A growing body of data suggests that the prevalence of COVID-19 pneumonia in patients with stomach cancer is much higher than in the general population. However, these mechanisms are still not fully understood. After a thorough examination of shared differentially expressed genes (DEGs) for gastric cancer (GC) and COVID-19 pneumonia, we performed functional annotation, protein-protein interaction (PPI) networks, module design, and pivot gene identification. qPCR was used to verify the expression of hub genes in GC. Finally, a pivotal gene transcription factor-gene regulatory network was create
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opioids are the primary regimens for perioperative analgesia with controversial effects on oncological survival. The underlying mechanism remains unexplored. This study developed survival-related gene co-expression networks based on RNA-seq and clinical characteristics from TCGA cohort. Two survival-related networks were identified, and drug-induced transcriptional profiles were predicted. Immune cell infiltration algorithm, least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression, and cox proportional models were executed to explore the correlation between opioid-related drugs and p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The use of gene development data from public database has become a new starting point to explore mitochondrial related gene expression and construct a prognostic prediction model of ovarian cancer.
METHODS: Data were obtained from the TCGA and ICGC databases, and the intersection with mitochondrial genes was used to obtain the differentially expressed genes. q-PCR, Cox proportional risk regression, minimal absolute contraction and selection operator regression analysis were performed to construct the prognostic risk model, and ROC curve was used to evaluate the model for centraliz
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer refers to malignant tumors occurring in the walls of the colon or rectum. The roles of WD Repeat Domain 12 (WDR12) and mitochondrial ribosome-associated tumor suppressor 4 (MRTO4) genes in colorectal cancer remain unclear. The colorectal cancer dataset GSE113513 configuration file was downloaded from the gene expression omnibus database generated from GPL15207. Differentially expressed genes screening, functional enrichment analysis, gene set enrichment analysis, Weighted Gene Co-expression Network Analysis, construction and analysis of protein-protein interaction networks, s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) is a chronic glomerular disease associated with podocyte injury which is named after the pathologic features of the kidney. The aim of this study is to decode the key changes in gene expression and regulatory network involved in the formation of FSGS. Integrated network analysis included Gene Expression Omnibus (GEO) datasets to identify differentially expressed genes (DEGs) between FSGS patients and healthy donors. Bioinformatics analysis was used to identify the roles of the DEGs and included the development of protein-protein interaction (PPI) netwo
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: As a systemic skeletal dysfunction, osteoporosis (OP) is characterized by low bone mass, impairment of bone microstructure, and a high global morbidity rate. There is increasing evidence that microRNAs (miRNAs) are associated with the pathogenesis of OP. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) is a systematic method for identifying clinically relevant genes involved in disease pathogenesis. However, the study of the miRNA-messenger RNA (mRNA) regulatory network in combination with WGCNA in OP is still lacking.
METHODS: The GSE93883 and GSE7158 microarray datasets we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer is one of the most common gynecological malignancies and is related to human papillomavirus (HPV) infection, especially high-risk type HPV16 and HPV18. Aberrantly expressed genes are involved in the development of cervical cancer, which set a genetic basis for patient prognosis. In this study, we identified a set of aberrantly expressed key genes from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database, which could be used to accurately predict the survival rate of patients with cervical squamous cell carcinoma (CESC). A total of 3,570 genes that are differentially expressed between normal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prognosis of Hepatosplenic T-Cell Lymphoma (HSTCL) is very poor, while the molecular mechanism of this disease has rarely been investigated and remains mysterious. The aim of the study is to screen differentially expressed genes (DEGs) of patients with HSTCL and normal controls, explore the pathogenesis, and provide guidance for the gene diagnosis and precise treatment of HSTCL.
METHODS: The genetic chip data GSE57520 of HSTCL was searched from the GEO database, and the quality control and DEGs screening were performed through BART online tools. In addition, FunRich software was u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pleiotropy is a common phenomenon in the genetics of cancers, which is rarely systematically evaluated. A novel idea for identifying shared gene functional modules using biclustering was proposed in this paper to explore the common molecular mechanisms among cancers and the relationships between different types of cancers. Gene expression datasets for 20 cancers were obtained. And genes differentially expressing in at least two types of cancers were selected using both moderated t-statistic and fold change to construct a 10417 × 20 matrix (gene-cancer matrix). 22 gene clusters shared by cancer
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medulloblastoma (MB) is one of the most frequent malignant brain tumors in children. The metastasis of MB outside the nervous system is associated with a poor prognosis. Our study aimed to explore the genes correlated with metastasis in MB. Using the data downloaded from the gene expression omnibus database, the differentially expressed genes were identified between the metastatic and nonmetastatic samples in MB, which were undergone functional enrichment. Prognosis related genes were identified using univariate Cox regression analysis. The gene set enrichment analysis was conducted to find MB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Triple negative breast cancer (TNBC) is an aggressive malignancy distinguished by resistance to standard breast cancer therapies. The absence of reliable prognostic tools hinders the ability to predict therapeutic response, resulting in some patients receiving treatment that is ineffective yet physically exhausting. miRNAs are small non-coding RNA molecules that regulate gene expression, and their dysregulated profiles in liquid biopsies hold immense potential as minimally invasive biomarkers for monitoring treatment response.
RESULTS: In this study, we seek to identify miRNAs tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the distinct subtypes of anoikis in hepatocellular carcinoma (HCC) and their underlying molecular mechanisms, and to construct a prognostic risk model. The gene expression profiles of HCC were downloaded from the cancer genome atlas and gene expression omnibus database, while anoikis-related genes were obtained from the GeneCards database. Unsupervised clustering algorithms were applied based on the expression of differentially expressed anoikis genes to identify related subtypes. Survival curves were used to analyze the differences in survival between subtypes,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While recent studies have highlighted oxidative stress (OS) as a pivotal factor influencing tumor dynamics, its specific interactions within the tumor microenvironment (TME) of colorectal cancer (CRC) remain elusive. This study seeks to unveil the impact of OS on the CRC TME and to develop an advanced OS-related risk signature (OSRRS) model. We analyzed OS-related pathway activities using both single-cell and bulk RNA-seq data. An unsupervised clustering algorithm was utilized to identify OS-related subtypes. Based on genes associated with the OS pathways, we constructed an OSRRS model employi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acrolein, a highly reactive environmental toxicant widely present in urban air and tobacco smoke, has been implicated in the development of multiple malignancies. In oral tissues, chronic acrolein exposure induces oxidative stress, inflammation, and genetic mutations, all of which are closely linked to the development of oral squamous cell carcinoma (OSCC). Although accumulating evidence indicates a strong association between acrolein exposure and OSCC, its prognostic significance remains poorly understood. In this study, we analyzed transcriptome data to identify differentially expressed gene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The enzyme 2'-5'-oligoadenylate synthetase 3 (OAS3) plays a well-established role in antiviral immunity, but its involvement in cancer biology remains poorly understood. This study aimed to comprehensively investigate the expression patterns, mutation characteristics, prognostic significance, functional roles, and therapeutic potential of OAS3 across multiple cancer types.
METHODS: Utilizing multi-omics data from public cancer databases, we analyzed OAS3 expression patterns, survival correlations, immune interactions, pathway enrichment, genomic associations, mutation profiles, an
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 (ENTPD2), an enzyme involved in extracellular nucleotide metabolism and purinergic signaling, has been linked to tumor-immune interactions, although its role in colorectal cancer (CRC) remains unclear. This study examined the expression pattern and regulatory context of ENTPD2 through integrative analysis of transcriptomic, proteomic, microRNA (miRNA), and single-cell transcriptomic datasets. Transcriptomic analyses showed that ENTPD2 mRNA levels are elevated in colorectal tumors compared with normal tissues and that higher expression is associa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is a lethal digestive malignancy with poor outcomes. Although N7-Methylguanosine (m7G) modification and immune-related genes (IRGs) individually affect GC prognosis and the tumor microenvironment, their mechanistic crosstalk remains unclear. Differentially expressed genes (DEGs) in GC were identified and used alongside m7G-related genes (m7G-RGs) to perform consensus clustering, defining molecular subtypes and yielding additional DEGs. Intersection of these gene sets identified m7G-related immune genes. Prognostic genes were selected via Least Absolute Shrinkage and Selecti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cholangiocarcinoma (CHOL) is a highly aggressive malignancy with a poor prognosis. Homologous recombination deficiency (HRD) is associated with genomic instability and cancer progression, making it a potential therapeutic target. The aim of this study is to develop novel potential prognostic biomarkers and construct an HRD-based prognostic risk prediction model for CHOL to enhance clinical precision medicine.
METHODS: We analyzed HRD across cancers using multiple datasets including TCGA-CHOL, TCGA-LIHC, GDC TARGET-OS, and IMvigor210. HRD scores were calculated using data from Thor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current biomarkers and prognostic systems lack sufficient evaluation of their predictive power on HMA efficacy for myeloid neoplasms. Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) was employed to uncover the target module correlated with HMA response. Based on this module, Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) regression was applied to establish a predictive model with non-zero coefficients, termed the HMA-29 model. The magenta module was identified as the target module correlating with HMA response (R² = 0.37, p = 2 × 10⁻⁴). LASSO regression established the HMA-29 mod
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive lobular carcinoma (ILC) is the second most common histological subtype of breast cancer and displays distinct clinical and biological behavior compared to breast cancer of no special type. However, current molecular classifications largely overlook its complex spatial organization and tumor microenvironment (TME). Here, we performed spatial transcriptomics on 43 hormone receptor-positive, HER2-negative (HR+/HER2-) ILC tumors with detailed morphological annotation and long-term clinical follow-up. By integrating spatial gene expression with histology and single-cell deconvolution, we c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования