Triple negative breast cancer (TNBC) is a highly aggressive subtype of breast cancer with the worst prognosis. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 (HNRNPA2B1), a member of the RNA-binding protein (RBP) hnRNPs family, is aberrantly expressed in various human cancers, serving as a marker of poor prognosis and acting as an oncogene. However, its expression, biological function, and molecular mechanism in TNBC remain unclear. In this study, we examined the expression of HNRNPA2B1 in one normal mammary epithelial cell line (MCF10A) and four TNBC cell lines (HS 578 T, BT-20, MDA-MB-468, an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs) bind to RNA, regulating gene expression and splicing. HnRNP L contributes to muscle development and the pathogenesis of myotonic dystrophy. We hypothesized that hnRNP L regulates muscle expression and splicing patterns. Using nanopore long-read transcriptome sequencing and qPCR analyses, we investigated the impact of Hnrnpl knockdown on myoblasts and knockdown of the orthologous gene smooth in Drosophila. Notch signaling genes and muscle-related genes were dysregulated in both models. Several genes had altered splicing patterns, including Lamp2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sperm motility and morphology are indispensable for sperm-egg interaction and successful fertilization. However, the RNA splicing mechanisms in an m6A-dependent manner regulating spermiogenesis-related genes remain poorly defined, and targeted therapy strategies to restore impaired sperm motility and morphology are lacking. In this study, we identify heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R (hnRNPR) as a critical m6A-dependent splicing mediator. Pathogenic mutations in HNRNPR cause sperm motility decline, morphological abnormality, and male infertility in both humans and mice. Mechanistically
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian heterogeneous nuclear ribonucleoproteins M (hnRNPM) is a critical splicing regulatory protein that has been reported to negatively regulate the RLR signaling pathway by impairing the binding of RIG-I and MDA5 to viral RNA. To explore the role of hnRNPM in the antiviral innate immune response in teleost fish, the hnRNPM homologue of triploid fish (3nhnRNPM) has been cloned and identified in this paper. The CDS of 3nhnRNPM gene is composed of 2016 nucleotides and encodes 671 amino acids. 3nhnRNPM migrated around 71 kDa in immunoblotting assay and was mainly detected in the nucleus in n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs) play important roles in the life cycle of influenza A virus (IAV). Our previous mass spectrometry analysis identified cellular hnRNP D as a novel interaction partner of the IAV polymerase basic 2 (PB2) protein. However, the functional implications of hnRNP D in IAV replication and the underlying mechanisms remained unknown. In this study, we confirmed that hnRNP D directly interacts with the PB2 protein of the A/Puerto Rico/8/1934 (PR8, H1N1) strain, while also binding to other proteins within viral ribonucleoprotein complexes (vRNP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycosis fungoides (MF) is the most common cutaneous T-cell lymphoma (CTCL). Causative genetic alterations in MF are unknown. The low recurrence of pathogenic small-scale mutations (ie, nucleotide substitutions, indels) in the disease, calls for the study of additional aspects of MF genetics. Here, we investigated structural genomic alterations in tumor-stage MF by integrating whole-genome sequencing and RNA-sequencing. Multiple genes with roles in cell physiology (n = 113) and metabolism (n = 92) were found to be impacted by genomic rearrangements, including 47 genes currently implicated in ca
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA), a leading genetic disease of children and infants, is caused by mutations or deletions of Survival Motor Neuron 1 (SMN1) gene. SMN2, a nearly identical copy of SMN1, fails to compensate for the loss of SMN1 due to skipping of exon 7. SMN2 predominantly produces SMNΔ7, an unstable protein. Here we report exon 6B, a novel exon, generated by exonization of an intronic Alu-like sequence of SMN. We validate the expression of exon 6B-containing transcripts SMN6B and SMN6BΔ7 in human tissues and cell lines. We confirm generation of SMN6B transcripts from both SMN1 and S
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA hydroxymethylation landscape is profoundly disrupted in gliomas, especially glioblastoma, marked by global loss of 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) and impaired Ten-eleven translocation (TET) enzyme activity. This review synthesizes evidence that TET family expression and subcellular localization are systematically altered in glioma: TET1 undergoes nuclear exclusion, while TET2 and TET3 show reduced nuclear abundance, directly contributing to 5hmC depletion. The extent of 5hmC loss correlates with tumor grade yet exhibits subtype heterogeneity, including a unique "5hmC-high" glioblastoma
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-associated fibroblasts (CAFs) are critical components of the tumor microenvironment (TME) and have important roles in carcinogenesis and metastasis by facilitating cancer cell proliferation, angiogenesis, extracellular matrix (ECM) remodeling, and drug resistance. The purpose of this study is to extensively describe CAFs in esophageal cancer (ESCA) and develop a CAF-based prognostic risk score to predict clinical outcomes in patients with ESCA. METHODS: Data for single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) were collected from the GEO database. The GEO and TCGA databases provided t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proximal spinal muscular atrophy (SMA) is a common motor neuron disease caused by homozygous loss of the survival motor neuron gene (SMN1). SMN2, a nearly identical copy of the gene and present in all SMA patients, fails to provide protection from SMA, due to the disruption of an exonic splicing enhancer (ESE) by a single translationally silent nucleotide exchange, which causes alternative splicing of SMN2 exon 7. Identification of splicing factors that stimulate exon 7 inclusion and thereby produce sufficient amounts of full-length transcripts from the SMN2 gene is of great importance for the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma brain metastasis (MBM) is frequent and has a very poor prognosis with no current predictive factors or therapeutic molecular targets. Our study unravels the molecular alterations of cell-surface glycoprotein CD44 variants during melanoma progression to MBM. High expression of CD44 splicing variant 6 (CD44v6) in primary melanoma (PRM) and regional lymph node metastases from AJCC Stage IIIC patients significantly predicts MBM development. The expression of CD44v6 also enhances the migration of MBM cells by hyaluronic acid and hepatocyte growth factor exposure. Additionally, CD44v6-posit
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sinonasal adenosquamous carcinoma is rare, and there are almost no studies detailing morphology or characterizing their genetic driver events. Further, many authors have termed sinonasal tumors with combined squamous carcinoma and glands as mucoepidermoid carcinoma but none have analyzed for the presence of MAML2 rearrangement.
METHODS: Cases from 2014 to 2020 were collected and diagnosed using World Health Organization criteria. They were tested for p16 expression by immunohistochemistry (70% cut-off), DEK::AFF2 fusion by fluorescence in situ hybridization (FISH) and AFF2 immunoh
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vestibular migraine (VM) is a disorder characterized by recurrent episodes of dizziness or vertigo and is often accompanied by headache. The mechanisms underlying vestibular dysfunction and pain in VM remain unclear.
METHODS: Chronic migraine (CM) and VM models were induced by NTG and kainic acid, respectively. Behavioral assessments were conducted to evaluate vestibular dysfunction and pain in the VM and CM models. Transmission electron microscopy (TEM) was used to examine peripheral receptor impairment. Immunofluorescence, including staining for Cellular Proto-oncogene (c-Fos),
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a rapidly progressive neurodegenerative disorder characterized by motor neuron degeneration leading to early mortality. Despite advances in understanding genetic and molecular contributors, effective disease-modifying therapies for sporadic ALS are of limited utility. The identification of the accumulation of TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) in 97% of total ALS cases represents a critical pathogenic hallmark. This review examines key biological mechanisms underlying TDP-43 pathology, emerging therapeutic strategies, and evolving approaches to clinical
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As tyrosine kinase inhibitors (TKIs) fail to induce long-term response in blast crisis chronic myelogenous leukemia (CML-BC) and Philadelphia chromosome-positive (Ph(+)) acute lymphoblastic leukemia (ALL), novel therapies targeting leukemia-dysregulated pathways are necessary. Exportin-1 (XPO1), also known as chromosome maintenance protein 1, regulates cell growth and differentiation by controlling the nucleocytoplasmic trafficking of proteins and RNAs, some of which are aberrantly modulated in BCR-ABL1(+) leukemias. Using CD34(+) progenitors from CML, B-ALL, and healthy individuals, we found
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasin (S100A7), a member of the S100 family of calcium-binding proteins, is highly expressed in high-grade ductal carcinoma in situ (DCIS) and in the benign hyperproliferative skin disorder psoriasis. The gene that encodes psoriasin and many other S100 genes are located within a gene cluster on chromosome region 1q21, known as the epidermal differentiation complex. This cluster contains genes for several differentiation markers that play important roles in the terminal differentiation of the epidermis. The purpose of the present study was to evaluate the role of psoriasin in the differenti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has made it possible to dissect cellular heterogeneity at single-cell resolution, and clustering is a key step in this analysis. Because scRNA-seq data are high-dimensional, sparse, and corrupted by dropout effects, clustering them accurately remains challenging. This paper proposes PDSFLRR, a clustering method built upon low-rank representation (LRR). To overcome the limitation of classical LRR models, which fix the dictionary to the raw data matrix, PDSFLRR learns the dictionary adaptively through a projection matrix, imposes an orthonormality constrain
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-small cell lung cancer (NSCLC) remains a leading cause of cancer mortality, with its molecular heterogeneity posing a therapeutic challenge. This study investigates the pharmacologically targetable METTL14-mediated pathway in modulating cancer stemness and response to combined radiotherapy and PD-1 blockade. We performed single-cell RNA sequencing and m6A methylation sequencing on matched untreated and radiotherapy/anti-PD-1-treated NSCLC samples. GANALYSIS: of 21,019 cells revealed that combined treatment reduced cancer stem cells (CSCs) and exhausted CD8+ T cells, while increasing naïve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peanut is a major global economic crop with its seeds rich in oil and unsaturated fatty acids. However, the genes expression network of seeds development on single-cell resolution is unclear, here we conducted single-nucleus RNA-seq (snRNA-seq) on peanut seeds, classifying 35,082 single-cells into 13 clusters and identifying three major cell-types (coat, cotyledon, embryonic axis). Combining pseudo-time analysis and bulk transcriptome identified the coat serving as the starting point of seed cell differentiation and elucidated the cotyledon and embryonic axis development heterogeneity with dif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic active Epstein-Barr virus (CAEBV) infection is characterized by chronic or recurrent infectious mononucleosis-like symptoms and the prognosis of CAEBV infection is quite poor. The incidence of myocarditis as a complication of EBV infection is not so high and it is unusual that heart failure appears as the initial symptom. However, it is very important to detect and treat chronic active myocarditis in the early phase of CAEBV infection because chronic active myocarditis disorganizes and decreases cardiomyocytes, resulting in the progression to heart failure. We report a case of a 45-yea
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования