L5178Y. We analyzed removal kinetics for UV-induced cyclobutane pyrimidine dimers and (6-4) photoproducts in US31 cells using monoclonal antibodies against these photoproducts. While nearly all (6-4) photoproducts were repaired within 6 h after UV-irradiation, more than 70% of cyclobutane pyrimidine dimers remained unrepaired even 24 h after UV-irradiation. These kinetics resembled those of Cockayne syndrome (CS) cells. Since US31 cells had a low efficiency of cell fusion and transfection,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования