Childhood allergic diseases, including asthma, rhinitis and eczema, are prevalent conditions that share strong genetic and environmental components. Diagnosis relies on clinical history and measurements of allergen-specific IgE. We hypothesize that a multi-omics model could accurately diagnose childhood allergic disease. We show that nasal DNA methylation has the strongest predictive power to diagnose childhood allergy, surpassing blood DNA methylation, genetic risk scores, and environmental factors. DNA methylation at only three nasal CpG sites classifies allergic disease in Dutch children ag
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic changes induced by obesity can lead to male infertility phenotype. As for the relationship between obesity and male infertility, early studies mostly focused on the endocrine aspect. Recent studies have found that obesity can cause epigenetic changes, such as DNA methylation, residual histone modification, small RNA, etc, affecting sperm maturation and development. DNA methylation is a regulatory marker on cytosine residue of cytosine-phosphate-guanine dinucleotide. Obesity leads to abnormal DNA methylation, changes mRNA expression abundance, affects imprinted gene expression induse
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate adenocarcinoma (PRAD) is a common malignancy with high incidence in men. The role of v-set and transmembrane domain-con … rough m6A methylation, thereby inhibiting ferroptosis. This study establishes a direct link between RNA methylation and ferroptosis in PRAD, revealing the METTL3/VSTM2L axis as a novel regulatory pathway and a potential therapeutic target.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis (OP) is a metabolic disorder characterized by reduced bone mineral density and degeneration of bone tissue microarchitecture. Osteogenic differentiation plays a pivotal role in OP pathogenesis by facilitating new bone formation, preserving bone strength and density, and counteracting bone resorption. RNA epigenetic modifications have been increasingly implicated in multiple aspects of bone metabolism. Our previous studies revealed the regulatory role of RAD51 in OP progression. This study aimed to investigate whether RAD51 undergoes RNA methylation modification to participate in O…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Invasive malignant pleomorphic adenoma (IMPA) is a highly invasive parotid gland tumor and lacks effective therapy. N6-Methyladenosine (m6A) is the most prevalent post-transcriptional modification of mRNAs in eukaryotes and plays an important role in the pathogenesis of multiple tumors. However, the significance of m6A-modified mRNAs in IMPA has not been elucidated to date. Hence, in this study, we attempted to profile the effect of IMPA in terms of m6A methylation in mRNA.
METHODS: Methylated RNA immunoprecipitation with next-generation sequencing (MeRIP-seq) and RNA sequencing (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Dilated cardiomyopathy (DCM)-associated heart failure (HF) presents a significant clinical challenge, underlying epigenetic mechanisms remaining poorly understood. This study aims to investigate the interplay between DNA methylation and gene expression in the hearts of patients with DCM-associated HF (DCM-HF).
METHODS: Atrial tissues were collected from five healthy donors and five heart transplant recipients suffering from heart failure due to DCM. We conducted RNA-sequencing (RNA-seq) to analyze mRNA expression profiles and performed whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) to ev
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent spontaneous abortion (RSA) is characterized by two or more consecutive pregnancy losses in the first trimester of pregnancy, exper … t of many pathophysiological phenomena. In this study, we first confirmed that high levels of m6 A mRNA methylation in decidual tissues are associated with RSA. Then, we used m6 A-modified RNA immunoprecipitation sequence (m6 A-seq) and RNA sequence (RNA-seq) to identify the differentially expressed m6 A methylation in decidual tissues from RSA patients and ident …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to synchronously determine epitranscriptome-wide RNA N6-methyladenosine (m6A) modifications and mRNA expression profile in high grade serous ovarian cancer (HGSOC). The methylated RNA immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq) was used to comprehensively examine the m6A modification profile and the RNA-sequencing (RNA-seq) was performed to analyze the mRNA expression profile in HGSOC and normal fallopian tube (FT) tissues. Go and KEGG analyses were carried out in the enrichment of those differentially methylated and expressed genes. MeRIP-seq data showed 53,794 m6A methylated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pituitary adenomas (PAs) are benign tumors in the pituitary gland. However, 30-40% of these tumors are invasive, complicating diagnosis and treatment. Invasive pituitary adenomas (IPAs) often respond poorly to conventional therapies, emphasizing the need for better diagnostic and therapeutic strategies. Understanding DNA methylation patterns in IPAs may reveal new biomarkers and therapeutic targets, leading to more effective management of this challenging disease.
METHODS: Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) and RNA sequencing (RNA-seq) were performed on 129 samples
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) is the most abundant messenger RNA (mRNA) modification and plays crucial roles in diverse physiological processes. Using a massively parallel assay for m6A (MPm6A), we discover that m6A specificity is globally regulated by suppressors that prevent m6A deposition in unmethylated transcriptome regions. We identify exon junction complexes (EJCs) as m6A suppressors that protect exon junction-proximal RNA within coding sequences from methylation and regulate mRNA stability through m6A suppression. EJC suppression of m6A underlies multiple global characteristics of mRNA m6A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic regulation of placental development and pregnancy-related disease processes has recently been a hot research topic. Implantation … fications are known, such as DNA methylation, histone modifications, non-coding RNA regulation, and RNA methylation. Recently, there has been increasing evidence that epigenetic modifications are critical for the immune microenvironment at the maternal-fetal interface. In this review, we highlight recent advances in the role of epigenetics in the immune microenvi …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The soleus muscle in humans is responsible for maintaining an upright posture and participating in walking and running. Under muscle disuse, it undergoes molecular signaling changes that result in altered force and work capacity. The triggering mechanisms and pathways of these changes are not yet fully understood. In this article, we aimed to detect the molecular pathways that are involved in the unloading-induced alterations in the human soleus muscle under 6-days of dry immersion. A 6-day dry immersion led to the downregulation of mitochondrial biogenesis and dynamics markers, upregulation o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All eukaryotes possess three DNA-dependent RNA polymerases, Pols I-III, while land plants possess two additional polymerases, Pol IV and Pol V. Derived through duplication of Pol II subunits, Pol IV produces 24-nt short interfering RNAs that interact with Pol V transcripts to target de novo DNA methylation and silence transcription of transposons. Members of the grass family encode additional duplicated subunits of Pol IV and V, raising questions regarding the function of each paralog. In this study, we identify a null allele of the putative Pol IV second subunit, NRPD2, and demonstrate that N
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome neurodevelopmental disorder is caused by mutations in the gene encoding the epigenetic regulator MECP2. While the MECP2 methyl-CpG binding domain (MBD) is well-characterized, the function of the adjacent intervening domain (ID) remains largely understudied. The ID has been described as a distinct RNA-binding region, yet evidence also suggests RNA competitively displaces MECP2 from DNA. Here, we address these conflicting findings by demonstrating the MBD and ID do not function in isolation but as a synergistic functional unit, establishing a new model for MECP2 function. We show t
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cisplatin resistance severely limits the efficacy of chemotherapy for cervical cancer (CC), and its molecular mechanisms remain incompletely understood. While epigenetic alterations such as DNA methylation are recognized as important contributors, the upstream regulatory networks, particularly the role of long non-coding RNAs (lncRNAs), are still unclear. This study aimed to explore novel mechanisms influencing cisplatin resistance in cervical cancer. Cisplatin-resistant CC cells (HeLa and SiHa) were established. A comprehensive approach employing mRNA and lncRNA microarrays, RT-qPCR, methylat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Corneal diseases are among the primary causes of blindness and vision loss worldwide. However, the pathogenesis of corneal diseases remains elusive, and diagnostic and therapeutic tools are limited. Thus, identifying new targets for the diagnosis and treatment of corneal diseases has gained great interest. Methylation, a type of epigenetic modification, modulates various cellular processes at both nucleic acid and protein levels. Growing evidence shows that methylation is a key regulator in the pathogenesis of corneal diseases, including inflammation, fibrosis, and neovascularization, making i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: H19 is the first long noncoding RNA (lncRNA) found to be associated with gene imprinting. It is highly expressed in the embryonic stage and may have important regulatory effects on human embryonic development. We investigated the differences between the levels of H19 promoter DNA methylation in the chorionic villi of patients who experienced spontaneous abortion (SA) following in vitro fertilization embryo transfer (IVF-ET) and those of patients with a normal early pregnancy (NEP). We also analyzed the associated DNA methyltransferase (DNMT) activity.
METHODS: Chorionic villus tis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Iron deficiency is extremely common after bariatric surgery. HEPCIDIN, encoded by Hamp, is a hormone that negatively regulates iron homeostasis.
OBJECTIVES: We aimed to investigate the alteration of Hamp expression and related regulatory factors to explore the probable role of DNA methylation in modulating Hamp expression in the context of iron deficiency after bariatric surgery.
SETTING: Laboratories of Diabetes Institute.
METHODS: RNA-seq was performed using rat liver tissue after either Roux-en-Y gastric bypass (RYGB) or sleeve gastrectomy surgery to identify differentially e
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cranial radiotherapy improves survival of the most common childhood cancers, including brain tumors and leukemia. Unfortunately, long-term survivors are faced with consequences of secondary neoplasia, including radiation-induced meningiomas (RIMs). We characterized 31 RIMs with exome/NF2 intronic sequencing, RNA sequencing and methylation profiling, and found NF2 gene rearrangements in 12/31 of RIMs, an observation previously unreported in sporadic meningioma (SM). Additionally, known recurrent mutations characteristic of SM, including AKT1, KLF4, TRAF7 and SMO, were not observed in RIMs. Comb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: During carcinogenesis, cells have an increased ability to survive in the face of death-inducing mechanisms (apoptosis). Subversion of apoptosis is regarded as one of the primary factors helping the evolution of tumor cells. This study described the gene expression and DNA methylation of selected genes associated with apoptosis in prostate cancer (PCa) and benign prostatic hyperplasia (BPH).
METHODS: The study involved a total of 195 participants: 65 with prostate cancer, 65 with BPH, and 65 apparently healthy controls. Circulating DNA/RNA was extracted using Qiagen kits. RNA was r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования