Corticotroph adenomas/pituitary neuroendocrine tumors (PitNETs) are associated with significant morbidity and mortality. Predictors of tumor behavior have not shown high prognostic accuracy. For somatotroph adenomas/PitNETs, E-cadherin expression correlates strongly with prognosis. E-cadherin expression has not been investigated in other PitNETs. A retrospective chart review of adults with corticotroph adenomas/PitNETs was conducted to assess correlation between E-cadherin expression and tumor characteristics. In addition, gene expression microarray was performed in subset of tumors (n = 16).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Network properties account for the complex relationship between genes, making it easier to identify complex patterns in their interactions. In this work, we leveraged these network properties for dual purposes. First, we clustered pediatric sarcoma tumors using network information flow as a similarity metric, computed by the Wasserstein distance. We demonstrate that this approach yields the best concordance with histological subtypes, validated against three state-of-the-art methods. Second, to identify molecular targets that would be missed by more conventional methods of analysis, we applied
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Personalized treatment for patients with advanced solid tumors critically depends on the deep characterization of tumor cells from patient biopsies. Here, we comprehensively characterize a pan-cancer cohort of 150 malignant serous effusion (MSE) samples at the cellular, molecular, and functional level. We find that MSE-derived cancer cells retain the genomic and transcriptomic profiles of their corresponding primary tumors, validating their use as a patient-relevant model system for solid tumor biology. Integrative analyses reveal that baseline gene expression patterns relate to global ex vivo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ferroptosis, as a novel form of programmed cell death, plays a crucial role in the occurrence and development of bladder cancer (BCa). However, the regulatory mechanisms of ferroptosis in the tumor microenvironment (TME) of BCa remain to be elucidated.
METHODS: Based on single-cell RNA (scRNA) transcriptomic data of BCa, we employed non-negative matrix factorization (NMF) dimensionality reduction clustering to identify novel ferroptosis-related cell subtypes within the BCa TME, aiming to explore the biological characteristics of these TME cell subtypes. Subsequently, we conducted
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) is a multifactorial and heterogeneous disease, ranking among the most prevalent malignancies in men. In 2020, there were 1,414,259 new cases of PCa worldwide, accounting for 7.3% of all malignant tumors. The incidence rate of PCa ranks third, following breast cancer and lung cancer. Patients diagnosed with high-grade PCa frequently present with existing or developing metastases, complicating their treatment and resulting in poorer prognoses, particularly for those with bone metastases. Utilizing single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), we identified specific ma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Complex interactions in the tumor microenvironment (TME) between bladder cancer (BLCA) and immune cells are critical for cancer progression. However, studies of neutrophil extracellular trap-associated long non-coding RNAs (NET-lncRNAs) in the TME of BLCA have not been reported. This study aims to screen for NET-lncRNAs in BLCA and to preliminarily explore their effects on BLCA development.
METHODS: The correlation of NET-related gene sets, which were identified from the cancer genome atlas (TCGA) BLCA datasets, with lncRNAs was analyzed and the prognosis-related genes were identi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N-Acylethanolamine Acid Amidase (NAAA) is an N-terminal cysteine hydrolase and plays a vital physiological role in inflammatory response. However, the roles of NAAA in tumor immunity are still unclear. By using a series of bioinformatics approaches, we study combined data from different databases, including the Cancer Genome Atlas, the Cancer Cell Line Encyclopedia, Genotype Tissue-Expression, cBioPortal, Human Protein Atlas, TIMER, and ImmuCellAI to investigate the role of NAAA expression in prognosis and tumor immunity response. We would like to reveal the potential correlations between NAAA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular immunotherapy represented by CD19-directed chimeric antigen receptor T (CAR-T) cells has achieved great success in recent years. An increasing number of CAR-T therapies are being developed for cancer treatment, but the frequent and varied adverse events, such as "on-target, off-tumor toxicity", limit CAR-T application. Here, we identify the target antigen expression patterns of CAR therapies in 18 tissues and organs (peripheral blood mononuclear cells, bone marrow, lymph nodes, spleen, heart, ascending aortic tissue, trachea, lung, skin, kidney, bladder, esophagus, stomach, small inte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triggering receptor expressed on myeloid cells-2 (TREM2) is a transmembrane receptor of the immunoglobulin superfamily and a crucial signaling hub for multiple pathological pathways that mediate immunity. Although increasing evidence supports a vital role for TREM2 in tumorigenesis of some cancers, no systematic pan-cancer analysis of TREM2 is available. Thus, we aimed to explore the prognostic value, and investigate the potential immunological functions, of TREM2 across 33 cancer types. Based on datasets from The Cancer Genome Atlas, and the Cancer Cell Line Encyclopedia, Genotype Tissue-Expr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Drug resistance mechanisms are the regulatory factors associated with drug metabolism and drug transport to inward and outward of the target cells. Maybridge fragment (MBF) library is a collection of pharmacophore rich compounds having affinity with membrane transporters. This study has been designed to evaluate the efficacy of MBFs in overcoming the leukemic cells' resistance to imatinib.
METHODS: Imatinib resistant cells (K562-R) were prepared using myelogenous leukemia cell line (K562) by titration method. The four MBFs were prioritized for determining their effect on imatinib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The question of whether the tumor mutation burden (TMB) is associated with either improved survival outcomes or improvement of immunotherapies remains controversial in various malignancies. The aim of this study is to investigate the genomic landscape of the relationship between TMB and immune cell infiltration in thymic epithelial tumors (TETs).
METHODS: We downloaded somatic mutation data, transcriptome sequencing data, and clinical information of TETs from the Cancer Genome Atlas (TCGA) database. We assessed the abundance of 22 immune fractions between low-TMB (TMB-L) and high-T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Uterine leiomyoma (ULM) is the most common gynecological tumor. Recent studies have revealed the role of hypovitaminosis D as a major risk factor in the disease development. CYP24A, a mitochondrial enzyme that catalyzes the degradation of 1,25(OH)2D3, is reported to be over-expressed in several human cancers. In this study, we aimed to investigate the expression level of CYP24A1 in leiomyoma samples compared with the adjacent tissues regarding the MED12 mutation profile.
MATERIALS AND METHODS: In the present study, 61 ULMs and adjacent tissue samples were collected from 51 women
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: In 5 patients, a change in the genetic landscape from HPV16 positive high-grade squamous intraepithelial lesion (HSIL) to squamous cervical cancer was traced, which occurred in these patients within the period from 7 months to 5 years after diagnosing HSIL.
MATERIALS AND METHODS: The DNA from paraffin blocks of dysplasia tissue and the tumor that emerged afterwards was used for the study, which was analyzed using the OncoScan FFPE microarray Assay Kit Affymetrix (USA) for genome-wide determination of gene abundance and 65 key somatic driver mutations of oncogenes and tumor suppres
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TLR5 is expressed in a variety of tumors. However, the clinical impact of TLR5 in Peripheral T-cell non-Hodgkin lymphomas (PTCLs) remains unclear. We analyzed differentially expressed genes in PTCLs samples from Gene Expression Omnibus database. We examined TLR5 and programed cell death-ligand1 (PD-L1) expression by immunohistochemistry in PTCLs tissues. Gene expression profiling shown PD-L1 and TLR5 expression was higher in PTCLs than in normal samples. The rates of high TLR5 and PD-L1 expression were 12.5% and 45.8%. We found association between TLR5 and PD-L1 expression. Low TLR5 expression
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer is the third leading cause of female death in the world. Serum microRNAs (miRNAs) are currently considered to be valuable as noninvasive cancer biomarkers, but their role in the prognosis of cervical cancer has not been elucidated. We aimed to find serum miRNAs that can be used as prognostic factors for cervical cancer. A traumatic pathological biopsy is the only reliable method for determining the severity of cervical cancer currently. Thus, noninvasive diagnostic markers are needed. The serological expression of candidate miRNAs were measured in 90 participants, including 60
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma has the highest propensity to metastasize to the brain compared to other cancers, as brain metastases are found frequently high in patients who have prolonged survival with visceral metastasis. Once disseminated in the brain, melanoma cells communicate with brain resident cells that include astrocytes and microglia. Microglia cells are the resident macrophages of the brain and are the main immunological cells in the CNS involved in neuroinflammation. Data on the interactions between brain metastatic melanoma cells and microglia and on the role of microglia-mediated neuroinflammation i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse malignant pleural mesothelioma (DMPM) is the most common primary malignant pleural neoplasm still posing major diagnostic, prognostic and therapeutic challenges. Plakophilins are structural proteins considered to be important for cell stability and adhesion in both tumor and normal tissues. Plakophilin 3 is a protein present in desmosomes of stratified and simple epithelia of normal tissues with presence in malignant cells of various tumors where it participates in the process of tumorigenesis. The aim of this study was to investigate the expression of plakophilin 3 protein in DMPM, bu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thymoma is the most common primary anterior mediastinal neoplasm with a high recurrence rate. Long noncoding RNAs (lncRNAs) have recently been indicated to be used as diagnostic and prognostic indicators for different cancers. The aim of this study was to identify new tumor-specific prognostic lncRNA markers that can improve the treatment and follow-up of patients with thymomas.
METHODS: One hundred seventeen thymoma patients with clinical information and level 3 RNAseqv2 data were downloaded from The Cancer Genome Atlas. Prognostic lncRNAs were identified using Kaplan-Meier survi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder outlet obstruction (BOO) and the ensuing clinical lower urinary tract dysfunction are common in elderly patients. BOO is accompanied by urodynamic changes in bladder function and leads to organ fibrosis and ultimately loss of contractility. Comprehensive transcriptome analysis of bladder samples from human patients with different urodynamically defined phenotypes of BOO revealed tumor necrosis factor (TNF)-α as the top upstream signaling pathway regulator. Herein, we validated next-generation sequencing and pathway analysis in cell-based models using bladder smooth muscle and urothelia
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Platin-containing regimes are currently considered as state-of-the-art therapies in malignant pleural mesotheliomas (MPM) but show dissatisfying response rates ranging from 6 to 16% only. Still, the reasons for the rather poor efficacy remain largely unknown. A clear stratification of patients based on new biomarkers seems to be a promising approach to enhance clinical management, which would be a long-needed improvement for MPM patients but does not seem likely soon unless new biomarkers can be validated. Twenty-four formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumour specimens were subjected to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования