The Dystrophin Glycoprotein Complex (DGC) is a large multi-protein complex that links cytoskeleton actin to the extracellular matrix. This complex is critical in maintaining the structural integrity of muscle fibers and the stability of the neuromuscular synapse. The DGC consists of dystrophin and its utrophin homolog, as well as dystroglycans, sarcoglycans, sarcospan, syntrophins, and dystrobrevins. Deficiencies in DGC proteins result in several forms of muscular dystrophy with varying symptoms and degrees of severity in addition to structurally abnormal neuromuscular junctions (NMJs). This m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein-protein interactions are at the basis of many cellular processes, and they are also involved in the interaction between pathogens and their host(s). Many intracellular pathogenic bacteria translocate proteins called effectors into the cytoplasm of the infected host cell, and these effectors can interact with one or several host protein(s). An effector named RicA was recently reported in Brucella abortus to specifically interact with human Rab2 and to affect intracellular trafficking of this pathogen.
RESULTS: In order to identify regions of the RicA protein involved in the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Since the publication of the first draft of the human genome in 2000, bioinformatic data have been accumulating at an overwhelming pace. Currently, more than 3 million sequences and 35 thousand structures of proteins and nucleic acids are available in public databases. Finding correlations in and between these data to answer critical research questions is extremely challenging. This problem needs to be approached from several directions: information science to organize and search the data; information visualization to assist in recognizing correlations; mathematics to formulate sta
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We have previously identified a locus on human chromosome 20q13.1, encompassing related genes of postulated WFDC-type protease inhibitors and semen coagulum proteins. Three of the genes with WFDC motif also coded for the Kunitz-type protease inhibitor motif. In this report, we have reinvestigated the locus for homologous genes encoding Kunitz motif only. The identified genes have been analyzed with respect to structure, expression and function.
RESULTS: We identified three novel genes; SPINT3, SPINT4 and SPINT5, and the structure of their transcripts were determined by sequencing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence similarity underlies most protein annotation, yet many functions remain hidden beyond detectable homology1-3. By mining millions of AlphaFold2 models4,5, we identify two human families of 'superdark' seven-transmembrane proteins-TM184 and PRRT-with structural homology to G-protein-coupled receptors (GPCRs). These proteins exhibit hallmark GPCR activities, including β-arrestin recruitment and GPCR kinase (GRK)-dependent phosphorylation. Here we focus on TM184C-the most broadly expressed and evolutionarily conserved superdark GPCR-like protein, which localizes to highly dynamic intracel
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CagY is the largest and most complex protein from Helicobacter pylori's (Hp) type IV secretion system (T4SS), playing a critical role in the modulation of gastric inflammation and risk for gastric cancer. CagY spans from the inner to the outer membrane, forming a channel through which Hp molecules are injected into human gastric cells. Yet, a tridimensional structure has been reported for only short segments of the protein. This intricate protein was modeled using different approaches, including homology modeling, ab initio, and deep learning techniques. The challengingly long middle repeat re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genomic RNA of rubella virus contains two long open reading frames (ORF), a 5'-proximal ORF that codes for the nonstructural proteins and a 3'-proximal ORF that encodes the structural proteins. The cDNA encoding the nonstructural protein ORF of the wild-type M33 strain of rubella virus has been obtained and sequenced. Comparison between the nonstructural proteins of the M33 and Therien strains of rubella virus revealed a 98% homology in nucleotide sequence and 98.1% in deduced amino acid sequence. To examine the processing of rubella virus nonstructural protein, the complete nonstructural
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vascular endothelial growth factor-A (VEGF-A) and its receptor, VEGF receptor-2 (VEGFR-2), represent a complex family of angiogenic molecules consisting of different ligands and receptors. Due to the importance of VEGF-A/VEGFR-2 signaling in tumor proliferation and angiogenesis, this study aimed to evaluate the protein and gene expression levels of VEGF-A and VEGFR-2 in canine prostate cancer (PC).
METHODS: We analyzed VEGF-A and VEGFR-2 expression in 87 PC samples by immunohistochemistry and quantitative-polymerase chain reaction. PC samples were graded according to the Gleason s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the functional role of the drug-dependent mesenchymal-epithelial transition (Met)-axiation "π" structural module of neurogenesis after processing by three components of Qingkailing injection in neurogenesis and angiogenesis in cerebral ischemia.
METHODS: We used a Glutathione S-transferase (GST)-pull down assay, isothermal titration calorimetry assay, and other related methods to identify the relationships among Met, inositol polyphosphate phosphatase like 1 (Inppl1), and death associated protein kinase 3 (Dapk3) in this allosteric module. The biological effects of the m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advanced computational tools focusing on protein-protein interaction (PPI) based drug development is a powerful platform to accelerate the therapeutic development of small lead molecules and repurposed drugs. Toll/interleukin-1 receptor (TIR) domain-containing adapter protein (TIRAP) and its interactions with other proteins in macrophages signalling are crucial components of severe or persistent inflammation. TIRAP activation through Bruton's tyrosine kinase (BTK) and Protein Kinase C delta (PKCδ) is essential for downstream inflammatory signalling. We created homology-based structural models
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nonstructural protein 3 (NS3) helicase of HCV is believed to be a plausible target for the identification and designing of potent antiviral drugs. NS3 protein is involved in a positive sense single-stranded viral replication as well as it also cleaves viral poly protein into diverse mature proteins at different time spans. Structural exploration of NS3 revealed that HCV helicase could also act as translocase. In order to identify potential inhibitors for HCV-3a, the current study has been designed. Serum samples from the Pakistani HCV positive patients were collected, sequenced and after p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type III secretion systems (T3SSs) are central virulence mechanisms used by a variety of Gram-negative bacteria to inject effector proteins into host cells. The needle polymer is an essential part of the T3SS that provides the effector proteins a continuous channel into the host cytoplasm. It has been shown for a few T3SSs that two chaperones stabilize the needle protein within the bacterial cytosol to prevent its premature polymerization. In this study, we characterized the chaperones of the enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) needle protein EscF. We found that Orf2 and Orf29, two poorly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kinesin-like proteins are microtubule-associated motors that play important roles in intracellular transport and cell division. We report here the characterization of a new human kinesin-like protein, Rabkinesin6 (RAB6KIFL). The composite cDNA sequence is 2957bp, and encodes a protein of 890 amino acids with a predicted molecular weight of 100kDa. It has high homology (93% similarity) with the mouse kinesin-like protein, Rab6kifl, indicating that it is the human homologue of the mouse gene. RAB6KIFL has all of the structural characteristics required to function as a microtubule-associated moto
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudorabies virus (PRV) is an acute infectious disease characterized by neurological and respiratory symptoms. In order to have a better understanding of the current prevalence of PRV in northeastern China, a strain of PRV was isolated by us. Then, protein structure analysis and pathogenicity testing of the virus were performed to give insight into the characterization of the isolated PRV strains. In this study, the PRV strain named CH/HLJPRVJ/2023 was isolated and identified. Genome-wide phylogenetic analysis shows CH/HLJPRVJ/2023 and HeN1 have higher homology. The CH/HLJPRVJ/2023 strain had
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leucine-rich alpha-2-glycoprotein (LRG) has been repeatedly proposed as a potential plasma biomarker for myelodysplastic syndrome (MDS).
OBJECTIVE: The goal of our work was to establish the total LRG plasma level and LRG posttranslational modifications (PTMs) as a suitable MDS biomarker.
METHODS: The total plasma LRG concentration was determined with ELISA, whilst the LRG-specific PTMs and their locations, were established using mass spectrometry and public mass spectrometry data re-analysis. Homology modelling and sequence analysis were used to establish the potential impact of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathological hallmark of Parkinson's disease is the presence of intracellular inclusions, Lewy bodies, and Lewy neurites, in the dopaminergic neurons of the substantia nigra and several other brain regions. Filamentous alpha-synuclein is the major component of these deposits and its aggregation is believed to play an important role in Parkinson's disease and several other neurodegenerative diseases. Two homologous proteins, beta- and gamma-synucleins, are also abundant in the brain. The synucleins are natively unfolded proteins. beta-Synuclein, which lacks 11 central hydrophobic residues c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins play a crucial role in almost all biological processes, serving as the building blocks of life and mediating various cellular functions, from enzymatic reactions to immune responses. Accurate annotation of protein functions is essential for advancing our understanding of biological systems and developing innovative biotechnological applications and therapeutic strategies. To predict protein function, researchers primarily rely on classical homology-based methods, which use evolutionary relationships, and increasingly on machine learning (ML) approaches. Lately, protein language models
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Src homology 2 domain-containing protein tyrosine phosphatase 2 (SHP2), encoded by the PTPN11 gene, is a ubiquitously expressed non-receptor protein tyrosine phosphatase that functions as a central signaling hub in multiple oncogenic pathways, including RAS-RAF-ERK, PI3K-AKT and JAK-STAT cascades. As a prototypical proto-oncoprotein of the protein tyrosine phosphatase family, SHP2 has been causally implicated in malignant transformation, tumor progression, metastatic dissemination and acquired therapeutic resistance, highlighting its significance as a compelling therapeutic target in oncology.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adaptor protein 180 (AP180) and its homolog, clathrin assembly lymphoid myeloid leukemia protein (CALM), are closely related proteins that play important roles in clathrin-mediated endocytosis. Here, we present the structure of the NH2-terminal domain of CALM bound to phosphatidylinositol-4,5- bisphosphate [PtdIns(4,5)P2] via a lysine-rich motif. This motif is found in other proteins predicted to have domains of similar structure (for example, Huntingtin interacting protein 1). The structure is in part similar to the epsin NH2-terminal (ENTH) domain, but epsin lacks the PtdIns(4,5)P2-binding s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure of the Ascaris allergen, ABA-1 was characterized at several levels. Purified allergen monomers eluted from reducing PAGE were found to reassociate into dimers in phosphate buffered saline containing 0.9 mM Ca2+. This association may involve the formation of disulfide bonds between monomers. The primary amino acid sequence was used to predict secondary structure and compare the allergen to other known proteins sequences. ABA-1 appears to be highly helical protein of two domains. Sequence analysis reveals short regions (25 amino acids) of high homology (76%) between ABA-1 and the m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования