Burkholderia pseudomallei, the aetiological agent of melioidosis, is an inhabitant of soil and water in many tropical and subtropical regions worldwide. It possesses six distinct type VI secretion systems (T6SS-1 to T6SS-6), but little is known about most of them, as they are poorly expressed in laboratory culture media. A genetic screen was devised to locate a putative repressor of the T6SS-2 gene cluster and a MarR family transcriptional regulator, termed TctR, was identified. The inactivation of tctR resulted in a 50-fold increase in the expression of an hcp2-lacZ transcriptional fusion, in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A major challenge in bacterial pathogenesis is understanding the molecular basis of the switch from saprophytism to virulence. Following a recent whole-genome transcriptomic analysis using tiling arrays, an article published in BMC Genomics reports the first use of RNA-seq in Listeria monocytogenes in order to identify genes controlled by sigma B, a transcriptional regulator with a critical role in virulence.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The bacterial DNA damage response (DDR) system promotes survival under stressful conditions and facilitates the emergence of drug-resistant mutations. The DDR system in Mycobacterium tuberculosis is primarily governed by LexA-mediated transcriptional repression. Although some other regulators, such as PafBC and McdR have been reported, whether additional regulatory inputs contribute to DDR remains to be characterized.
RESULTS: By performing a bacterial one-hybrid screen, we identified several transcriptional regulators, including Rv2282c, Rv1985c and Rv1990c, that activate DDR gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Group A Streptococcus (GAS) is a human-restricted pathogen whose global incidence has surged in the post-COVID era. The ability of GAS to shift from a colonizing to invasive phenotype depends on coordinated virulence gene regulation in response to host-derived signals. However, the mechanisms by which individual stress-sensing systems interact to reshape the virulence gene regulatory landscape remain incompletely understood. Here, we define the regulatory programs of two conserved transcriptional regulator paralogs, SpxA1 and SpxA2, using an integrated multi-omic approach combining
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biofilm formation by bacterial pathogens represents a major challenge in aquaculture, since biofilms promote persistence and increase tolerance to antimicrobial treatments. Yersinia ruckeri, the etiological agent of enteric redmouth disease in salmonids, contributes to recurrent infections in aquaculture. However, the molecular mechanisms governing biofilm development in this pathogen remain poorly understood. In this study, we investigated the role of the global transcriptional regulator Fur in the biofilm formation of Y. ruckeri. To this aim, a fur deletion mutant (Δfur) was phenotypically,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Litter is a major source for harboring and transmitting Salmonella from one flock to another flock. The objective of this experiment was to elucidate the persistence mechanism of S. Infantis by analyzing transcriptomic changes in the presence of litter. To achieve this, four treatments were arranged: (1) BHI, (2) BHI+Litter, (3) PBS, and (4) PBS+Litter. Each treatment was inoculated with S. Infantis, and RNA was extracted. Quality, quantity, and integrity of RNA were assessed and then subjected to Illumina sequencing. HISAT2 was used to align reads to the reference genome, HTSeq to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clavulanic acid (CA) is a specific metabolite that inhibits β-lactamases, which inactivate β-lactam antibiotics, therefore reinstating the activity of β-lactams against β-lactamase-producing pathogens, and surmounting β-lactam resistance. While extensive efforts have been made to optimize CA production through random mutagenesis, these approaches often introduce deleterious mutations, limiting further yield improvements. In this study, whole-genome sequencing, time-resolved transcriptomics, and independent component analysis (ICA)-based gene co-expression network analysis were employed to eluc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhodococcus qingshengii N9T-4 is a super oligotroph that grows on a completely inorganic basal medium without any additional carbon and nitrogen sources. This oligotrophy may facilitate low-carbon and low-cost bioprocessing for compounds of economic significance. In this study, an operon containing three Cupriavidus necator H16 genes that are involved in polyhydroxyalkanoate (PHA) biosynthesis, phaC1AB1, was expressed in N9T-4 cells under the promoter of aldA encoding an NAD+-dependent aliphatic aldehyde dehydrogenase, which is highly expressed under the oligotrophic conditions. The three prot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: For microorganisms on a paper surface, the lack of water is one of the most important stress factors. A strain of Bacillus megaterium FDU301 was isolated from plaques on a paper surface using culture medium with polyethylene glycol 200 (PEG200) to simulate an arid condition. Global transcriptomic analysis of B. megaterium FDU301 grown under normal and simulated arid conditions was performed via RNA-seq technology to identify genes involved in arid stress adaptation.
RESULTS: The transcriptome of B. megaterium FDU301 grown in LB medium under arid (15% PEG200 (w/w)) and normal condi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial pathogens utilize gene expression versatility to adapt to environmental changes. Vibrio cholerae, the causative agent of cholera, encounters redox-potential changes when it transitions from oxygen-rich aquatic reservoirs to the oxygen-limiting human gastrointestinal tract. We previously showed that the virulence regulator AphB uses thiol-based switches to sense the anoxic host environment and transcriptionally activate the key virulence activator tcpP. Here, by performing a high-throughput transposon sequencing screen in vivo, we identified OhrR as another regulator that enables V. c
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Haemophilus ducreyi causes the sexually transmitted disease chancroid and a chronic limb ulceration syndrome in children. In humans, H. ducreyi is found in an abscess and overcomes a hostile environment to establish infection. To sense and respond to membrane stress, bacteria utilize two-component systems (TCSs) and extracytoplasmic function (ECF) sigma factors. We previously showed that activation of CpxRA, the only intact TCS in H. ducreyi, does not regulate homologues of envelope protein folding factors but does downregulate genes encoding envelope-localized proteins, including many virulen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of bacterial gene expression by small RNA (sRNA) molecules is an increasingly recognized phenomenon but one that is not yet fully understood. We show that the sRNA RyhB suppresses several virulence-associated phenotypes of Shigella dysenteriae, a causative agent of bacillary dysentery in humans. The virulence genes repressed by S. dysenteriae RyhB include those encoding the type III secretion apparatus, its secreted effectors, and specific chaperones. Suppression of Shigella virulence occurs via RyhB-dependent repression of the transcriptional activator VirB, leading to reduced expr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pyogenes is a globally prominent bacterial pathogen that exhibits strict tropism for the human host, yet bacterial factors responsible for the ability of S. pyogenes to compete within this limited biological niche are not well understood. Using an engineered recombinase-based in vivo expression technology (RIVET) system, we identified an in vivo-induced promoter region upstream of a predicted Class IIb bacteriocin system in the M18 serotype S. pyogenes strain MGAS8232. This promoter element was not active under in vitro laboratory conditions, but was highly induced within the mou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing antibiotic resistance urges for new technologies for studying microbes and antimicrobial mechanism of action. We adapted thermal proteome profiling (TPP) to probe the thermostability of Escherichia coli proteins in vivoE. coli had a more thermostable proteome than human cells, with protein thermostability depending on subcellular location-forming a high-to-low gradient from the cell surface to the cytoplasm. While subunits of protein complexes residing in one compartment melted similarly, protein complexes spanning compartments often had their subunits melting in a location-wise man
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To assess the occurrence of, and characterise, extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and AmpC β-lactamase (AmpC)-producing Enterobacteriaceae isolated by veterinary diagnostic laboratories from infection sites in companion animals in New Zealand.
METHODS: Selected Enterobacteriaceae isolates were submitted by seven New Zealand veterinary diagnostic laboratories. They were isolated from infection sites in companion animals between June 2012 and June 2013, and were resistant to amoxicillin-clavulanic acid, fluoroquinolones, or any combination of two or more antimicrobials. Based on disk di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leukocyte cell-derived chemotaxin-2 (LECT2) is an important protein of the innate immune system for the defense against bacterial infection. We cloned and characterized the LECT2 gene from Asian seabass (Lates calcarifer). Its complete cDNA consisted of an open reading frame of 459 bp encoding a protein of 152 amino acids. The genomic DNA sequence of this gene consists of four exons and three introns. Quantitative real-time PCR revealed that the LECT2 gene was expressed predominantly in liver while its expression was moderate in spleen and heart, and weak in other tissues. The LECT2 transcript
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phenol- and naphthalene-degrading indigenous Pseudomonas pseudoalcaligenes strain C70 has great potential for the bioremediation of polluted areas. It harbours two chromosomally located catechol meta pathways, one of which is structurally and phylogenetically very similar to the Pseudomonas sp. CF600 dmp operon and the other to the P. stutzeri AN10 nah lower operon. The key enzymes of the catechol meta pathway, catechol 2,3-dioxygenase (C23O) from strain C70, PheB and NahH, have an amino acid identity of 85%. The metabolic and regulatory phenotypes of the wild-type and the mutant strain C70Δph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the trends and the diversity of CTX-M types of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) in Escherichia coli isolated from food animals in China over a ten-year period. From 2003 to 2012, 2815 E. coli isolates collected from diseased animals (chickens, pigs, and waterfowl) were screened for the prevalence of CTX-M genes. CTX-M-positive isolates were tested for their susceptibilities to 10 antimicrobial agents and the clonal relationship of CTX-M-producing E. coli isolates was also assessed. Overall, 677 (20.1%) of the 2815 E. coli isolates carried CTX-M gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial differentiation is often associated with the asymmetric localization of regulatory proteins, such as histidine kinases. PdhS is an essential and polarly localized histidine kinase in the pathogenic alphaproteobacterium Brucella abortus. After cell division, PdhS is asymmetrically segregated between the two sibling cells, highlighting a differentiation event. However, the function(s) of PdhS in the B. abortus cell cycle remains unknown. We used an original approach, the pentapeptide scanning mutagenesis method, to generate a thermosensitive allele of pdhS. We report that a B. abortus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quinolones and fluoroquinolones are widely used antibacterial agents. Nalidixic acid (NA) is a first-generation quinolone-based antibiotic that has a narrow spectrum and poor pharmacokinetics. Here, we describe a family of peptide-nalidixic acid conjugates featuring different levels of hydrophobicity and molecular charge prepared by solid-phase peptide synthesis that exhibit intriguing improvements in potency. In comparison to NA, which has a low level of potency in S. aureus, the NA peptide conjugates with optimized hydrophobicities and molecular charges exhibited significantly improved antib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования