We evaluated the reliability of a novel multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) assay in detecting integration of human papillomavirus (HPV) based on the viral E2/E6 copy number ratio in formalin-fixed and paraffin-embedded cervical lesions. The MLPA results were compared with those of amplification of papillomavirus oncogene transcripts for RNA, detection of integrated papillomavirus sequences for DNA, and HPV fluorescence in situ hybridization (FISH). DNA was isolated from 41 formalin-fixed and paraffin-embedded HPV-positive cervical lesions (cervical intraepithelial neoplasi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many p53 functions require p53 transport into the nucleus. Mutant p53 also generally accumulates in the nucleus of transformed or neoplastic cells. However, examples of cytoplasmic accumulation of wild-type or mutant p53 have also been reported. Various explanations have been provided for defective nuclear localization. Here we propose a novel example of cytoplasmic p53 localization which occurs in cells showing gene amplification and appears to be due to the formation of stable p53 multimers. We studied a methotrexate-resistant Chinese hamster cell line (MTX M) carrying amplified dihydrofolat…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Increasing resistance to broad-spectrum beta-lactams and carbapenems is a significant concern in healthcare settings. This study … read sequencing revealed IncL plasmid-mediated dissemination of OXA-48 β-lactamase and bla CTX-M-15 gene amplification, demonstrating its added value for antimicrobial resistance monitoring.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The past and present scenario of COVID-19 has revealed the necessity of simple point-of-care tests. When combined with the great advantages of amplification, lateral flow assay nucleic acid analysis represents a more sensitive molecular diagnostic technique compared to universal protein analysis. Room temperature operation, an enzyme-free nature, and in situ elongation make hybrid chain reaction amplification (HCR) a good candidate for amplified combined lateral flow assays (LFAs). Since dual modes of detection can not only satisfy different application scenarios, but also reduce the false-neg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid and efficient detection of microRNA (miRNA) of breast cancer 1 gene mutation (BRCA1) at their earliest stages is one of the crucial challenges in cancer diagnostics. In this study, a highly-sensitive electrochemical DNA biosensor was fabricated by double signal amplification (DSA) strategy for the detection of ultra-trace miRNA of BRCA1. In the presence of target miRNA of BRCA1, the well-matched RNA-DNA duplexes were specifically recognized by double-strand specific nuclease (DSN), and the DNA part of the duplexes were then cleaved and miRNAs were released to trigger another following cy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: In this present study, the utility of a newly developed loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and real-time PCR assays designed to amplify the virB gene region of Brucella melitensis was evaluated from human clinical specimens.
METHODS AND RESULTS: Fifty-four culture-confirmed cases of brucellosis and 54 culture negative but clinically suspected cases of brucellosis were included in the study. Whole blood, serum and other nonblood specimens were collected and subjected to blood culture using automatic blood culture system, serological tests, LAMP assay and real-time PCR. Overall
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human papillomavirus (HPV) is an important prognostic factor for tonsillar squamous cell carcinoma (TSCC). HPV-positive and HPV-negative TSC … HPV-positive/HGF-low expression tumors had the most favorable prognosis. c-Met expression and c-Met gene amplification were not associated with survival outcomes in TSCC patients. In conclusion, HGF may be a potential prognostic marker in HPV-negative TSCC, whereas c-Met exhibited limited clinical significance in TSCC.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pelizaeus-Merzbacher disease (PMD) is a rare X-linked recessive disorder with a prototype of a dysmyelinating leukodystrophy that is caused by a mutation in the proteolipid protein 1 (PLP1) gene on the long arm of the X chromosome in band Xq22. This mutation results in abnormal expression or production of PLP. We here present a Korean boy with spastic quadriplegia, horizontal nystagmus, saccadic gaze, intentional tremor, head titubation, ataxia, and developmental delay. The brain magnetic resonance imaging (MRI) showed abnormally high signal intensities in the white matter tract, including a s
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study examined the clinical correlation between the presence of human cytomegalovirus (HCMV) pp67 mRNA in cerebrospinal fluid (CSF) and active HCMV central nervous system (CNS) disease in patients with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). In total, 76 CSF specimens collected from 65 HIV-1-positive patients diagnosed with HCMV CNS disease, other non-HCMV-related CNS diseases, or no CNS disease were tested for the presence of HCMV pp67 mRNA using the NucliSens cytomegalovirus (CMV) pp67 assay (Organon Teknika, Durham, N.C.). The results were compared to those of a nested PCR for the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Fibroblast growth factor receptor (FGFR) 2 gene amplification and its prognostic significance have been reported in resectable gastric cancers, information on these features remains limited in the metastatic setting. The presence of FGFR2 amplification was assessed in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues using a quantitative PCR-based gene copy number assay with advanced gastric cancer cohorts. A total of 327 patients with tumor portion of ≥70% were analyzed for clinical features. Among these patients, 260 who received first-line fluoropyrimidine and platinum chemotherapy were an…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two gene sequences specific for Mycobacterium tuberculosis were evaluated for the diagnosis of pulmonary tuberculous (PTB) in pleural fluid (PF), bronchoalveolar lavage fluid (BAL) and sputum (Sp). The 240 bp sequence (nts 460-700) coding for the MPB 64 protein coding gene and the 123 bp IS6110 insertion element present in multiple copies in the mycobacterial genome were amplified using the polymerase chain reaction. Fifty-nine clinical specimens were studied. The diagnosis of PTB was confirmed by positive M. tuberculosis cultures in 14 specimens, and by the presence of characteristic histolog
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enteroviruses (EVs) have been proposed as environmental triggers in type 1 diabetes (T1D), potentially through activation of innate immune pathways and type I interferon (IFN) responses. However, the relationship between detectable viral infection and IFN-related transcriptional responses remains unclear.
METHODS: In this cross-sectional, exploratory study, peripheral blood samples from individuals with new-onset T1D, established T1D, and healthy controls were analyzed by an enterovirus 5'NCR-targeted RT-PCR assay and for the expression of innate immune receptors (TLR3, TLR7, TLR8
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MEIS1::NCOA1/2 fusion undifferentiated spindle cell sarcomas generally arise from genitourinary and gynecologic tracts and mostly exhibit low-grade malignancies according to limited cases. Here, we report two cases from pelvic cavities. Case 1 showed low-grade morphology of monotonous spindle cells with moderate atypia in short fascicular or storiform patterns, while case 2 exhibited marked atypia, brisk mitosis, and significant necrosis. Notably, both cases identified intracytoplasmic eosinophilic globules. Next-generation sequencing analysis observed MEIS1::NCOA2 rearrangements in both cases
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) infection has increasingly been a serious problem worldwide. The H. pylori infection can result in a series of stomach diseases including gastric carcinoma. There are two specific virulence genes (cagA and vacA) of H. pylori that are closely related to the occurrence of gastric cancer, and the common molecular detection methods (PCR, qPCR) are not suitable for high-screening test due to the requirement of expensive instruments and well-trained personals. Herein, we develop a rapid visual assay based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for detecting
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For over two decades, multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) has served as the gold standard for genetic testing of spinal muscular atrophy. However, there is emerging evidence questioning the reliability of MLPA in determining the copy numbers (CNs) of the survival of motor neuron (SMN) gene in certain cases. Recently, digital polymerase chain reaction (dPCR) has shown potential for better performance in copy number variant detection. This study aimed to compare MLPA and dPCR in quantifying SMN1 and SMN2 CNs, identify reasons for observed discrepancies, and explore the clinic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient manufacture of recombinant adeno-associated virus (rAAV) vectors for gene therapy remains challenging. Packaging cell lines containing stable integration of the AAV rep/cap genes have been explored, however rAAV production needs to be induced using wild-type adenoviruses to promote episomal amplification of the integrated rep/cap genes by mobilizing a cis-acting replication element (CARE). The adenovirus proteins responsible are not fully defined, and using adenovirus during rAAV manufacture leads to contamination of the rAAV preparation. 'TESSA' is a helper adenovirus with a self-re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Secondary angiosarcoma (AS) most commonly follows breast cancer and includes postirradiation AS (PRAS) and lymphedema-associated AS. The frequent amplification of MYC (8q24.21) in secondary AS and the rising incidence of PRAS and atypical vascular lesions (AVLs) have prompted interest in the diagnostic and prognostic utility of MYC in AS.
METHODS: Retrospective series with ≥2 cases of cutaneous AS and describing the use of fluorescence in situ hybridization (FISH) for MYC amplification or immunohistochemistry (IHC) for MYC overexpression were included.
RESULTS: Sixteen studies me
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A gene, phl, encoding a phenylacetyl-CoA ligase was cloned from a phage library of Penicillium chrysogenum AS-P-78. The presence of five introns in the phl gene was confirmed by reverse transcriptase-PCR. The phl gene encoded an aryl-CoA ligase closely related to Arabidopsis thaliana 4-coumaroyl-CoA ligase. The Phl protein contained most of the amino acids defining the aryl-CoA (4-coumaroyl-CoA) ligase substrate-specificity code and differed from acetyl-CoA ligase and other acyl-CoA ligases. The phl gene was not linked to the penicillin gene cluster. Amplification of phl in an autonomous repli
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the pathogenesis of complete hydatidiform mole (complete mole), we employed a newly developed gene amplification method by polymerase chain reaction (PCR) for the restriction fragment length polymorphism (RFLPs) analysis of extranuclear DNA (mitochondrial DNA) of complete mole. Whole cellular DNA was extracted from six molar tissues and from peripheral blood mononuclear cells of parents. Two hyperpolymorphic regions of mitochondrial DNA, a 1.5-kb-long fragment and a 1.9-kb-long fragment, were selectively amplified from the extracted DNA by the PCR method. The amplification produ…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma stands out as the most frequent central nervous system neoplasia, presenting a poor prognosis. The aim of this study was to verify the frequency and clinical significance of the aneuploidy of chromosomes 7 and 10, EGFR amplification, PTEN and TP53 deletions and 1p/19q deficiency in adult patients diagnosed with glioblastoma. The sample consisted of 40 patients treated from November 2011 to March 2015 at two major neurosurgery services from Southern Brazil. Molecular cytogenetic analyses of the tumor were performed through fluorescent in situ hybridization (FISH). The clinical feat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.