BACKGROUND: The development and progression of bladder cancer are closely linked to its complex tumor microenvironment. Hedyotis diffusa and Scutellaria barbata (HD-SB) are commonly used as a prominent herbal pair for treating bladder cancer. However, the pharmacological targets and molecular mechanisms by which HD-SB impacts bladder cancer require further elucidation. Additionally, it remains uncertain whether this herbal pair affects the prognosis and treatment efficacy of bladder cancer. METHODS: We employed network pharmacology to predict the targets of HD-SB and bladder cancer, identifyin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The expression of c-jun, mitogen-activated protein kinase phosphatase-1 (mkp-1), caspase-3 and glial fibrillary acidic protein (gfap) was examined at 1, 3 and 7 days after cortical cold injury in rats by in situ hybridisation and immunocytochemistry. Alterations of gene expression were related to metabolic disturbances and delayed cell death, as revealed by cerebral protein synthesis autoradiography, ATP bioluminescence, pH fluorescence and terminal transferase biotinylated dUTP nick end labelling (TUNEL). Protein synthesis autoradiographies depicted sharply demarcated cortex lesions, which we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disease-associated variants can lead to variable phenotypic outcomes in neurodevelopmental disorders, but the biological mechanisms underlying this variability remain poorly understood. Here, we develop a framework to investigate this phenomenon using the 16p12.1 deletion as a paradigm of variable expressivity. Using induced pluripotent stem cell models from affected families and CRISPR-edited lines with the 16p12.1 deletion, we find that the deletion and rare variants in the genetic background jointly influence chromatin accessibility and expression of neurodevelopmental genes. Cellular analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aortic Dissection (AD) is a cardiovascular emergency with high mortality, of which one feature is the phenotypic switch of vascular smooth muscle cells (VSMCs). Transient Receptor Potential Channel Interacting (PKD1) has been regarded as one regulator as well as one biomarker for AD. However, multiple candidate pathways were reported though which PKD1 regulates AD in previous study, a comprehensive insight is still absent. In this study, we compared the AD and normal samples in transcriptome scale, and detected 717 PKD1-related differential expressed genes, which enriched in mitogen-activated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is unclear how the 22q11.2 deletion predisposes to psychiatric disease. To study this, we generated induced pluripotent stem cells from deletion carriers and controls and utilized CRISPR/Cas9 to introduce the heterozygous deletion into a control cell line. Here, we show that upon differentiation into neural progenitor cells, the deletion acted in trans to alter the abundance of transcripts associated with risk for neurodevelopmental disorders including autism. In excitatory neurons, altered transcripts encoded presynaptic factors and were associated with genetic risk for schizophrenia, incl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Noise exposure is an important contributor to age-related hearing loss (ARHL) or presbycusis; however, the underlying mechanism remains elusive. This study re-analyzed two Mus musculus cochlear transcriptomic datasets on acoustic trauma from the Gene Expression Omnibus (GEO) database to investigate mechanisms underlying noise-accelerated cochlear aging. We defined age-related differentially expressed genes (ARDEGs) as those genes that were both differentially expressed in response to noise exposure in cochleae and belonged to the aging-related genes (ARGs) set. This analytical step yielded 14
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (HL) and sarcopenia (ARS) are prevalent geriatric syndromes sharing common risk factors. This study aimed to identify shared biomarkers and elucidate convergent pathogenic mechanisms. Transcriptomic datasets were obtained from public database. Differential expression analysis was performed, followed by enrichment analysis. Hub genes were identified via LASSO regression, SVM-RFE, and random forest algorithms. Diagnostic performance was evaluated using receiver operating characteristic curve analysis across 6 independent cohorts. Comprehensive integrative analysis reveal
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Helicobacter pylori (H. pylori) infection is a major risk factor of peptic ulcer, gastric cancer, and gastric mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma. The interplay between H. pylori and host is an important issue for elucidation of pathogenesis of H. pylori-related diseases. We aimed to examine simultaneously dynamic changes of multiple molecular pathways of infection affected by different H. pylori strains by cDNA microarrays.
METHODOLOGY: To elucidate the cross-talk between H. pylori and gastric epithelial cells, we isolated three different H. pylori strains from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of the protooncogene c-jun is induced in the uteri of ovariectomized rats in response to treatment with 17 beta-estradiol (E2-17 beta). E2 also specifically induces the uterine expression of jun-B-encoding mRNA. Medroxyprogesterone acetate and testosterone propionate treatment had no effect on the expression of c-jun- and jun-B-encoding mRNAs. Dexamethasone treatment, however, induced expression of c-jun mRNA, although less than that observed in response to E2. Cycloheximide treatment failed to block the E2-induced expression of c-jun and jun-B mRNAs, indicating that these were imme
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genes involved in different biological processes form complex interaction networks. However, only few of them have a high number of interactions with the other genes in the network and therefore they may play a major role. In previous bioinformatics and experimental studies, these genes were identified and termed as "leader genes". In the current ab initio theoretical study, genes involved in human OLP (Oral Lichen Planus) pathogenesis are identified and ranked according to their number of interactions, in order to obtain a broader view of its molecular mechanisms and to plan targe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine mastitis caused by Escherichia coli remains one of the most economically significant diseases in the dairy industry. This study performed a multi-layer transcriptome analysis of publicly available microarray data (GSE15025) derived from 15 German Holstein-Friesian heifers experimentally inoculated with E. coli, yielding 30 microarray samples across three GEO datasets (GSE15019, GSE15020, GSE15022) representing infected quarters at 6 h and 24 h post-inoculation and neighboring uninfected quarters at 24 h. Using an analytical framework combining WGCNA, differential gene expression profili
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: We aimed to explore the mechanisms and pathways of exercise-based interventions in the treatment of polycystic ovarian syndrome (PCOS).
METHODS: In this literature review, studies related to exercise therapy for PCOS that were published in the past 20 years were searched, potentially effective active ingredients were screened, and gene prediction of active ingredients and diseases was conducted using the compound and GeneCards databases, respectively, to identify potential targets of exercised-related bioactive molecules in PCOS. Finally, hub genes and signaling pathwa
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seasonal and pandemic influenza infections are serious threats to public health and the global economy. Since antigenic drift reduces the effectiveness of conventional therapies against the virus, herbal medicine has been proposed as an alternative. Fritillaria thunbergii (FT) have been traditionally used to treat airway inflammatory diseases such as coughs, bronchitis, pneumonia, and fever-based illnesses. Herein, we used a network pharmacology-based strategy to predict potential compounds from Fritillaria thunbergii (FT), target genes, and cellular pathways to better combat influenza and inf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The pathogenesis of thyroid-associated orbitopathy (TAO) remains unclear. The aim of this study is to elucidate the gene expression profile of orbital fat from patients with active, but untreated, TAO.
METHODS: A case-control gene expression study was conducted using test samples of orbital fat from TAO patients and control orbital fat specimens; apart from drugs to control thyrotoxicosis, the TAO patients had received no treatment for orbital disease. cDNA expression analysis was performed using the Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 platform and validated using quantitativ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Medication-related osteonecrosis of the jaw (MRONJ) is a severe complication associated with antiresorptive or antiangiogenic therapy, yet its molecular mechanisms remain poorly understood. This study aimed to identify potential core genes involved in MRONJ pathogenesis through integrative bioinformatics analysis.
METHODS: GSE7116 dataset (PBMC samples from 11 MRONJ and 10 non-MRONJ multiple myeloma patients on bisphosphonates) was analyzed. DEGs were identified using GEO2R. Functional enrichment, PPI network, hub gene identification, ROC-based diagnostic evaluation, and independe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BLCA) exhibits considerable heterogeneity, and research into its tumor microenvironment and prognostic biomarkers remains insufficient. This study aims to identify key prognostic genes and immune microenvironment factors to enhance clinical assessment. Primary tumor (PT) and lymph node metastasis (LNM) samples were obtained from patients with BLCA, and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was conducted to analyze cellular composition and functional variations. Prognostic genes were identified based on integrated bulk transcriptomic data, leading to the development of a risk m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Danshen Decoction comprises Salvia miltiorrhiza, Santalum album, and Amomum villosum. It can promote blood circulation and remove blood stasis, and is commonly used in the treatment of gastric and duodenal ulcers, coronary heart disease, angina pectoris, etc. This research is based on network pharmacology and is experimentally verified to explore the potential mechanism of Danshen Decoction in the treatment of ischemic cardiomyopathy (ICM).
METHODS: The effective components and targets of Danshen Decoction were firstly extracted from Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacolo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex diseases are associated with the effects of multiple genes, proteins, and biological pathways. In this context, the tools of Network Medicine are compatible as a platform to systematically explore not only the molecular complexity of a specific disease but may also lead to the identification of disease modules and pathways. Such an approach enables us to gain a better understanding of how environmental chemical exposures affect the function of human cells, providing better perceptions about the mechanisms involved and helping to monitor/prevent exposure and disease to chemicals such as
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postmenopausal osteoporosis (PMO) is an aging-associated disease that manifests as degradation of bone tissue microstructure leading to decreased bone mass and increased bone fragility. Differentiation of peripheral blood mononuclear cells into osteoclasts is an important process in the development of PMO and identification of key genes that drive differentiation is essential to reveal the mechanism of PMO. The present study combined bioinformatics analysis of a Gene Expression Omnibus dataset of PMO and drug (bisphosphonate) target prediction using the STITCH database to identify hub genes in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Severe damage to one side of the brain often leads to adverse consequences and can also cause widespread changes throughout the brain, especially in the contralateral area. Studying molecular changes in the contralateral cerebral hemisphere, especially with regard to genetic regulation, can help discover potential treatment strategies to promote recovery after severe brain trauma on one side. Methods: In our study, the right motor cortex was surgically removed to simulate severe unilateral brain injury, and changes in glial cells and synaptic structure in the contralateral cortex w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.