Clostridial neurotoxins (CNTs) are the deadliest toxins known and the causative agents of botulism and tetanus. Despite their structural and functional complexity, no CNT homologs are currently known outside Clostridium. Here, we report the first homologs of Clostridium CNTs within the genome of the rice fermentation organism Weissella oryzae SG25. One gene in W. oryzae S25 encodes a protein with a four-domain architecture and HExxH protease motif common to botulinum neurotoxins (BoNTs). An adjacent gene with partial similarity to CNTs is also present, and both genes seem to have been laterall
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dichloromethane (DCM) is a volatile toxic halogenated solvent mainly produced and used industrially. DCM-degrading bacteria have long been models of choice for studying bacterial dehalogenation metabolism at the physiological, biochemical and genetic levels, and have also been used in bioremediation processes. DCM-degrading strains isolated in recent years will be discussed in the context of enzymes known to catalyze dehalogenation of DCM. Insights into the modes of adaptation of bacteria to DCM gained by comparative genomic analysis, highlight the importance of horizontal gene transfer in the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Burkholderia pseudomallei is a soil-dwelling saprophyte and the cause of melioidosis. Horizontal gene transfer contributes to the genetic diversity of this pathogen and may be an important determinant of virulence potential. The genome contains genomic island (GI) regions that encode a broad array of functions. Although there is some evidence for the variable distribution of genomic islands in B. pseudomallei isolates, little is known about the extent of variation between related strains or their association with disease or environmental survival.
RESULTS: Five islands from B. pse
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The environmental co-occurrence of disinfectants and antibiotics has emerged as a typical multi-pollutant issue, with river sediments serving as critical sinks and accumulation media. However, whether their combined exposure accelerate antibiotic resistance genes (ARGs) dissemination in sediments remains unclear. Here, we systematically evaluated the effects of single and combined exposures to sodium hypochlorite and representative antibiotics on the sediment resistome and microbial communities. The results demonstrated that combined exposure generally increased the relative abundances of ARGs
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Curcumin exhibits a broad spectrum of applications spanning multiple domains, including its incorporation in dietary supplements, functional beverages, cosmetic formulations, and nutraceutical products. Nevertheless, its potential influence on the development of antibiotic resistance remains to be fully elucidated. Therefore, this study aims to investigate the effects of curcumin on the conjugative transfer of plasmids carrying antibiotic resistance genes (ARGs). Our findings indicate that curcumin significantly enhanced the transfer of RP4 plasmid, as well as clinically relevant plasmids carr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The most common mechanism of trimethoprim (TMP)-resistance is the acquisition of dihydrofolate reductase enzyme resistant to this drug. Previous molecular characterization of TMP-genes resistance in Chilean isolates of Shigella sonnei searching for dfrA1 and dfrA8, showed solely the presence of dfrA8 (formerly dhfrIIIc). However, these genetic markers were absent in S. sonnei strains further isolated during an outbreak in 2009. To identify the TMP-resistance gene in these strains, a genomic DNA library from a TMP-resistant (TMP(R)) S. sonnei representative strain for the outbreak was used to c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Vancomycin-resistant Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis (VRE) are a common cause of healthcare-associated infections. Whole genome sequencing-based typing methods yield the highest discriminatory power for outbreak surveillance in the hospital. We analysed the clonal composition of enteric VRE populations of at-risk patients over several weeks to characterise VRE population diversity and dynamics.
METHODS: Five bone marrow transplant recipients (three colonised with vanA-positive isolates, two colonised with vanB-positive isolates) contributed three rectal swabs over a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Morganella morganii is an emerging nosocomial opportunistic pathogen with increasing multidrug resistance. Antibiotic resistance, driven primarily by the horizontal transfer of resistance genes, has become a global health crisis. Integrons, mobile genetic elements, are now understood to facilitate the transfer of these genes, contributing to the rapid proliferation of resistant strains. Understanding the regulatory role of integrons in drug resistance gene expression is crucial for developing novel strategies to combat this pressing public health issue.
OBJECTIVE: To investigate t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Extracellular electron uptake (EEU) is a form of extracellular electron transfer that enables microorganisms to use solid-phase electron donors for respiration and biosynthesis, with important implications for biogeochemical cycling and biotechnology. Thioclava electrotropha is a metabolically versatile marine Alphaproteobacterium capable of autotrophic sulfur oxidation, heterotrophic growth, in addition to cathodic electron uptake despite lacking homologs to known extracellular electron transfer proteins from mineral-reducing or mineral-oxidizing microbes. Here, we explore the gen
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus anginosus is an important cause of pyogenic infections, bacteremia, and chronic maxillary sinusitis. Mobile genetic elements (MGEs) play a key role in lateral gene transfer, resulting in broad transfer of antibiotic resistance genes (ARGs). However, studies on ARG-associated MGEs in S. anginosus are still rare. To fill this gap, we used sequencing data from 11 clinical S. anginosus to characterize their mobilome diversity through comparative analysis. We found 47 well-characterized MGEs, including 23 putative integrative and conjugative elements (ICEs), 16 prophages/integrative m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterial genotoxin colibactin interferes with the eukaryotic cell cycle by causing dsDNA breaks. It has been linked to bacterially induced colorectal cancer in humans. Colibactin is encoded by a 54 kb genomic region in Enterobacteriaceae. The colibactin genes commonly co-occur with the yersiniabactin biosynthetic determinant. Investigating the prevalence and sequence diversity of the colibactin determinant and its linkage to the yersiniabactin operon in prokaryotic genomes, we discovered mainly species-specific lineages of the colibactin determinant and classified three main structural se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previously, we reported the isolation of Klebsiella pneumoniae subspecies pneumoniae strain Kp 5-1 from a southern green stink bug (Nezara viridula) that is a significant pest of numerous economically important crops. We subsequently sequenced the strains whole genome. Here, we report the presence of a functional plasmid-borne type IV secretion (TFSS) system that was identified using genomic mining of the annotated genome. Comparison of the Kp 5-1 resident 186 kb plasmid (pKp 5-1) with nine other Klebsiella with plasmids of comparable size from clinical and environmental strains revealed putat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The availability of multiple bacterial genome sequences has revealed a surprising extent of variability among strains of the same species. The human gastric pathogen Helicobacter pylori is known as one of the most genetically diverse species. We have compared the genome sequence of the duodenal ulcer strain P12 and six other H. pylori genomes to elucidate the genetic repertoire and genome evolution mechanisms of this species. In agreement with previous findings, we estimate that the core genome comprises about 1200 genes and that H. pylori possesses an open pan-genome. Strain-specific genes ar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis, the plague bacillus, has an exceptional pathogenicity but the factors responsible for its extreme virulence are still unknown. A genome comparison with its less virulent ancestor Yersinia pseudotuberculosis identified a few Y. pestis-specific regions acquired after their divergence. One of them potentially encodes a prophage (YpfPhi), similar to filamentous phages associated with virulence in other pathogens. We show here that YpfPhi forms filamentous phage particles infectious for other Y. pestis isolates. Although it was previously suggested that YpfPhi is restricted to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria gonorrhoeae is an obligate human pathogen that is the etiological agent of gonorrhea. We explored variations in the genes of a multidrug-resistant N. gonorrhoeae isolate from a Korean patient in an effort to understand the prevalence, antibiotic resistance, and importance of horizontal gene transfer within this important, naturally competent organism. Here, we report the complete annotated genome sequence of N. gonorrhoeae strain NCCP11945.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Owing to the long residence times of water, water reservoirs readily contribute to the accumulation of antibiotic resistant gene (ARG). It is of great public health significance to explore bacterial communities, antibiotic resistomes, and the potential public health risks of water reservoirs. In this study, metagenomic sequencing was used to analyze and compare the bacterial communities, ARG profiles, ARG-horizontal transfer, and ARG-carrying pathogens in the water and sediments of the Dongping Lake Reservoir in the dry and the wet seasons. Compared with that of the sediments, the results show
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growing interest in multidrug-resistant (MDR) Citrobacter species stems from their epidemiological significance and their potential to harbor antibiotic resistance genes (ARGs), with mobile genetic elements playing a central role in their dissemination. Wastewater treatment plants play an important role in the formation of such MDR strains due to the high rate of horizontal gene transfer in these environments. In this study, we isolated the MDR strain KOS1-1 of Citrobacter portucalensis from wastewater, sequenced its genome, and characterized its ARG content and plasmid profile. This strai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Food waste contains abundant resistomes, including antibiotic and heavy metal resistance genes (ARGs and MRGs), which pose risks to the environment and human health. Composting can be used for food waste treatment, but it fails to effectively eliminate these resistomes. Thus, this study investigated the performance of lime to regulate the dynamics and mobility of ARGs and MRGs in food waste composting by metagenomics. Genome-resolved analysis was further conducted to identify the ARGs and MRGs hosts and their horizontal gene transfer (HGT) events. Results showed that lime addition at 1 % (wet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs) are DNA sequences capable of editing a host genome sequence. CRISPR and its specific CRISPR-associated (Cas) protein complexes have been adapted for various applications. These include activating or inhibiting specific genetic sequences or acting as molecular scissors to cut and modify the host DNA precisely. CRISPR-Cas systems are also naturally present in many oral bacteria, where they aid in nutrition, biofilm formation, inter- and intraspecies communication (quorum sensing), horizontal gene transfer, virulence, inflammatio
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования