Pancreatic cancer (PC) represents a highly aggressive malignancy characterized by a 5 year survival rate of less than 12%. Recent investigations suggest that mitophagy may constitute a potential therapeutic target for PC. This study aims to elucidate the molecular mechanisms underlying circ-0030167's regulation of PC, extending our prior investigations. mRNA sequencing analysis demonstrated significant enrichment of mitophagy-related signaling pathways in PC cells overexpressing circ-0030167. Integrated analysis utilizing RNA-binding protein (RBP) databases identified IGF2BP1 as a binding part
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) represents a reversible and ubiquitous posttranscriptional modification of mRNA. It plays a crucial role in immune cell development and is implicated in a range of pathological conditions. Nevertheless, the precise role of m6A in LPS-induced macrophage inflammatory responses remains elusive. In the present study, we investigated the role of the m6A writer Zc3h13 in LPS-induced liver inflammation. Macrophages, which are vital components of the immune system, play critical roles in liver injury. Our results demonstrate that Zc3h13 is highly expressed in liver macrophages
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SNHG5 serves as a key factor in regulating various cancers, and Dexmedetomidine (Dex) protects against myocardial ischemia/reperfusion (I/R) injury. However, the role of SNHG5 in Dex-mediated protection during myocardial I/R remains uninvestigated. In this study, models of rat myocardial I/R injury and hypoxia/reoxygenation (H/R)-induced cardiomyocyte injury were generated. The infarct size, histological changes and apoptosis in heart tissues were evaluated by TTC, HE, and TUNEL staining. CCK-8, flow cytometry and immunofluorescence were employed to assess cell viability, apoptosis and autopha
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: RNA-seq is a well-established method for studying the transcriptome. Popular methods for library preparation in RNA-seq such as Illumina TruSeq® RNA v2 kit use a poly-A pulldown strategy. Such methods can cause loss of coverage at the 5' end of genes, impacting the ability to detect fusions when used on degraded samples. The goal of this study was to quantify the effects RNA degradation has on fusion detection when using poly-A selected mRNA and to identify the variables involved in this process.
RESULTS: Using both artificially and naturally degraded samples, we found that there
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The relative levels, rates of synthesis and stabilities of the abundant Epstein-Barr virus (EBV)-encoded small RNAs, EBER-1 and EBER-2, were examined in Daudi Burkitt's lymphoma cells. Although both RNAs are transcribed at approximately equal rates, the steady-state level of EBER-1 is at least 10-fold greater than that of EBER-2. This is shown to be due to a much faster rate of turnover of EBER-2. In the presence of actinomycin D, the half-lives of EBER-1 and EBER-2 are 8 to 9 h and 0.75 h, respectively. Following treatment of the cells with human interferon (IFN) alpha the transcription of bo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is the most common adult-onset motor neuron disease and is characterized by the degeneration of upper and lower motor neurons. It has become increasingly clear that RNA dysregulation is a key contributor to ALS pathogenesis. The major ALS genes SOD1, TARDBP, FUS, and C9orf72 are involved in aspects of RNA metabolism processes such as mRNA transcription, alternative splicing, RNA transport, mRNA stabilization, and miRNA biogenesis. In this review, we highlight the current understanding of RNA dysregulation in ALS pathogenesis involving these major ALS genes a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HIV-1 trans-activation response (TAR) RNA is a key regulatory element necessary for viral replication, presenting a high-value target for anti-HIV therapeutics. Recent advances in RNA-targeted drug discovery have leveraged large, diverse compound libraries, such as the Enamine collection, using structure-based virtual screening to uncover novel modulators of RNA structure and function. In this study, we employed an integrative in silico approach combining high-throughput virtual screening of the Enamine library against the central bulge region of HIV-1 TAR RNA with molecular dynamics (MD)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous RNA immunoprecipitation followed by proteomic approaches successfully demonstrated that Embryonic Lethal, Abnormal Vision, Drosophila-Like 1 (ELAVL1) interacts with hepatitis B virus (HBV)-derived RNAs. Although ELAVL family proteins stabilize AU-rich element (ARE)-containing mRNAs, their role in HBV transcription remains unclear. This study conducted loss-of-function assays of ELAVL1 for inducible HBV-replicating HepAD38 cells and HBx-overexpressed HepG2 cells. In addition, clinicopathological analyses in primary hepatocellular carcinoma (HCC) surgical samples were also conducted. Le
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have investigated the effect of high hydrostatic pressure on the stability of RNA polymerase molecules during transcription. RNA polymerase molecules participating in stalled or active ternary transcribing complexes do not dissociate from the template DNA and nascent RNA at pressures up to 180 MPa. A lower limit for the free energy of stabilization of an elongating ternary complex relative to the quaternary structure of the free RNAP molecules is estimated to be 20 kcal/mol. The rate of elongation decreases at high pressure; transcription completely halts at sufficiently high pressure. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Genome-wide association studies have uncovered single-nucleotide polymorphisms (SNPs) linked to radiation therapy (RT)-induced toxicities in patients with prostate cancer. SNP rs17599026, located in intron 21 of the KDM3B gene, has been associated with late-onset urinary toxicity, with an increased frequency of urination observed 2 years post-RT compared with pretreatment conditions. This study aimed to explore the underlying mechanisms driving this association.
METHODS AND MATERIALS: A clustered regularly interspaced short palindromic repeats-dead Cas9 prime editing system was used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Studies describing the performance characteristics of the cobas®6800 system for SARS-CoV-2 detection in deep respiratory speci … CoV-2 assay on the cobas®6800 System and compared to a lab developed assay. Additonally, SARS-CoV-2 RNA stability was assessed after one freeze-thaw cycle with or without lysis buffer.
RESULTS: In total, 221 (58.3 %) oro- and nasopharyngeal swabs, 131 (34.6 %) deep respiratory specimens, and n = 25 (6.6 %) swabs of unknown origin were included to study clinica …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Characterization of ternary complexes containing an Escherichia coli lac promoter DNA fragment, CAP protein and RNA polymerase, separated on non-denaturing polyacrylamide gels and footprinted in the gel slice, reveals a striking stabilization of CAP against dissociation in the open complex, compared to the CAP-DNA complex lacking RNA polymerase. The stabilization is lost when half a helical turn of DNA is inserted between CAP and polymerase sites, but is partially restored with an 11 base-pair insert; stimulation of transcription parallels the stabilization effect. This behavior suggests a dir
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maternal protein homeostasis and timely degradation of maternal mRNAs are essential for meiotic cell-cycle progression and subsequent embryonic development, but the mechanisms of maternal protein degradation are poorly understood. Here, we show that KLHL8, a substrate adaptor of Cullin-RING E3 ubiquitin ligases, is highly expressed in mouse oocytes and co-localizes with mitochondria. Oocyte-specific deletion of Klhl8 causes oocyte maturation defects and female infertility. ZAR1, an RNA binding protein that is required for mitochondria-associated ribonucleoprotein domain (MARDO) dissolution, is
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragile X Syndrome, as well as some manifestations of autism spectrum disorder, results from improper RNA regulation due to a deficiency of fragile X mental retardation protein (FMRP). FMRP and its autosomal paralogs, fragile X related proteins 1 & 2 (FXR1P/2P), have been implicated in many aspects of RNA regulation, from protein synthesis to mRNA stability and decay. The literature on the fragile X related proteins' (FXPs) role in mRNA regulation and their potential mRNA targets is vast. Therefore, we developed an approach to investigate the function of FXPs in translational control using thr…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-binding proteins (RBPs) are essential regulators of RNA metabolism and gene expression, influencing processes such as splicing, stability, localization, and translation. Despite their critical roles in health and disease, including cancer, identifying RNA-protein interactions remains challenging due to technical limitations and biases of existing methods. Here we review and compare experimental techniques-including in vitro affinity purification, in vivo crosslinking, and proximity labeling-and computational prediction tools for RBP identification. We assess their strengths, limitations, a
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In preeclampsia (PE), preexistent maternal endothelial dysfunction leads to impaired placentation and vascular maladaptation. Long noncoding RNAs (lncRNAs) have been shown to participate in the placentation process. LncRNA fms-related tyrosine kinase 1 pseudogene 1 (FLT1P1) was previously reported to be upregulated in PE. In this study, we verified the effect of FLT1P1 and its cognate gene FLT1 on trophoblast cell proliferation and angiogenesis by using Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay, tube formation assay, and western blot analysis. Their binding to RNA binding protein dyskeratosis congenit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-based therapeutics have revolutionized precision medicine due to their unprecedented potency, specificity, and adaptability. However, the inherent limited stability of RNA, including mRNA used in vaccines, is a major obstacle to the full realization of their potential. This instability, coupled with the centralized nature of vaccine production, currently limits the generation of RNA therapeutics at the point of care, which will otherwise fully harness the potential of these agents. Here, a microfluidic platform is presented for on-demand, personalized synthesis of modified mRNA stabilized
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replicating RNA, including self-amplifying RNA (saRNA) and trans-amplifying RNA (taRNA), holds great potential for advancing the next generation of RNA-based vaccines. Unlike in vitro transcribed mRNA found in most current RNA vaccines, saRNA or taRNA can be massively replicated within cells in the presence of RNA-amplifying enzymes known as replicases. We recently demonstrated that this property could enhance immune responses with minimal injected RNA amounts. In saRNA-based vaccines, replicase and antigens are encoded on the same mRNA molecule, resulting in very long RNA sequences, which pos
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activated rheumatoid arthritis synovial fibroblasts (RASFs) exhibit tumor-like properties, which play a significant role in joint degradation in RA. The prevalence of N6-methyladenosine (m6A) as a modification in mRNA is involved in diverse biological processes; however, its specific implications in the pathogenesis of RA have yet to be fully elucidated. This study seeks to explore the impact and underlying mechanisms of m6A methylation on the proliferation, migration, and invasion of RASFs. Our study revealed an upregulation of METTL3 expression in synovium and SFs from patients with RA. More
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования