Cis-regulatory elements (CREs) orchestrate the spatiotemporal precision of gene expression that underlies plant development, adaptation, and domestication. Decoding the cis-regulatory grammar of plant genomes remains a central challenge in modern biology, with profound implications for programmable crop engineering. Here, recent conceptual and technological advances are synthesized to reshape our understanding of plant CREs. This review first argues that CRE function is not only an intrinsic property of DNA sequence alone but also emerges from a multidimensional context, including chromatin ac
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bromodomain and extraterminal domain (BET) proteins are epigenetic readers that couple chromatin acetylation to oncogenic and immune-regulatory gene transcription, making them attractive targets for combination with immune checkpoint inhibitors (ICIs) in precision oncology. This review synthesizes current mechanistic, medicinal-chemistry, and translational evidence on BET-ICI combination strategies. We describe how BET blockade reshapes tumor chromatin architecture, suppresses PD-L1 expression, and enhances antigen presentation, thereby increasing tumor susceptibility to immune-mediated attack
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bleeding disorders arising from dysfunctional platelet-protein interactions pose a significant clinical challenge due to their heterogeneity … e often limited by availability, cost, immunogenicity, and inadequate precision. Recent advances in computational biology and peptide engineering now offer potential for improved hematologic therapeutics. This review outlines two major strategies in peptide drug design: Structure-based modeling and small motif-based design. These approaches enable the creation of short …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review summarizes major advances in mast cell (MC) research published between January 2024 and December 2025. Recent discoveries have reshaped our understanding of MC biology, revealing previously unrecognized roles in brain development, mucosal immunity, neuroimmune communication, and cancer. High-resolution structural studies have provided new insights into high affinity receptor for immunoglobulin (Ig)E (FcεRI) signaling, while emerging evidence has expanded the functional repertoire of inflammasome components and established Mas-related G-protein coupled receptor member (MRGPRX)2 as a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of complex and rapidly evolving pathogens necessitates innovative vaccine platforms that move beyond traditional methods. This review explores the transformative potential of next-generation vaccine technologies, focusing on the combined use of synthetic biology, nanotechnology, and systems immunology. Synthetic biology provides modular tools for designing antigenic components with improved immunogenicity, as seen in mRNA, DNA, and peptide-based platforms featuring codon optimization and self-amplifying constructs. At the same time, nanotechnology enables precise antigen delivery
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although there has been increased knowledge about the molecular biology of neuroendocrine tumors (NETs), little is known about thymic carcinoids and even less about those with excessive hormone disorders, such as ectopic ACTH syndrome. This study was designed to gain insights into the molecular networks underlying the tumorigenesis of thymic carcinoids with ACTH secretion. By an approach integrating cDNA microarray and methods of computational biology, we compare gene expression profile between ACTH-producing thymic carcinoids and the normal thymus. In total, there are 63 biological categories…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomics has entered a phase in which AI agents can autonomously discover, configure, execute, and chain bioinformatics operations from natural-language instructions. We term this paradigm "agentic genomics": the delegation of multi-step genomic analyses to autonomous software agents that select tools, manage dependencies, and adapt execution in response to intermediate results, mediated by large language models (LLMs) and constrained by domain-specific skill libraries. We argue that agentic genomics shifts the bottleneck in computational biology from pipeline construction to validation. We ex…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-alcoholic fatty acid liver disease (NAFLD), non-alcoholic steatohepatitis (NASH) and hepatocellular carcinoma (HCC) are the fatal liver diseases which encompass a spectrum of disease severity associated with increased risk of type 2 diabetes mellitus (T2DM), a metabolic disorder. Heat shock proteins serve as markers in early prognosis and diagnosis of early stages of liver diseases associated with metabolic disorder. This review aims to comprehensively investigate the significance of HSP90 isoforms in T2DM and liver diseases. Additionally, we explore the collective knowledge on plant-based
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A central challenge in biology is to use existing measurements to predict the outcomes of future experiments. For the rapidly evolving influenza virus, variants examined in one study will often have little to no overlap with other studies, making it difficult to discern patterns or unify datasets. We develop a computational framework that predicts how an antibody or serum would inhibit any variant from any other study. We validate this method using hemagglutination inhibition data from seven studies and predict 2,000,000 new values ± uncertainties. Our analysis quantifies the transferability b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungal plasma membrane proteins have long been recognized as targets for the development of antifungal agents. Despite recent progress in experimental approaches and computational structural predictions, our knowledge of the structural dynamics and spatial distribution of these membrane proteins in the context of their native lipid environment remains limited. By applying cryo-electron tomography (cryoET) and subtomogram analysis, we aim to characterize the structural characteristics and spatial distribution of membrane proteins present in Candida glabrata plasma membranes. This study has resu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxic ischemic encephalopathy (HIE) is a significant cause of death and neurological disability in newborns. Therapeutic hypothermia at 33.5 °C is one of the most common treatments in HIE and generally improves outcome; however 45-55% of injuries still result in death or severe neurodevelopmental disability. We have developed a systems biology model of cerebral oxygen transport and metabolism to model the impact of hypothermia on the piglet brain (the neonatal preclinical animal model) tissue physiology. This computational model is an extension of the BrainSignals model of the adult brain. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Разработка вакцины для агентов биоугрозы сопряжена с рядом проблем, связанных с открытием, доклиническим развитием и выдачей лицензии. Потребность в высоком сдерживании для работы с живыми агентами ограничивает объем и виды исследований, которые могут быть проведены с использованием полных патогенов, а небольшие рынки уменьшают потенциальную прибыль для промышленности. Вместе с тем для понимания основы уменьшения вирусного воздействия и характеристики защитной иммунной реакции используется ряд инструментов, начиная от сравнительного патогенеза вирусных штаммов на молекулярном уровне и кончая н
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of Alzheimer's disease (AD) continues to increase, despite decades of effort to develop disease-modifying therapies. In response, the National Institute on Aging (NIA) established the TaRget Enablement to Accelerate Therapy Development for Alzheimer's Disease (TREAT-AD) centers to address the gap between basic research and translational drug discovery. Situated within a robust AD research environment, the Indiana University School of Medicine (IUSM)-Purdue University TREAT-AD Center is one of two National Institutes of Health (NIH)-supported centers funded to accomplish this miss
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The article deals with BB-SPICE (SPICE for Biochemical and Biological Systems), an extension of the famous Simulation Program with Integrated Circuit Emphasis (SPICE). BB-SPICE environment is composed of three modules: a new textual and compact description formalism for biological systems, a converter that handles this description and generates the SPICE netlist of the equivalent electronic circuit and NGSPICE which is an open-source SPICE simulator. In addition, the environment provides back and forth interfaces with SBML (System Biology Markup Language), a very common description language us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The unfolded protein response (UPR) is a fundamental stress pathway coopted in cancer, and it is thought to drive adaptation, tumor progression, and therapeutic resistance. While the analysis of 'single-effector' biomarkers within the tumor microenvironment often fails to capture its spatial, temporal, and cellular complexity, recent advances in high-resolution spatial transcriptomics and single-cell multiomics may enable a shift from static readouts toward more comprehensive multigene UPR signatures. This could help resolve proteostatic heterogeneity at unprecedented resolution. In this revie
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Noncovalent interactions play a central role in chemistry, biology, and materials science, governing processes ranging from molecular recognition and protein folding to crystal packing and supramolecular assembly. The rational design of these interactions relies on principles such as directionality and complementarity, which control the organization and stability of molecular complexes. Although energetic decomposition analyses can provide insight into these features, their computational cost limits their application to large-scale systems. Here, we introduce a simple density-based descriptor,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Academia-industry partnerships are an important driver of innovation in drug discovery, and their success depends on intentional problem selection, effective resource sharing, and robust communication during project execution. This outlook highlights select Merck Sharp & Dohme Discovery Chemistry (MSD DC) collaborations reported over the past five years to illustrate principles that underpin productive academia-industry partnerships. Through representative case studies in synthesis collaborations, we illustrate two complementary collaboration strategies: targeted development of synthetic metho
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conformational flexibility of bioactive molecules poses a major challenge to computational biology. tCONCOORD generates structure ensembles based on geometrical considerations and has been successfully applied to predict protein conformational flexibility and essential degrees of freedom. We have now developed a graphical user interface (GUI) for tCONCOORD, which substantially facilitates the simulation setup and provides valuable insights into the structure analysis and constraint definition process in tCONCOORD. Moreover, users can influence the constraint definition process by interactively…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of oligonucleotide-based microarrays (biochips) is a major thrust area in the rapidly growing biotechnology industry, which encompasses a diverse range of research areas including genomics, proteomics, computational biology, and pharmaceuticals, among other activities. Microarray experiments have proved to be unique in offering cost-effective and efficient analysis at the genomic level. In the last few years, biochips have gained increasing acceptance in the study of genetic and cellular processes. As the increase in experimental throughput has posed many challenges to the rese…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein function prediction is crucial for narrowing the gap between the rapid growth of protein sequences and the limited availability of experimental annotations. In recent years, protein language models (pLMs) that learn representations from large-scale sequence data have emerged as scalable frameworks for modeling protein function. However, most pLMs rely on self-supervised pretraining and struggle to capture correlations among functional labels, which constrains their applicability to annotation-specific tasks. To address this limitation, we present ProtDML, a protein function prediction
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования